Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480826
• Subject: XM_006713681.3
• Aligned Length: 1546
• Identities: 1441
• Gaps: 80

Alignment

Query    1  ATGGATGGGACAGAGACCCGGCAGCGGAGGCTGGACAGCTGTGGCAAGCCAGGGGAGCTGGGGCTTCCTCACCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATGGGACAGAGACCCGGCAGCGGAGGCTGGACAGCTGTGGCAAGCCAGGGGAGCTGGGGCTTCCTCACCC  74

Query   75  CCTCAGCACAGGAGGACTCCCTGTAGCCTCAGAAGATGGAGCTCTCAGGGCCCCTGAGAGCCAAAGCGTGACCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCAGCACAGGAGGACTCCCTGTAGCCTCAGAAGATGGAGCTCTCAGGGCCCCTGAGAGCCAAAGCGTGACCC  148

Query  149  CCAAGCCACTGGAGACTGAGCCTAGCAGGGAGACCGCCTGGTCCATAGGCCTTCAGGTGACCATGCCCTTCATG  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  149  CCAAGCCACTGGAGACTGAGCCTAGCAGGGAGACCACCTGGTCCATAGGCCTTCAGGTGACCGTGCCCTTCATG  222

Query  223  TTTGCAGGCCTGGGACTGTCCTGGGCCGGCATGCTTCTGGACTATTTCCAGCACTGGCCTGTGTTTGTGGAGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTTGCAGGCCTGGGACTGTCCTGGGCCGGCATGCTTCTGGACTATTTCCAGCACTGGCCTGTGTTTGTGGAGGT  296

Query  297  GAAAGACCTTTTGACATTGGTGCCGCCCCTGGTGGGCCTGAAGGGGAACCTGGAGATGACACTGGCATCCAGAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAAGACCTTTTGACATTGGTGCCGCCCCTGGTGGGCCTGAAGGGGAACCTGGAGATGACACTGGCATCCAGAC  370

Query  371  TCTCCACAGCTGCCAACACTGGACAAATTGATGACCCCCAGGAGCAGCACAGAGTCATCAGCAGCAACCTGGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTCCACAGCTGCCAACACTGGACAAATTGATGACCCCCAGGAGCAGCACAGAGTCATCAGCAGCAACCTGGCC  444

Query  445  CTCATCCAGGTGCAGGCCACTGTCGTGGGGCTCTTGGCTGCTGTGGCTGCGCTGCTGTTGGGCGTGGTGTCTCG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTCATCCAGGTGCAGGCCACTGTCGTGGGGCTCTTGGCTGCTGTGGCTGCGCTGCTGTTGGGCGTGGTGTCTCG  518

Query  519  AGAGGAAGTGGATGTCGCCAAGGTGGAGTTGCTGTGTGCCAGCAGTGTCCTCACTGCCTTCCTTGCAGCCTTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAGGAAGTGGATGTCGCCAAGGTGGAGTTGCTGTGTGCCAGCAGTGTCCTCACTGCCTTCCTTGCAGCCTTTG  592

Query  593  CCCTGGGGGTGCTGATGGTCTGTATAGTGATTGGTGCTCGAAAGCTCGGGGTCAACCCAGACAACATTGCCACG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCTGGGGGTGCTGATGGTCTGTATAGTGATTGGTGCTCGAAAGCTCGGGGTCAACCCAGACAACATTGCCACG  666

Query  667  CCCATTGCAGCCAGCCTGGGAGACCTCATCACACTGTCCATTCTGGCTTTGGTTAGCAGCTTCTTCTACAGACA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCATTGCAGCCAGCCTGGGAGACCTCATCACACTGTCCATTCTGGCTTTGGTTAGCAGCTTCTTCTACAGACA  740

Query  741  CAAAGATAGTCGGTATCTGACGCCGCTGGTCTGCCTCAGCTTTGCGGCTCTGACCCCAGTGTGGGTCCTCATTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAAAGATAGTCGGTATCTGACGCCGCTGGTCTGCCTCAGCTTTGCGGCTCTGACCCCAGTGTGGGTCCTCATTG  814

Query  815  CCAAGCAGAGCCCACCCATCGTGAAGATCCTGAAGTTTGGCTGGTTCCCAATCATCCTGGCCATGGTCATCAGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCAAGCAGAGCCCACCCATCGTGAAGATCCTGAAGTTTGGCTGGTTCCCAATCATCCTGGCCATGGTCATCAGC  888

Query  889  AGTTTCGGAGGACTCATCTTGAGCAAAACCGTTTCTAAACAGCAGTACAAAGGCATGGCGATATTTACCCCCGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGTTTCGGAGGACTCATCTTGAGCAAAACCGTTTCTAAACAGCAGTACAAAGGCATGGCGATATTTACCCCCGT  962

Query  963  CATATGTGGTGTTGGTGGCAATCTGGTGGCCATTCAGACCAGCCGAATCTCAACCTACCTGCACATGTGGAGTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATATGTGGTGTTGGTGGCAATCTGGTGGCCATTCAGACCAGCCGAATCTCAACCTACCTGCACATGTGGAGTG  1036

Query 1037  CACCTGGCGTCCTGCCCCTCCAGATGAAGAAATTCTGGCCCAACCCGTGTTCTACTTTCTGCACGTCAGAAATC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACCTGGCGTCCTGCCCCTCCAGATGAAGAAATTCTGGCCCAACCCGTGTTCTACTTTCTGCACGTCAGAAATC  1110

Query 1111  AATTCCATGTCAGCTCGAGTCCTGCTCTTGCTGGTGGTCCCAGGCCATCTGATTTTCTTCTACATCATCTACCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AATTCCATGTCAGCTCGAGTCCTGCTCTTGCTGGTGGTCCCAGGCCATCTGATTTTCTTCTACATCATCTACCT  1184

Query 1185  GGTGGAGGGTCAGTCAGTCATAAACAGCCAGACCTTTGTGGTGCTCTACCTGCTGGCAGGCCTGATCCAGGTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGTGGAGGGTCAGTCAGTCATAAACAGCCAGACCTTTGTGGTGCTCTACCTGCTGGCAGGCCTGATCCAGGTGA  1258

Query 1259  CAATCCTGCTGTACCTGGCAGAAGTGATGGTTCGGCTGACTTGGCACCAGGCCCTGGATCCTGACAACCACTGC  1332
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAATCCTGCTGTACCTCGCAGAAGTGATGGTTCGGCTGACTTGGCACCAGGCCCTGGATCCTGACAACCACTGC  1332

Query 1333  ATCCCCTACCTTACAGGGCTGGGGGACCTGCTCGGTACTGGCCTCC-TGG--CACTCTGCTTTTTCACTGACTG  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..| |||| |||  |||.|||||     .|||    
Sbjct 1333  ATCCCCTACCTTACAGGGCTGGGGGACCTGCTCGGTTCAAG-CTCCGTGGGCCACACTGCT-----GCTG----  1396

Query 1404  GCTACTAAGAGCAAGG-------------CAGAGCTGGGTGGCATCTCAGAAC---TGGCATCTGGACCTCCCT  1461
              |.|.|||   ||||             ||| |.|||  |||.||..|.|||   |  ||||||.| |||   
Sbjct 1397  --TGCCAAG---AAGGTGTACAGCCTCCCCAG-GATGG--GGCCTCATACAACCCTT--CATCTGCA-CTC---  1456

Query 1462  AAC---------TGGGCCCCGCTG----------GTCCCATTTGCTCAT-----------------  1491
            |||         | |.||..||||          .|||..||||.|..|                 
Sbjct 1457  AACATTTAATCGT-GTCCTTGCTGTCTTTTTATTTTCCTTTTTGTTTGTTAGCAAAAACCTCTATT  1521