Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480726
- Subject:
- NM_016691.4
- Aligned Length:
- 2238
- Identities:
- 2050
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGACTTCTTGGAGGAGCCAATCCCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTTCAATACAATTGATTGGGTGAGAGA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGACTTCTTGGAGGAGCCAATCCCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTTCAACACAATTGATTGGGTGAGAGA 74
Query 75 GAAGTCTCGAGACCGGGATAGGCACCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAGAGTCAACATGGGCCTTAATTCACA 148
|||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAAATCTCGAGACCGAGATAGGCACCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAGAGTCAACATGGGCCTTAATTCACA 148
Query 149 GTGTGAGTGATGCTTTTTCCGGCTGGTTGTTGATGCTCCTTATTGGGCTTTTATCAGGTTCGTTAGCTGGTTTG 222
|||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||..||
Sbjct 149 GTGTGAGCGATGCTTTCTCTGGTTGGTTGTTAATGCTCCTTATTGGCCTTTTATCAGGTTCCTTAGCTGGCCTG 222
Query 223 ATAGACATCTCTGCTCATTGGATGACAGACTTAAAAGAAGGTATATGCACAGGGGGATTCTGGTTTAACCATGA 296
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 223 ATAGACATCTCTGCTCACTGGATGACAGACTTAAAAGAAGGGATATGTACAGGGGGGTTCTGGTTTAACCATGA 296
Query 297 ACATTGTTGCTGGAACTCTGAGCATGTCACCTTTGAAGAGAGAGACAAATGTCCAGAGTGGAATAGTTGGTCCC 370
.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||
Sbjct 297 GCACTGTTGCTGGAATTCTGAGCATGTTACCTTTGAACACAGAGACAAATGTCCAGAGTGGAATAGCTGGGCCC 370
Query 371 AGCTTATCATCAGCACAGATGAGGGAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTATTTCATGTACGTCCTCTGGGCTCTC 444
||||.|||||||..||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 371 AGCTCATCATCAATACAGATCAGGGAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTACTTCATGTACGTCCTCTGGGCTCTT 444
Query 445 CTATTTGCCTTCCTTGCCGTATCTCTTGTCAAGGTGTTTGCGCCTTATGCCTGTGGCTCTGGAATCCCTGAGAT 518
||.|||||.||||||||.||||||||||||||||..|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 CTGTTTGCTTTCCTTGCTGTATCTCTTGTCAAGGCATTTGCACCTTATGCCTGTGGTTCTGGAATCCCTGAGAT 518
Query 519 AAAAACTATCTTGAGTGGTTTCATTATTAGGGGCTATTTGGGTAAGTGGACTCTGGTTATCAAAACCATCACCT 592
.|||||.|||.|||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|
Sbjct 519 CAAAACCATCCTGAGTGGTTTCATTATTAGAGGCTATCTGGGTAAGTGGACCCTTGTCATCAAAACTATCACTT 592
Query 593 TGGTGCTGGCAGTGTCGTCTGGCTTGAGCCTGGGCAAAGAGGGCCCTCTAGTGCACGTGGCTTGCTGCTGTGGG 666
|||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGTGTTGGCGGTGTCATCTGGCTTGAGCCTGGGCAAGGAGGGCCCCCTGGTGCACGTGGCTTGCTGCTGTGGG 666
Query 667 AACATCCTGTGCCACTGCTTCAACAAATACAGGAAGAATGAAGCCAAGCGCAGAGAGGTCTTGTCGGCTGCAGC 740
||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct 667 AACATCTTGTGCCACTGCTTCAACAAATACCGGAAGAATGAAGCCAAGCGGAGAGAGGTCTTATCAGCTGCAGC 740
Query 741 AGCAGCTGGTGTATCTGTAGCCTTTGGAGCACCTATAGGTGGAGTATTATTCAGCCTTGAAGAGGTCAGCTACT 814
.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 741 GGCTGCCGGTGTATCTGTAGCCTTTGGGGCCCCTATTGGTGGAGTATTATTCAGCCTGGAAGAGGTCAGCTACT 814
Query 815 ATTTTCCCCTCAAAACATTGTGGCGTTCATTCTTTGCTGCCTTGGTGGCAGCATTCACTCTACGCTCCATCAAT 888
|.|||||||||||||||.|.||||||||.|||||.|||||..||||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 815 ACTTTCCCCTCAAAACACTATGGCGTTCTTTCTTCGCTGCTCTGGTGGCAGCGTTCACACTCCGCTCCATCAAT 888
Query 889 CCATTTGGGAACAGCCGCCTGGTACTATTTTATGTGGAGTTTCACACCCCATGGCATCTCTTTGAGCTCGTGCC 962
|||||.||.|||||||||.|.||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCATTCGGAAACAGCCGCTTAGTTCTGTTTTATGTGGAGTTCCACACCCCGTGGCATCTCTTTGAGCTCGTGCC 962
Query 963 ATTCATTCTGCTGGGCATATTTGGTGGTCTGTGGGGAGCACTGTTTATCCGCACAAACATTGCCTGGTGTCGGA 1036
|||||||.|.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ATTCATTGTACTAGGCATATTCGGTGGCCTCTGGGGAGCTCTGTTTATCCGCACAAACATTGCCTGGTGTCGGA 1036
Query 1037 AGCGAAAGACCACCCAGTTGGGCAAGTATCCTGTTATAGAGGTACTCGTCGTGACAGCCATCACTGCCATCCTG 1110
||||.||.|||||.||||||||||||||||||||..|.|||||||||.|.|||||.|||||||||||||||.||
Sbjct 1037 AGCGTAAAACCACACAGTTGGGCAAGTATCCTGTCGTCGAGGTACTCATTGTGACGGCCATCACTGCCATCTTG 1110
Query 1111 GCTTTCCCCAATGAATACACTCGGATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGAGCTGTTTAATGACTGTGGCCTTCT 1184
|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1111 GCTTTCCCCAATGAATATACCCGGATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGAGCTGTTCAATGACTGCGGCCTCCT 1184
Query 1185 GGACTCCTCCAAGCTCTGTGATTATGAGAACCGTTTCAACACAAGCAAAGGGGGTGAACTGCCTGACAGACCGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1185 GGACTCCTCCAAGCTCTGTGATTATGAGAACCACTTCAACACAAGCAAAGGCGGTGAGCTGCCTGACAGACCTG 1258
Query 1259 CTGGCGTGGGAGTCTACAGTGCAATGTGGCAGCTGGCTTTAACACTCATACTGAAAATTGTCATTACTATATTC 1332
||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1259 CTGGCGTGGGCATCTACAGTGCCATGTGGCAGCTGGCTCTGACACTCATACTGAAAATAGTCATTACTATATTC 1332
Query 1333 ACCTTTGGCATGAAGATCCCTTCTGGCCTCTTTATCCCTAGCATGGCTGTTGGTGCTATAGCAGGTCGACTTCT 1406
|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|
Sbjct 1333 ACCTTTGGCATGAAGATTCCTTCTGGTCTCTTTATCCCCAGCATGGCTGTCGGTGCTATAGCAGGCCGTCTTTT 1406
Query 1407 AGGAGTAGGAATGGAACAGCTGGCTTATTACCACCAGGAATGGACCGTCTTCAATAGCTGGTGTAGTCAGGGAG 1480
||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||..|.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGGAGTCGGAATGGAGCAACTGGCTTATTACCACCACGACTGGGGCATCTTCAATAGCTGGTGTAGTCAGGGAG 1480
Query 1481 CTGATTGCATCACCCCCGGCCTTTATGCAATGGTTGGGGCTGCAGCCTGCTTAGGTGGGGTGACTCGGATGACT 1554
|||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTGATTGTATCACCCCTGGCCTTTATGCCATGGTTGGGGCTGCTGCCTGCTTAGGTGGGGTGACTCGGATGACT 1554
Query 1555 GTTTCTCTTGTTGTCATAATGTTTGAACTGACTGGTGGCTTAGAATACATCGTGCCTCTGATGGCTGCAGCCAT 1628
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1555 GTTTCTCTTGTTGTCATAATGTTTGAACTGACTGGTGGCCTGGAATATATTGTGCCTCTGATGGCTGCAGCTAT 1628
Query 1629 GACAAGCAAGTGGGTGGCAGATGCTCTTGGGCGGGAGGGCATCTATGATGCCCACATCCGTCTCAATGGATACC 1702
||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GACAAGCAAGTGGGTGGCCGATGCTCTTGGGCGAGAGGGCATTTATGATGCCCACATCCGTCTCAATGGATACC 1702
Query 1703 CCTTTCTTGAAGCCAAAGAAGAGTTTGCTCATAAGACCCTGGCAATGGATGTGATGAAACCCCGGAGAAATGAT 1776
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1703 CCTTTCTTGAAGCCAAAGAAGAATTTGCTCATAAGACTCTGGCAATGGATGTGATGAAGCCCCGGAGAAATGAC 1776
Query 1777 CCTTTGTTGACTGTCCTTACTCAGGACAGTATGACTGTGGAAGATGTAGAGACCATAATCAGTGAAACCACTTA 1850
||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1777 CCCTTGCTGACTGTCCTTACTCAGGACAGTATGACTGTGGAGGATGTCGAGACCATAATCAGCGAAACCACGTA 1850
Query 1851 CAGTGGCTTCCCAGTGGTGGTATCCCGGGAGTCCCAAAGACTTGTGGGCTTTGTCCTCCGAAGAGATCTCATTA 1924
|||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1851 CAGTGGCTTTCCGGTGGTAGTGTCCCGAGAGTCGCAAAGACTTGTAGGCTTTGTTCTTCGAAGAGATCTCATTA 1924
Query 1925 TTTCAATTGAAAATGCTCGAAAGAAACAGGATGGGGTTGTTAGCACTTCCATCATTTATTTCACGGAGCATTCT 1998
|||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1925 TTTCAATTGAAAATGCTCGGAAGAAACAGGACGGGGTTGTGAGCACTTCCATCATTTATTTCACGGAGCATTCG 1998
Query 1999 CCTCCATTGCCACCATACACTCCACCCACTCTAAAGCTTCGGAACATCCTCGATCTCAGCCCCTTCACTGTGAC 2072
||||||.||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CCTCCAATGCCTCCATACACCCCACCTACCCTGAAGCTTCGGAACATCCTGGACCTCAGCCCCTTCACTGTGAC 2072
Query 2073 TGACCTTACACCCATGGAGATCGTAGTGGATATTTTCCGAAAGCTGGGACTGCGGCAGTGCCTGGTTACACACA 2146
.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGACCTTACGCCAATGGAGATCGTGGTGGACATCTTCCGCAAGCTGGGCCTGCGCCAGTGCCTGGTTACACACA 2146
Query 2147 ACGGGCGATTGCTTGGAATCATTACCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATAGCACAGATGGCGAACCAAGATCCT 2220
|||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 2147 ACGGGCGCTTACTTGGAATCATCACCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATAGCACAGATGGCAAACCAAGACCCT 2220
Query 2221 GATTCCATTCTCTTCAAC 2238
||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GATTCCATTCTCTTCAAC 2238