Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480553
• Subject: NM_010838.4
• Aligned Length: 1156
• Identities: 966
• Gaps: 47

Alignment

Query    1  ATGGCTGAGCCCCGCCAGGAGTTCGAAGTGATGGAAGATCACGCTGGGACGTACGGGTTGGGGGACAGGAAAGA  74
            ||||||||.||.|||||||||||.||....||||||||.||.|||||                        |||
Sbjct    1  ATGGCTGACCCTCGCCAGGAGTTTGACACAATGGAAGACCATGCTGG------------------------AGA  50

Query   75  TCAGGGGGGCTACACCATGCACCAAGACCAAGAGGGTGACACGGACGCTGGCCTGAAAGCTGAAGAAGCAGGCA  148
            |         |||||..|||.||||||||||||.||.||||.||||..||||.|.|||||.|||||||||||||
Sbjct   51  T---------TACACTCTGCTCCAAGACCAAGAAGGAGACATGGACCATGGCTTAAAAGCCGAAGAAGCAGGCA  115

Query  149  TTGGAGACACCCCCAGCCTGGAAGACGAAGCTGCTGGTCACGTGACCCAAGCTCGCATGGTCAGTAAAAGCAAA  222
            |.|||||||||||.|.||.|||.|||.||||.|||||.||.|||||.||||||||..|||.|      ||||||
Sbjct  116  TCGGAGACACCCCGAACCAGGAGGACCAAGCCGCTGGGCATGTGACTCAAGCTCGTGTGGCC------AGCAAA  183

Query  223  GACGGGACTGGAAGCGATGACAAAAAAGCCAAGGGGGCTGATGGTAAAA------CGAAGATCGCCACACCGCG  290
            |||.||||.||||..||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||      ||||||||||||||||.||
Sbjct  184  GACAGGACAGGAAATGACGAGAAGAAAGCCAAGGGCGCTGATGGCAAAACCGGGGCGAAGATCGCCACACCTCG  257

Query  291  GGGAGCAGCCCCTCCAGGCCAGAAGGGCCAGGCCAACGCCACCAGGATTCCAGCAAAAACCCCGCCC-GCTCCA  363
            ||||||||||.||||.|.||||||||||..|.||||||||||||||||.||.||.||.|||.||||| || ||.
Sbjct  258  GGGAGCAGCCTCTCCGGCCCAGAAGGGCACGTCCAACGCCACCAGGATCCCGGCCAAGACCACGCCCAGC-CCT  330

Query  364  AAGACACCACCCAGCTCTGGTGAACCTCCAAAATCAGGGGATCGCAGCGGCTACAGCAGCCCCGGCTCCCCAGG  437
            |||||.||.||..|.||.||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  331  AAGACTCCTCCAGGGTCAGGTGAACCACCAAAATCCGGAGAACGAAGCGGCTACAGCAGCCCCGGCTCTCCCGG  404

Query  438  CACTCCCGGCAGCCGCTCCCGCACCCCGTCCCTTCCAACCCCACCCACCCGGGAGCCCAAGAAGGTGGCAGTGG  511
            .||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  405  AACGCCTGGCAGTCGCTCGCGCACCCCATCCCTACCAACACCGCCCACCCGGGAGCCCAAGAAGGTGGCAGTGG  478

Query  512  TCCGTACTCCACCCAAGTCGCCGTCTTCCGCCAAGAGCCGCCTGCAGACAGCCCCCGTGCCCATGCCAGACCTG  585
            ||||.|||||.||.|||||.||.||..|....|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  479  TCCGCACTCCCCCTAAGTCACCATCAGCTAGTAAGAGCCGCCTGCAGACTGCCCCTGTGCCCATGCCAGACCTA  552

Query  586  AAGAATGTCAAGTCCAAGATCGGCTCCACTGAGAACCTGAAGCACCAGCCGGGAGGCGGGAAGGTGCAGATAAT  659
            ||||||||||.|||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct  553  AAGAATGTCAGGTCGAAGATTGGCTCTACTGAGAACCTGAAGCACCAGCCAGGAGGTGGCAAGGTGCAGATAAT  626

Query  660  TAATAAGAAGCTGGATCTTAGCAACGTCCAGTCCAAGTGTGGCTCAAAGGATAATATCAAACACGTCCCGGGAG  733
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  627  TAATAAGAAGCTGGATCTTAGCAACGTCCAGTCCAAGTGTGGCTCGAAGGATAATATCAAACACGTCCCGGGTG  700

Query  734  GCGGCAGTGTGCAAATAGTCTACAAACCAGTTGACCTGAGCAAGGTGACCTCCAAGTGTGGCTCATTAGGCAAC  807
            |.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  701  GAGGCAGTGTGCAAATAGTCTACAAGCCGGTGGACCTGAGCAAAGTGACCTCCAAGTGTGGCTCGTTAGGGAAC  774

Query  808  ATCCATCATAAACCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCTGAGAAGCTTGACTTCAAGGACAGAGTCCAGTC  881
            ||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  775  ATCCATCACAAGCCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCAGAGAAGCTGGACTTCAAGGACAGAGTCCAGTC  848

Query  882  GAAGATTGGGTCCCTGGACAATATCACCCACGTCCCTGGCGGAGGAAATAAAAAGATTGAAACCCACAAGCTGA  955
            |||||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  849  GAAGATTGGCTCCTTGGATAATATCACCCACGTCCCTGGAGGAGGGAATAAGAAGATTGAAACCCACAAGCTGA  922

Query  956  CCTTCCGCGAGAACGCCAAAGCCAAGACAGACCACGGGGCGGAGATCGTGTACAAGTCGCCAGTGGTGTCTGGG  1029
            |||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct  923  CCTTCAGGGAGAATGCCAAAGCCAAGACAGACCATGGAGCAGAAATTGTGTATAAGTCACCCGTGGTGTCTGGG  996

Query 1030  GACACGTCTCCACGGCATCTCAGCAATGTCTCCTCCACCGGCAGCATCGACATGGTAGACTCGCCCCAGCTCGC  1103
            |||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct  997  GACACATCTCCACGGCACCTCAGCAATGTGTCTTCCACGGGCAGCATCGACATGGTGGACTCACCACAGCTTGC  1070

Query 1104  CACGCTAGCTGACGAGGTGTCTGCCTCCCTGGCCAAGCAGGGTTTG  1149
            |||.|||||.||.||.||||||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1071  CACACTAGCCGATGAAGTGTCTGCTTCCTTGGCCAAGCAGGGTTTG  1116