Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480726
- Subject:
- NM_001282163.1
- Aligned Length:
- 2298
- Identities:
- 2237
- Gaps:
- 60
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------------------ATGGACTTCTTGGA 14
||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTCCTACCAGAGGACAAGTCGTACAATGGTGGAGGAATAGGTTCTTCAAATAGGATCATGGACTTCTTGGA 74
Query 15 GGAGCCAATCCCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTTCAATACAATTGATTGGGTGAGAGAGAAGTCTCGAGACC 88
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGAGCCAATCCCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTTCAATACAATTGATTGGGTGAGAGAGAAGTCTCGAGACC 148
Query 89 GGGATAGGCACCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAGAGTCAACATGGGCCTTAATTCACAGTGTGAGTGATGCT 162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGGATAGGCACCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAGAGTCAACATGGGCCTTAATTCACAGTGTGAGTGATGCT 222
Query 163 TTTTCCGGCTGGTTGTTGATGCTCCTTATTGGGCTTTTATCAGGTTCGTTAGCTGGTTTGATAGACATCTCTGC 236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTTTCCGGCTGGTTGTTGATGCTCCTTATTGGGCTTTTATCAGGTTCGTTAGCTGGTTTGATAGACATCTCTGC 296
Query 237 TCATTGGATGACAGACTTAAAAGAAGGTATATGCACAGGGGGATTCTGGTTTAACCATGAACATTGTTGCTGGA 310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCATTGGATGACAGACTTAAAAGAAGGTATATGCACAGGGGGATTCTGGTTTAACCATGAACATTGTTGCTGGA 370
Query 311 ACTCTGAGCATGTCACCTTTGAAGAGAGAGACAAATGTCCAGAGTGGAATAGTTGGTCCCAGCTTATCATCAGC 384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACTCTGAGCATGTCACCTTTGAAGAGAGAGACAAATGTCCAGAGTGGAATAGTTGGTCCCAGCTTATCATCAGC 444
Query 385 ACAGATGAGGGAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTATTTCATGTACGTCCTCTGGGCTCTCCTATTTGCCTTCCT 458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACAGATGAGGGAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTATTTCATGTACGTCCTCTGGGCTCTCCTATTTGCCTTCCT 518
Query 459 TGCCGTATCTCTTGTCAAGGTGTTTGCGCCTTATGCCTGTGGCTCTGGAATCCCTGAGATAAAAACTATCTTGA 532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGCCGTATCTCTTGTCAAGGTGTTTGCGCCTTATGCCTGTGGCTCTGGAATCCCTGAGATAAAAACTATCTTGA 592
Query 533 GTGGTTTCATTATTAGGGGCTATTTGGGTAAGTGGACTCTGGTTATCAAAACCATCACCTTGGTGCTGGCAGTG 606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GTGGTTTCATTATTAGGGGCTATTTGGGTAAGTGGACTCTGGTTATCAAAACCATCACCTTGGTGCTGGCAGTG 666
Query 607 TCGTCTGGCTTGAGCCTGGGCAAAGAGGGCCCTCTAGTGCACGTGGCTTGCTGCTGTGGGAACATCCTGTGCCA 680
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCATCTGGCTTGAGCCTGGGCAAAGAGGGCCCTCTAGTGCACGTGGCTTGCTGCTGTGGGAACATCCTGTGCCA 740
Query 681 CTGCTTCAACAAATACAGGAAGAATGAAGCCAAGCGCAGAGAGGTCTTGTCGGCTGCAGCAGCAGCTGGTGTAT 754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTGCTTCAACAAATACAGGAAGAATGAAGCCAAGCGCAGAGAGGTCTTGTCGGCTGCAGCAGCAGCTGGTGTAT 814
Query 755 CTGTAGCCTTTGGAGCACCTATAGGTGGAGTATTATTCAGCCTTGAAGAGGTCAGCTACTATTTTCCCCTCAAA 828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTGTAGCCTTTGGAGCACCTATAGGTGGAGTATTATTCAGCCTTGAAGAGGTCAGCTACTATTTTCCCCTCAAA 888
Query 829 ACATTGTGGCGTTCATTCTTTGCTGCCTTGGTGGCAGCATTCACTCTACGCTCCATCAATCCATTTGGGAACAG 902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACATTGTGGCGTTCATTCTTTGCTGCCTTGGTGGCAGCATTCACTCTACGCTCCATCAATCCATTTGGGAACAG 962
Query 903 CCGCCTGGTACTATTTTATGTGGAGTTTCACACCCCATGGCATCTCTTTGAGCTCGTGCCATTCATTCTGCTGG 976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCGCCTGGTACTATTTTATGTGGAGTTTCACACCCCATGGCATCTCTTTGAGCTCGTGCCATTCATTCTGCTGG 1036
Query 977 GCATATTTGGTGGTCTGTGGGGAGCACTGTTTATCCGCACAAACATTGCCTGGTGTCGGAAGCGAAAGACCACC 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCATATTTGGTGGTCTGTGGGGAGCACTGTTTATCCGCACAAACATTGCCTGGTGTCGGAAGCGAAAGACCACC 1110
Query 1051 CAGTTGGGCAAGTATCCTGTTATAGAGGTACTCGTCGTGACAGCCATCACTGCCATCCTGGCTTTCCCCAATGA 1124
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CAGTTGGGCAAGTATCCTGTTATAGAGGTACTCGTCGTGACAGCCATCACTGCCATCCTGGCTTTCCCCAATGA 1184
Query 1125 ATACACTCGGATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGAGCTGTTTAATGACTGTGGCCTTCTGGACTCCTCCAAGC 1198
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ATACACTCGGATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGAGCTGTTTAATGACTGTGGCCTTCTGGACTCCTCCAAGC 1258
Query 1199 TCTGTGATTATGAGAACCGTTTCAACACAAGCAAAGGGGGTGAACTGCCTGACAGACCGGCTGGCGTGGGAGTC 1272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCTGTGATTATGAGAACCGTTTCAACACAAGCAAAGGGGGTGAACTGCCTGACAGACCGGCTGGCGTGGGAGTC 1332
Query 1273 TACAGTGCAATGTGGCAGCTGGCTTTAACACTCATACTGAAAATTGTCATTACTATATTCACCTTTGGCATGAA 1346
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TACAGTGCAATGTGGCAGCTGGCTTTAACACTCATACTGAAAATTGTCATTACTATATTCACCTTTGGCATGAA 1406
Query 1347 GATCCCTTCTGGCCTCTTTATCCCTAGCATGGCTGTTGGTGCTATAGCAGGTCGACTTCTAGGAGTAGGAATGG 1420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GATCCCTTCTGGCCTCTTTATCCCTAGCATGGCTGTTGGTGCTATAGCAGGTCGACTTCTAGGAGTAGGAATGG 1480
Query 1421 AACAGCTGGCTTATTACCACCAGGAATGGACCGTCTTCAATAGCTGGTGTAGTCAGGGAGCTGATTGCATCACC 1494
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AACAGCTGGCTTATTACCACCAGGAATGGACCGTCTTCAATAGCTGGTGTAGTCAGGGAGCTGATTGCATCACC 1554
Query 1495 CCCGGCCTTTATGCAATGGTTGGGGCTGCAGCCTGCTTAGGTGGGGTGACTCGGATGACTGTTTCTCTTGTTGT 1568
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCCGGCCTTTATGCAATGGTTGGGGCTGCAGCCTGCTTAGGTGGGGTGACTCGGATGACTGTTTCTCTTGTTGT 1628
Query 1569 CATAATGTTTGAACTGACTGGTGGCTTAGAATACATCGTGCCTCTGATGGCTGCAGCCATGACAAGCAAGTGGG 1642
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CATAATGTTTGAACTGACTGGTGGCTTAGAATACATCGTGCCTCTGATGGCTGCAGCCATGACAAGCAAGTGGG 1702
Query 1643 TGGCAGATGCTCTTGGGCGGGAGGGCATCTATGATGCCCACATCCGTCTCAATGGATACCCCTTTCTTGAAGCC 1716
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGGCAGATGCTCTTGGGCGGGAGGGCATCTATGATGCCCACATCCGTCTCAATGGATACCCCTTTCTTGAAGCC 1776
Query 1717 AAAGAAGAGTTTGCTCATAAGACCCTGGCAATGGATGTGATGAAACCCCGGAGAAATGATCCTTTGTTGACTGT 1790
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AAAGAAGAGTTTGCTCATAAGACCCTGGCAATGGATGTGATGAAACCCCGGAGAAATGATCCTTTGTTGACTGT 1850
Query 1791 CCTTACTCAGGACAGTATGACTGTGGAAGATGTAGAGACCATAATCAGTGAAACCACTTACAGTGGCTTCCCAG 1864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CCTTACTCAGGACAGTATGACTGTGGAAGATGTAGAGACCATAATCAGTGAAACCACTTACAGTGGCTTCCCAG 1924
Query 1865 TGGTGGTATCCCGGGAGTCCCAAAGACTTGTGGGCTTTGTCCTCCGAAGAGATCTCATTATTTCAATTGAAAAT 1938
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TGGTGGTATCCCGGGAGTCCCAAAGACTTGTGGGCTTTGTCCTCCGAAGAGATCTCATTATTTCAATTGAAAAT 1998
Query 1939 GCTCGAAAGAAACAGGATGGGGTTGTTAGCACTTCCATCATTTATTTCACGGAGCATTCTCCTCCATTGCCACC 2012
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GCTCGAAAGAAACAGGATGGGGTTGTTAGCACTTCCATCATTTATTTCACGGAGCATTCTCCTCCATTGCCACC 2072
Query 2013 ATACACTCCACCCACTCTAAAGCTTCGGAACATCCTCGATCTCAGCCCCTTCACTGTGACTGACCTTACACCCA 2086
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 ATACACTCCACCCACTCTAAAGCTTCGGAACATCCTCGATCTCAGCCCCTTCACTGTGACTGACCTTACACCCA 2146
Query 2087 TGGAGATCGTAGTGGATATTTTCCGAAAGCTGGGACTGCGGCAGTGCCTGGTTACACACAACGGGCGATTGCTT 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TGGAGATCGTAGTGGATATTTTCCGAAAGCTGGGACTGCGGCAGTGCCTGGTTACACACAACGGGCGATTGCTT 2220
Query 2161 GGAATCATTACCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATAGCACAGATGGCGAACCAAGATCCTGATTCCATTCTCTT 2234
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GGAATCATTACCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATAGCACAGATGGCGAACCAAGATCCTGATTCCATTCTCTT 2294
Query 2235 CAAC 2238
||||
Sbjct 2295 CAAC 2298