Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480726
• Subject: XM_011247445.2
• Aligned Length: 2517
• Identities: 2050
• Gaps: 279

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCATGTGGCAGGGAATGAACTCAGGGAGACAGGCTTGGCCGCTGGACCATTTACCCACTGACTCATCTCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCAGCTCCCAGGAGCCATGGATAACAGAGGCTTTCATCAGGGGAGTTTTAGTAGCTTCCAGAGCAGCTCTAGTG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ATGAAGACTTGATGGACATCCCAGGGACTGCTATGGACTTCTCTATGAGAGATGACGTGCCGCCTTTAGATCGA  222

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGGACTTCTTGGAGGA  17
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAATAGAAGGGAACAAGTCATACAATGGTGGTGGAATAGGCTCTTCAAATAGAGTCATGGACTTCTTGGAGGA  296

Query   18  GCCAATCCCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTTCAATACAATTGATTGGGTGAGAGAGAAGTCTCGAGACCGGG  91
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  297  GCCAATCCCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTTCAACACAATTGATTGGGTGAGAGAGAAATCTCGAGACCGAG  370

Query   92  ATAGGCACCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAGAGTCAACATGGGCCTTAATTCACAGTGTGAGTGATGCTTTT  165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  371  ATAGGCACCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAGAGTCAACATGGGCCTTAATTCACAGTGTGAGCGATGCTTTC  444

Query  166  TCCGGCTGGTTGTTGATGCTCCTTATTGGGCTTTTATCAGGTTCGTTAGCTGGTTTGATAGACATCTCTGCTCA  239
            ||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCTGGTTGGTTGTTAATGCTCCTTATTGGCCTTTTATCAGGTTCCTTAGCTGGCCTGATAGACATCTCTGCTCA  518

Query  240  TTGGATGACAGACTTAAAAGAAGGTATATGCACAGGGGGATTCTGGTTTAACCATGAACATTGTTGCTGGAACT  313
            .|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct  519  CTGGATGACAGACTTAAAAGAAGGGATATGTACAGGGGGGTTCTGGTTTAACCATGAGCACTGTTGCTGGAATT  592

Query  314  CTGAGCATGTCACCTTTGAAGAGAGAGACAAATGTCCAGAGTGGAATAGTTGGTCCCAGCTTATCATCAGCACA  387
            ||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||||..|||
Sbjct  593  CTGAGCATGTTACCTTTGAACACAGAGACAAATGTCCAGAGTGGAATAGCTGGGCCCAGCTCATCATCAATACA  666

Query  388  GATGAGGGAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTATTTCATGTACGTCCTCTGGGCTCTCCTATTTGCCTTCCTTGC  461
            |||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  667  GATCAGGGAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTACTTCATGTACGTCCTCTGGGCTCTTCTGTTTGCTTTCCTTGC  740

Query  462  CGTATCTCTTGTCAAGGTGTTTGCGCCTTATGCCTGTGGCTCTGGAATCCCTGAGATAAAAACTATCTTGAGTG  535
            .||||||||||||||||..|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.||||||
Sbjct  741  TGTATCTCTTGTCAAGGCATTTGCACCTTATGCCTGTGGTTCTGGAATCCCTGAGATCAAAACCATCCTGAGTG  814

Query  536  GTTTCATTATTAGGGGCTATTTGGGTAAGTGGACTCTGGTTATCAAAACCATCACCTTGGTGCTGGCAGTGTCG  609
            |||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.
Sbjct  815  GTTTCATTATTAGAGGCTATCTGGGTAAGTGGACCCTTGTCATCAAAACTATCACTTTGGTGTTGGCGGTGTCA  888

Query  610  TCTGGCTTGAGCCTGGGCAAAGAGGGCCCTCTAGTGCACGTGGCTTGCTGCTGTGGGAACATCCTGTGCCACTG  683
            ||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  889  TCTGGCTTGAGCCTGGGCAAGGAGGGCCCCCTGGTGCACGTGGCTTGCTGCTGTGGGAACATCTTGTGCCACTG  962

Query  684  CTTCAACAAATACAGGAAGAATGAAGCCAAGCGCAGAGAGGTCTTGTCGGCTGCAGCAGCAGCTGGTGTATCTG  757
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct  963  CTTCAACAAATACCGGAAGAATGAAGCCAAGCGGAGAGAGGTCTTATCAGCTGCAGCGGCTGCCGGTGTATCTG  1036

Query  758  TAGCCTTTGGAGCACCTATAGGTGGAGTATTATTCAGCCTTGAAGAGGTCAGCTACTATTTTCCCCTCAAAACA  831
            ||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037  TAGCCTTTGGGGCCCCTATTGGTGGAGTATTATTCAGCCTGGAAGAGGTCAGCTACTACTTTCCCCTCAAAACA  1110

Query  832  TTGTGGCGTTCATTCTTTGCTGCCTTGGTGGCAGCATTCACTCTACGCTCCATCAATCCATTTGGGAACAGCCG  905
            .|.||||||||.|||||.|||||..||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1111  CTATGGCGTTCTTTCTTCGCTGCTCTGGTGGCAGCGTTCACACTCCGCTCCATCAATCCATTCGGAAACAGCCG  1184

Query  906  CCTGGTACTATTTTATGTGGAGTTTCACACCCCATGGCATCTCTTTGAGCTCGTGCCATTCATTCTGCTGGGCA  979
            |.|.||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||
Sbjct 1185  CTTAGTTCTGTTTTATGTGGAGTTCCACACCCCGTGGCATCTCTTTGAGCTCGTGCCATTCATTGTACTAGGCA  1258

Query  980  TATTTGGTGGTCTGTGGGGAGCACTGTTTATCCGCACAAACATTGCCTGGTGTCGGAAGCGAAAGACCACCCAG  1053
            ||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1259  TATTCGGTGGCCTCTGGGGAGCTCTGTTTATCCGCACAAACATTGCCTGGTGTCGGAAGCGTAAAACCACACAG  1332

Query 1054  TTGGGCAAGTATCCTGTTATAGAGGTACTCGTCGTGACAGCCATCACTGCCATCCTGGCTTTCCCCAATGAATA  1127
            |||||||||||||||||..|.|||||||||.|.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTGGGCAAGTATCCTGTCGTCGAGGTACTCATTGTGACGGCCATCACTGCCATCTTGGCTTTCCCCAATGAATA  1406

Query 1128  CACTCGGATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGAGCTGTTTAATGACTGTGGCCTTCTGGACTCCTCCAAGCTCT  1201
            .||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TACCCGGATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGAGCTGTTCAATGACTGCGGCCTCCTGGACTCCTCCAAGCTCT  1480

Query 1202  GTGATTATGAGAACCGTTTCAACACAAGCAAAGGGGGTGAACTGCCTGACAGACCGGCTGGCGTGGGAGTCTAC  1275
            |||||||||||||||..|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||..|||||
Sbjct 1481  GTGATTATGAGAACCACTTCAACACAAGCAAAGGCGGTGAGCTGCCTGACAGACCTGCTGGCGTGGGCATCTAC  1554

Query 1276  AGTGCAATGTGGCAGCTGGCTTTAACACTCATACTGAAAATTGTCATTACTATATTCACCTTTGGCATGAAGAT  1349
            |||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGTGCCATGTGGCAGCTGGCTCTGACACTCATACTGAAAATAGTCATTACTATATTCACCTTTGGCATGAAGAT  1628

Query 1350  CCCTTCTGGCCTCTTTATCCCTAGCATGGCTGTTGGTGCTATAGCAGGTCGACTTCTAGGAGTAGGAATGGAAC  1423
            .||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|||||||.||||||||.|
Sbjct 1629  TCCTTCTGGTCTCTTTATCCCCAGCATGGCTGTCGGTGCTATAGCAGGCCGTCTTTTAGGAGTCGGAATGGAGC  1702

Query 1424  AGCTGGCTTATTACCACCAGGAATGGACCGTCTTCAATAGCTGGTGTAGTCAGGGAGCTGATTGCATCACCCCC  1497
            |.|||||||||||||||||.||.|||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1703  AACTGGCTTATTACCACCACGACTGGGGCATCTTCAATAGCTGGTGTAGTCAGGGAGCTGATTGTATCACCCCT  1776

Query 1498  GGCCTTTATGCAATGGTTGGGGCTGCAGCCTGCTTAGGTGGGGTGACTCGGATGACTGTTTCTCTTGTTGTCAT  1571
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GGCCTTTATGCCATGGTTGGGGCTGCTGCCTGCTTAGGTGGGGTGACTCGGATGACTGTTTCTCTTGTTGTCAT  1850

Query 1572  AATGTTTGAACTGACTGGTGGCTTAGAATACATCGTGCCTCTGATGGCTGCAGCCATGACAAGCAAGTGGGTGG  1645
            ||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AATGTTTGAACTGACTGGTGGCCTGGAATATATTGTGCCTCTGATGGCTGCAGCTATGACAAGCAAGTGGGTGG  1924

Query 1646  CAGATGCTCTTGGGCGGGAGGGCATCTATGATGCCCACATCCGTCTCAATGGATACCCCTTTCTTGAAGCCAAA  1719
            |.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCGATGCTCTTGGGCGAGAGGGCATTTATGATGCCCACATCCGTCTCAATGGATACCCCTTTCTTGAAGCCAAA  1998

Query 1720  GAAGAGTTTGCTCATAAGACCCTGGCAATGGATGTGATGAAACCCCGGAGAAATGATCCTTTGTTGACTGTCCT  1793
            |||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||.||||||||||
Sbjct 1999  GAAGAATTTGCTCATAAGACTCTGGCAATGGATGTGATGAAGCCCCGGAGAAATGACCCCTTGCTGACTGTCCT  2072

Query 1794  TACTCAGGACAGTATGACTGTGGAAGATGTAGAGACCATAATCAGTGAAACCACTTACAGTGGCTTCCCAGTGG  1867
            ||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 2073  TACTCAGGACAGTATGACTGTGGAGGATGTCGAGACCATAATCAGCGAAACCACGTACAGTGGCTTTCCGGTGG  2146

Query 1868  TGGTATCCCGGGAGTCCCAAAGACTTGTGGGCTTTGTCCTCCGAAGAGATCTCATTATTTCAATTGAAAATGCT  1941
            |.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TAGTGTCCCGAGAGTCGCAAAGACTTGTAGGCTTTGTTCTTCGAAGAGATCTCATTATTTCAATTGAAAATGCT  2220

Query 1942  CGAAAGAAACAGGATGGGGTTGTTAGCACTTCCATCATTTATTTCACGGAGCATTCTCCTCCATTGCCACCATA  2015
            ||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||
Sbjct 2221  CGGAAGAAACAGGACGGGGTTGTGAGCACTTCCATCATTTATTTCACGGAGCATTCGCCTCCAATGCCTCCATA  2294

Query 2016  CACTCCACCCACTCTAAAGCTTCGGAACATCCTCGATCTCAGCCCCTTCACTGTGACTGACCTTACACCCATGG  2089
            |||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 2295  CACCCCACCTACCCTGAAGCTTCGGAACATCCTGGACCTCAGCCCCTTCACTGTGACAGACCTTACGCCAATGG  2368

Query 2090  AGATCGTAGTGGATATTTTCCGAAAGCTGGGACTGCGGCAGTGCCTGGTTACACACAACGGGCGATTGCTTGGA  2163
            |||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 2369  AGATCGTGGTGGACATCTTCCGCAAGCTGGGCCTGCGCCAGTGCCTGGTTACACACAACGGGCGCTTACTTGGA  2442

Query 2164  ATCATTACCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATAGCACAGATGGCGAACCAAGATCCTGATTCCATTCTCTTCAA  2237
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ATCATCACCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATAGCACAGATGGCAAACCAAGACCCTGATTCCATTCTCTTCAA  2516

Query 2238  C  2238
            |
Sbjct 2517  C  2517