Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480443
• Subject: XM_006534062.3
• Aligned Length: 2088
• Identities: 1955
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ATGGAGGAGAAGCCCGGCCAGCCACAGCCTCAGCACCATCACAGCCACCACCATCCGCACCATCACCCTCAGCA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGGAGGAGAAGCCCGGCCAGCCACAGCCTCAGCACCATCACAGCCACCACCATCCGCACCATCATCCCCAGCA  74

Query   75  GCAGCAGCAGCAGC---CGCACCACCACCACCATTATTATTTCTACAACCACAGCCACAACCACCACCACCACC  145
            ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGCAGCAGCAGCAGTCGCACCACCACCACCATTATTATTTCTACAACCACAGCCACAACCACCACCACCACC  148

Query  146  ATCATCACCAGCAGCCTCACCAATACCTGCAGCATGGAGCCGAGGGCAGCCCCAAGGCCCAGCCAAAGCCGCTG  219
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  ACCATCACCAGCAGCCTCACCAATACCTGCAGCATGGAGCCGAGGGCAGCCCCAAGGCCCAGCCCAAGCCGCTG  222

Query  220  AAACATGAGCAGAAACACACCCTCCAGCAGCACCAGGAAACGCCGAAGAAGAAAACAGGCTATGGTGAACTAAA  293
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  223  AAACATGAGCAGAAACACACCCTCCAGCAGCACCAGGAAACGCCGAAGAAGAAAACAGGCTATGGTGAAATAAA  296

Query  294  CGGTAATGCTGGAGAAAGAGAAATATCTTTAAAGAACCTGAGTTCTGATGAAGCCACCAACCCTATTTCCAGGG  367
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGGTAATGCTGGAGAAAGAGAAATATCTTTAAAGAGCCTCAGTTCTGATGAAGCTACCAACCCTATTTCCAGGG  370

Query  368  TCCTCAATGGCAACCAGCAAGTTGTAGACACTAGCCTGAAGCAGACTGTAAAGGCCAACACCTTTGGGAAAGCA  441
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|||.|||||||||.||||||
Sbjct  371  TCCTTAATGGCAACCAGCAAGTTGTAGAAACAAGCCTGAAGCAGACTGTAAAGACCAGCACCTTTGGAAAAGCA  444

Query  442  GGAATTAAAACCAAGAATTTCATTCAGAAAAACAGTATGGACAAAAAGAATGGGAAGTCTTATGAAAATAAATC  515
            |||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  GGAATCAAAACCAAGAATTTTATTCAGAAAAACAGTATGGACAAAAAGAATGGGAAGTCTTATGAAAACAAATC  518

Query  516  TGGAGAGAATCAGTCTGTAGATAAGTCTGATACTATACCAATTCCAAATGGTGTGGTAACAAATAATTCTGGTT  589
            ||||||||..|||.|||||||||||.|.|||||.|||.||||||||||||||||..||||||.||.|||.||.|
Sbjct  519  TGGAGAGACCCAGGCTGTAGATAAGACCGATACCATAGCAATTCCAAATGGTGTTATAACAAGTAGTTCAGGCT  592

Query  590  ATATTACTAATGGTTATATGGGTAAAGGAGCAGATAATGATGGTAGTGGATCTGAGAGCGGATATACAACTCCT  663
            ||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  593  ATATTACTAATGGTTATATGAGCAAAGGAGCAGATAATGATGGTAGTGGATCTGAGAGTGGATATACCACTCCT  666

Query  664  AAAAAAAGGAAAGCTAGGCGCAATAGTGCCAAGGGTTGTGAAAACCTTAATATAGTGCAGGACAAAATAATGCA  737
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||  
Sbjct  667  AAAAAAAGGAAAGCTAGGCGCAATAGTGCCAAGGGTTGTGAAAACCTTAATTTAGTGCAGGACAAAATAATG--  738

Query  738  ACAAGAGACCAGTGTCCCAACCTTAAAACAGGGACTTGAAACTTTCAAGCCTGACTATAGTGAACAAAAGGGAA  811
             ||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  -CAAGAGACTAGTGTCCCAGCATTAAAACAGGGACTTGAAACTTTAAAGCCTGACTATAGTGAACAAAAGGGAA  811

Query  812  ATCGAGTAGATGGTTCGAAGCCCATTTGGAAGTATGAAACTGGGCCTGGAGGAACAAGTCGAGGAAAACCTGCT  885
            ..||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  812  TGCGAGTAGATGGTTCAAAGCCTATTTGGAAATATGAAACTGGACCTGGAGGAACAAGTCGTGGAAAACCTGCT  885

Query  886  GTGGGTGATATGCTTCGGAAAAGCTCAGATAGTAAACCTGGTGTGAGCAGCAAAAAGTTTGATGATCGGCCCAA  959
            .|||||||..|||||||.||||||||.||||.||||||||||.||||.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  886  ATGGGTGACGTGCTTCGTAAAAGCTCTGATATTAAACCTGGTTTGAGTAGCAAAAAATTTGATGATCGGCCTAA  959

Query  960  AGGAAAGCATGCTTCAGCTGTTGCCTCCAAAGAGGACTCGTGGACCCTATTTAAACCACCCCCAGTTTTTCCAG  1033
            ||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  960  AGGAAAGCATGCCTCAGCTGCTGCCTCCAAAGAGGACTCATGGACCTTGTTTAAGCCACCCCCAGTTTTTCCAG  1033

Query 1034  TGGACAATAGCAGTGCTAAAATAGTTCCTAAAATAAGTTATGCAAGCAAAGTTAAGGAAAACCTCAACAAAACT  1107
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  TGGACAATAGCAGTGCAAAAATAGTTCCTAAAATAAGTTATGCAAGCAAAGTTAAGGAAAACCTCAACAAAACT  1107

Query 1108  ATACAGAACTCTTCTGTGTCACCAACTTCATCTTCATCATCTTCATCATCTACCGGGGAAACTCAGACCCAATC  1181
            .||||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||   |||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1108  GTACAGAACTCCTCCGTGTCACCATCTTCATCTTCATCA---TCATCATCTACTGGGGAAACTCAGACCCAGTC  1178

Query 1182  ATCAAGTCGCTTATCCCAGGTCCCTATGTCAGCGCTGAAATCTGTTACTTCTGCCAACTTTTCTAATGGGCCTG  1255
            .||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||
Sbjct 1179  TTCAAGTCGGTTATCCCAGGTCCCGATGTCAGCTCTGAAATCTGTTACTTCTGCCAGTTTTTCTAATGGGCCTG  1252

Query 1256  TTTTAGCAGGGACTGATGGAAATGTTTATCCTCCAGGGGGTCAGCCACTGCTAACTACTGCTGCTAATACTCTA  1329
            ||||||||||.||||||||||.|||.||.||..|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||
Sbjct 1253  TTTTAGCAGGAACTGATGGAAGTGTGTACCCATCTGGGGGTCAGCCACTGCTAACGACTGCTGCTAATACTTTA  1326

Query 1330  ACACCCATCTCTTCTGGGACAGATTCAGTTCTCCAGGACATGAGTCTAACTTCAGCAGCTGTTGAACAAATTAA  1403
            ||||||||||||.|||||||.|||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1327  ACACCCATCTCTACTGGGACTGATTCTGTTCTTCAGGACATGAGTCTGGCTTCAGCAGCCGTTGAACAAATTAA  1400

Query 1404  GACTAGCCTTTTTATCTATCCTTCAAATATGCAAACTATGCTGTTGAGCACAGCACAAGTGGATCTGCCCTCTC  1477
            ..||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.||   .||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1401  ATCTAGCCTTTTTATCTACCCTTCAAATATGCAAACAGTGCTGTTAAG---TGCACAAGTAGATCTGCCCTCTC  1471

Query 1478  AGACAGATCAGCAAAACCTGGGGGATATCTTCCAGAATCAGTGGGGTTTATCATTTATAAATGAGCCCAGTGCT  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472  AGACAGATCAGCAAAACCTGGGGGATATCTTCCAGAATCAATGGGGTTTATCATTTATAAATGAGCCCAGTGCT  1545

Query 1552  GGCCCTGAGACTGTTACTGGGAAGTCATCAGAGCATAAAGTGATGGAGGTGACATTTCAAGGAGAATATCCTGC  1625
            |||||.||||||||||.|||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546  GGCCCAGAGACTGTTATTGGAAAGTCATCAGATCATAAAGTGATGGAAGTGACATTTCAAGGAGAATATCCTGC  1619

Query 1626  TACTTTGGTTTCACAGGGTGCTGAAATAATTCCCTCAGGAACTGAGCATCCTGTGTTTCCCAAGGCTTACGAGC  1699
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1620  CACTTTGGTTTCACAGGGTGCTGAAATAATTCCCTCAGGAACTGAGCATCCTGTGTTTCCCAAGGCTTATGAGC  1693

Query 1700  TGGAGAAACGGACTAGTCCTCAAGTTCTGGGTAGCATTCTAAAATCTGGGACTACTAGTGAGAGTGGAGCCTTA  1773
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||   ||||||||||||||||
Sbjct 1694  TGGAAAAACGGACTAGTCCTCAAGTTCTGGGTCACATTCTAAAACCTGGGACTAC---TGAGAGTGGAGCCTTA  1764

Query 1774  TCCTTGGAACCCAGTCATATAGGTGACCTGCAGAAAGCAGACACCAGTAGTCAAGGTGCTTTAGTGTTTCTCTC  1847
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1765  TCCTTGGACCCCAGTCATATAGGTGACCTGCAAAAAGCAGACACCAGTAGTCAAGGTGCTTTAGTGTTTCTCTC  1838

Query 1848  AAAGGACTACGAGATAGAAAGTCAAAATCCTCTGGCCTCTCCTACGAACACTTTGTTAGGCTCTGCCAAAGAAC  1921
            ||||||||||||.|||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1839  AAAGGACTACGAAATAGAAAATCAAAATCCCCTGGCCTCTCCTACGAACACTTTGTTAGGCTCCGCCAAAGAAC  1912

Query 1922  AGAGATACCAGAGAGGCCTAGAAAGGAATGATAGCTGGGGTTCTTTTGACCTGAGGGCTGCTATTGTATATCAC  1995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1913  AGAGATACCAGAGAGGCCTAGAAAGGAATGATAGCTGGGGTTCTTTTGACCTGAGGGCTGCTATTGTATATCAC  1986

Query 1996  ACTAAAGAAATGGAATCTATTTGGAATTTGCAGAAGCAAGATCCCAAAAGGATAATCACTTACAATGAAGCCAT  2069
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1987  ACTAAAGAAATGGAATCTATATGGAATTTGCAGAAGCAAGATCCCAAAAGGATAATCACTTACAATGAAGCCAT  2060

Query 2070  GGATAGTCCAGATCAA  2085
            ||||||||||||||||
Sbjct 2061  GGATAGTCCAGATCAA  2076