Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481095
• Subject: NM_019707.5
• Aligned Length: 2149
• Identities: 1870
• Gaps: 17

Alignment

Query    1  ATGCAGCCGAGAACTCCGCTCGTTCTGTGCGTTCTCCTGTCCCAGGTGCTGCTGCTAACATCTGCAGAAGATTT  74
            |||||||||||||||||||||...||||||||.||.||||||||||||||.|||.|.||.||||||||.|||.|
Sbjct    1  ATGCAGCCGAGAACTCCGCTCACCCTGTGCGTCCTGCTGTCCCAGGTGCTCCTGGTCACGTCTGCAGATGATCT  74

Query   75  GGACTGCACTCCTGGATTTCAGCAGAAAGTGTTCCATATCAATCAGCCAGCTGAATTCATTGAGGACCAGTCAA  148
            |||.|||||.||||||||.||||.|||||||||.||.|||.|.|||||.||.||||||||.|||||||||.|..
Sbjct   75  GGAGTGCACCCCTGGATTCCAGCGGAAAGTGTTACACATCCACCAGCCTGCCGAATTCATCGAGGACCAGCCTG  148

Query  149  TTCTAAACTTGACCTTCAGTGACTGTAAGGGAAACGACAAGCTACGCTATGAGGTCTCGAGCCCATACTTCAAG  222
            |.||||||||||||||||.||||||.|||||.|||||.|||||.|.|||.||||||||.||||||.||||||||
Sbjct  149  TCCTAAACTTGACCTTCAATGACTGCAAGGGCAACGAGAAGCTGCACTACGAGGTCTCAAGCCCACACTTCAAG  222

Query  223  GTGAACAGCGATGGCGGCTTAGTTGCTCTGAGAAACATAACTGCAGTGGGCAAAACTCTGTTCGTCCATGCACG  296
            |||||||||||.|||..||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||..||.|||||.||||||||..|
Sbjct  223  GTGAACAGCGACGGCACCTTAGTGGCTCTCAGGAACATCACTGCGGTGGGCAGGACCCTGTTTGTCCATGCGAG  296

Query  297  GACCCCCCATGCGGAAGATATGGCAGAACTCGTGATTGTCGGGGGGAAAGACATCCAGGGCTCCTTGCAGGATA  370
            |||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACTCCTCATGCTGAAGACATGGCAGAACTCGTGATTGTCGGGGGCAAAGACATCCAGGGCTCCTTGCAGGATA  370

Query  371  TATTTAAATTTGCAAGAACTTCTCCTGTCCCAAGACAAAAGAGGTCCATTGTGGTATCTCCCATTTTAATTCCA  444
            |.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||
Sbjct  371  TCTTTAAATTTGCAAGGACATCTCCTGTCCCAAGACAAAAGAGGTCCATTGTGGTGTCCCCCATCTTGATCCCA  444

Query  445  GAGAATCAGAGACAGCCTTTCCCAAGAGATGTTGGCAAGGTAGTCGATAGTGACAGGCCAGAAAGGTCCAAGTT  518
            |||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||.||||||||||
Sbjct  445  GAGAACCAGAGACAGCCCTTCCCCAGAGATGTCGGCAAGGTAGTCGATAGCGACAGACCCGAAGGGTCCAAGTT  518

Query  519  CCGGCTCACTGGAAAGGGAGTGGATCAAGAGCCTAAAGGAATTTTCAGAATCAATGAGAACACAGGGAGCGTCT  592
            |||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  519  CCGGCTCACCGGGAAGGGAGTGGATCAAGACCCTAAAGGAACTTTCAGAATCAATGAGAACACAGGCAGTGTCT  592

Query  593  CCATGACACGGACCTTGGACAGAGAAGTAATCGCTGTTTATCAACTATTTGTGGAGACCACTGATGTCAATGGC  666
            ||.|||||||||||.|||||||||||...||||||..|||||||||.|.||||||.|||||.||||.||.||||
Sbjct  593  CCGTGACACGGACCCTGGACAGAGAAACGATCGCTACTTATCAACTGTATGTGGAAACCACGGATGCCAGTGGC  666

Query  667  AAAACTCTCGAGGGGCCGGTGCCTCTGGAAGTCATTGTGATTGATCAGAATGACAACCGACCGATCTTTCGGGA  740
            ||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.|||||
Sbjct  667  AAAACTCTGGAAGGGCCAGTGCCTCTGGAAGTCATTGTGATTGACCAGAACGACAACAGACCCATCTTCCGGGA  740

Query  741  AGGCCCCTACATCGGCCACGTCATGGAAGGGTCACCCACAGGCACCACAGTGATGCGGATGACAGCCTTTGATG  814
            ||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  741  AGGCCCTTACATCGGCCATGTCATGGAAGGGTCACCCACAGGGACCACGGTGATGCGGATGACAGCGTTTGATG  814

Query  815  CAGATGACCCAGCCACCGATAATGCCCTCCTGCGGTATAATATCCGTCGGCAGACGCCTGACAAGCCATCTCCC  888
            ||||||||||.||.||.||.|||||.||||||.||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  815  CAGATGACCCGGCTACTGACAATGCTCTCCTGAGGTACAACATCCGTCAGCAGACGCCTGACAAGCCATCTCCT  888

Query  889  AACATGTTCTACATCGATCCTGAGAAAGGAGACATTGTCACTGTTGTGTCACCTGCGCTGCTGGACCGAGAGAC  962
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  AACATGTTCTACATCGATCCCGAGAAAGGAGACATTGTCACCGTGGTGTCACCTGCGCTGCTGGACCGGGAGAC  962

Query  963  TCTGGAAAATCCCAAGTATGAACTGATCATCGAGGCTCAAGATATGGCTGGACTGGATGTTGGATTAACAGGCA  1036
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||.|||.|.|||||||
Sbjct  963  TCTGGAAAACCCCAAGTATGAACTGATCATCGAAGCTCAAGATATGGCAGGATTGGATGTCGGACTGACAGGCA  1036

Query 1037  CGGCCACAGCCACGATCATGATCGATGACAAAAATGATCACTCACCAAAATTCACCAAGAAAGAGTTTCAAGCC  1110
            |.|||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGCCACAGCCACCATCGTGATCGATGACAAAAATGATCACTCACCAAAATTCACCAAGAAAGAGTTTCAAGCC  1110

Query 1111  ACAGTCGAGGAAGGAGCTGTGGGAGTTATTGTCAATTTGACAGTTGAAGATAAGGATGACCCCGCCACAGGTGC  1184
            |||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||..|||||||.||
Sbjct 1111  ACAGTGGAGGAGGGAGCTGTGGGGGTCATTGTCAACTTGACAGTGGAAGACAAAGACGACCCTACCACAGGAGC  1184

Query 1185  ATGGAGGGCTGCCTACACCATCATCAACGGAAACCCCGGGCAGAGCTTTGAAATCCACACCAACCCTCAAACCA  1258
            .|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1185  CTGGAGGGCTGCATACACCATCATCAATGGAAATCCTGGGCAGAGCTTCGAGATCCACACCAACCCACAGACCA  1258

Query 1259  ACGAAGGGATGCTTTCTGTTGTCAAACCATTGGACTATGAAATTTCTGCCTTCCACACCCTGCTGATCAAAGTG  1332
            ||||.||.|||||.|||||.|||||.||..||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACGAGGGCATGCTCTCTGTGGTCAAGCCCCTGGACTATGAGATCTCTGCCTTTCACACCCTGCTGATCAAAGTG  1332

Query 1333  GAAAATGAAGACCCACTCGTACCCGACGTCTCCTACGGCCCCAGCTCCACAGCCACCGTCCACATCACTGTCCT  1406
            ||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1333  GAGAATGAGGACCCACTGGTACCCGACGTCTCCTATGGCCCCAGCTCCACGGCAACTGTCCACATCACAGTCCT  1406

Query 1407  GGATGTCAACGAGGGCCCAGTCTTCTACCCAGACCCCATGATGGTGACCAGGCAGGAGGACCTCTCTGTGGGCA  1480
            |||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|..||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1407  GGATGTCAACGAGGGACCAGTCTTCTACCCGGACCCCATGATGGTGACTAAACAGGAGAACATCTCTGTGGGCA  1480

Query 1481  GCGTGCTGCTGACAGTGAATGCCACGGACCCCGACTCCCTGCAGCATCAAACCATCAGGTATTCTGTTTACAAG  1554
            |.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||.|.||||||
Sbjct 1481  GTGTGCTGCTGACAGTGAATGCCACAGACCCAGACTCCCTGCAACATCAAACTATCAGGTACTCTATCTACAAG  1554

Query 1555  GACCCAGCAGGTTGGCTGAATATTAACCCCATCAATGGGACTGTTGACACCACAGCTGTGCTGGACCGTGAGTC  1628
            |||||||||||.|||||||.|||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 1555  GACCCAGCAGGCTGGCTGAGTATCAACCCCATCAATGGAACGGTGGACACCACAGCTGTGTTGGACCGGGAGTC  1628

Query 1629  CACATTTGTCGACAACAGCGTGTACACTGCTCTCTTCCTGGCAATTGACAGTGGCAACCCTCCCGCTACGGGCA  1702
            |.||||.|||.|||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct 1629  CCCATTCGTCCACAACAGTGTGTACACGGCCCTGTTCCTGGCCATCGACAGTGGCAACCCTCCTGCAACTGGCA  1702

Query 1703  CTGGGACTTTGCTGATAACCCTGGAGGACGTGAATGACAATGCCCCGTTCATTTACCCCACAGTAGCTGAAGTC  1776
            |.||||||.|||||||||||||.||||||.|.||||||||.||.||..||||||||||.||.||.|||||.|||
Sbjct 1703  CCGGGACTCTGCTGATAACCCTAGAGGACATTAATGACAACGCTCCTGTCATTTACCCAACTGTGGCTGAGGTC  1776

Query 1777  TGTGATGATGCCAAAAACCTCAGTGTAGTCATTTTGGGAGCATCAGATAAGGATCTTCACCCGAATACAGATCC  1850
            ||.||||||||||.|||||||||.||.||||||.||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1777  TGCGATGATGCCAGAAACCTCAGCGTGGTCATTCTGGGGGCTTCGGACAAGGACCTTCACCCCAACACAGACCC  1850

Query 1851  TTTCAAATTTGAAATCCACAAACAAGCTGTTCCTGATAAAGTCTGGAAGATCTCCAAGATCAACAATACACACG  1924
            .|||||.|||||.||.||.|||||..|.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1851  CTTCAAGTTTGAGATTCATAAACAGACAGTCCCTGATAAAGTCTGGAAGATCTCCAAAATCAACAACACCCACG  1924

Query 1925  CCCTGGTAAGCCTTCTTCAAAATCTGAACAAAGCAAACTACAACCTGCCCATCATGGTGACAGATTCAGGGAAA  1998
            ||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1925  CCCTCGTGAGCCTTCTTCAGAATCTGAACAAGGCAAACTACAACCTGCCCATCATGGTGACAGATTCAGGGAAG  1998

Query 1999  CCACCCATGACGAATATCACAGATCTCAGGGTACAAGTGTGCTCCTGCAGGAATTCCAAAGTGGACTGCAACGC  2072
            ||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||.|||.|||||||||||||||||||.
Sbjct 1999  CCACCCATGACGAACATCACGGACCTCAGGGTGCAGGTGTGCTCTTGCAAGAACTCCAAAGTGGACTGCAACGG  2072

Query 2073  GGCGGGGGCCCTGCGCTTCAGCCTGCCCTCAG-----TCCTGCTCCTCAGCCTCTTCAGCTTAGCTTGTCTG--  2139
            |||.||||||||||.|.||||     ||||||     |.||||||.||...|||.||||||||  |||||.|  
Sbjct 2073  GGCTGGGGCCCTGCACCTCAG-----CCTCAGCTTGCTGCTGCTCTTCTCTCTCCTCAGCTTA--TTGTCAGGT  2139

Query 2140  ---  2139
               
Sbjct 2140  CTG  2142