Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000480726
- Subject:
- XM_011247442.1
- Aligned Length:
- 2553
- Identities:
- 2050
- Gaps:
- 315
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCCATGTGGCAGGGAATGAACTCAGGGAGACAGGCTTGGCCGCTGGACCATTTACCCACTGACTCATCTCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCAGCTCCCAGGGAGCTCGGAGTGGAACCCAGGACCTTACATGTTAGGAGCCATGGATAACAGAGGCTTTCATC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AGGGGAGTTTTAGTAGCTTCCAGAGCAGCTCTAGTGATGAAGACTTGATGGACATCCCAGGGACTGCTATGGAC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TTCTCTATGAGAGATGACGTGCCGCCTTTAGATCGAGAAATAGAAGGGAACAAGTCATACAATGGTGGTGGAAT 296
Query 1 -------------------ATGGACTTCTTGGAGGAGCCAATCCCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTTCAATA 55
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 AGGCTCTTCAAATAGAGTCATGGACTTCTTGGAGGAGCCAATCCCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTTCAACA 370
Query 56 CAATTGATTGGGTGAGAGAGAAGTCTCGAGACCGGGATAGGCACCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAGAGTCA 129
||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CAATTGATTGGGTGAGAGAGAAATCTCGAGACCGAGATAGGCACCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAGAGTCA 444
Query 130 ACATGGGCCTTAATTCACAGTGTGAGTGATGCTTTTTCCGGCTGGTTGTTGATGCTCCTTATTGGGCTTTTATC 203
||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445 ACATGGGCCTTAATTCACAGTGTGAGCGATGCTTTCTCTGGTTGGTTGTTAATGCTCCTTATTGGCCTTTTATC 518
Query 204 AGGTTCGTTAGCTGGTTTGATAGACATCTCTGCTCATTGGATGACAGACTTAAAAGAAGGTATATGCACAGGGG 277
||||||.||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 519 AGGTTCCTTAGCTGGCCTGATAGACATCTCTGCTCACTGGATGACAGACTTAAAAGAAGGGATATGTACAGGGG 592
Query 278 GATTCTGGTTTAACCATGAACATTGTTGCTGGAACTCTGAGCATGTCACCTTTGAAGAGAGAGACAAATGTCCA 351
|.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||
Sbjct 593 GGTTCTGGTTTAACCATGAGCACTGTTGCTGGAATTCTGAGCATGTTACCTTTGAACACAGAGACAAATGTCCA 666
Query 352 GAGTGGAATAGTTGGTCCCAGCTTATCATCAGCACAGATGAGGGAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTATTTCAT 425
|||||||||||.|||.|||||||.|||||||..||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 667 GAGTGGAATAGCTGGGCCCAGCTCATCATCAATACAGATCAGGGAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTACTTCAT 740
Query 426 GTACGTCCTCTGGGCTCTCCTATTTGCCTTCCTTGCCGTATCTCTTGTCAAGGTGTTTGCGCCTTATGCCTGTG 499
||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||..|||||.|||||||||||||
Sbjct 741 GTACGTCCTCTGGGCTCTTCTGTTTGCTTTCCTTGCTGTATCTCTTGTCAAGGCATTTGCACCTTATGCCTGTG 814
Query 500 GCTCTGGAATCCCTGAGATAAAAACTATCTTGAGTGGTTTCATTATTAGGGGCTATTTGGGTAAGTGGACTCTG 573
|.|||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||.
Sbjct 815 GTTCTGGAATCCCTGAGATCAAAACCATCCTGAGTGGTTTCATTATTAGAGGCTATCTGGGTAAGTGGACCCTT 888
Query 574 GTTATCAAAACCATCACCTTGGTGCTGGCAGTGTCGTCTGGCTTGAGCCTGGGCAAAGAGGGCCCTCTAGTGCA 647
||.||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 889 GTCATCAAAACTATCACTTTGGTGTTGGCGGTGTCATCTGGCTTGAGCCTGGGCAAGGAGGGCCCCCTGGTGCA 962
Query 648 CGTGGCTTGCTGCTGTGGGAACATCCTGTGCCACTGCTTCAACAAATACAGGAAGAATGAAGCCAAGCGCAGAG 721
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||
Sbjct 963 CGTGGCTTGCTGCTGTGGGAACATCTTGTGCCACTGCTTCAACAAATACCGGAAGAATGAAGCCAAGCGGAGAG 1036
Query 722 AGGTCTTGTCGGCTGCAGCAGCAGCTGGTGTATCTGTAGCCTTTGGAGCACCTATAGGTGGAGTATTATTCAGC 795
|||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGGTCTTATCAGCTGCAGCGGCTGCCGGTGTATCTGTAGCCTTTGGGGCCCCTATTGGTGGAGTATTATTCAGC 1110
Query 796 CTTGAAGAGGTCAGCTACTATTTTCCCCTCAAAACATTGTGGCGTTCATTCTTTGCTGCCTTGGTGGCAGCATT 869
||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||.|||||.|||||..||||||||||.||
Sbjct 1111 CTGGAAGAGGTCAGCTACTACTTTCCCCTCAAAACACTATGGCGTTCTTTCTTCGCTGCTCTGGTGGCAGCGTT 1184
Query 870 CACTCTACGCTCCATCAATCCATTTGGGAACAGCCGCCTGGTACTATTTTATGTGGAGTTTCACACCCCATGGC 943
|||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.|.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1185 CACACTCCGCTCCATCAATCCATTCGGAAACAGCCGCTTAGTTCTGTTTTATGTGGAGTTCCACACCCCGTGGC 1258
Query 944 ATCTCTTTGAGCTCGTGCCATTCATTCTGCTGGGCATATTTGGTGGTCTGTGGGGAGCACTGTTTATCCGCACA 1017
||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1259 ATCTCTTTGAGCTCGTGCCATTCATTGTACTAGGCATATTCGGTGGCCTCTGGGGAGCTCTGTTTATCCGCACA 1332
Query 1018 AACATTGCCTGGTGTCGGAAGCGAAAGACCACCCAGTTGGGCAAGTATCCTGTTATAGAGGTACTCGTCGTGAC 1091
|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||..|.|||||||||.|.|||||
Sbjct 1333 AACATTGCCTGGTGTCGGAAGCGTAAAACCACACAGTTGGGCAAGTATCCTGTCGTCGAGGTACTCATTGTGAC 1406
Query 1092 AGCCATCACTGCCATCCTGGCTTTCCCCAATGAATACACTCGGATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGAGCTGT 1165
.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGCCATCACTGCCATCTTGGCTTTCCCCAATGAATATACCCGGATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGAGCTGT 1480
Query 1166 TTAATGACTGTGGCCTTCTGGACTCCTCCAAGCTCTGTGATTATGAGAACCGTTTCAACACAAGCAAAGGGGGT 1239
|.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1481 TCAATGACTGCGGCCTCCTGGACTCCTCCAAGCTCTGTGATTATGAGAACCACTTCAACACAAGCAAAGGCGGT 1554
Query 1240 GAACTGCCTGACAGACCGGCTGGCGTGGGAGTCTACAGTGCAATGTGGCAGCTGGCTTTAACACTCATACTGAA 1313
||.||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1555 GAGCTGCCTGACAGACCTGCTGGCGTGGGCATCTACAGTGCCATGTGGCAGCTGGCTCTGACACTCATACTGAA 1628
Query 1314 AATTGTCATTACTATATTCACCTTTGGCATGAAGATCCCTTCTGGCCTCTTTATCCCTAGCATGGCTGTTGGTG 1387
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1629 AATAGTCATTACTATATTCACCTTTGGCATGAAGATTCCTTCTGGTCTCTTTATCCCCAGCATGGCTGTCGGTG 1702
Query 1388 CTATAGCAGGTCGACTTCTAGGAGTAGGAATGGAACAGCTGGCTTATTACCACCAGGAATGGACCGTCTTCAAT 1461
||||||||||.||.|||.|||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||..|.||||||||
Sbjct 1703 CTATAGCAGGCCGTCTTTTAGGAGTCGGAATGGAGCAACTGGCTTATTACCACCACGACTGGGGCATCTTCAAT 1776
Query 1462 AGCTGGTGTAGTCAGGGAGCTGATTGCATCACCCCCGGCCTTTATGCAATGGTTGGGGCTGCAGCCTGCTTAGG 1535
||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1777 AGCTGGTGTAGTCAGGGAGCTGATTGTATCACCCCTGGCCTTTATGCCATGGTTGGGGCTGCTGCCTGCTTAGG 1850
Query 1536 TGGGGTGACTCGGATGACTGTTTCTCTTGTTGTCATAATGTTTGAACTGACTGGTGGCTTAGAATACATCGTGC 1609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.||||
Sbjct 1851 TGGGGTGACTCGGATGACTGTTTCTCTTGTTGTCATAATGTTTGAACTGACTGGTGGCCTGGAATATATTGTGC 1924
Query 1610 CTCTGATGGCTGCAGCCATGACAAGCAAGTGGGTGGCAGATGCTCTTGGGCGGGAGGGCATCTATGATGCCCAC 1683
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1925 CTCTGATGGCTGCAGCTATGACAAGCAAGTGGGTGGCCGATGCTCTTGGGCGAGAGGGCATTTATGATGCCCAC 1998
Query 1684 ATCCGTCTCAATGGATACCCCTTTCTTGAAGCCAAAGAAGAGTTTGCTCATAAGACCCTGGCAATGGATGTGAT 1757
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1999 ATCCGTCTCAATGGATACCCCTTTCTTGAAGCCAAAGAAGAATTTGCTCATAAGACTCTGGCAATGGATGTGAT 2072
Query 1758 GAAACCCCGGAGAAATGATCCTTTGTTGACTGTCCTTACTCAGGACAGTATGACTGTGGAAGATGTAGAGACCA 1831
|||.||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 2073 GAAGCCCCGGAGAAATGACCCCTTGCTGACTGTCCTTACTCAGGACAGTATGACTGTGGAGGATGTCGAGACCA 2146
Query 1832 TAATCAGTGAAACCACTTACAGTGGCTTCCCAGTGGTGGTATCCCGGGAGTCCCAAAGACTTGTGGGCTTTGTC 1905
|||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 2147 TAATCAGCGAAACCACGTACAGTGGCTTTCCGGTGGTAGTGTCCCGAGAGTCGCAAAGACTTGTAGGCTTTGTT 2220
Query 1906 CTCCGAAGAGATCTCATTATTTCAATTGAAAATGCTCGAAAGAAACAGGATGGGGTTGTTAGCACTTCCATCAT 1979
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2221 CTTCGAAGAGATCTCATTATTTCAATTGAAAATGCTCGGAAGAAACAGGACGGGGTTGTGAGCACTTCCATCAT 2294
Query 1980 TTATTTCACGGAGCATTCTCCTCCATTGCCACCATACACTCCACCCACTCTAAAGCTTCGGAACATCCTCGATC 2053
||||||||||||||||||.||||||.||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 2295 TTATTTCACGGAGCATTCGCCTCCAATGCCTCCATACACCCCACCTACCCTGAAGCTTCGGAACATCCTGGACC 2368
Query 2054 TCAGCCCCTTCACTGTGACTGACCTTACACCCATGGAGATCGTAGTGGATATTTTCCGAAAGCTGGGACTGCGG 2127
|||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.
Sbjct 2369 TCAGCCCCTTCACTGTGACAGACCTTACGCCAATGGAGATCGTGGTGGACATCTTCCGCAAGCTGGGCCTGCGC 2442
Query 2128 CAGTGCCTGGTTACACACAACGGGCGATTGCTTGGAATCATTACCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATAGCACA 2201
||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CAGTGCCTGGTTACACACAACGGGCGCTTACTTGGAATCATCACCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATAGCACA 2516
Query 2202 GATGGCGAACCAAGATCCTGATTCCATTCTCTTCAAC 2238
||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GATGGCAAACCAAGACCCTGATTCCATTCTCTTCAAC 2553