Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480275
• Subject: XM_017010714.2
• Aligned Length: 1839
• Identities: 1733
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  ATGTGCTGCTGGCCGCTGCTCCTGCTGTGGGGGCTGCTCCCCGGGACGGCGGCGGGGGGCTCGGGCCGAACCTA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGCTGCTGGCCGCTGCTCCTGCTGTGGGGGCTGCTCCCCGGGACGGCGGCGGGGGGCTCGGGCCGAACCTA  74

Query   75  TCCGCACCGGACCCTCCTGGACTCGGAGGGCAAGTACTGGCTGGGCTGGAGCCAGCGGGGCAGCCAGATCGCCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCCGCACCGGACCCTCCTGGACTCGGAGGGCAAGTACTGGCTGGGCTGGAGCCAGCGGGGCAGCCAGATCGCCT  148

Query  149  TCCGCCTCCAGGTGCGCACTGCAGGCTACGTGGGCTTCGGCTTCTCGCCCACCGGGGCCATGGCGTCCGCCGAC  222
            ||||                                                                      
Sbjct  149  TCCG----------------------------------------------------------------------  152

Query  223  ATCGTCGTGGGCGGGGTGGCCCACGGGCGGCCCTACCTCCAGGATTATTTTACAAATGCAAATAGAGAGTTGAA  296
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  153  -----------------------------------CCTCCAGGATTATTTTACAAATGCAAATAGAGAGTTGAA  191

Query  297  AAAAGATGCTCAGCAAGATTACCATCTAGAATATGCCATGGAAAATAGCACACACACAATAATTGAATTTACCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  192  AAAAGATGCTCAGCAAGATTACCATCTAGAATATGCCATGGAAAATAGCACACACACAATAATTGAATTTACCA  265

Query  371  GAGAGCTGCATACATGTGACATAAATGACAAGAGTATAACGGATAGCACTGTGAGAGTGATCTGGGCCTACCAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  266  GAGAGCTGCATACATGTGACATAAATGACAAGAGTATAACGGATAGCACTGTGAGAGTGATCTGGGCCTACCAC  339

Query  445  CATGAAGATGCAGGAGAAGCTGGTCCCAAGTACCATGACTCCAATAGGGGCACCAAGAGTTTGCGGTTATTGAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  340  CATGAAGATGCAGGAGAAGCTGGTCCCAAGTACCATGACTCCAATAGGGGCACCAAGAGTTTGCGGTTATTGAA  413

Query  519  TCCTGAGAAAACTAGTGTGCTATCTACAGCCTTACCATACTTTGATCTGGTAAATCAGGACGTCCCCATCCCAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  414  TCCTGAGAAAACTAGTGTGCTATCTACAGCCTTACCATACTTTGATCTGGTAAATCAGGACGTCCCCATCCCAA  487

Query  593  ACAAAGATACAACATATTGGTGCCAAATGTTTAAGATTCCTGTGTTCCAAGAAAAGCATCATGTAATAAAGGTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  488  ACAAAGATACAACATATTGGTGCCAAATGTTTAAGATTCCTGTGTTCCAAGAAAAGCATCATGTAATAAAGGTT  561

Query  667  GAGCCAGTGATACAGAGAGGCCATGAGAGTCTGGTGCACCACATCCTGCTCTATCAGTGCAGCAACAACTTTAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  562  GAGCCAGTGATACAGAGAGGCCATGAGAGTCTGGTGCACCACATCCTGCTCTATCAGTGCAGCAACAACTTTAA  635

Query  741  CGACAGCGTTCTGGAGTCCGGCCACGAGTGCTATCACCCCAACATGCCCGATGCATTCCTCACCTGTGAAACTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  636  CGACAGCGTTCTGGAGTCCGGCCACGAGTGCTATCACCCCAACATGCCCGATGCATTCCTCACCTGTGAAACTG  709

Query  815  TGATTTTTGCCTGGGCTATTGGTGGAGAGGGCTTTTCTTATCCACCTCATGTTGGATTATCCCTTGGCACTCCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  TGATTTTTGCCTGGGCTATTGGTGGAGAGGGCTTTTCTTATCCACCTCATGTTGGATTATCCCTTGGCACTCCA  783

Query  889  TTAGATCCGCATTATGTGCTCCTAGAAGTCCATTATGATAATCCCACTTATGAGGAAGGCTTAATAGATAATTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  784  TTAGATCCGCATTATGTGCTCCTAGAAGTCCATTATGATAATCCCACTTATGAGGAAGGCTTAATAGATAATTC  857

Query  963  TGGACTGAGGTTATTTTACACAATGGATATAAGGAAATATGATGCTGGGGTGATTGAGGCTGGCCTCTGGGTGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  858  TGGACTGAGGTTATTTTACACAATGGATATAAGGAAATATGATGCTGGGGTGATTGAGGCTGGCCTCTGGGTGA  931

Query 1037  GCCTCTTCCATACCATCCCTCCAGGGATGCCTGAGTTCCAGTCTGAGGGTCACTGCACTTTGGAGTGCCTGGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  932  GCCTCTTCCATACCATCCCTCCAGGGATGCCTGAGTTCCAGTCTGAGGGTCACTGCACTTTGGAGTGCCTGGAA  1005

Query 1111  GAGGCTCTGGAAGCCGAAAAGCCAAGTGGAATTCATGTGTTTGCTGTTCTTCTCCATGCTCACCTGGCTGGCAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006  GAGGCTCTGGAAGCCGAAAAGCCAAGTGGAATTCATGTGTTTGCTGTTCTTCTCCATGCTCACCTGGCTGGCAG  1079

Query 1185  AGGCATCAGGCTGCGTCATTTTCGAAAAGGGAAGGAAATGAAATTACTTGCCTATGATGATGATTTTGACTTCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080  AGGCATCAGGCTGCGTCATTTTCGAAAAGGGAAGGAAATGAAATTACTTGCCTATGATGATGATTTTGACTTCA  1153

Query 1259  ATTTCCAGGAGTTTCAGTATCTAAAGGAAGAACAAACAATCTTACCAGGAGATAACCTAATTACTGAGTGTCGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154  ATTTCCAGGAGTTTCAGTATCTAAAGGAAGAACAAACAATCTTACCAGGAGATAACCTAATTACTGAGTGTCGC  1227

Query 1333  TACAACACGAAAGATAGAGCTGAGATGACTTGGGGAGGACTAAGCACCAGGAGTGAAATGTGTCTCTCATACCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1228  TACAACACGAAAGATAGAGCTGAGATGACTTGGGGAGGACTAAGCACCAGGAGTGAAATGTGTCTCTCATACCT  1301

Query 1407  TCTTTATTACCCAAGAATTAATCTTACTCGATGTGCAAGTATTCCAGACATTATGGAACAACTTCAGTTCATTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1302  TCTTTATTACCCAAGAATTAATCTTACTCGATGTGCAAGTATTCCAGACATTATGGAACAACTTCAGTTCATTG  1375

Query 1481  GGGTTAAGGAGATCTACAGACCAGTCACGACCTGGCCTTTCATTATCAAAAGTCCCAAGCAATATAAAAACCTT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376  GGGTTAAGGAGATCTACAGACCAGTCACGACCTGGCCTTTCATTATCAAAAGTCCCAAGCAATATAAAAACCTT  1449

Query 1555  TCTTTCATGGATGCTATGAATAAGTTTAAATGGACTAAAAAGGAAGGTCTCTCCTTCAACGAGCTGGTCCTCAG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1450  TCTTTCATGGATGCTATGAATAAGTTTAAATGGACTAAAAAGGAAGGTCTCTCCTTCAACAAGCTGGTCCTCAG  1523

Query 1629  CCTGCCAGTGAATGTGAGATGTTCCAAGACAGACAATGCTGAGTGGTCGATTCAAGGAATGACAGCATTACCTC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1524  CCTGCCAGTGAATGTGAGATGTTCCAAGACAGACAATGCTGAGTGGTCGATTCAAGGAATGACAGCATTACCTC  1597

Query 1703  CAGATATAGAAAGACCCTATAAAGCAGAACCTTTGGTGTGTGGCACGTCTTCTTCCTCTTCCCTGCACAGAGAT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1598  CAGATATAGAAAGACCCTATAAAGCAGAACCTTTGGTGTGTGGCACGTCTTCTTCCTCTTCCCTGCACAGAGAT  1671

Query 1777  TTCTCCATCAACTTGCTTGTTTGCCTTCTGCTACTCAGCTGCACGCTGAGCACCAAGAGCTTG  1839
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1672  TTCTCCATCAACTTGCTTGTTTGCCTTCTGCTACTCAGCTGCACGCTGAGCACCAAGAGCTTG  1734