Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000481095
- Subject:
- XM_017312550.1
- Aligned Length:
- 2204
- Identities:
- 1862
- Gaps:
- 76
Alignment
Query 1 -----------ATGCAGCCGAGAACTCCG-------CTCGTT-------CTGTGCGTTC--------TCCTGTC 41
|||||||.| .||||| || .|| |.|||.||.| |.|||.|
Sbjct 1 ATGGAGCACAGATGCAGCAG---CCTCCGGGATGTCCT-ATTGAGTCAGCAGTGTGTACTGGTGAAATTCTGGC 70
Query 42 C----------------------CAGGTGCTGCTGCTAACATCTGCAGAAGATTTGGACTGCACTCCTGGATTT 93
| .|||||||.|||.|.||.||||||||.|||.||||.|||||.||||||||.
Sbjct 71 CATCCGCAGTGATTACAGCATGTGAGGTGCTCCTGGTCACGTCTGCAGATGATCTGGAGTGCACCCCTGGATTC 144
Query 94 CAGCAGAAAGTGTTCCATATCAATCAGCCAGCTGAATTCATTGAGGACCAGTCAATTCTAAACTTGACCTTCAG 167
||||.|||||||||.||.|||.|.|||||.||.||||||||.|||||||||.|..|.||||||||||||||||.
Sbjct 145 CAGCGGAAAGTGTTACACATCCACCAGCCTGCCGAATTCATCGAGGACCAGCCTGTCCTAAACTTGACCTTCAA 218
Query 168 TGACTGTAAGGGAAACGACAAGCTACGCTATGAGGTCTCGAGCCCATACTTCAAGGTGAACAGCGATGGCGGCT 241
||||||.|||||.|||||.|||||.|.|||.||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.|||..||
Sbjct 219 TGACTGCAAGGGCAACGAGAAGCTGCACTACGAGGTCTCAAGCCCACACTTCAAGGTGAACAGCGACGGCACCT 292
Query 242 TAGTTGCTCTGAGAAACATAACTGCAGTGGGCAAAACTCTGTTCGTCCATGCACGGACCCCCCATGCGGAAGAT 315
||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||..||.|||||.||||||||..||||.||.|||||.|||||.
Sbjct 293 TAGTGGCTCTCAGGAACATCACTGCGGTGGGCAGGACCCTGTTTGTCCATGCGAGGACTCCTCATGCTGAAGAC 366
Query 316 ATGGCAGAACTCGTGATTGTCGGGGGGAAAGACATCCAGGGCTCCTTGCAGGATATATTTAAATTTGCAAGAAC 389
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 367 ATGGCAGAACTCGTGATTGTCGGGGGCAAAGACATCCAGGGCTCCTTGCAGGATATCTTTAAATTTGCAAGGAC 440
Query 390 TTCTCCTGTCCCAAGACAAAAGAGGTCCATTGTGGTATCTCCCATTTTAATTCCAGAGAATCAGAGACAGCCTT 463
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 441 ATCTCCTGTCCCAAGACAAAAGAGGTCCATTGTGGTGTCCCCCATCTTGATCCCAGAGAACCAGAGACAGCCCT 514
Query 464 TCCCAAGAGATGTTGGCAAGGTAGTCGATAGTGACAGGCCAGAAAGGTCCAAGTTCCGGCTCACTGGAAAGGGA 537
||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||.|||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 515 TCCCCAGAGATGTCGGCAAGGTAGTCGATAGCGACAGACCCGAAGGGTCCAAGTTCCGGCTCACCGGGAAGGGA 588
Query 538 GTGGATCAAGAGCCTAAAGGAATTTTCAGAATCAATGAGAACACAGGGAGCGTCTCCATGACACGGACCTTGGA 611
|||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 589 GTGGATCAAGACCCTAAAGGAACTTTCAGAATCAATGAGAACACAGGCAGTGTCTCCGTGACACGGACCCTGGA 662
Query 612 CAGAGAAGTAATCGCTGTTTATCAACTATTTGTGGAGACCACTGATGTCAATGGCAAAACTCTCGAGGGGCCGG 685
|||||||...||||||..|||||||||.|.||||||.|||||.||||.||.||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 663 CAGAGAAACGATCGCTACTTATCAACTGTATGTGGAAACCACGGATGCCAGTGGCAAAACTCTGGAAGGGCCAG 736
Query 686 TGCCTCTGGAAGTCATTGTGATTGATCAGAATGACAACCGACCGATCTTTCGGGAAGGCCCCTACATCGGCCAC 759
|||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 737 TGCCTCTGGAAGTCATTGTGATTGACCAGAACGACAACAGACCCATCTTCCGGGAAGGCCCTTACATCGGCCAT 810
Query 760 GTCATGGAAGGGTCACCCACAGGCACCACAGTGATGCGGATGACAGCCTTTGATGCAGATGACCCAGCCACCGA 833
|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 811 GTCATGGAAGGGTCACCCACAGGGACCACGGTGATGCGGATGACAGCGTTTGATGCAGATGACCCGGCTACTGA 884
Query 834 TAATGCCCTCCTGCGGTATAATATCCGTCGGCAGACGCCTGACAAGCCATCTCCCAACATGTTCTACATCGATC 907
.|||||.||||||.||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 885 CAATGCTCTCCTGAGGTACAACATCCGTCAGCAGACGCCTGACAAGCCATCTCCTAACATGTTCTACATCGATC 958
Query 908 CTGAGAAAGGAGACATTGTCACTGTTGTGTCACCTGCGCTGCTGGACCGAGAGACTCTGGAAAATCCCAAGTAT 981
|.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 959 CCGAGAAAGGAGACATTGTCACCGTGGTGTCACCTGCGCTGCTGGACCGGGAGACTCTGGAAAACCCCAAGTAT 1032
Query 982 GAACTGATCATCGAGGCTCAAGATATGGCTGGACTGGATGTTGGATTAACAGGCACGGCCACAGCCACGATCAT 1055
||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||.|||.|.||||||||.|||||||||||.|||.|
Sbjct 1033 GAACTGATCATCGAAGCTCAAGATATGGCAGGATTGGATGTCGGACTGACAGGCACAGCCACAGCCACCATCGT 1106
Query 1056 GATCGATGACAAAAATGATCACTCACCAAAATTCACCAAGAAAGAGTTTCAAGCCACAGTCGAGGAAGGAGCTG 1129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1107 GATCGATGACAAAAATGATCACTCACCAAAATTCACCAAGAAAGAGTTTCAAGCCACAGTGGAGGAGGGAGCTG 1180
Query 1130 TGGGAGTTATTGTCAATTTGACAGTTGAAGATAAGGATGACCCCGCCACAGGTGCATGGAGGGCTGCCTACACC 1203
||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||..|||||||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1181 TGGGGGTCATTGTCAACTTGACAGTGGAAGACAAAGACGACCCTACCACAGGAGCCTGGAGGGCTGCATACACC 1254
Query 1204 ATCATCAACGGAAACCCCGGGCAGAGCTTTGAAATCCACACCAACCCTCAAACCAACGAAGGGATGCTTTCTGT 1277
||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1255 ATCATCAATGGAAATCCTGGGCAGAGCTTCGAGATCCACACCAACCCACAGACCAACGAGGGCATGCTCTCTGT 1328
Query 1278 TGTCAAACCATTGGACTATGAAATTTCTGCCTTCCACACCCTGCTGATCAAAGTGGAAAATGAAGACCCACTCG 1351
.|||||.||..||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1329 GGTCAAGCCCCTGGACTATGAGATCTCTGCCTTTCACACCCTGCTGATCAAAGTGGAGAATGAGGACCCACTGG 1402
Query 1352 TACCCGACGTCTCCTACGGCCCCAGCTCCACAGCCACCGTCCACATCACTGTCCTGGATGTCAACGAGGGCCCA 1425
||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1403 TACCCGACGTCTCCTATGGCCCCAGCTCCACGGCAACTGTCCACATCACAGTCCTGGATGTCAACGAGGGACCA 1476
Query 1426 GTCTTCTACCCAGACCCCATGATGGTGACCAGGCAGGAGGACCTCTCTGTGGGCAGCGTGCTGCTGACAGTGAA 1499
|||||||||||.|||||||||||||||||.|..||||||.||.|||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1477 GTCTTCTACCCGGACCCCATGATGGTGACTAAACAGGAGAACATCTCTGTGGGCAGTGTGCTGCTGACAGTGAA 1550
Query 1500 TGCCACGGACCCCGACTCCCTGCAGCATCAAACCATCAGGTATTCTGTTTACAAGGACCCAGCAGGTTGGCTGA 1573
||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||.|.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1551 TGCCACAGACCCAGACTCCCTGCAACATCAAACTATCAGGTACTCTATCTACAAGGACCCAGCAGGCTGGCTGA 1624
Query 1574 ATATTAACCCCATCAATGGGACTGTTGACACCACAGCTGTGCTGGACCGTGAGTCCACATTTGTCGACAACAGC 1647
.|||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|||||||.||||||.||||.|||.|||||||.
Sbjct 1625 GTATCAACCCCATCAATGGAACGGTGGACACCACAGCTGTGTTGGACCGGGAGTCCCCATTCGTCCACAACAGT 1698
Query 1648 GTGTACACTGCTCTCTTCCTGGCAATTGACAGTGGCAACCCTCCCGCTACGGGCACTGGGACTTTGCTGATAAC 1721
||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||.||||||||||
Sbjct 1699 GTGTACACGGCCCTGTTCCTGGCCATCGACAGTGGCAACCCTCCTGCAACTGGCACCGGGACTCTGCTGATAAC 1772
Query 1722 CCTGGAGGACGTGAATGACAATGCCCCGTTCATTTACCCCACAGTAGCTGAAGTCTGTGATGATGCCAAAAACC 1795
|||.||||||.|.||||||||.||.||..||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||.|||||
Sbjct 1773 CCTAGAGGACATTAATGACAACGCTCCTGTCATTTACCCAACTGTGGCTGAGGTCTGCGATGATGCCAGAAACC 1846
Query 1796 TCAGTGTAGTCATTTTGGGAGCATCAGATAAGGATCTTCACCCGAATACAGATCCTTTCAAATTTGAAATCCAC 1869
||||.||.||||||.||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||.||.
Sbjct 1847 TCAGCGTGGTCATTCTGGGGGCTTCGGACAAGGACCTTCACCCCAACACAGACCCCTTCAAGTTTGAGATTCAT 1920
Query 1870 AAACAAGCTGTTCCTGATAAAGTCTGGAAGATCTCCAAGATCAACAATACACACGCCCTGGTAAGCCTTCTTCA 1943
|||||..|.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1921 AAACAGACAGTCCCTGATAAAGTCTGGAAGATCTCCAAAATCAACAACACCCACGCCCTCGTGAGCCTTCTTCA 1994
Query 1944 AAATCTGAACAAAGCAAACTACAACCTGCCCATCATGGTGACAGATTCAGGGAAACCACCCATGACGAATATCA 2017
.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1995 GAATCTGAACAAGGCAAACTACAACCTGCCCATCATGGTGACAGATTCAGGGAAGCCACCCATGACGAACATCA 2068
Query 2018 CAGATCTCAGGGTACAAGTGTGCTCCTGCAGGAATTCCAAAGTGGACTGCAACGCGGCGGGGGCCCTGCGCTTC 2091
|.||.||||||||.||.||||||||.||||.|||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||||.|.||
Sbjct 2069 CGGACCTCAGGGTGCAGGTGTGCTCTTGCAAGAACTCCAAAGTGGACTGCAACGGGGCTGGGGCCCTGCACCTC 2142
Query 2092 AGCCTGCCCTCAG-----TCCTGCTCCTCAGCCTCTTCAGCTTAGCTTGTCTG----- 2139
|| |||||| |.||||||.||...|||.|||||||| |||||.|
Sbjct 2143 AG-----CCTCAGCTTGCTGCTGCTCTTCTCTCTCCTCAGCTTA--TTGTCAGGTCTG 2193