Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000481234
- Subject:
- XM_017027059.1
- Aligned Length:
- 3421
- Identities:
- 3278
- Gaps:
- 134
Alignment
Query 1 ATGGCTGGGGCTGGCGGGG-------------------GCCTCGGGGT--CTGGG----GGAACCTGGT----- 44
|||| ||||||| .||||||..| ||||| ||| .||||
Sbjct 1 ATGG--------GGCGGGGACCAGCCGCTCCTCCCAGCCCCTCGGCCTCACTGGGCGGAGGA--GTGGTTGAGA 64
Query 45 -GCTG------------------------CTGGGCCTGTGCAGCTGGACAGGGGCCAGGGCGCCT--------- 84
|||| |.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65 GGCTGACTCCGTTTTCTCTGGGTTCCCTCCAGGGCCTGTGCAGCTGGACAGGGGCCAGGGCGCCTGACCTTCCT 138
Query 85 ------------GCCCCCAACCCAGGGAGGAACCTGACAGTGGAGACTCAGACCACCAGCTCCATCTCCCTGAG 146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 139 TCCCAATTCTCAGCCCCCAACCCAGGGAGGAACCTGACAGTGGAGACTCAGACCACCAGCTCCATCTCCCTGAG 212
Query 147 CTGGGAGGTCCCCGATGGCCTAGACTCACAGAACTCCAACTACTGGGTTCAGTGTACTGGAGACGGCGGCACAA 220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213 CTGGGAGGTCCCCGATGGCCTAGACTCACAGAACTCCAACTACTGGGTTCAGTGTACTGGAGACGGCGGCACAA 286
Query 221 CAGAGACTCGAAACACAACAGCCACCAACGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTCATTGTATACGTGTTCT 294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 287 CAGAGACTCGAAACACAACAGCCACCAACGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTCATTGTATACGTGTTCT 360
Query 295 GTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGGGACTGTCACTACTGCCACAGCTCCCAACCCAGTGAG 368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 GTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGGGACTGTCACTACTGCCACAGCTCCCAACCCAGTGAG 434
Query 369 GAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCCGACGGCCCAGACCCAC 442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 GAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCCGACGGCCCAGACCCAC 508
Query 443 AGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAGCACAGCACACACCAAC 516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 509 AGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAGCACAGCACACACTAAC 582
Query 517 ATCACCGTGGATGGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGCGTTTTCCATGTGGGTGGGAAAGAATGGAATCAACAG 590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 583 ATCACCGTGGATGGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGCGTTTTCCATGTGGGTGGGAAAGAATGGAATCAACAG 656
Query 591 CTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCTCACAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCACCA 664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 CTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCTCACAACCCAGTGAGGAACCTGAGAGTGGAGGCTCAGACCACCA 730
Query 665 GCTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCACAGACCCACAGAACTCCACCTACTGCGTTCAGTGCACT 738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 731 GCTCCATCTCCCTGAGCTGGGAGGTCCCCGATGGCACAGACCCACAGAACTCGACCTACTGCGTTCAGTGCACT 804
Query 739 GGAGATGGTGGCAGAACAGAGACTCGAAACACAACAGACACCAGAGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTC 812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 805 GGAGATGGTGGCAGAACAGAGACTCGAAACACAACAGACACCAGAGTCACCGTGGATGGCCTTGGACCCGGGTC 878
Query 813 ATTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGAGATTGTCACTAGTGCCACAG 886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 879 ATTGTATACGTGTTCTGTGTGGGTGGAGAAAGACGGAGTAAATAGCTCTGTGGAGATTGTCACTAGTGCCACAG 952
Query 887 CTCCCAACCCAGTGAGAAACCTGACAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCC 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 CTCCCAACCCAGTGAGAAACCTGACAGTGGAGGCTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTGACCTGGGAGGTCCCC 1026
Query 961 GATGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAG 1034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027 GATGGCCCAGACCCACAGAACTCCACCTACGGGGTTGAGTACACTGGAGATGGTGGCAGAGCAGGGACTCGAAG 1100
Query 1035 CACAGCATACACCAACATCACCGTGGATAGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGTGTTTTCCGTGTGGGTGGGGA 1108
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101 CACAGCACACACCAACATCACCGTGGATAGACTTGAACCCGGGTGTTTGTATGTGTTTTCCGTGTGGGTGGGGA 1174
Query 1109 AGAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCCCCCAACCCAGTGAGAAACCTCCATATG 1182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175 AGAATGGAATCAACAGCTCCCGGGAGACTCGAAATGCCACCACAGCCCCCAACCCAGTGAGAAACCTCCATATG 1248
Query 1183 GAGACTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTATGCTGGGAAGTCCCCGATGGCCCATACCCTCAGGACTACACCTA 1256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249 GAGACTCAGACCAACAGCTCCATCGCCCTATGCTGGGAAGTCCCCGATGGCCCATACCCTCAGGACTACACCTA 1322
Query 1257 CTGGGTAGAGTACACTGGAGACGGTGGTGGCACAGAGACCCGAAACACAACAAATACCAGTGTGACAGCTGAGA 1330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323 CTGGGTAGAGTACACTGGAGACGGTGGTGGCACAGAGACCCGAAACACAACAAATACCAGTGTGACAGCTGAGA 1396
Query 1331 GACTTGAGCCCGGAACCTTGTACACATTCTCTGTATGGGCAGAAAAAAATGGAGCACGTGGCTCCAGGCAGAAT 1404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397 GACTTGAGCCCGGAACCTTGTACACATTCTCTGTATGGGCAGAAAAAAATGGAGCACGTGGCTCCAGGCAGAAT 1470
Query 1405 GTCAGCATCTCCACAGTCCCCAACGCAGTGACAAGCCTCAGCAAGCAGGACTGGACCAACAGCACCATTGCTTT 1478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1471 GTCAGCATCTCCACAGTCCCCAACGCAGTGACAAGCCTCAGCAAGCAGGACTGGACCAACAGCACCATTGCTTT 1544
Query 1479 GCGCTGGACAGCTCCCCAGGGCCCAGGCCAGTCTTCCTACAGCTACTGGGTCTCATGGGTCAGGGAAGGCATGA 1552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1545 GCGCTGGACAGCTCCCCAGGGCCCAGGCCAGTCTTCCTACAGCTACTGGGTCTCATGGGTCAGGGAAGGCATGA 1618
Query 1553 CTGACCCCAGGACCCAAAGCACCTCAGGTACTGACATCACCCTAAAGGAACTGGAAGCTGGCAGCCTGTACCAC 1626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1619 CTGACCCCAGGACCCAAAGCACCTCAGGTACTGACATCACCCTAAAGGAACTGGAAGCTGGCAGCCTGTACCAC 1692
Query 1627 CTCACCGTCTGGGCCGAGAGGAATGAGGTCAGAGGCTATAACAGCACCCTCACTGCAGCCACTGCTCCCAATGA 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1693 CTCACCGTCTGGGCCGAGAGGAATGAGGTCAGAGGCTATAACAGCACCCTCACTGCAGCCACTGCTCCCAATGA 1766
Query 1701 GGTCACAGATCTCCAGAATGAAACTCAGACTAAGAACTCAGTCATGCTGTGGTGGAAGGCCCCTGGAGACCCCC 1774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1767 GGTCACAGATCTCCAGAATGAAACTCAGACTAAGAACTCAGTCATGCTGTGGTGGAAGGCCCCTGGAGACCCCC 1840
Query 1775 ACTCTCAGTTGTACGTATACTGGGTCCAGTGGGCCAGCAAGGGACATCCCCGGAGGGGGCAAGATCCCCAAGCG 1848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1841 ACTCTCAGTTGTACGTATACTGGGTCCAGTGGGCCAGCAAGGGACATCCCCGGAGGGGGCAAGATCCCCAAGCG 1914
Query 1849 AATTGGGTCAACCAGACCAGCAGGACCAATGAGACGTGGTACAAAGTGGAGGCCCTGGAACCCGGGACGCTGTA 1922
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1915 AATTGGGTCAACCAGACCAGCAGGACCAATGAGACGTGGTACAAAGTGGAGGCCCTGGAACCCGGGACGTTGTA 1988
Query 1923 CAATTTCACCGTGTGGGCAGAGAGGAATGACGTAGCCAGTTCCACGCAGAGCCTCTGTGCGTCCACATACCCAG 1996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1989 CAATTTCACCGTGTGGGCAGAGAGGAATGACGTAGCCAGTTCCACGCAGAGCCTCTGTGCGTCCACATACCCAG 2062
Query 1997 ACACAGTCACCATCACTTCCTGTGTCAGCACCTCAGCGGGCTATGGAGTCAACTTGATCTGGTCCTGCCCCCAG 2070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2063 ACACAGTCACCATCACTTCCTGTGTCAGCACCTCAGCGGGCTATGGAGTCAACTTGATCTGGTCCTGCCCCCAG 2136
Query 2071 GGAGGCTACGAGGCCTTTGAGTTGGAGGTGGGAGGACAGCGGGGCTCCCAGGACAGATCTTCATGTGGGGAGGC 2144
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2137 GGAGGCTACGAGGCCTTTGAGTTGGAGGTGGGAGGACAGCGGGGCTCCCAGGACAGATCTTCATGTGGGGAGGC 2210
Query 2145 TGTGTCTGTGTTGGGTCTCGGGCCGGCTCGGTCCTACCCAGCCACCATCACGACCATCTGGGACGGAATGAAGG 2218
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2211 TGTGTCTGTGTTGGGTCTCGGGCCGGCTCGGTCCTACCCAGCCACCATCACGACCATCTGGGACGGAATGAAGG 2284
Query 2219 TCGTGTCTCACTCTGTGGTCTGCCACACCGAGAGTGCAGGGGTCATTGCCGGAGCCTTTGTGGGCATCCTCCTG 2292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2285 TCGTGTCTCACTCTGTGGTCTGCCACACCGAGAGTGCAGGGGTCATTGCCGGAGCCTTTGTGGGCATCCTCCTG 2358
Query 2293 TTTCTCATCCTCGTGGGCCTGCTGATTTTCTTCCTGAAGAGGAGGAATAAGAAGAAGCAGCAGAAACCAGAACT 2366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2359 TTTCTCATCCTCGTGGGCCTGCTGATTTTCTTCCTGAAGAGGAGGAATAAGAAGAAGCAGCAGAAACCAGAACT 2432
Query 2367 CAGGGATCTGGTCTTTAGCTCCCCAGGGGACATCCCAGCTGAAGACTTCGCTGACCACGTCAGGAAGAATGAGA 2440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2433 CAGGGATCTGGTCTTTAGCTCCCCAGGGGACATCCCAGCTGAAGACTTCGCTGACCACGTCAGGAAGAATGAGA 2506
Query 2441 GGGACAGCAACTGTGGTTTTGCAGACGAGTACCAGCAACTCTCCCTGGTGGGCCACAGCCAGTCTCAGATGGTG 2514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2507 GGGACAGCAACTGTGGTTTTGCAGACGAGTACCAGCAACTCTCCCTGGTGGGCCACAGCCAGTCTCAGATGGTG 2580
Query 2515 GCTTCGGCTTCAGAGAACAACGCCAAGAACCGCTACAGAAATGTGCTGCCCTATGACTGGTCCCGGGTGCCCCT 2588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2581 GCTTCGGCTTCAGAGAACAACGCCAAGAACCGCTACAGAAATGTGCTGCCCTATGACTGGTCCCGGGTGCCCCT 2654
Query 2589 GAAGCCCATCCATGAGGAGCCAGGCTCTGACTACATCAATGCCAGCTTCATGCCCGGTCTCTGGAGCCCCCAGG 2662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2655 GAAGCCCATCCATGAGGAGCCAGGCTCTGACTACATCAATGCCAGCTTCATGCCCGGTCTCTGGAGCCCCCAGG 2728
Query 2663 AGTTCATTGCAACCCAGGGTCCCCTGCCACAGACAGTGGGTGACTTCTGGCGCCTGGTGTGGGAACAGCAGAGC 2736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2729 AGTTCATTGCAACCCAGGGTCCCCTGCCACAGACAGTGGGTGACTTCTGGCGCCTGGTGTGGGAACAGCAGAGC 2802
Query 2737 CACACCCTGGTCATGCTGACCAACTGCATGGAGGCCGGCCGGGTGAAGTGTGAGCATTACTGGCCTCTGGACTC 2810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2803 CACACCCTGGTCATGCTGACCAACTGCATGGAGGCCGGCCGGGTGAAGTGTGAGCATTACTGGCCTCTGGACTC 2876
Query 2811 GCAGCCCTGCACCCATGGGCACCTGCGGGTAACCCTGGTAGGTGAGGAAGTGATGGAGAACTGGACGGTGCGGG 2884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2877 GCAGCCCTGCACCCATGGGCACCTGCGGGTAACCCTGGTAGGTGAGGAAGTGATGGAGAACTGGACGGTGCGGG 2950
Query 2885 AACTGCTGCTCCTCCAGGTGGAGGAGCAGAAGACACTGTCTGTGCGCCAATTCCACTACCAGGCCTGGCCGGAT 2958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2951 AACTGCTGCTCCTCCAGGTGGAGGAGCAGAAGACACTGTCTGTGCGCCAATTCCACTACCAGGCCTGGCCGGAT 3024
Query 2959 CACGGCGTTCCCTCCTCCCCAGACACCTTGCTGGCTTTCTGGAGGATGCTTCGGCAGTGGCTGGATCAGACCAT 3032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3025 CACGGCGTTCCCTCCTCCCCAGACACCTTGCTGGCTTTCTGGAGGATGCTTCGGCAGTGGCTGGATCAGACCAT 3098
Query 3033 GGAGGGAGGCCCACCCATTGTGCACTGCAGTGCTGGCGTGGGTCGCACAGGAACCCTCATTGCCCTGGACGTCC 3106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3099 GGAGGGAGGCCCACCCATTGTGCACTGCAGTGCTGGCGTGGGTCGCACAGGAACCCTCATTGCCCTGGACGTCC 3172
Query 3107 TGCTCCGGCAGCTGCAGTCCGAGGGTCTCCTTGGGCCCTTCAGCTTTGTAAGGAAGATGAGAGAGAGTCGGCCG 3180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3173 TGCTCCGGCAGCTGCAGTCCGAGGGTCTCCTTGGGCCCTTCAGCTTTGTAAGGAAGATGAGAGAGAGTCGGCCG 3246
Query 3181 TTGATGGTGCAGACTGAGGCTCAGTACGTATTCCTGCATCAGTGCATCCTGCGGTTCCTCCAACAGTCAGCCCA 3254
|||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 3247 TTGATGGTGCAGACTG------------------------------------------------AGTCAGCCCA 3272
Query 3255 GGCCCCAGCCGAGAAGGAAGTCCCGTATGAGGATGTCGAAAACCTCATCTACGAGAACGTGGCCGCCATCCAGG 3328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3273 GGCCCCAGCCGAGAAGGAAGTCCCGTATGAGGATGTCGAAAACCTCATCTACGAGAACGTGGCCGCCATCCAGG 3346
Query 3329 CCCACAAGTTGGAGGTC 3345
|||||||||||||||||
Sbjct 3347 CCCACAAGTTGGAGGTC 3363