Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000480826
• Subject: XM_017006705.1
• Aligned Length: 1591
• Identities: 1441
• Gaps: 125

Alignment

Query    1  ATGGATGGGACAGAGACCCGGCAGCGGAGGCTGGACAGCTGTGGCAAGCCAGGGGAGCTGGGGCTTCCTCACCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATGGGACAGAGACCCGGCAGCGGAGGCTGGACAGCTGTGGCAAGCCAGGGGAGCTGGGGCTTCCTCACCC  74

Query   75  CCTCAGCACAGGAGGACTCCCTGTAGCCTCAGAAGATGGAGCTCTCAGGGCCCCTGAGAGCCAAAGCGTGACCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCAGCACAGGAGGACTCCCTGTAGCCTCAGAAGATGGAGCTCTCAGGGCCCCTGAGAGCCAAAGCGTGACCC  148

Query  149  CCAAGCCACTGGAGACTGAGCCTAGCAGGGAGACCGCCTGGTCCATAGGCCTTCAGGTGACCATGCCCTTCATG  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  149  CCAAGCCACTGGAGACTGAGCCTAGCAGGGAGACCACCTGGTCCATAGGCCTTCAGGTGACCGTGCCCTTCATG  222

Query  223  TTTGCAGGCCTGGGACTGTCCTGGGCCGGCATGCTTCTGGACTATTTCCAGCACTGGCCTGTGTTTGTGGAGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTTGCAGGCCTGGGACTGTCCTGGGCCGGCATGCTTCTGGACTATTTCCAGCACTGGCCTGTGTTTGTGGAGGT  296

Query  297  GAAAGACCTTTTGACATTGGTGCCGCCCCTGGTGGGCCTGAAGGGGAACCTGGAGATGACACTGGCATCCAGAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAAGACCTTTTGACATTGGTGCCGCCCCTGGTGGGCCTGAAGGGGAACCTGGAGATGACACTGGCATCCAGAC  370

Query  371  TCTCCACAGCT---------------------------------------------GCCAACACTGGACAAATT  399
            |||||||||||                                             ||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTCCACAGCTGTAAGTGGACACCTGGACATTCGAGGCGGCCACAACGTGAGGCAGGCCAACACTGGACAAATT  444

Query  400  GATGACCCCCAGGAGCAGCACAGAGTCATCAGCAGCAACCTGGCCCTCATCCAGGTGCAGGCCACTGTCGTGGG  473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATGACCCCCAGGAGCAGCACAGAGTCATCAGCAGCAACCTGGCCCTCATCCAGGTGCAGGCCACTGTCGTGGG  518

Query  474  GCTCTTGGCTGCTGTGGCTGCGCTGCTGTTGGGCGTGGTGTCTCGAGAGGAAGTGGATGTCGCCAAGGTGGAGT  547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTCTTGGCTGCTGTGGCTGCGCTGCTGTTGGGCGTGGTGTCTCGAGAGGAAGTGGATGTCGCCAAGGTGGAGT  592

Query  548  TGCTGTGTGCCAGCAGTGTCCTCACTGCCTTCCTTGCAGCCTTTGCCCTGGGGGTGCTGATGGTCTGTATAGTG  621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCTGTGTGCCAGCAGTGTCCTCACTGCCTTCCTTGCAGCCTTTGCCCTGGGGGTGCTGATGGTCTGTATAGTG  666

Query  622  ATTGGTGCTCGAAAGCTCGGGGTCAACCCAGACAACATTGCCACGCCCATTGCAGCCAGCCTGGGAGACCTCAT  695
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTGGTGCTCGAAAGCTCGGGGTCAACCCAGACAACATTGCCACGCCCATTGCAGCCAGCCTGGGAGACCTCAT  740

Query  696  CACACTGTCCATTCTGGCTTTGGTTAGCAGCTTCTTCTACAGACACAAAGATAGTCGGTATCTGACGCCGCTGG  769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CACACTGTCCATTCTGGCTTTGGTTAGCAGCTTCTTCTACAGACACAAAGATAGTCGGTATCTGACGCCGCTGG  814

Query  770  TCTGCCTCAGCTTTGCGGCTCTGACCCCAGTGTGGGTCCTCATTGCCAAGCAGAGCCCACCCATCGTGAAGATC  843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTGCCTCAGCTTTGCGGCTCTGACCCCAGTGTGGGTCCTCATTGCCAAGCAGAGCCCACCCATCGTGAAGATC  888

Query  844  CTGAAGTTTGGCTGGTTCCCAATCATCCTGGCCATGGTCATCAGCAGTTTCGGAGGACTCATCTTGAGCAAAAC  917
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGAAGTTTGGCTGGTTCCCAATCATCCTGGCCATGGTCATCAGCAGTTTCGGAGGACTCATCTTGAGCAAAAC  962

Query  918  CGTTTCTAAACAGCAGTACAAAGGCATGGCGATATTTACCCCCGTCATATGTGGTGTTGGTGGCAATCTGGTGG  991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGTTTCTAAACAGCAGTACAAAGGCATGGCGATATTTACCCCCGTCATATGTGGTGTTGGTGGCAATCTGGTGG  1036

Query  992  CCATTCAGACCAGCCGAATCTCAACCTACCTGCACATGTGGAGTGCACCTGGCGTCCTGCCCCTCCAGATGAAG  1065
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCATTCAGACCAGCCGAATCTCAACCTACCTGCACATGTGGAGTGCACCTGGCGTCCTGCCCCTCCAGATGAAG  1110

Query 1066  AAATTCTGGCCCAACCCGTGTTCTACTTTCTGCACGTCAGAAATCAATTCCATGTCAGCTCGAGTCCTGCTCTT  1139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAATTCTGGCCCAACCCGTGTTCTACTTTCTGCACGTCAGAAATCAATTCCATGTCAGCTCGAGTCCTGCTCTT  1184

Query 1140  GCTGGTGGTCCCAGGCCATCTGATTTTCTTCTACATCATCTACCTGGTGGAGGGTCAGTCAGTCATAAACAGCC  1213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCTGGTGGTCCCAGGCCATCTGATTTTCTTCTACATCATCTACCTGGTGGAGGGTCAGTCAGTCATAAACAGCC  1258

Query 1214  AGACCTTTGTGGTGCTCTACCTGCTGGCAGGCCTGATCCAGGTGACAATCCTGCTGTACCTGGCAGAAGTGATG  1287
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1259  AGACCTTTGTGGTGCTCTACCTGCTGGCAGGCCTGATCCAGGTGACAATCCTGCTGTACCTCGCAGAAGTGATG  1332

Query 1288  GTTCGGCTGACTTGGCACCAGGCCCTGGATCCTGACAACCACTGCATCCCCTACCTTACAGGGCTGGGGGACCT  1361
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTTCGGCTGACTTGGCACCAGGCCCTGGATCCTGACAACCACTGCATCCCCTACCTTACAGGGCTGGGGGACCT  1406

Query 1362  GCTCGGTACTGGCCTCC-TGG--CACTCTGCTTTTTCACTGACTGGCTACTAAGAGCAAGG-------------  1419
            |||||||.|..| |||| |||  |||.|||||     .|||      |.|.|||   ||||             
Sbjct 1407  GCTCGGTTCAAG-CTCCGTGGGCCACACTGCT-----GCTG------TGCCAAG---AAGGTGTACAGCCTCCC  1465

Query 1420  CAGAGCTGGGTGGCATCTCAGAAC---TGGCATCTGGACCTCCCTAAC---------TGGGCCCCGCTG-----  1476
            ||| |.|||  |||.||..|.|||   |  ||||||.| |||   |||         | |.||..||||     
Sbjct 1466  CAG-GATGG--GGCCTCATACAACCCTT--CATCTGCA-CTC---AACATTTAATCGT-GTCCTTGCTGTCTTT  1529

Query 1477  -----GTCCCATTTGCTCAT-----------------  1491
                 .|||..||||.|..|                 
Sbjct 1530  TTATTTTCCTTTTTGTTTGTTAGCAAAAACCTCTATT  1566