Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481234
• Subject: XM_011527188.1
• Aligned Length: 3345
• Identities: 2781
• Gaps: 561

Alignment

Query    1  ATGGCTGGGGCTGGCGGGGGCCTCGGGGTCTGGGGGAACCTGGTGCTGCTGGGCCTGTGCAGCTGGACAGGGGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CAGGGCGCCTGCCCCCAACCCAGGGAGGAACCTGACAGTGGAGACTCAGACCACCAGCTCCATCTCCCTGAGCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGGAGGTCCCCGATGGCCTAGACTCACAGAACTCCAACTACTGGGTTCAGTGTACTGGAGACGGCGGCACAACA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GAGACTCGAAACACAACAGCCACCAACGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTCATTGTATACGTGTTCTGT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGGGACTGTCACTACTGCCACAGCTCCCAACCCAGTGAGGA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  ACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCCGACGGCCCAGACCCACAG  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  AACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAGCACAGCACACACCAACAT  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  CACCGTGGATGGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGCGTTTTCCATGTGGGTGGGAAAGAATGGAATCAACAGCT  592
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------ATGTGGGTGGGAAAGAATGGAATCAACAGCT  31

Query  593  CCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCTCACAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCACCAGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   32  CCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCTCACAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCACCAGC  105

Query  667  TCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCACAGACCCACAGAACTCCACCTACTGCGTTCAGTGCACTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  106  TCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCACAGACCCACAGAACTCGACCTACTGCGTTCAGTGCACTGG  179

Query  741  AGATGGTGGCAGAACAGAGACTCGAAACACAACAGACACCAGAGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTCAT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  180  AGATGGTGGCAGAACAGAGACTCGAAACACAACAGACACCAGAGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTCAT  253

Query  815  TGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGAGATTGTCACTAGTGCCACAGCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  254  TGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGAGATTGTCACTAGTGCCACAGCT  327

Query  889  CCCAACCCAGTGAGAAACCTGACAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCCGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  328  CCCAACCCAGTGAGAAACCTGACAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCCGA  401

Query  963  TGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAGCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  402  TGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAGCA  475

Query 1037  CAGCATACACCAACATCACCGTGGATAGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGTGTTTTCCGTGTGGGTGGGGAAG  1110
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  476  CAGCACACACCAACATCACCGTGGATAGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGTGTTTTCCGTGTGGGTGGGGAAG  549

Query 1111  AATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCCCCCAACCCAGTGAGAAACCTCCATATGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  550  AATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCCCCCAACCCAGTGAGAAACCTCCATATGGA  623

Query 1185  GACTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTATGCTGGGAAGTCCCCGATGGCCCATACCCTCAGGACTACACCTACT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  624  GACTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTATGCTGGGAAGTCCCCGATGGCCCATACCCTCAGGACTACACCTACT  697

Query 1259  GGGTAGAGTACACTGGAGACGGTGGTGGCACAGAGACCCGAAACACAACAAATACCAGTGTGACAGCTGAGAGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  698  GGGTAGAGTACACTGGAGACGGTGGTGGCACAGAGACCCGAAACACAACAAATACCAGTGTGACAGCTGAGAGA  771

Query 1333  CTTGAGCCCGGAACCTTGTACACATTCTCTGTATGGGCAGAAAAAAATGGAGCACGTGGCTCCAGGCAGAATGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  772  CTTGAGCCCGGAACCTTGTACACATTCTCTGTATGGGCAGAAAAAAATGGAGCACGTGGCTCCAGGCAGAATGT  845

Query 1407  CAGCATCTCCACAGTCCCCAACGCAGTGACAAGCCTCAGCAAGCAGGACTGGACCAACAGCACCATTGCTTTGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  846  CAGCATCTCCACAGTCCCCAACGCAGTGACAAGCCTCAGCAAGCAGGACTGGACCAACAGCACCATTGCTTTGC  919

Query 1481  GCTGGACAGCTCCCCAGGGCCCAGGCCAGTCTTCCTACAGCTACTGGGTCTCATGGGTCAGGGAAGGCATGACT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  920  GCTGGACAGCTCCCCAGGGCCCAGGCCAGTCTTCCTACAGCTACTGGGTCTCATGGGTCAGGGAAGGCATGACT  993

Query 1555  GACCCCAGGACCCAAAGCACCTCAGGTACTGACATCACCCTAAAGGAACTGGAAGCTGGCAGCCTGTACCACCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  994  GACCCCAGGACCCAAAGCACCTCAGGTACTGACATCACCCTAAAGGAACTGGAAGCTGGCAGCCTGTACCACCT  1067

Query 1629  CACCGTCTGGGCCGAGAGGAATGAGGTCAGAGGCTATAACAGCACCCTCACTGCAGCCACTGCTCCCAATGAGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1068  CACCGTCTGGGCCGAGAGGAATGAGGTCAGAGGCTATAACAGCACCCTCACTGCAGCCACTGCTCCCAATGAGG  1141

Query 1703  TCACAGATCTCCAGAATGAAACTCAGACTAAGAACTCAGTCATGCTGTGGTGGAAGGCCCCTGGAGACCCCCAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1142  TCACAGATCTCCAGAATGAAACTCAGACTAAGAACTCAGTCATGCTGTGGTGGAAGGCCCCTGGAGACCCCCAC  1215

Query 1777  TCTCAGTTGTACGTATACTGGGTCCAGTGGGCCAGCAAGGGACATCCCCGGAGGGGGCAAGATCCCCAAGCGAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1216  TCTCAGTTGTACGTATACTGGGTCCAGTGGGCCAGCAAGGGACATCCCCGGAGGGGGCAAGATCCCCAAGCGAA  1289

Query 1851  TTGGGTCAACCAGACCAGCAGGACCAATGAGACGTGGTACAAAGTGGAGGCCCTGGAACCCGGGACGCTGTACA  1924
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1290  TTGGGTCAACCAGACCAGCAGGACCAATGAGACGTGGTACAAAGTGGAGGCCCTGGAACCCGGGACGTTGTACA  1363

Query 1925  ATTTCACCGTGTGGGCAGAGAGGAATGACGTAGCCAGTTCCACGCAGAGCCTCTGTGCGTCCACATACCCAGAC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1364  ATTTCACCGTGTGGGCAGAGAGGAATGACGTAGCCAGTTCCACGCAGAGCCTCTGTGCGTCCACATACCCAGAC  1437

Query 1999  ACAGTCACCATCACTTCCTGTGTCAGCACCTCAGCGGGCTATGGAGTCAACTTGATCTGGTCCTGCCCCCAGGG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438  ACAGTCACCATCACTTCCTGTGTCAGCACCTCAGCGGGCTATGGAGTCAACTTGATCTGGTCCTGCCCCCAGGG  1511

Query 2073  AGGCTACGAGGCCTTTGAGTTGGAGGTGGGAGGACAGCGGGGCTCCCAGGACAGATCTTCATGTGGGGAGGCTG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1512  AGGCTACGAGGCCTTTGAGTTGGAGGTGGGAGGACAGCGGGGCTCCCAGGACAGATCTTCATGTGGGGAGGCTG  1585

Query 2147  TGTCTGTGTTGGGTCTCGGGCCGGCTCGGTCCTACCCAGCCACCATCACGACCATCTGGGACGGAATGAAGGTC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1586  TGTCTGTGTTGGGTCTCGGGCCGGCTCGGTCCTACCCAGCCACCATCACGACCATCTGGGACGGAATGAAGGTC  1659

Query 2221  GTGTCTCACTCTGTGGTCTGCCACACCGAGAGTGCAGGGGTCATTGCCGGAGCCTTTGTGGGCATCCTCCTGTT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1660  GTGTCTCACTCTGTGGTCTGCCACACCGAGAGTGCAGGGGTCATTGCCGGAGCCTTTGTGGGCATCCTCCTGTT  1733

Query 2295  TCTCATCCTCGTGGGCCTGCTGATTTTCTTCCTGAAGAGGAGGAATAAGAAGAAGCAGCAGAAACCAGAACTCA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1734  TCTCATCCTCGTGGGCCTGCTGATTTTCTTCCTGAAGAGGAGGAATAAGAAGAAGCAGCAGAAACCAGAACTCA  1807

Query 2369  GGGATCTGGTCTTTAGCTCCCCAGGGGACATCCCAGCTGAAGACTTCGCTGACCACGTCAGGAAGAATGAGAGG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1808  GGGATCTGGTCTTTAGCTCCCCAGGGGACATCCCAGCTGAAGACTTCGCTGACCACGTCAGGAAGAATGAGAGG  1881

Query 2443  GACAGCAACTGTGGTTTTGCAGACGAGTACCAGCAACTCTCCCTGGTGGGCCACAGCCAGTCTCAGATGGTGGC  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1882  GACAGCAACTGTGGTTTTGCAGACGAGTACCAGCAACTCTCCCTGGTGGGCCACAGCCAGTCTCAGATGGTGGC  1955

Query 2517  TTCGGCTTCAGAGAACAACGCCAAGAACCGCTACAGAAATGTGCTGCCCTATGACTGGTCCCGGGTGCCCCTGA  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1956  TTCGGCTTCAGAGAACAACGCCAAGAACCGCTACAGAAATGTGCTGCCCTATGACTGGTCCCGGGTGCCCCTGA  2029

Query 2591  AGCCCATCCATGAGGAGCCAGGCTCTGACTACATCAATGCCAGCTTCATGCCCGGTCTCTGGAGCCCCCAGGAG  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2030  AGCCCATCCATGAGGAGCCAGGCTCTGACTACATCAATGCCAGCTTCATGCCCGGTCTCTGGAGCCCCCAGGAG  2103

Query 2665  TTCATTGCAACCCAGGGTCCCCTGCCACAGACAGTGGGTGACTTCTGGCGCCTGGTGTGGGAACAGCAGAGCCA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2104  TTCATTGCAACCCAGGGTCCCCTGCCACAGACAGTGGGTGACTTCTGGCGCCTGGTGTGGGAACAGCAGAGCCA  2177

Query 2739  CACCCTGGTCATGCTGACCAACTGCATGGAGGCCGGCCGGGTGAAGTGTGAGCATTACTGGCCTCTGGACTCGC  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2178  CACCCTGGTCATGCTGACCAACTGCATGGAGGCCGGCCGGGTGAAGTGTGAGCATTACTGGCCTCTGGACTCGC  2251

Query 2813  AGCCCTGCACCCATGGGCACCTGCGGGTAACCCTGGTAGGTGAGGAAGTGATGGAGAACTGGACGGTGCGGGAA  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2252  AGCCCTGCACCCATGGGCACCTGCGGGTAACCCTGGTAGGTGAGGAAGTGATGGAGAACTGGACGGTGCGGGAA  2325

Query 2887  CTGCTGCTCCTCCAGGTGGAGGAGCAGAAGACACTGTCTGTGCGCCAATTCCACTACCAGGCCTGGCCGGATCA  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2326  CTGCTGCTCCTCCAGGTGGAGGAGCAGAAGACACTGTCTGTGCGCCAATTCCACTACCAGGCCTGGCCGGATCA  2399

Query 2961  CGGCGTTCCCTCCTCCCCAGACACCTTGCTGGCTTTCTGGAGGATGCTTCGGCAGTGGCTGGATCAGACCATGG  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2400  CGGCGTTCCCTCCTCCCCAGACACCTTGCTGGCTTTCTGGAGGATGCTTCGGCAGTGGCTGGATCAGACCATGG  2473

Query 3035  AGGGAGGCCCACCCATTGTGCACTGCAGTGCTGGCGTGGGTCGCACAGGAACCCTCATTGCCCTGGACGTCCTG  3108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2474  AGGGAGGCCCACCCATTGTGCACTGCAGTGCTGGCGTGGGTCGCACAGGAACCCTCATTGCCCTGGACGTCCTG  2547

Query 3109  CTCCGGCAGCTGCAGTCCGAGGGTCTCCTTGGGCCCTTCAGCTTTGTAAGGAAGATGAGAGAGAGTCGGCCGTT  3182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2548  CTCCGGCAGCTGCAGTCCGAGGGTCTCCTTGGGCCCTTCAGCTTTGTAAGGAAGATGAGAGAGAGTCGGCCGTT  2621

Query 3183  GATGGTGCAGACTGAGGCTCAGTACGTATTCCTGCATCAGTGCATCCTGCGGTTCCTCCAACAGTCAGCCCAGG  3256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2622  GATGGTGCAGACTGAGGCTCAGTACGTATTCCTGCATCAGTGCATCCTGCGGTTCCTCCAACAGTCAGCCCAGG  2695

Query 3257  CCCCAGCCGAGAAGGAAGTCCCGTATGAGGATGTCGAAAACCTCATCTACGAGAACGTGGCCGCCATCCAGGCC  3330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2696  CCCCAGCCGAGAAGGAAGTCCCGTATGAGGATGTCGAAAACCTCATCTACGAGAACGTGGCCGCCATCCAGGCC  2769

Query 3331  CACAAGTTGGAGGTC  3345
            |||||||||||||||
Sbjct 2770  CACAAGTTGGAGGTC  2784