Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481231
• Subject: XM_024452792.1
• Aligned Length: 1572
• Identities: 1428
• Gaps: 123

Alignment

Query    1  ATGGAGGAAGGAGGCGGCGGCGTACGGAGTCTGGTCCCGGGCGGGCCGGTGTTACTGGTCCTCTGCGGCCTCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGAAGGAGGCGGCGGCGTACGGAGTCTGGTCCCGGGCGGGCCGGTGTTACTGGTCCTCTGCGGCCTCCT  74

Query   75  GGAGGCGTCCGGCGGCGGCCGAGCCCTTCCTCAACTCAGCGATGACATCCCTTTCCGAGTCAACTGGCCCGGCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGGCGTCCGGCGGCGGCCGAGCCCTTCCTCAACTCAGCGATGACATCCCTTTCCGAGTCAACTGGCCCGGCA  148

Query  149  CCGAGTTCTCTCTGCCCACAACTGGAGTTTTATATAAAGAAGATAATTATGTCATCATGACAACTGCACATAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGAGTTCTCTCTGCCCACAACTGGAGTTTTATATAAAGAAGATAATTATGTCATCATGACAACTGCACATAAA  222

Query  223  GAAAAATATAAATGCATACTTCCCCTTGTGACAAGTGGGGATGAGGAAGAAGAAAAGGATTATAAAGGCCCTAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAAAATATAAATGCATACTTCCCCTTGTGACAAGTGGGGATGAGGAAGAAGAAAAGGATTATAAAGGCCCTAA  296

Query  297  TCCAAGAGAGCTTTTGGAGCCACTATTTAAACAAAGCAGTTGTTCCTACAGAATTGAGTCTTATTGGACTTACG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCAAGAGAGCTTTTGGAGCCACTATTTAAACAAAGCAGTTGTTCCTACAGAATTGAGTCTTATTGGACTTACG  370

Query  371  AAGTATGTCATGGAAAACACATTCGGCAGTACCATGAAGAGAAAGAAACTGGTCAGAAAATAAATATTCACGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGTATGTCATGGAAAACACATTCGGCAGTACCATGAAGAGAAAGAAACTGGTCAGAAAATAAATATTCACGAG  444

Query  445  TACTACCTTGGGAATATGTTGGCCAAGAACCTTCTATTTGAAAAAGAACGAGAAGCAGAAGAAAAGGAAAAATC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACTACCTTGGGAATATGTTGGCCAAGAACCTTCTATTTGAAAAAGAACGAGAAGCAGAAGAAAAGGAAAAATC  518

Query  519  AAATGAGATTCCCACTAAAAATATCGAAGGTCAGATGACACCATACTATCCTGTGGGAATGGGAAATGGTACAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAATGAGATTCCCACTAAAAATATCGAAGGTCAGATGACACCATACTATCCTGTGGGAATGGGAAATGGTACAC  592

Query  593  CTTGTAGTTTGAAACAGAACCGGCCCAGATCAAGTACTGTGATGTACATATGTCATCCTGAATCTAAGCATGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTTGTAGTTTGAAACAGAACCGGCCCAGATCAAGTACTGTGATGTACATATGTCATCCTGAATCTAAGCATGAA  666

Query  667  ATTCTTTCAGTAGCTGAAGTTACAACTTGTGAATATGAAGTTGTCATTTTGACACCACTCTTGTGCAGTCATCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTCTTTCAGTAGCTGAAGTTACAACTTGTGAATATGAAGTTGTCATTTTGACACCACTCTTGTGCAGTCATCC  740

Query  741  TAAATATAGGTTCAGAGCATCTCCTGTGAATGACATATTTTGTCAATCACTGCCAGGATCTCCATTTAAGCCCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAAATATAGGTTCAGAGCATCTCCTGTGAATGACATATTTTGTCAATCACTGCCAGGATCTCCATTTAAGCCCC  814

Query  815  TCACCCTGAGGCAGCTGGAGCAGCAGGAAGAAATACTAAGGGTGCCTTTTAGGAGAAATAAAGAGGAAGATTTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCACCCTGAGGCAGCTGGAGCAGCAGGAAGAAATACTAAGGGTGCCTTTTAGGAGAAATAAAGAGGAAGATTTG  888

Query  889  CAATCAACTAAAGAAGAGAGATTTCCAGCGATCCACAAGTCGATTGCTATTGGCTCTCAGCCAGTGCTCACTGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAATCAACTAAAGAAGAGAGATTTCCAGCGATCCACAAGTCGATTGCTATTGGCTCTCAGCCAGTGCTCACTGT  962

Query  963  TGGGACAACCCACATATCCAAATTGACAGATGACCAACTCATAAAAGAGTTTCTTAGTGGTTCTTACTGCTTTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGGACAACCCACATATCCAAATTGACAGATGACCAACTCATAAAAGAGTTTCTTAGTGGTTCTTACTGCTTTC  1036

Query 1037  GTGGGGGTGTCGGTTGGTGGAAATATGAATTCTGCTATGGCAAACATGTACATCAATACCATGAGGACAAGGAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGGGGGTGTCGGTTGGTGGAAATATGAATTCTGCTATGGCAAACATGTACATCAATACCATGAGGACAAGGAT  1110

Query 1111  AGTGGGAAAACCTCTGTGGTTGTCGGGACATGGAACCAAGAAGAGCATATTGAATGGGCTAAGAAGAATACTGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGTGGGAAAACCTCTGTGGTTGTCGGGACATGGAACCAAGAAGAGCATATTGAATGGGCTAAGAAGAATACTGC  1184

Query 1185  TAGAGCTTATCATCTTCAAGACGATGGTACCCAGACAGTCAGGATGGTGTCACATTTTTATGGAAATGGAGATA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAGAGCTTATCATCTTCAAGACGATGGTACCCAGACAGTCAGGATGGTGTCACATTTTTATGGAAATGGAGATA  1258

Query 1259  TTTGTGATATAACTGACAAACCAAGACAGGTGACTGTAAAACTAAAGTGCAAAGAATCAGATTCACCTCATGCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTTGTGATATAACTGACAAACCAAGACAGGTGACTGTAAAACTAAAGTGCAAAGAATCAGATTCACCTCATGCT  1332

Query 1333  GTTACTGTATATATGCTAGAGCCTCACTCCTGTCAATATATTCTTGGGGTTGAATCTC--------------CA  1392
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|.|||              .|
Sbjct 1333  GTTACTGTATATATGCTAGAGCCTCACTCCTGTCAATATATTCTTGGGGGTCTAGCTCTATCACCCACATTGGA  1406

Query 1393  GTGATCT-GTAAAATCTTAGAT-ACAGCAGATGAAA----ATGGACT-------TCTTTC--TCTC-----CCC  1446
            |||..|| |||.||||..||.| ||.||||....||    .|||.||       ||||.|  .|||     |||
Sbjct 1407  GTGCACTGGTACAATCACAGCTCACTGCAGCCTCAACTCTCTGGGCTCAAGCCATCTTCCCACCTCAGCCTCCC  1480

Query 1447  AAC-----------------------------------------------------------------------  1449
            ||.                                                                       
Sbjct 1481  AAGTAGCTGGGACCACAGGTGTGCACCACCATGCTTGGCTTCTTTTTTTTTTTTTCCTCTGGAGAGACAGGGTC  1554

Query 1450  ------------------  1449
                              
Sbjct 1555  TTACCATATTGCCCAGAC  1572