Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480553
- Subject:
- XM_006532407.3
- Aligned Length:
- 1244
- Identities:
- 967
- Gaps:
- 136
Alignment
Query 1 ATGGCTGAGCCCCGCCAGGAGTTCGAAGTGATGGAAGATCACGCTGGGACGTACGGGTTGGGGGACAGGAAAGA 74
||||||||.||.|||||||||||.||....||||||||.||.||||| |||
Sbjct 1 ATGGCTGACCCTCGCCAGGAGTTTGACACAATGGAAGACCATGCTGG------------------------AGA 50
Query 75 TCAGGGGGGCTACACCATGCACCAAGACCAAGAGGGTGACACGGACGCTGGC---------------------- 126
| |||||..|||.||||||||||||.||.||||.||||..||||
Sbjct 51 T---------TACACTCTGCTCCAAGACCAAGAAGGAGACATGGACCATGGCTTAAAAGAGTCTCCCCCACAGC 115
Query 127 ------------------------------------------------------------------CTGAAAGC 134
||| ||||
Sbjct 116 CCCCCGCCGATGATGGAGCGGAGGAACCAGGGTCGGAGACCTCCGATGCTAAGAGCACTCCAACTGCTG-AAGC 188
Query 135 TGAAGAAGCAGGCATTGGAGACACCCCCAGCCTGGAAGACGAAGCTGCTGGTCACGTGACCCAAGCTCGCATGG 208
.||||||||||||||.|||||||||||.|.||.|||.|||.||||.|||||.||.|||||.||||||||..|||
Sbjct 189 CGAAGAAGCAGGCATCGGAGACACCCCGAACCAGGAGGACCAAGCCGCTGGGCATGTGACTCAAGCTCGTGTGG 262
Query 209 TCAGTAAAAGCAAAGACGGGACTGGAAGCGATGACAAAAAAGCCAAGGGGGCTGATGGTAAAA------CGAAG 276
.| |||||||||.||||.||||..||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||| |||||
Sbjct 263 CC------AGCAAAGACAGGACAGGAAATGACGAGAAGAAAGCCAAGGGCGCTGATGGCAAAACCGGGGCGAAG 330
Query 277 ATCGCCACACCGCGGGGAGCAGCCCCTCCAGGCCAGAAGGGCCAGGCCAACGCCACCAGGATTCCAGCAAAAAC 350
|||||||||||.||||||||||||.||||.|.||||||||||..|.||||||||||||||||.||.||.||.||
Sbjct 331 ATCGCCACACCTCGGGGAGCAGCCTCTCCGGCCCAGAAGGGCACGTCCAACGCCACCAGGATCCCGGCCAAGAC 404
Query 351 CCCGCCC-GCTCCAAAGACACCACCCAGCTCTGGTGAACCTCCAAAATCAGGGGATCGCAGCGGCTACAGCAGC 423
|.||||| || ||.|||||.||.||..|.||.||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 405 CACGCCCAGC-CCTAAGACTCCTCCAGGGTCAGGTGAACCACCAAAATCCGGAGAACGAAGCGGCTACAGCAGC 477
Query 424 CCCGGCTCCCCAGGCACTCCCGGCAGCCGCTCCCGCACCCCGTCCCTTCCAACCCCACCCACCCGGGAGCCCAA 497
||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 478 CCCGGCTCTCCCGGAACGCCTGGCAGTCGCTCGCGCACCCCATCCCTACCAACACCGCCCACCCGGGAGCCCAA 551
Query 498 GAAGGTGGCAGTGGTCCGTACTCCACCCAAGTCGCCGTCTTCCGCCAAGAGCCGCCTGCAGACAGCCCCCGTGC 571
||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||..|....|||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 552 GAAGGTGGCAGTGGTCCGCACTCCCCCTAAGTCACCATCAGCTAGTAAGAGCCGCCTGCAGACTGCCCCTGTGC 625
Query 572 CCATGCCAGACCTGAAGAATGTCAAGTCCAAGATCGGCTCCACTGAGAACCTGAAGCACCAGCCGGGAGGCGGG 645
|||||||||||||.||||||||||.|||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 626 CCATGCCAGACCTAAAGAATGTCAGGTCGAAGATTGGCTCTACTGAGAACCTGAAGCACCAGCCAGGAGGTGGC 699
Query 646 AAGGTGCAGATAATTAATAAGAAGCTGGATCTTAGCAACGTCCAGTCCAAGTGTGGCTCAAAGGATAATATCAA 719
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 700 AAGGTGCAGATAATTAATAAGAAGCTGGATCTTAGCAACGTCCAGTCCAAGTGTGGCTCGAAGGATAATATCAA 773
Query 720 ACACGTCCCGGGAGGCGGCAGTGTGCAAATAGTCTACAAACCAGTTGACCTGAGCAAGGTGACCTCCAAGTGTG 793
||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 774 ACACGTCCCGGGTGGAGGCAGTGTGCAAATAGTCTACAAGCCGGTGGACCTGAGCAAAGTGACCTCCAAGTGTG 847
Query 794 GCTCATTAGGCAACATCCATCATAAACCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCTGAGAAGCTTGACTTCAAG 867
||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 848 GCTCGTTAGGGAACATCCATCACAAGCCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCAGAGAAGCTGGACTTCAAG 921
Query 868 GACAGAGTCCAGTCGAAGATTGGGTCCCTGGACAATATCACCCACGTCCCTGGCGGAGGAAATAAAAAGATTGA 941
|||||||||||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 922 GACAGAGTCCAGTCGAAGATTGGCTCCTTGGATAATATCACCCACGTCCCTGGAGGAGGGAATAAGAAGATTGA 995
Query 942 AACCCACAAGCTGACCTTCCGCGAGAACGCCAAAGCCAAGACAGACCACGGGGCGGAGATCGTGTACAAGTCGC 1015
|||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.|
Sbjct 996 AACCCACAAGCTGACCTTCAGGGAGAATGCCAAAGCCAAGACAGACCATGGAGCAGAAATTGTGTATAAGTCAC 1069
Query 1016 CAGTGGTGTCTGGGGACACGTCTCCACGGCATCTCAGCAATGTCTCCTCCACCGGCAGCATCGACATGGTAGAC 1089
|.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1070 CCGTGGTGTCTGGGGACACATCTCCACGGCACCTCAGCAATGTGTCTTCCACGGGCAGCATCGACATGGTGGAC 1143
Query 1090 TCGCCCCAGCTCGCCACGCTAGCTGACGAGGTGTCTGCCTCCCTGGCCAAGCAGGGTTTG 1149
||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1144 TCACCACAGCTTGCCACACTAGCCGATGAAGTGTCTGCTTCCTTGGCCAAGCAGGGTTTG 1203