Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480180
• Subject: XM_011240155.1
• Aligned Length: 2524
• Identities: 1868
• Gaps: 353

Alignment

Query    1  ATGGGAAATTATAAATCTAGACCAACCCAAACTTGTACTGATGAATGGAAGAAAAAAGTCAGTGAATCATATGT  74
            |||||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||.
Sbjct    1  ATGGGGAATTACAAATCCAGACCGACACAGACTTGTTCTGATGAATGGAAGAAGAAAGTTAGTGAATCTTATGC  74

Query   75  TATCACAATAGAAAGATTAGAAGATGACCTGCAGATCAAGGAAAAAGAACTGACAGAACTAAGGAATATATTTG  148
            |||.|.|||||||||..|.||||||||||||||||||||.|||||.|||.|...|||||||||..|.||.||||
Sbjct   75  TATTATAATAGAAAGGCTGGAAGATGACCTGCAGATCAAAGAAAATGAATTTCAAGAACTAAGACACATCTTTG  148

Query  149  GCTCTGATGAAGCCTTCAGTAAAGTCAATTTAAATTACCGCACTGAAAATGGGCTGTCTCTACTTCATTTATGT  222
            |||||||.||||||||||||.||||||.|||||||||||||||.||...|||.|||||.|||||.||..|.||.
Sbjct  149  GCTCTGACGAAGCCTTCAGTGAAGTCAGTTTAAATTACCGCACAGAGCGTGGCCTGTCCCTACTGCACCTCTGC  222

Query  223  TGCATTTGTGGAGGCAAGAAATCACATATTCGAACTCTTATGTTGAAAGGGCTCCGCCCATCTCGACTGACAAG  296
            ||....||.||.|||||.||.||.|||||.||..|.||||||||.|||||||||||.|||||..||||||||||
Sbjct  223  TGTGCCTGCGGTGGCAACAAGTCGCATATCCGTGCCCTTATGTTAAAAGGGCTCCGTCCATCCAGACTGACAAG  296

Query  297  AAATGGATTTACAGCCTTGCATTTAGCAGTTTACAAGGATAATGC--AGAATTGATCACTTCTCTGCTTCACAG  368
            ||||||.|||.||||..||||.||.||.|||||||||||||  ||  .|||.|.||||||||.|||.|.||.||
Sbjct  297  AAATGGGTTTCCAGCTCTGCACTTGGCTGTTTACAAGGATA--GCCTGGAACTTATCACTTCACTGTTGCATAG  368

Query  369  TGGAGCTGATATACAGCAGGTTGGATACGGTGGCCTCACTGCCCTCCATATTGCTACAATAGCTGGCCACCTAG  442
            .|||||.|||.|.|||||.|..|||||.||.||||||||.||||||||.||.|||.||||||||||.||||.||
Sbjct  369  CGGAGCAGATGTTCAGCAAGCGGGATATGGCGGCCTCACAGCCCTCCACATCGCTGCAATAGCTGGGCACCCAG  442

Query  443  AGGCTGCTGATGTGCTGTTGCAACATGGAGCTAATGTCAATATTCAAGATGCAGTTTTTTTCACTCCATTGCAT  516
            ||||.|..||.||||||.||||.||||||||.|||||.||..|||||||||||||.||.|||||.|||.||||.
Sbjct  443  AGGCCGTGGAAGTGCTGCTGCAGCATGGAGCCAATGTGAACGTTCAAGATGCAGTCTTCTTCACCCCACTGCAC  516

Query  517  ATTGCAGCGTACTATGGACATGAACAGGTAACTCGCCTTCTTTTGAAATTTGGTGCTGATGTAAATGTAAGTGG  590
            ||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||..|..|.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  517  ATCGCAGCCTATTACGGGCACGAGCAGGTAACCAGTGTCCTTTTGAAGTTTGGAGCTGATGTCAATGTAAGCGG  590

Query  591  TGAAGTTGGAGATAGACCCCTCCACCTAGCATCTGCAAAAGGATTCTTGAATATTGCAAAACTCTTGATGGAAG  664
            ||||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||..||||||   .|||.||
Sbjct  591  TGAAGTTGGAGACAGGCCTCTGCACCTGGCCTCTGCAAAAGGGTTCTTCAACATTGTGAAACTC---CTGGTAG  661

Query  665  AAGGCAGCAAAGCAGATGTGAATGCTCAAGATAATGAAGACCATGTCCCACTCCATTTCTGTTCTCGATTTGGA  738
            ||||.|.||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  662  AAGGGAACAAAGCCGACGTGAACGCTCAGGACAATGAAGACCATGTCCCTCTGCACTTCTGTTCTCGATTTGGA  735

Query  739  CACCATGATATAGTTAAGTATCTGCTGCAAAGTGATTTGGAAGTTCAACCTCATGTTGTTAATATCTATGGAGA  812
            |||||..|||||||.|..||..||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||..||||.||||||||.||
Sbjct  736  CACCACAATATAGTGAGCTACTTGCTCCAGAGTGACTTGGAGGTTCAGCCTCACGTCATTAACATCTATGGTGA  809

Query  813  TACCCCCTTACACCTGGCATGCTACAATGGCAAATTTGAAGTTGCCAAGGAAATCATCCAAATATCAGGAACAG  886
            .||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||..||||..||.|||||||.|
Sbjct  810  CACTCCTTTGCACCTGGCGTGCTACAATGGAAATTTTGAAGTTGCCAAGGAAATTGTCCACGTAACAGGAACTG  883

Query  887  AAAGTCTGACTAAGGAAAACATCTTCAGTGAAACAGCTTTTCATAGTGCTTGTACCTATGGCAAGAGCATTGAC  960
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  884  AAAGTCTGACTAAGGAAAACATCTTCAGTGAGACAGCTTTTCACAGTGCTTGTACCTATGGCAAGAACATTGAC  957

Query  961  CTAGTCAAATTTCTTCTTGATCAGAATGTCATAAACATCAACCACCAAGGAAGGGATGGGCACACTGGATTACA  1034
            ||.||||||||.||||||||||||||||...|.|||||.|||||.|.||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  958  CTGGTCAAATTCCTTCTTGATCAGAATGCTGTGAACATTAACCATCGAGGAAGAGATGGGCACACAGGATTACA  1031

Query 1035  CTCTGCTTGCTACCACGGTCACATTCGCCTGGTTCAGTTCTTACTGGATAATGGAGCTGATATGAATCTAGTGG  1108
            |||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 1032  CTCTGCTTGCTACCATGGCCACATACGCCTGGTTCAGTTCCTACTGGATAATGGTGCAGATATGAATCTAGTTG  1105

Query 1109  CTTGTGATCCCAGCAGGTCTAGTGGTGAAAAAGATGAGCAGACATGTTTGATGTGGGCTTATGAAAAAGGGCAT  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1106  CTTGTGATCCCAGCAGGTCTAGTGGTGAAAAAGATGAGCAGACATGTTTGATGTGGGCTTATGAGAAAGGACAT  1179

Query 1183  GATGCCATTGTCACACTCCTGAAGCATTATAAGAGACCACAAGATGAATTGCCCTGTAATGAATATTCTCAGCC  1256
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||..||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1180  GATGCCATTGTTACACTCCTGAAGCACTATAAGAGACCCCAGGATGAGCTGCCATGTAACGAATATTCTCAGCC  1253

Query 1257  TGGAGGAGATGGCTCCTATGTGTCTGTTCCATCACCCTTGGGGAAGATTAAAAGCATGACAAAAGAGAAGGCAG  1330
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254  TGGAGGAGATGGCTCCTATGTGTCTGTCCCATCCCCCTTGGGGAAGATTAAAAGCATGACAAAAGAGAAGGCAG  1327

Query 1331  ATATTCTCCTCCTAAGAGCTGGATTGCCTTCACATTTCCATCTTCAGCTCTCAGAAATTGAGTTCCATGAGATT  1404
            ||.||||||||||.||.||||.|||.||.||.|.|||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1328  ATGTTCTCCTCCTGAGGGCTGAATTACCCTCCCGTTTCCATCTGCAGCTCTCGGAAATTGAATTCCATGAGATT  1401

Query 1405  ATTGGCTCAGGTTCTTTTGGGAAAGTATATAAAGGACGATGCAGAAATAAAATAGTGGCTATAAAACGTTATCG  1478
            ||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 1402  ATCGGCTCAGGTTCTTTTGGGAAAGTCTATAAAGGGCGATGCAGAAATAAAATAGTGGCAATCAAACGATACCG  1475

Query 1479  AGCCAATACCTACTGCTCCAAGTCAGATGTGGATATGTTTTGCCGAGAGGTGTCCATTCTCTGCCAGCTCAATC  1552
            ||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1476  AGCCAACACCTACTGCTCCAAGTCAGACGTGGATATGTTTTGCCGAGAAGTGTCCATCCTCTGCCAGCTCAATC  1549

Query 1553  ATCCCTGCGTAATTCAGTTTGTGGGTGCTTGCTTGAATGATCCCAGCCAGTTTGCCATTGTCACTCAATACATA  1626
            |.||||||||..||||||||||||||||.|||.||.||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1550  ACCCCTGCGTGGTTCAGTTTGTGGGTGCCTGCCTGGATGACCCCAGCCAGTTTGCCATTGTCACACAATACATT  1623

Query 1627  TCAGGGGGTTCTCTGTTCTCCCTCCTTCATGAGCAGAAGAGGATTCTTGATTTGCAGTCTAAATTAATTATTGC  1700
            |||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1624  TCAGGAGGCTCTCTGTTCTCCCTGCTTCATGAACAGAAGAGAATTCTTGACTTGCAGTCTAAATTAATCATTGC  1697

Query 1701  AGTAGATGTTGCCAAAGGCATGGAGTACCTTCACAACCTGACACAGCCAATTATACATCGTGACTTGAACAGTC  1774
            ||||||.||||||||.||||||||||||||.||||.|.||||.||||||||.|||||.||.|||.|||||||||
Sbjct 1698  AGTAGACGTTGCCAAGGGCATGGAGTACCTGCACAGCTTGACCCAGCCAATCATACACCGCGACCTGAACAGTC  1771

Query 1775  ACAATATTCTTCTCTATGAGGATGGGCATGCTGTGGTGGCAGATTTTGGAGAATCAAGATTTCTACAGTCTCTG  1848
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1772  ACAATATTCTTCTCTATGAGGACGGCCATGCTGTGGTGGCAGATTTTGGAGAATCAAGATTTCTGCAGTCCCTG  1845

Query 1849  GATGAAGACAACATGACAAAACAACCTGGGAACCTCCGTTGGATGGCTCCTGAGGTGTTCACGCAGTGCACTCG  1922
            ||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1846  GATGAAGACAACATGACAAAGCAGCCAGGGAACCTGCGCTGGATGGCCCCCGAGGTGTTCACACAGTGCACGCG  1919

Query 1923  GTACACCATCAAAGCAGATGTCTTCAGCTATGCTCTGTGTCTGTGGGAAATTCTCACTGGCGAAATTCCATTCG  1996
            .|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||..|.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1920  CTACACCATCAAGGCTGATGTCTTCAGTTACGCCCTGTGTCTGTGGGAGCTCCTCACTGGAGAAATTCCATTCG  1993

Query 1997  CTCATCTCAAGCCAGCGGCTGCGGCAGCAGACATGGCTTACCACCACATCAGACCTCCCATTGGCTATTCCATT  2070
            |||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 1994  CTCATCTGAAGCCAGCCGCTGCAGCAGCAGATATGGCGTACCACCACATCAGACCTCCCATCGGCTACTCCATC  2067

Query 2071  CCCAAGCCCATATCATCTCTGCTGATACGAGGGTGGAACGCATGTCCTGAAGG-----------AAGAC---CC  2130
            ||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||.|           |||||   ||
Sbjct 2068  CCCAAGCCAATCTCATCTCTGCTGATGCGGGGCTGGAATGCATGTCCCGAATGCCTGTGTAATCAAGACTGGCC  2141

Query 2131  --GAATTTTCTGAAGTTGTCATGAAGTTAGAAGAGTGTCTCT-GCAACATTGAGCTGATGTCTCCTGCATCAAG  2201
              ||||         |||..|||.||  |..|||.||.||.| |.||    ||.|.||..||||          
Sbjct 2142  TGGAAT---------TTGCGATGGAG--ACCAGACTGACTTTGGGAA----GACCCGAGTTCTC----------  2190

Query 2202  TAACAGCAGTGGGTCTCTCTCACCTTCTTCTTCTTCTGATTGCCTGGTGAACCGGGGAGGACCTGGCCGGAGTC  2275
                                                                                      
Sbjct 2191  --------------------------------------------------------------------------  2190

Query 2276  ATGTGGCAGCATTAAGAAGTCGTTTCGAATTGGAATATGCTCTAAATGCAAGGTCCTATGCTGCTTTGTCCCAA  2349
                                                                                      
Sbjct 2191  --------------------------------------------------------------------------  2190

Query 2350  AGTGCTGGACAATATTCCTCTCAAGGTCTGTCTTTGGAGGAGATGAAAAGAAGTCTTCAATACACACCCATTGA  2423
                                                                                      
Sbjct 2191  --------------------------------------------------------------------------  2190

Query 2424  CAAATATGGCTATGTATCCGATCCCATGAGCTCAATGCATTTTCATTCTTGCCGAAATAGTAGCAGCTTTGAGG  2497
                                                                                      
Sbjct 2191  --------------------------------------------------------------------------  2190

Query 2498  ACAGCAGC  2505
                    
Sbjct 2191  --------  2190