Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480205
- Subject:
- NM_001310332.1
- Aligned Length:
- 2763
- Identities:
- 1767
- Gaps:
- 996
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGACTTATGCACCAGGGCTGGGGAGCCCAGCCTAACTCAAAATACTCATCCAAGACAGCAGGCACTGGAGCA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GCTGTTGGAAGACAAGGTTGAAGATGATATGCTGCAGCTTTCAGAATTTGACCCCCTATTGAGAGAGATTGCTC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CTGGCCCCCTCACCACACCCTCTGTCCCAGGCTCCACTCCTGGTCCCTGCTTCCTCTGTGGTTCTGCCCCAGGC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 ACACTGCACTGCCCATCCTGTAAACAGGCCCTGTGTCCAGCCTGTGACCACCTGTTCCATGGACACCCATCCCG 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 TGCTCATCACCTCCGCCAGACCCTGCCTGGGGTCCTGCAGGGTACCCACCTGAGCCCCAGTTTACCTGCCTCAG 370
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 371 CCCAACCACGGCCCCAGTCGACCTCCCTGCTGGCCCTGGGAGACAGCTCTCTTTCTTCCCCTAATCCTGCAAGT 444
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 445 GCTCATTTGCCCTGGCACTGTGCTGCCTGTGCCATGCTAAATGAGCCTTGGGCAGTGCTCTGTGTGGCCTGTGA 518
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 519 TCGGCCCCGAGGCTGTAAGGGGTTGGGGTTGGGAACTGAGGGTCCCCAAGGAACTGGAGGCCTAGAACCTGATC 592
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 593 TTGCACGGGGTCGGTGGGCCTGCCAGAGCTGTACCTTTGAGAATGAGGCAGCTGCTGTGCTATGTTCCATATGT 666
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 667 GAGCGACCTCGGCTGGCCCAGCCTCCCAGCTTGGTGGTGGATTCCCGAGATGCTGGCATTTGCCTGCAACCCCT 740
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 741 TCAGCAGGGGGATGCTTTGCTGGCCTCTGCCCAGAGTCAAGTCTGGTACTGTATTCACTGTACCTTCTGCAACT 814
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 815 CGAGCCCTGGCTGGGTGTGTGTTATGTGCAACCGGACTAGTAGCCCCATTCCAGCACAACATGCCCCCCGGCCC 888
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 889 TATGCCAGCTCTTTGGAAAAGGGACCCCCCAAGCCTGGGCCCCCACGACGCCTTAGTGCCCCCCTGCCCAGTTC 962
Query 1 ----------------------------------ATGCGGGAAGAAGGCCTCCAGCTAGTGAGCATGATCCGGG 40
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTGTGGAGATCCTGAGAAGCAGCGCCAAGACAAGATGCGGGAAGAAGGCCTCCAGCTAGTGAGCATGATCCGGG 1036
Query 41 AAGGGGAAGCCGCAGGTGCCTGTCCAGAGGAGATCTTCTCGGCTCTGCAGTACTCGGGCACTGAGGTGCCTCTG 114
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAGGGGAAGCCGCAGGTGCCTGTCCAGAGGAGATCTTCTCGGCTCTGCAGTACTCGGGCACTGAGGTGCCTCTG 1110
Query 115 CAGTGGTTGCGCTCAGAACTGCCCTACGTCCTGGAGATGGTGGCTGAGCTGGCTGGACAGCAGGACCCTGGGCT 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CAGTGGTTGCGCTCAGAACTGCCCTACGTCCTGGAGATGGTGGCTGAGCTGGCTGGACAGCAGGACCCTGGGCT 1184
Query 189 GGGTGCCTTTTCCTGTCAGGAGGCCCGGAGAGCCTGGCTGGATCGTCATGGCAACCTTGATGAAGCTGTGGAGG 262
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGGTGCCTTTTCCTGTCAGGAGGCCCGGAGAGCCTGGCTGGATCGTCATGGCAACCTTGATGAAGCTGTGGAGG 1258
Query 263 AGTGTGTGAGGACCAGGCGAAGGAAGGTGCAGGAGCTCCAGTCTCTAGGCTTTGGGCCTGAGGAGGGGTCTCTC 336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGTGTGTGAGGACCAGGCGAAGGAAGGTGCAGGAGCTCCAGTCTCTAGGCTTTGGGCCTGAGGAGGGGTCTCTC 1332
Query 337 CAGGCATTGTTCCAGCACGGAGGTGATGTGTCACGGGCCCTGACTGAGCTACAGCGCCAACGCCTAGAGCCCTT 410
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGGCATTGTTCCAGCACGGAGGTGATGTGTCACGGGCCCTGACTGAGCTACAGCGCCAACGCCTAGAGCCCTT 1406
Query 411 CCGCCAGCGCCTCTGGGACAGTGGCCCTGAGCCCACCCCTTCCTGGGATGGGCCAGACAAGCAGAGCCTGGTCA 484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CCGCCAGCGCCTCTGGGACAGTGGCCCTGAGCCCACCCCTTCCTGGGATGGGCCAGACAAGCAGAGCCTGGTCA 1480
Query 485 GGCGGCTTTTGGCAGTCTACGCACTCCCCAGCTGGGGCCGGGCAGAGCTGGCACTGTCACTGCTGCAGGAGACA 558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GGCGGCTTTTGGCAGTCTACGCACTCCCCAGCTGGGGCCGGGCAGAGCTGGCACTGTCACTGCTGCAGGAGACA 1554
Query 559 CCCAGGAACTATGAGTTGGGGGATGTGGTAGAAGCTGTGAGGCACAGCCAGGACCGGGCCTTCCTGCGCCGCTT 632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCCAGGAACTATGAGTTGGGGGATGTGGTAGAAGCTGTGAGGCACAGCCAGGACCGGGCCTTCCTGCGCCGCTT 1628
Query 633 GCTTGCCCAGGAGTGTGCCGTGTGTGGCTGGGCCCTGCCCCACAACCGGATGCAGGCCCTGACTTCCTGTGAGT 706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCTTGCCCAGGAGTGTGCCGTGTGTGGCTGGGCCCTGCCCCACAACCGGATGCAGGCCCTGACTTCCTGTGAGT 1702
Query 707 GCACCATCTGTCCTGACTGCTTCCGCCAGCACTTCACCATCGCCTTGAAGGAGAAGCACATCACAGACATGGTG 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GCACCATCTGTCCTGACTGCTTCCGCCAGCACTTCACCATCGCCTTGAAGGAGAAGCACATCACAGACATGGTG 1776
Query 781 TGCCCTGCCTGTGGCCGCCCCGACCTCACCGATGACACACAGTTGCTCAGCTACTTCTCTACCCTTGACATCCA 854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TGCCCTGCCTGTGGCCGCCCCGACCTCACCGATGACACACAGTTGCTCAGCTACTTCTCTACCCTTGACATCCA 1850
Query 855 GCTTCGCGAGAGCCTAGAGCCAGATGCCTATGCGTTGTTCCATAAGAAGCTGACCGAGGGTGTGCTGATGCGGG 928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GCTTCGCGAGAGCCTAGAGCCAGATGCCTATGCGTTGTTCCATAAGAAGCTGACCGAGGGTGTGCTGATGCGGG 1924
Query 929 ACCCCAAGTTCTTGTGGTGTGCCCAGTGCTCCTTTGGCTTCATATATGAGCGTGAGCAGCTGGAGGCAACTTGT 1002
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ACCCCAAGTTCTTGTGGTGTGCCCAGTGCTCCTTTGGCTTCATATATGAGCGTGAGCAGCTGGAGGCAACTTGT 1998
Query 1003 CCCCAGTGTCACCAGACCTTCTGTGTGCGCTGCAAGCGCCAGTGGGAGGAGCAGCACCGAGGTCGGAGCTGTGA 1076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CCCCAGTGTCACCAGACCTTCTGTGTGCGCTGCAAGCGCCAGTGGGAGGAGCAGCACCGAGGTCGGAGCTGTGA 2072
Query 1077 GGACTTCCAGAACTGGAAACGCATGAACGACCCAGAATACCAGGCCCAGGGCCTAGCAATGTATCTTCAGGAAA 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GGACTTCCAGAACTGGAAACGCATGAACGACCCAGAATACCAGGCCCAGGGCCTAGCAATGTATCTTCAGGAAA 2146
Query 1151 ACGGCATTGACTGCCCCAAATGCAAGTTCTCGTACGCCCTGGCCCGAGGAGGCTGCATGCACTTTCACTGTACC 1224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ACGGCATTGACTGCCCCAAATGCAAGTTCTCGTACGCCCTGGCCCGAGGAGGCTGCATGCACTTTCACTGTACC 2220
Query 1225 CAGTGCCGCCACCAGTTCTGCAGCGGCTGCTACAATGCCTTTTACGCCAAGAATAAATGTCCAGAGCCTAACTG 1298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CAGTGCCGCCACCAGTTCTGCAGCGGCTGCTACAATGCCTTTTACGCCAAGAATAAATGTCCAGAGCCTAACTG 2294
Query 1299 CAGGGTGAAAAAGTCCCTGCACGGCCACCACCCTCGAGACTGCCTCTTCTACCTGCGGGACTGGACTGCTCTCC 1372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CAGGGTGAAAAAGTCCCTGCACGGCCACCACCCTCGAGACTGCCTCTTCTACCTGCGGGACTGGACTGCTCTCC 2368
Query 1373 GGCTTCAGAAGCTGCTACAGGACAATAACGTCATGTTTAATACAGAGCCTCCAGCTGGGGCCCGGGCAGTCCCT 1446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 GGCTTCAGAAGCTGCTACAGGACAATAACGTCATGTTTAATACAGAGCCTCCAGCTGGGGCCCGGGCAGTCCCT 2442
Query 1447 GGAGGCGGCTGCCGAGTGATAGAGCAGAAGGAGGTTCCCAATGGGCTCAGGGACGAAGCTTGTGGCAAGGAAAC 1520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GGAGGCGGCTGCCGAGTGATAGAGCAGAAGGAGGTTCCCAATGGGCTCAGGGACGAAGCTTGTGGCAAGGAAAC 2516
Query 1521 TCCAGCTGGCTATGCCGGCCTGTGCCAGGCACACTACAAAGAGTATCTTGTGAGCCTCATCAATGCCCACTCGC 1594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TCCAGCTGGCTATGCCGGCCTGTGCCAGGCACACTACAAAGAGTATCTTGTGAGCCTCATCAATGCCCACTCGC 2590
Query 1595 TGGACCCAGCCACCTTGTATGAGGTGGAAGAGCTGGAGACGGCCACTGAGCGCTACCTGCACGTACGCCCCCAG 1668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TGGACCCAGCCACCTTGTATGAGGTGGAAGAGCTGGAGACGGCCACTGAGCGCTACCTGCACGTACGCCCCCAG 2664
Query 1669 CCTTTGGCTGGAGAGGATCCCCCTGCTTACCAGGCCCGCTTGTTACAGAAGCTGACAGAAGAGGTACCCTTGGG 1742
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CCTTTGGCTGGAGAGGATCCCCCTGCTTACCAGGCCCGCTTGTTACAGAAGCTGACAGAAGAGGTACCCTTGGG 2738
Query 1743 ACAGAGTATCCCCCGCAGGCGGAAG 1767
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 ACAGAGTATCCCCCGCAGGCGGAAG 2763
