Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480443
- Subject:
- XM_017314730.1
- Aligned Length:
- 2085
- Identities:
- 1494
- Gaps:
- 489
Alignment
Query 1 ATGGAGGAGAAGCCCGGCCAGCCACAGCCTCAGCACCATCACAGCCACCACCATCCGCACCATCACCCTCAGCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GCAGCAGCAGCAGCCGCACCACCACCACCATTATTATTTCTACAACCACAGCCACAACCACCACCACCACCATC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ATCACCAGCAGCCTCACCAATACCTGCAGCATGGAGCCGAGGGCAGCCCCAAGGCCCAGCCAAAGCCGCTGAAA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CATGAGCAGAAACACACCCTCCAGCAGCACCAGGAAACGCCGAAGAAGAAAACAGGCTATGGTGAACTAAACGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TAATGCTGGAGAAAGAGAAATATCTTTAAAGAACCTGAGTTCTGATGAAGCCACCAACCCTATTTCCAGGGTCC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TCAATGGCAACCAGCAAGTTGTAGACACTAGCCTGAAGCAGACTGTAAAGGCCAACACCTTTGGGAAAGCAGGA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 ATTAAAACCAAGAATTTCATTCAGAAAAACAGTATGGACAAAAAGAATGGGAAGTCTTATGAAAATAAATCTGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------ATGGACAAAAAGAATGGGAAGTCTTATGAAAACAAATCTGG 41
Query 519 AGAGAATCAGTCTGTAGATAAGTCTGATACTATACCAATTCCAAATGGTGTGGTAACAAATAATTCTGGTTATA 592
|||||..|||.|||||||||||.|.|||||.|||.||||||||||||||||..||||||.||.|||.||.||||
Sbjct 42 AGAGACCCAGGCTGTAGATAAGACCGATACCATAGCAATTCCAAATGGTGTTATAACAAGTAGTTCAGGCTATA 115
Query 593 TTACTAATGGTTATATGGGTAAAGGAGCAGATAATGATGGTAGTGGATCTGAGAGCGGATATACAACTCCTAAA 666
|||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 116 TTACTAATGGTTATATGAGCAAAGGAGCAGATAATGATGGTAGTGGATCTGAGAGTGGATATACCACTCCTAAA 189
Query 667 AAAAGGAAAGCTAGGCGCAATAGTGCCAAGGGTTGTGAAAACCTTAATATAGTGCAGGACAAAATAATGCAACA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||| ||
Sbjct 190 AAAAGGAAAGCTAGGCGCAATAGTGCCAAGGGTTGTGAAAACCTTAATTTAGTGCAGGACAAAATAATG---CA 260
Query 741 AGAGACCAGTGTCCCAACCTTAAAACAGGGACTTGAAACTTTCAAGCCTGACTATAGTGAACAAAAGGGAAATC 814
||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct 261 AGAGACTAGTGTCCCAGCATTAAAACAGGGACTTGAAACTTTAAAGCCTGACTATAGTGAACAAAAGGGAATGC 334
Query 815 GAGTAGATGGTTCGAAGCCCATTTGGAAGTATGAAACTGGGCCTGGAGGAACAAGTCGAGGAAAACCTGCTGTG 888
|||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 335 GAGTAGATGGTTCAAAGCCTATTTGGAAATATGAAACTGGACCTGGAGGAACAAGTCGTGGAAAACCTGCTATG 408
Query 889 GGTGATATGCTTCGGAAAAGCTCAGATAGTAAACCTGGTGTGAGCAGCAAAAAGTTTGATGATCGGCCCAAAGG 962
|||||..|||||||.||||||||.||||.||||||||||.||||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 409 GGTGACGTGCTTCGTAAAAGCTCTGATATTAAACCTGGTTTGAGTAGCAAAAAATTTGATGATCGGCCTAAAGG 482
Query 963 AAAGCATGCTTCAGCTGTTGCCTCCAAAGAGGACTCGTGGACCCTATTTAAACCACCCCCAGTTTTTCCAGTGG 1036
|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||.||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 483 AAAGCATGCCTCAGCTGCTGCCTCCAAAGAGGACTCATGGACCTTGTTTAAGCCACCCCCAGTTTTTCCAGTGG 556
Query 1037 ACAATAGCAGTGCTAAAATAGTTCCTAAAATAAGTTATGCAAGCAAAGTTAAGGAAAACCTCAACAAAACTATA 1110
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 557 ACAATAGCAGTGCAAAAATAGTTCCTAAAATAAGTTATGCAAGCAAAGTTAAGGAAAACCTCAACAAAACTGTA 630
Query 1111 CAGAACTCTTCTGTGTCACCAACTTCATCTTCATCATCTTCATCATCTACCGGGGAAACTCAGACCCAATCATC 1184
||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||| |||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 631 CAGAACTCCTCCGTGTCACCATCTTCATCTTCATCA---TCATCATCTACTGGGGAAACTCAGACCCAGTCTTC 701
Query 1185 AAGTCGCTTATCCCAGGTCCCTATGTCAGCGCTGAAATCTGTTACTTCTGCCAACTTTTCTAATGGGCCTGTTT 1258
||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct 702 AAGTCGGTTATCCCAGGTCCCGATGTCAGCTCTGAAATCTGTTACTTCTGCCAGTTTTTCTAATGGGCCTGTTT 775
Query 1259 TAGCAGGGACTGATGGAAATGTTTATCCTCCAGGGGGTCAGCCACTGCTAACTACTGCTGCTAATACTCTAACA 1332
|||||||.||||||||||.|||.||.||..|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||
Sbjct 776 TAGCAGGAACTGATGGAAGTGTGTACCCATCTGGGGGTCAGCCACTGCTAACGACTGCTGCTAATACTTTAACA 849
Query 1333 CCCATCTCTTCTGGGACAGATTCAGTTCTCCAGGACATGAGTCTAACTTCAGCAGCTGTTGAACAAATTAAGAC 1406
|||||||||.|||||||.|||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||..|
Sbjct 850 CCCATCTCTACTGGGACTGATTCTGTTCTTCAGGACATGAGTCTGGCTTCAGCAGCCGTTGAACAAATTAAATC 923
Query 1407 TAGCCTTTTTATCTATCCTTCAAATATGCAAACTATGCTGTTGAGCACAGCACAAGTGGATCTGCCCTCTCAGA 1480
|||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.|| .||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 924 TAGCCTTTTTATCTACCCTTCAAATATGCAAACAGTGCTGTTAAG---TGCACAAGTAGATCTGCCCTCTCAGA 994
Query 1481 CAGATCAGCAAAACCTGGGGGATATCTTCCAGAATCAGTGGGGTTTATCATTTATAAATGAGCCCAGTGCTGGC 1554
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 995 CAGATCAGCAAAACCTGGGGGATATCTTCCAGAATCAATGGGGTTTATCATTTATAAATGAGCCCAGTGCTGGC 1068
Query 1555 CCTGAGACTGTTACTGGGAAGTCATCAGAGCATAAAGTGATGGAGGTGACATTTCAAGGAGAATATCCTGCTAC 1628
||.||||||||||.|||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1069 CCAGAGACTGTTATTGGAAAGTCATCAGATCATAAAGTGATGGAAGTGACATTTCAAGGAGAATATCCTGCCAC 1142
Query 1629 TTTGGTTTCACAGGGTGCTGAAATAATTCCCTCAGGAACTGAGCATCCTGTGTTTCCCAAGGCTTACGAGCTGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1143 TTTGGTTTCACAGGGTGCTGAAATAATTCCCTCAGGAACTGAGCATCCTGTGTTTCCCAAGGCTTATGAGCTGG 1216
Query 1703 AGAAACGGACTAGTCCTCAAGTTCTGGGTAGCATTCTAAAATCTGGGACTACTAGTGAGAGTGGAGCCTTATCC 1776
|.|||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 1217 AAAAACGGACTAGTCCTCAAGTTCTGGGTCACATTCTAAAACCTGGGACTAC---TGAGAGTGGAGCCTTATCC 1287
Query 1777 TTGGAACCCAGTCATATAGGTGACCTGCAGAAAGCAGACACCAGTAGTCAAGGTGCTTTAGTGTTTCTCTCAAA 1850
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1288 TTGGACCCCAGTCATATAGGTGACCTGCAAAAAGCAGACACCAGTAGTCAAGGTGCTTTAGTGTTTCTCTCAAA 1361
Query 1851 GGACTACGAGATAGAAAGTCAAAATCCTCTGGCCTCTCCTACGAACACTTTGTTAGGCTCTGCCAAAGAACAGA 1924
|||||||||.|||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1362 GGACTACGAAATAGAAAATCAAAATCCCCTGGCCTCTCCTACGAACACTTTGTTAGGCTCCGCCAAAGAACAGA 1435
Query 1925 GATACCAGAGAGGCCTAGAAAGGAATGATAGCTGGGGTTCTTTTGACCTGAGGGCTGCTATTGTATATCACACT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1436 GATACCAGAGAGGCCTAGAAAGGAATGATAGCTGGGGTTCTTTTGACCTGAGGGCTGCTATTGTATATCACACT 1509
Query 1999 AAAGAAATGGAATCTATTTGGAATTTGCAGAAGCAAGATCCCAAAAGGATAATCACTTACAATGAAGCCATGGA 2072
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1510 AAAGAAATGGAATCTATATGGAATTTGCAGAAGCAAGATCCCAAAAGGATAATCACTTACAATGAAGCCATGGA 1583
Query 2073 TAGTCCAGATCAA 2085
|||||||||||||
Sbjct 1584 TAGTCCAGATCAA 1596