Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480261
- Subject:
- XM_006524311.3
- Aligned Length:
- 1625
- Identities:
- 1267
- Gaps:
- 148
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGACTCCAGGTACTTGTGGCCCACACGACCTTCATGTGGACAATACAACGTGTGTGTGGCAAAGAAGTGGCTC 74
Query 1 ------------------------------------------------ATGCTAGAACGGCCTCCT---GCACT 23
.||||.|.| |||| ||..|
Sbjct 75 TCTTGTGGGCCACAGGACCAAGTGCTGTTTGAGTGGACACATTGCTTTGTGCTCGGA-----TCCTTTAGCGTT 143
Query 24 GGCCATGCCCATGCCCACGGAGGGCACCCCGCCACCTCTGAGTGGCACCCCCATCCCAGTCCCAGCCTACTTCC 97
|||||||.||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 144 GGCCATGACCATGCCCACCGAGGGCACCCCACCACCCCTAAGTGGTACCCCCATCCCAGTTCCAGCTTACTTCC 217
Query 98 GCCACGCAGAACCTGGATTCTCCCTCAAGAGGCCCAGGGGGCTCAGCCGGAGCCTCCCACCTCCGCCCCCTGCC 171
|.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..||||.|||||.||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 218 GACACGCAGAGCCTGGTTTCTCCCTCAAAAGGCCTGGGGGCCTCAGTCGGAGCCTCCCACCTCGGCCCCCTGCC 291
Query 172 AAGGGCAGCATTCCCATCAGCCGCCTCTTCCCTCCTCGGACCCCAGGCTGGCACCAGCTGCAGCCCCGGCGGGT 245
||||||.||||.||..|||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||..|||||||||.||||
Sbjct 292 AAGGGCTGCATCCCTGTCAGCCGTCTATTCCCCCCTCGCACCCCAGGCTGGCACCAGCCCCAGCCCCGGAGGGT 365
Query 246 GTCATTCCGGGGCGAGGCCTCAGAGACTCTGCAGAGCCCTGGGTATGACCCAAGCCGGCCAGAGTCCTTCTTCC 319
|||.||||.|.|.|||.||||||||.|.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 366 GTCTTTCCTGTGTGAGACCTCAGAGCCCCTGCAGAGTCCTGGGTATGACCCGAGCCGGCCCGAGTCCTTCTTTC 439
Query 320 AGCAGAGCTTCCAGAGGCTCAGCCGCCTGGGCCATGGCTCCTACGGAGAGGTCTTCAAGGTGCGCTCCAAGGAG 393
||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 440 AGCAGAACTTCCAGAGGCTCAGCCGCCTGGGTCATGGCTCATATGGAGAAGTCTTCAAGGTGCGCTCTAAGGAA 513
Query 394 GACGGCCGGCTCTATGCGGTAAAGCGTTCCATGTCACCATTCCGGGGCCCCAAGGACCGGGCCCGCAAGTTGGC 467
||.||.||.||||||||.||.|||||.|.||||||.||||||||.||||||||.|||||..|.||.||..||||
Sbjct 514 GATGGGCGACTCTATGCTGTTAAGCGCTACATGTCGCCATTCCGCGGCCCCAAAGACCGAACTCGTAAACTGGC 587
Query 468 CGAGGTGGGCAGCCACGAGAAGGTGGGGCAGCACCCATGCTGCGTGCGGCTGGAGCAGGCCTGGGAGGAGGGCG 541
.|||||.||..||||.|||||.|||||||||||.|||..|||||||.|.|||||||.|||||||||||||||.|
Sbjct 588 TGAGGTAGGTGGCCATGAGAAAGTGGGGCAGCATCCACACTGCGTGAGACTGGAGCGGGCCTGGGAGGAGGGTG 661
Query 542 GCATCCTGTACCTGCAGACGGAGCTGTGCGGGCCCAGCCTGCAGCAACACTGTGAGGCCTGGGGTGCCAGCCTG 615
|||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 662 GCATCCTATACCTGCAGACAGAACTCTGCGGGCCCAGCCTGCAGCAACACTGTGAAGCCTGGGGGGCCAGCCTG 735
Query 616 CCTGAGGCCCAGGTCTGGGGCTACCTGCGGGACACGCTGCTTGCCCTGGCCCATCTGCACAGCCAGGGCCTGGT 689
||.|||||||||||||||||||||.|||||||||..||.||.||.||||.||||||.||.||.||.|||||.||
Sbjct 736 CCAGAGGCCCAGGTCTGGGGCTACTTGCGGGACATTCTTCTGGCTCTGGACCATCTACATAGTCAAGGCCTAGT 809
Query 690 GCACCTTGATGTCAAGCCTGCCAACATCTTCCTGGGGCCCCGGGGCCGCTGCAAGCTGGGTGACTTCGGACTGC 763
.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 810 TCACCTTGATGTCAAGCCTGCCAACATCTTCTTGGGCCCCCGGGGCCGCTGCAAGCTGGGCGACTTTGGACTAC 883
Query 764 TGGTGGAGCTGGGTACAGCAGGAGCTGGTGAGGTCCAGGAGGGAGACCCCCGCTACATGGCCCCCGAGCTGCTG 837
||||||||||||||.||||.||.|||||.||||.||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 884 TGGTGGAGCTGGGTTCAGCCGGTGCTGGCGAGGCCCAGGAGGGAGATCCTCGCTACATGGCCCCAGAACTGCTG 957
Query 838 CAGGGCTCCTATGGGACAGCAGCGGATGTGTTCAGTCTGGGCCTCACCATCCTGGAAGTGGCATGCAACATGGA 911
||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.||.||||||||
Sbjct 958 CAGGGCTCTTATGGGACAGCAGCAGATGTGTTCAGTCTGGGTCTCACCATCTTGGAAGTGGCCTGTAACATGGA 1031
Query 912 GCTGCCCCACGGTGGGGAGGGCTGGCAGCAGCTGCGCCAGGGCTACCTGCCCCCTGAGTTCACTGCCGGTCTGT 985
.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1032 ACTGCCCCATGGTGGGGAGGGCTGGCAGCAGCTGCGCCAGGGATACTTGCCCCCTGAGTTCACTGCTGGTCTGT 1105
Query 986 CTTCCGAGCTGCGTTCTGTCCTTGTCATGATGCTGGAGCCAGACCCCAAGCTGCGGGCCACGGCCGAGGCCCTG 1059
||||.|||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||||||.||||.||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 1106 CTTCTGAGCTGCGTTCTGTCCTCGCCATGATGCTGGAGCCTGACCCCCAGCTTCGAGCCACAGCTGAGGCCCTG 1179
Query 1060 CTGGCACTGCCTGTGTTGAGGCAGCCGCGGGCCTGGGGTGTGCTGTGGTGCATGGCAGCGGAGGCCCTGAGCCG 1133
.||||..|.||..||.||||||||||.||..|||||..|||.|||||||..|||||.|||||.|||||.||.||
Sbjct 1180 TTGGCCTTACCCATGCTGAGGCAGCCACGTCCCTGGAATGTTCTGTGGTATATGGCTGCGGAAGCCCTAAGTCG 1253
Query 1134 AGGGTGGGCCCTGTGGCAGGCCCTGCTTGCCCTGCTCTGCTGGCTCTGGCATGGGCTGGCTCACCCTGCCAGCT 1207
|||.|||||||||||||||||||||.|..|.||||||||||||||||||||.|||||||..||.||||||||.|
Sbjct 1254 AGGCTGGGCCCTGTGGCAGGCCCTGGTCACTCTGCTCTGCTGGCTCTGGCACGGGCTGGTGCATCCTGCCAGTT 1327
Query 1208 GGCTACAGCCCCTGGGCCCGCCAGCCACCCCGCCTGGCTCACCACCCTGCAGTTTGCTCCTGGACAGCAGCCTC 1281
||||.|||||.|..|||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||....|||||||||||||.||||
Sbjct 1328 GGCTGCAGCCTCCAGGCCCACCGGCCACACCACCTGGCTCTCCACCTTGCAGCCCCCTCCTGGACAGCACCCTC 1401
Query 1282 TCCAGCAACTGGGATGACGACAGCCTAGGGCCTTCACTCTCCCCTGAGGCTGTCCTGGCCCGG---ACTGTGGG 1352
|||||||.|||||||.|.||||||.||||.||.|||||||||||.|||.|.||||||.||||| ||| .|
Sbjct 1402 TCCAGCAGCTGGGATAATGACAGCATAGGTCCCTCACTCTCCCCAGAGACCGTCCTGTCCCGGATCACT---AG 1472
Query 1353 GAGCACCTCCACCCCCCGGAGCAGGTGCACACCCAGGGATGCCCTGGACCTAAGTGACATCAACTCAGAGCCTC 1426
.||.|||||.|||||.|||.| ||||||||||||||||||||.|||..|..||||||||||||
Sbjct 1473 AAGAACCTCTACCCCTCGGGG------------CAGGGATGCCCTGGACCTAACTGATGTGGACTCAGAGCCTC 1534
Query 1427 CTCGGGGCTCCTTCCCCTCCTTTGAGCCTCGGAACCTCCTCAGCCTGTTTGAGGACACCCTAGACCCAACC 1497
|..|.||..|||.||||.||||||||||..||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1535 CAAGAGGTCCCTGCCCCACCTTTGAGCCAAGGAACCTCCTCAGCCTGTTTGAGGACTCCCTAGACCCAGCC 1605