Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480726
• Subject: XM_011247446.2
• Aligned Length: 2436
• Identities: 2050
• Gaps: 198

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGAGCCATGGATAACAGAGGCTTTCATCAGGGGAGTTTTAGTAGCTTCCAGAGCAGCTCTAGTGATGAAGA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTTGATGGACATCCCAGGGACTGCTATGGACTTCTCTATGAGAGATGACGTGCCGCCTTTAGATCGAGAAATAG  148

Query    1  --------------------------------------------------ATGGACTTCTTGGAGGAGCCAATC  24
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGGGAACAAGTCATACAATGGTGGTGGAATAGGCTCTTCAAATAGAGTCATGGACTTCTTGGAGGAGCCAATC  222

Query   25  CCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTTCAATACAATTGATTGGGTGAGAGAGAAGTCTCGAGACCGGGATAGGCA  98
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  223  CCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTTCAACACAATTGATTGGGTGAGAGAGAAATCTCGAGACCGAGATAGGCA  296

Query   99  CCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAGAGTCAACATGGGCCTTAATTCACAGTGTGAGTGATGCTTTTTCCGGCT  172
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|
Sbjct  297  CCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAGAGTCAACATGGGCCTTAATTCACAGTGTGAGCGATGCTTTCTCTGGTT  370

Query  173  GGTTGTTGATGCTCCTTATTGGGCTTTTATCAGGTTCGTTAGCTGGTTTGATAGACATCTCTGCTCATTGGATG  246
            |||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  371  GGTTGTTAATGCTCCTTATTGGCCTTTTATCAGGTTCCTTAGCTGGCCTGATAGACATCTCTGCTCACTGGATG  444

Query  247  ACAGACTTAAAAGAAGGTATATGCACAGGGGGATTCTGGTTTAACCATGAACATTGTTGCTGGAACTCTGAGCA  320
            |||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  445  ACAGACTTAAAAGAAGGGATATGTACAGGGGGGTTCTGGTTTAACCATGAGCACTGTTGCTGGAATTCTGAGCA  518

Query  321  TGTCACCTTTGAAGAGAGAGACAAATGTCCAGAGTGGAATAGTTGGTCCCAGCTTATCATCAGCACAGATGAGG  394
            |||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||||..||||||.|||
Sbjct  519  TGTTACCTTTGAACACAGAGACAAATGTCCAGAGTGGAATAGCTGGGCCCAGCTCATCATCAATACAGATCAGG  592

Query  395  GAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTATTTCATGTACGTCCTCTGGGCTCTCCTATTTGCCTTCCTTGCCGTATCT  468
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct  593  GAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTACTTCATGTACGTCCTCTGGGCTCTTCTGTTTGCTTTCCTTGCTGTATCT  666

Query  469  CTTGTCAAGGTGTTTGCGCCTTATGCCTGTGGCTCTGGAATCCCTGAGATAAAAACTATCTTGAGTGGTTTCAT  542
            ||||||||||..|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||
Sbjct  667  CTTGTCAAGGCATTTGCACCTTATGCCTGTGGTTCTGGAATCCCTGAGATCAAAACCATCCTGAGTGGTTTCAT  740

Query  543  TATTAGGGGCTATTTGGGTAAGTGGACTCTGGTTATCAAAACCATCACCTTGGTGCTGGCAGTGTCGTCTGGCT  616
            ||||||.||||||.|||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.|||||||
Sbjct  741  TATTAGAGGCTATCTGGGTAAGTGGACCCTTGTCATCAAAACTATCACTTTGGTGTTGGCGGTGTCATCTGGCT  814

Query  617  TGAGCCTGGGCAAAGAGGGCCCTCTAGTGCACGTGGCTTGCTGCTGTGGGAACATCCTGTGCCACTGCTTCAAC  690
            |||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  815  TGAGCCTGGGCAAGGAGGGCCCCCTGGTGCACGTGGCTTGCTGCTGTGGGAACATCTTGTGCCACTGCTTCAAC  888

Query  691  AAATACAGGAAGAATGAAGCCAAGCGCAGAGAGGTCTTGTCGGCTGCAGCAGCAGCTGGTGTATCTGTAGCCTT  764
            ||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  889  AAATACCGGAAGAATGAAGCCAAGCGGAGAGAGGTCTTATCAGCTGCAGCGGCTGCCGGTGTATCTGTAGCCTT  962

Query  765  TGGAGCACCTATAGGTGGAGTATTATTCAGCCTTGAAGAGGTCAGCTACTATTTTCCCCTCAAAACATTGTGGC  838
            |||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||
Sbjct  963  TGGGGCCCCTATTGGTGGAGTATTATTCAGCCTGGAAGAGGTCAGCTACTACTTTCCCCTCAAAACACTATGGC  1036

Query  839  GTTCATTCTTTGCTGCCTTGGTGGCAGCATTCACTCTACGCTCCATCAATCCATTTGGGAACAGCCGCCTGGTA  912
            ||||.|||||.|||||..||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.|.||.
Sbjct 1037  GTTCTTTCTTCGCTGCTCTGGTGGCAGCGTTCACACTCCGCTCCATCAATCCATTCGGAAACAGCCGCTTAGTT  1110

Query  913  CTATTTTATGTGGAGTTTCACACCCCATGGCATCTCTTTGAGCTCGTGCCATTCATTCTGCTGGGCATATTTGG  986
            ||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||.||
Sbjct 1111  CTGTTTTATGTGGAGTTCCACACCCCGTGGCATCTCTTTGAGCTCGTGCCATTCATTGTACTAGGCATATTCGG  1184

Query  987  TGGTCTGTGGGGAGCACTGTTTATCCGCACAAACATTGCCTGGTGTCGGAAGCGAAAGACCACCCAGTTGGGCA  1060
            |||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 1185  TGGCCTCTGGGGAGCTCTGTTTATCCGCACAAACATTGCCTGGTGTCGGAAGCGTAAAACCACACAGTTGGGCA  1258

Query 1061  AGTATCCTGTTATAGAGGTACTCGTCGTGACAGCCATCACTGCCATCCTGGCTTTCCCCAATGAATACACTCGG  1134
            ||||||||||..|.|||||||||.|.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1259  AGTATCCTGTCGTCGAGGTACTCATTGTGACGGCCATCACTGCCATCTTGGCTTTCCCCAATGAATATACCCGG  1332

Query 1135  ATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGAGCTGTTTAATGACTGTGGCCTTCTGGACTCCTCCAAGCTCTGTGATTA  1208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGAGCTGTTCAATGACTGCGGCCTCCTGGACTCCTCCAAGCTCTGTGATTA  1406

Query 1209  TGAGAACCGTTTCAACACAAGCAAAGGGGGTGAACTGCCTGACAGACCGGCTGGCGTGGGAGTCTACAGTGCAA  1282
            ||||||||..|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||.|
Sbjct 1407  TGAGAACCACTTCAACACAAGCAAAGGCGGTGAGCTGCCTGACAGACCTGCTGGCGTGGGCATCTACAGTGCCA  1480

Query 1283  TGTGGCAGCTGGCTTTAACACTCATACTGAAAATTGTCATTACTATATTCACCTTTGGCATGAAGATCCCTTCT  1356
            ||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481  TGTGGCAGCTGGCTCTGACACTCATACTGAAAATAGTCATTACTATATTCACCTTTGGCATGAAGATTCCTTCT  1554

Query 1357  GGCCTCTTTATCCCTAGCATGGCTGTTGGTGCTATAGCAGGTCGACTTCTAGGAGTAGGAATGGAACAGCTGGC  1430
            ||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1555  GGTCTCTTTATCCCCAGCATGGCTGTCGGTGCTATAGCAGGCCGTCTTTTAGGAGTCGGAATGGAGCAACTGGC  1628

Query 1431  TTATTACCACCAGGAATGGACCGTCTTCAATAGCTGGTGTAGTCAGGGAGCTGATTGCATCACCCCCGGCCTTT  1504
            ||||||||||||.||.|||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1629  TTATTACCACCACGACTGGGGCATCTTCAATAGCTGGTGTAGTCAGGGAGCTGATTGTATCACCCCTGGCCTTT  1702

Query 1505  ATGCAATGGTTGGGGCTGCAGCCTGCTTAGGTGGGGTGACTCGGATGACTGTTTCTCTTGTTGTCATAATGTTT  1578
            ||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATGCCATGGTTGGGGCTGCTGCCTGCTTAGGTGGGGTGACTCGGATGACTGTTTCTCTTGTTGTCATAATGTTT  1776

Query 1579  GAACTGACTGGTGGCTTAGAATACATCGTGCCTCTGATGGCTGCAGCCATGACAAGCAAGTGGGTGGCAGATGC  1652
            |||||||||||||||.|.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1777  GAACTGACTGGTGGCCTGGAATATATTGTGCCTCTGATGGCTGCAGCTATGACAAGCAAGTGGGTGGCCGATGC  1850

Query 1653  TCTTGGGCGGGAGGGCATCTATGATGCCCACATCCGTCTCAATGGATACCCCTTTCTTGAAGCCAAAGAAGAGT  1726
            |||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1851  TCTTGGGCGAGAGGGCATTTATGATGCCCACATCCGTCTCAATGGATACCCCTTTCTTGAAGCCAAAGAAGAAT  1924

Query 1727  TTGCTCATAAGACCCTGGCAATGGATGTGATGAAACCCCGGAGAAATGATCCTTTGTTGACTGTCCTTACTCAG  1800
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1925  TTGCTCATAAGACTCTGGCAATGGATGTGATGAAGCCCCGGAGAAATGACCCCTTGCTGACTGTCCTTACTCAG  1998

Query 1801  GACAGTATGACTGTGGAAGATGTAGAGACCATAATCAGTGAAACCACTTACAGTGGCTTCCCAGTGGTGGTATC  1874
            |||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 1999  GACAGTATGACTGTGGAGGATGTCGAGACCATAATCAGCGAAACCACGTACAGTGGCTTTCCGGTGGTAGTGTC  2072

Query 1875  CCGGGAGTCCCAAAGACTTGTGGGCTTTGTCCTCCGAAGAGATCTCATTATTTCAATTGAAAATGCTCGAAAGA  1948
            |||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2073  CCGAGAGTCGCAAAGACTTGTAGGCTTTGTTCTTCGAAGAGATCTCATTATTTCAATTGAAAATGCTCGGAAGA  2146

Query 1949  AACAGGATGGGGTTGTTAGCACTTCCATCATTTATTTCACGGAGCATTCTCCTCCATTGCCACCATACACTCCA  2022
            |||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.||||||||.|||
Sbjct 2147  AACAGGACGGGGTTGTGAGCACTTCCATCATTTATTTCACGGAGCATTCGCCTCCAATGCCTCCATACACCCCA  2220

Query 2023  CCCACTCTAAAGCTTCGGAACATCCTCGATCTCAGCCCCTTCACTGTGACTGACCTTACACCCATGGAGATCGT  2096
            ||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 2221  CCTACCCTGAAGCTTCGGAACATCCTGGACCTCAGCCCCTTCACTGTGACAGACCTTACGCCAATGGAGATCGT  2294

Query 2097  AGTGGATATTTTCCGAAAGCTGGGACTGCGGCAGTGCCTGGTTACACACAACGGGCGATTGCTTGGAATCATTA  2170
            .|||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 2295  GGTGGACATCTTCCGCAAGCTGGGCCTGCGCCAGTGCCTGGTTACACACAACGGGCGCTTACTTGGAATCATCA  2368

Query 2171  CCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATAGCACAGATGGCGAACCAAGATCCTGATTCCATTCTCTTCAAC  2238
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATAGCACAGATGGCAAACCAAGACCCTGATTCCATTCTCTTCAAC  2436