Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000481095
- Subject:
- XM_011248295.1
- Aligned Length:
- 2168
- Identities:
- 1798
- Gaps:
- 118
Alignment
Query 1 ATGCAGCCGAGAACTCCGCTCGTTCTGTGCGTTCTCCTGTCCCAGGTGCTGCTGCTAACATCTGCAGAAGATTT 74
|||.||.|.|||| ||.||||
Sbjct 1 ATGAAGTCAAGAA---------------------------------------------------CAAAAGA--- 20
Query 75 GGACTGCACTCCTGGATTTCAGCAGAAAGTGTTCCATATCAATCAGCCAGCTGAATTCATTG--AGGACCAG-- 144
.|| ||.|||||| ||| ||.||.|.||| ||||||.||.|| .||..|.|
Sbjct 21 -AAC----CTGCTGGAT----------AGT--------TCTATTACCCA-CTGAATGCAATGTATGGTGCTGTC 70
Query 145 --------TCAATTCTAAACT-------TGACCTTCAGTGACTGTAAGGGAAACGACAAGCTACGCTATGAGGT 203
||.||| ||| |||||||||.||||||.|||||.|||||.|||||.|.|||.|||||
Sbjct 71 TCTGTGGCTCCATT----ACTGATGATGTGACCTTCAATGACTGCAAGGGCAACGAGAAGCTGCACTACGAGGT 140
Query 204 CTCGAGCCCATACTTCAAGGTGAACAGCGATGGCGGCTTAGTTGCTCTGAGAAACATAACTGCAGTGGGCAAAA 277
|||.||||||.|||||||||||||||||||.|||..||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||..|
Sbjct 141 CTCAAGCCCACACTTCAAGGTGAACAGCGACGGCACCTTAGTGGCTCTCAGGAACATCACTGCGGTGGGCAGGA 214
Query 278 CTCTGTTCGTCCATGCACGGACCCCCCATGCGGAAGATATGGCAGAACTCGTGATTGTCGGGGGGAAAGACATC 351
|.|||||.||||||||..||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 215 CCCTGTTTGTCCATGCGAGGACTCCTCATGCTGAAGACATGGCAGAACTCGTGATTGTCGGGGGCAAAGACATC 288
Query 352 CAGGGCTCCTTGCAGGATATATTTAAATTTGCAAGAACTTCTCCTGTCCCAAGACAAAAGAGGTCCATTGTGGT 425
||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 289 CAGGGCTCCTTGCAGGATATCTTTAAATTTGCAAGGACATCTCCTGTCCCAAGACAAAAGAGGTCCATTGTGGT 362
Query 426 ATCTCCCATTTTAATTCCAGAGAATCAGAGACAGCCTTTCCCAAGAGATGTTGGCAAGGTAGTCGATAGTGACA 499
.||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 363 GTCCCCCATCTTGATCCCAGAGAACCAGAGACAGCCCTTCCCCAGAGATGTCGGCAAGGTAGTCGATAGCGACA 436
Query 500 GGCCAGAAAGGTCCAAGTTCCGGCTCACTGGAAAGGGAGTGGATCAAGAGCCTAAAGGAATTTTCAGAATCAAT 573
|.||.|||.|||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 437 GACCCGAAGGGTCCAAGTTCCGGCTCACCGGGAAGGGAGTGGATCAAGACCCTAAAGGAACTTTCAGAATCAAT 510
Query 574 GAGAACACAGGGAGCGTCTCCATGACACGGACCTTGGACAGAGAAGTAATCGCTGTTTATCAACTATTTGTGGA 647
|||||||||||.||.||||||.|||||||||||.|||||||||||...||||||..|||||||||.|.||||||
Sbjct 511 GAGAACACAGGCAGTGTCTCCGTGACACGGACCCTGGACAGAGAAACGATCGCTACTTATCAACTGTATGTGGA 584
Query 648 GACCACTGATGTCAATGGCAAAACTCTCGAGGGGCCGGTGCCTCTGGAAGTCATTGTGATTGATCAGAATGACA 721
.|||||.||||.||.||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 585 AACCACGGATGCCAGTGGCAAAACTCTGGAAGGGCCAGTGCCTCTGGAAGTCATTGTGATTGACCAGAACGACA 658
Query 722 ACCGACCGATCTTTCGGGAAGGCCCCTACATCGGCCACGTCATGGAAGGGTCACCCACAGGCACCACAGTGATG 795
||.||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 659 ACAGACCCATCTTCCGGGAAGGCCCTTACATCGGCCATGTCATGGAAGGGTCACCCACAGGGACCACGGTGATG 732
Query 796 CGGATGACAGCCTTTGATGCAGATGACCCAGCCACCGATAATGCCCTCCTGCGGTATAATATCCGTCGGCAGAC 869
|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||.||||.||.|||||||.||||||
Sbjct 733 CGGATGACAGCGTTTGATGCAGATGACCCGGCTACTGACAATGCTCTCCTGAGGTACAACATCCGTCAGCAGAC 806
Query 870 GCCTGACAAGCCATCTCCCAACATGTTCTACATCGATCCTGAGAAAGGAGACATTGTCACTGTTGTGTCACCTG 943
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 807 GCCTGACAAGCCATCTCCTAACATGTTCTACATCGATCCCGAGAAAGGAGACATTGTCACCGTGGTGTCACCTG 880
Query 944 CGCTGCTGGACCGAGAGACTCTGGAAAATCCCAAGTATGAACTGATCATCGAGGCTCAAGATATGGCTGGACTG 1017
|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||
Sbjct 881 CGCTGCTGGACCGGGAGACTCTGGAAAACCCCAAGTATGAACTGATCATCGAAGCTCAAGATATGGCAGGATTG 954
Query 1018 GATGTTGGATTAACAGGCACGGCCACAGCCACGATCATGATCGATGACAAAAATGATCACTCACCAAAATTCAC 1091
|||||.|||.|.||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 955 GATGTCGGACTGACAGGCACAGCCACAGCCACCATCGTGATCGATGACAAAAATGATCACTCACCAAAATTCAC 1028
Query 1092 CAAGAAAGAGTTTCAAGCCACAGTCGAGGAAGGAGCTGTGGGAGTTATTGTCAATTTGACAGTTGAAGATAAGG 1165
||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.|
Sbjct 1029 CAAGAAAGAGTTTCAAGCCACAGTGGAGGAGGGAGCTGTGGGGGTCATTGTCAACTTGACAGTGGAAGACAAAG 1102
Query 1166 ATGACCCCGCCACAGGTGCATGGAGGGCTGCCTACACCATCATCAACGGAAACCCCGGGCAGAGCTTTGAAATC 1239
|.|||||..|||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1103 ACGACCCTACCACAGGAGCCTGGAGGGCTGCATACACCATCATCAATGGAAATCCTGGGCAGAGCTTCGAGATC 1176
Query 1240 CACACCAACCCTCAAACCAACGAAGGGATGCTTTCTGTTGTCAAACCATTGGACTATGAAATTTCTGCCTTCCA 1313
|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||..||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 1177 CACACCAACCCACAGACCAACGAGGGCATGCTCTCTGTGGTCAAGCCCCTGGACTATGAGATCTCTGCCTTTCA 1250
Query 1314 CACCCTGCTGATCAAAGTGGAAAATGAAGACCCACTCGTACCCGACGTCTCCTACGGCCCCAGCTCCACAGCCA 1387
|||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 1251 CACCCTGCTGATCAAAGTGGAGAATGAGGACCCACTGGTACCCGACGTCTCCTATGGCCCCAGCTCCACGGCAA 1324
Query 1388 CCGTCCACATCACTGTCCTGGATGTCAACGAGGGCCCAGTCTTCTACCCAGACCCCATGATGGTGACCAGGCAG 1461
|.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|..|||
Sbjct 1325 CTGTCCACATCACAGTCCTGGATGTCAACGAGGGACCAGTCTTCTACCCGGACCCCATGATGGTGACTAAACAG 1398
Query 1462 GAGGACCTCTCTGTGGGCAGCGTGCTGCTGACAGTGAATGCCACGGACCCCGACTCCCTGCAGCATCAAACCAT 1535
|||.||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1399 GAGAACATCTCTGTGGGCAGTGTGCTGCTGACAGTGAATGCCACAGACCCAGACTCCCTGCAACATCAAACTAT 1472
Query 1536 CAGGTATTCTGTTTACAAGGACCCAGCAGGTTGGCTGAATATTAACCCCATCAATGGGACTGTTGACACCACAG 1609
||||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||.|||.||||||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 1473 CAGGTACTCTATCTACAAGGACCCAGCAGGCTGGCTGAGTATCAACCCCATCAATGGAACGGTGGACACCACAG 1546
Query 1610 CTGTGCTGGACCGTGAGTCCACATTTGTCGACAACAGCGTGTACACTGCTCTCTTCCTGGCAATTGACAGTGGC 1683
|||||.|||||||.||||||.||||.|||.|||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1547 CTGTGTTGGACCGGGAGTCCCCATTCGTCCACAACAGTGTGTACACGGCCCTGTTCCTGGCCATCGACAGTGGC 1620
Query 1684 AACCCTCCCGCTACGGGCACTGGGACTTTGCTGATAACCCTGGAGGACGTGAATGACAATGCCCCGTTCATTTA 1757
||||||||.||.||.|||||.||||||.|||||||||||||.||||||.|.||||||||.||.||..|||||||
Sbjct 1621 AACCCTCCTGCAACTGGCACCGGGACTCTGCTGATAACCCTAGAGGACATTAATGACAACGCTCCTGTCATTTA 1694
Query 1758 CCCCACAGTAGCTGAAGTCTGTGATGATGCCAAAAACCTCAGTGTAGTCATTTTGGGAGCATCAGATAAGGATC 1831
|||.||.||.|||||.|||||.||||||||||.|||||||||.||.||||||.||||.||.||.||.|||||.|
Sbjct 1695 CCCAACTGTGGCTGAGGTCTGCGATGATGCCAGAAACCTCAGCGTGGTCATTCTGGGGGCTTCGGACAAGGACC 1768
Query 1832 TTCACCCGAATACAGATCCTTTCAAATTTGAAATCCACAAACAAGCTGTTCCTGATAAAGTCTGGAAGATCTCC 1905
|||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||..|.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1769 TTCACCCCAACACAGACCCCTTCAAGTTTGAGATTCATAAACAGACAGTCCCTGATAAAGTCTGGAAGATCTCC 1842
Query 1906 AAGATCAACAATACACACGCCCTGGTAAGCCTTCTTCAAAATCTGAACAAAGCAAACTACAACCTGCCCATCAT 1979
||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1843 AAAATCAACAACACCCACGCCCTCGTGAGCCTTCTTCAGAATCTGAACAAGGCAAACTACAACCTGCCCATCAT 1916
Query 1980 GGTGACAGATTCAGGGAAACCACCCATGACGAATATCACAGATCTCAGGGTACAAGTGTGCTCCTGCAGGAATT 2053
||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||.|||.|
Sbjct 1917 GGTGACAGATTCAGGGAAGCCACCCATGACGAACATCACGGACCTCAGGGTGCAGGTGTGCTCTTGCAAGAACT 1990
Query 2054 CCAAAGTGGACTGCAACGCGGCGGGGGCCCTGCGCTTCAGCCTGCCCTCAG-----TCCTGCTCCTCAGCCTCT 2122
||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|.|||| |||||| |.||||||.||...|||.
Sbjct 1991 CCAAAGTGGACTGCAACGGGGCTGGGGCCCTGCACCTCAG-----CCTCAGCTTGCTGCTGCTCTTCTCTCTCC 2059
Query 2123 TCAGCTTAGCTTGTCTG----- 2139
|||||||| |||||.|
Sbjct 2060 TCAGCTTA--TTGTCAGGTCTG 2079