Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481095
• Subject: XM_006530628.3
• Aligned Length: 2149
• Identities: 1835
• Gaps: 56

Alignment

Query    1  ATGCAGCCGAGAACTCCGCTCGTTCTGTGCGTTCTCCTGTCCCAGGTGCTGCTGCTAACATCTGCAGAAGATTT  74
                                                .||   ||||||||.|||.|.||.||||||||.|||.|
Sbjct    1  ------------------------------------ATG---CAGGTGCTCCTGGTCACGTCTGCAGATGATCT  35

Query   75  GGACTGCACTCCTGGATTTCAGCAGAAAGTGTTCCATATCAATCAGCCAGCTGAATTCATTGAGGACCAGTCAA  148
            |||.|||||.||||||||.||||.|||||||||.||.|||.|.|||||.||.||||||||.|||||||||.|..
Sbjct   36  GGAGTGCACCCCTGGATTCCAGCGGAAAGTGTTACACATCCACCAGCCTGCCGAATTCATCGAGGACCAGCCTG  109

Query  149  TTCTAAACTTGACCTTCAGTGACTGTAAGGGAAACGACAAGCTACGCTATGAGGTCTCGAGCCCATACTTCAAG  222
            |.||||||||||||||||.||||||.|||||.|||||.|||||.|.|||.||||||||.||||||.||||||||
Sbjct  110  TCCTAAACTTGACCTTCAATGACTGCAAGGGCAACGAGAAGCTGCACTACGAGGTCTCAAGCCCACACTTCAAG  183

Query  223  GTGAACAGCGATGGCGGCTTAGTTGCTCTGAGAAACATAACTGCAGTGGGCAAAACTCTGTTCGTCCATGCACG  296
            |||||||||||.|||..||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||..||.|||||.||||||||..|
Sbjct  184  GTGAACAGCGACGGCACCTTAGTGGCTCTCAGGAACATCACTGCGGTGGGCAGGACCCTGTTTGTCCATGCGAG  257

Query  297  GACCCCCCATGCGGAAGATATGGCAGAACTCGTGATTGTCGGGGGGAAAGACATCCAGGGCTCCTTGCAGGATA  370
            |||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  258  GACTCCTCATGCTGAAGACATGGCAGAACTCGTGATTGTCGGGGGCAAAGACATCCAGGGCTCCTTGCAGGATA  331

Query  371  TATTTAAATTTGCAAGAACTTCTCCTGTCCCAAGACAAAAGAGGTCCATTGTGGTATCTCCCATTTTAATTCCA  444
            |.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||
Sbjct  332  TCTTTAAATTTGCAAGGACATCTCCTGTCCCAAGACAAAAGAGGTCCATTGTGGTGTCCCCCATCTTGATCCCA  405

Query  445  GAGAATCAGAGACAGCCTTTCCCAAGAGATGTTGGCAAGGTAGTCGATAGTGACAGGCCAGAAAGGTCCAAGTT  518
            |||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||.||||||||||
Sbjct  406  GAGAACCAGAGACAGCCCTTCCCCAGAGATGTCGGCAAGGTAGTCGATAGCGACAGACCCGAAGGGTCCAAGTT  479

Query  519  CCGGCTCACTGGAAAGGGAGTGGATCAAGAGCCTAAAGGAATTTTCAGAATCAATGAGAACACAGGGAGCGTCT  592
            |||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  480  CCGGCTCACCGGGAAGGGAGTGGATCAAGACCCTAAAGGAACTTTCAGAATCAATGAGAACACAGGCAGTGTCT  553

Query  593  CCATGACACGGACCTTGGACAGAGAAGTAATCGCTGTTTATCAACTATTTGTGGAGACCACTGATGTCAATGGC  666
            ||.|||||||||||.|||||||||||...||||||..|||||||||.|.||||||.|||||.||||.||.||||
Sbjct  554  CCGTGACACGGACCCTGGACAGAGAAACGATCGCTACTTATCAACTGTATGTGGAAACCACGGATGCCAGTGGC  627

Query  667  AAAACTCTCGAGGGGCCGGTGCCTCTGGAAGTCATTGTGATTGATCAGAATGACAACCGACCGATCTTTCGGGA  740
            ||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.|||||
Sbjct  628  AAAACTCTGGAAGGGCCAGTGCCTCTGGAAGTCATTGTGATTGACCAGAACGACAACAGACCCATCTTCCGGGA  701

Query  741  AGGCCCCTACATCGGCCACGTCATGGAAGGGTCACCCACAGGCACCACAGTGATGCGGATGACAGCCTTTGATG  814
            ||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  702  AGGCCCTTACATCGGCCATGTCATGGAAGGGTCACCCACAGGGACCACGGTGATGCGGATGACAGCGTTTGATG  775

Query  815  CAGATGACCCAGCCACCGATAATGCCCTCCTGCGGTATAATATCCGTCGGCAGACGCCTGACAAGCCATCTCCC  888
            ||||||||||.||.||.||.|||||.||||||.||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  776  CAGATGACCCGGCTACTGACAATGCTCTCCTGAGGTACAACATCCGTCAGCAGACGCCTGACAAGCCATCTCCT  849

Query  889  AACATGTTCTACATCGATCCTGAGAAAGGAGACATTGTCACTGTTGTGTCACCTGCGCTGCTGGACCGAGAGAC  962
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  850  AACATGTTCTACATCGATCCCGAGAAAGGAGACATTGTCACCGTGGTGTCACCTGCGCTGCTGGACCGGGAGAC  923

Query  963  TCTGGAAAATCCCAAGTATGAACTGATCATCGAGGCTCAAGATATGGCTGGACTGGATGTTGGATTAACAGGCA  1036
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||.|||.|.|||||||
Sbjct  924  TCTGGAAAACCCCAAGTATGAACTGATCATCGAAGCTCAAGATATGGCAGGATTGGATGTCGGACTGACAGGCA  997

Query 1037  CGGCCACAGCCACGATCATGATCGATGACAAAAATGATCACTCACCAAAATTCACCAAGAAAGAGTTTCAAGCC  1110
            |.|||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  998  CAGCCACAGCCACCATCGTGATCGATGACAAAAATGATCACTCACCAAAATTCACCAAGAAAGAGTTTCAAGCC  1071

Query 1111  ACAGTCGAGGAAGGAGCTGTGGGAGTTATTGTCAATTTGACAGTTGAAGATAAGGATGACCCCGCCACAGGTGC  1184
            |||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||..|||||||.||
Sbjct 1072  ACAGTGGAGGAGGGAGCTGTGGGGGTCATTGTCAACTTGACAGTGGAAGACAAAGACGACCCTACCACAGGAGC  1145

Query 1185  ATGGAGGGCTGCCTACACCATCATCAACGGAAACCCCGGGCAGAGCTTTGAAATCCACACCAACCCTCAAACCA  1258
            .|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1146  CTGGAGGGCTGCATACACCATCATCAATGGAAATCCTGGGCAGAGCTTCGAGATCCACACCAACCCACAGACCA  1219

Query 1259  ACGAAGGGATGCTTTCTGTTGTCAAACCATTGGACTATGAAATTTCTGCCTTCCACACCCTGCTGATCAAAGTG  1332
            ||||.||.|||||.|||||.|||||.||..||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1220  ACGAGGGCATGCTCTCTGTGGTCAAGCCCCTGGACTATGAGATCTCTGCCTTTCACACCCTGCTGATCAAAGTG  1293

Query 1333  GAAAATGAAGACCCACTCGTACCCGACGTCTCCTACGGCCCCAGCTCCACAGCCACCGTCCACATCACTGTCCT  1406
            ||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1294  GAGAATGAGGACCCACTGGTACCCGACGTCTCCTATGGCCCCAGCTCCACGGCAACTGTCCACATCACAGTCCT  1367

Query 1407  GGATGTCAACGAGGGCCCAGTCTTCTACCCAGACCCCATGATGGTGACCAGGCAGGAGGACCTCTCTGTGGGCA  1480
            |||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|..||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1368  GGATGTCAACGAGGGACCAGTCTTCTACCCGGACCCCATGATGGTGACTAAACAGGAGAACATCTCTGTGGGCA  1441

Query 1481  GCGTGCTGCTGACAGTGAATGCCACGGACCCCGACTCCCTGCAGCATCAAACCATCAGGTATTCTGTTTACAAG  1554
            |.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||.|.||||||
Sbjct 1442  GTGTGCTGCTGACAGTGAATGCCACAGACCCAGACTCCCTGCAACATCAAACTATCAGGTACTCTATCTACAAG  1515

Query 1555  GACCCAGCAGGTTGGCTGAATATTAACCCCATCAATGGGACTGTTGACACCACAGCTGTGCTGGACCGTGAGTC  1628
            |||||||||||.|||||||.|||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|||||||.|||||
Sbjct 1516  GACCCAGCAGGCTGGCTGAGTATCAACCCCATCAATGGAACGGTGGACACCACAGCTGTGTTGGACCGGGAGTC  1589

Query 1629  CACATTTGTCGACAACAGCGTGTACACTGCTCTCTTCCTGGCAATTGACAGTGGCAACCCTCCCGCTACGGGCA  1702
            |.||||.|||.|||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct 1590  CCCATTCGTCCACAACAGTGTGTACACGGCCCTGTTCCTGGCCATCGACAGTGGCAACCCTCCTGCAACTGGCA  1663

Query 1703  CTGGGACTTTGCTGATAACCCTGGAGGACGTGAATGACAATGCCCCGTTCATTTACCCCACAGTAGCTGAAGTC  1776
            |.||||||.|||||||||||||.||||||.|.||||||||.||.||..||||||||||.||.||.|||||.|||
Sbjct 1664  CCGGGACTCTGCTGATAACCCTAGAGGACATTAATGACAACGCTCCTGTCATTTACCCAACTGTGGCTGAGGTC  1737

Query 1777  TGTGATGATGCCAAAAACCTCAGTGTAGTCATTTTGGGAGCATCAGATAAGGATCTTCACCCGAATACAGATCC  1850
            ||.||||||||||.|||||||||.||.||||||.||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1738  TGCGATGATGCCAGAAACCTCAGCGTGGTCATTCTGGGGGCTTCGGACAAGGACCTTCACCCCAACACAGACCC  1811

Query 1851  TTTCAAATTTGAAATCCACAAACAAGCTGTTCCTGATAAAGTCTGGAAGATCTCCAAGATCAACAATACACACG  1924
            .|||||.|||||.||.||.|||||..|.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1812  CTTCAAGTTTGAGATTCATAAACAGACAGTCCCTGATAAAGTCTGGAAGATCTCCAAAATCAACAACACCCACG  1885

Query 1925  CCCTGGTAAGCCTTCTTCAAAATCTGAACAAAGCAAACTACAACCTGCCCATCATGGTGACAGATTCAGGGAAA  1998
            ||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1886  CCCTCGTGAGCCTTCTTCAGAATCTGAACAAGGCAAACTACAACCTGCCCATCATGGTGACAGATTCAGGGAAG  1959

Query 1999  CCACCCATGACGAATATCACAGATCTCAGGGTACAAGTGTGCTCCTGCAGGAATTCCAAAGTGGACTGCAACGC  2072
            ||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||.|||.|||||||||||||||||||.
Sbjct 1960  CCACCCATGACGAACATCACGGACCTCAGGGTGCAGGTGTGCTCTTGCAAGAACTCCAAAGTGGACTGCAACGG  2033

Query 2073  GGCGGGGGCCCTGCGCTTCAGCCTGCCCTCAG-----TCCTGCTCCTCAGCCTCTTCAGCTTAGCTTGTCTG--  2139
            |||.||||||||||.|.||||     ||||||     |.||||||.||...|||.||||||||  |||||.|  
Sbjct 2034  GGCTGGGGCCCTGCACCTCAG-----CCTCAGCTTGCTGCTGCTCTTCTCTCTCCTCAGCTTA--TTGTCAGGT  2100

Query 2140  ---  2139
               
Sbjct 2101  CTG  2103