Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480353
- Subject:
- XM_006716066.1
- Aligned Length:
- 1257
- Identities:
- 1020
- Gaps:
- 222
Alignment
Query 1 ATGGCAGGCTCCCTGCCTCCCTGCGTGGTGGACTGTGGCACCGGGTATACCAAGCTTGGCTACGCAGGCAACAC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGGCTCCCTGCCTCCCTGCGTGGTGGACTGTGGCACCGGGTATACCAAGCTTGGCTACGCAGGCAACAC 74
Query 75 TGAGCCCCAGTTCATTATTCCTTCATGTATTGCCATCAGAGAGTCAGCAAAGGTAGTTGACCAAGCTCAAAGGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGAGCCCCAGTTCATTATTCCTTCATGTATTGCCATCAGAGAGTCAGCAAAGGTAGTTGACCAAGCTCAAAGGA 148
Query 149 GAGTGTTGAGGGGAGTTGATGACCTTGACTTTTTCATAGGAGATGAAGCCATCGATAAACCTACATATGCTACA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GAGTGTTGAGGGGAGTTGATGACCTTGACTTTTTCATAGGAGATGAAGCCATCGATAAACCTACATATGCTACA 222
Query 223 AAGTGGCCGATACGACATGGAATCATTGAAGACTGGGATCTTATGGAAAGGTTCATGGAGCAAGTGGTTTTTAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AAGTGGCCGATACGACATGGAATCATTGAAGACTGGGATCTTATGGAAAGGTTCATGGAGCAAGTGGTTTTTAA 296
Query 297 ATATCTTCGAGCTGAACCTGAGGACCATTATTTTTTAATGACAGAACCTCCACTCAATACACCAGAAAACAGAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATATCTTCGAGCTGAACCTGAGGACCATTATTTTTTAATGACAGAACCTCCACTCAATACACCAGAAAACAGAG 370
Query 371 AGTATCTTGCAGAAATTATGTTTGAATCATTTAACGTACCAGGACTCTACATTGCAGTTCAGGCAGTGCTGGCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGTATCTTGCAGAAATTATGTTTGAATCATTTAACGTACCAGGACTCTACATTGCAGTTCAGGCAGTGCTGGCC 444
Query 445 TTGGCGGCATCTTGGACATCTCGACAAGTGGGTGAACGTACGTTAACGGGGATAGTCATTGACAGCGGAGATGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTGGCGGCATCTTGGACATCTCGACAAGTGGGTGAACGTACGTTAACGGGGATAGTCATTGACAGCGGAGATGG 518
Query 519 AGTCACCCATGTTATCCCAGTGGCAGAAGGTTATGTAATTGGAAGCTGCATCAAACACATCCCGATTGCAGGTA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGTCACCCATGTTATCCCAGTGGCAGAAGGTTATGTAATTGGAAGCTGCATCAAACACATCCCGATTGCAGGTA 592
Query 593 GAGATATTACGTATTTCATTCAACAGCTGCTAAGGGAGAGGGAGGTGGGAATCCCTCCTGAGCAGTCACTGGAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAGATATTACGTATTTCATTCAACAGCTGCTAAGGGAGAGGGAGGTGGGAATCCCTCCTGAGCAGTCACTGGAG 666
Query 667 ACCGCAAAAGCCATTAAGGAGAAATACTGTTACATTTGCCCCGATATAGTCAAGGAATTTGCCAAGTATGATGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACCGCAAAAGCCATTAAGGAGAAATACTGTTACATTTGCCCCGATATAGTCAAGGAATTTGCCAAGTATGATGT 740
Query 741 GGATCCCCGGAAGTGGATCAAACAGTACACGGGTATCAATGCGATCAACCAGAAGAAGTTTGTTATAGACGTTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGATCCCCGGAAGTGGATCAAACAGTACACGGGTATCAATGCGATCAACCAGAAGAAGTTTGTTATAGACGTTG 814
Query 815 GTTACGAAAGATTCCTGGGACCTGAAATATTCTTTCACCCGGAGTTTGCCAACCCAGACTTTATGGAGTCCATC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTTACGAAAGATTCCTGGGACCTGAAATATTCTTTCACCCGGAGTTTGCCAACCCAGACTTTATGGAGTCCATC 888
Query 889 TCAGATGTTGTTGATGAAGTAATACAGAACTGCCCCATCGATGTGCGGCGCCCGCTGTATAAGAATGTCGTACT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCAGATGTTGTTGATGAAGTAATACAGAACTGCCCCATCGATGTGCGGCGCCCGCTGTATAAGA---------- 952
Query 963 CTCAGGAGGCTCCACCATGTTCAGGGATTTCGGACGCCGACTGCAGAGGGATTTGAAGAGAGTGGTGGATGCTA 1036
||||||..||| |.||| .|.|||| |||||||.| .|.|||.
Sbjct 953 CTCAGGTCGCT-------------GAATT-----------GTACAGA-------GAAGAGAAT----CAGGCTC 991
Query 1037 GGCTGAGGCTCAGCGAGGAGCTCAGC--GGCGGGAGGATCAAGCCGAAGCCTGTGGAGGTCCAGGTGGTCACGC 1108
..|||| |||| .|||||| .||| ||| |||||| || ||||
Sbjct 992 AACTGA----CAGC-----ACTCAGCATTGCG------TCA--------CCTGTG-----CC--GTGG------ 1029
Query 1109 ATCAC-ATGCAGCGCTACGCCGTGTGGTTCGGAGGCTCCATGCTGGCCTCGACTCCCGAGTTCTTTCAGGTCTG 1181
|..|| |||
Sbjct 1030 AATACTATG----------------------------------------------------------------- 1038
Query 1182 CCACACCAAGAAGGACTATGAAGAGTACGGGCCCAGCATCTGCCGCCACAACCCCGTCTTTGGAGTCATGTCC 1254
Sbjct 1039 ------------------------------------------------------------------------- 1038