Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481463
• Subject: NM_001282733.1
• Aligned Length: 2073
• Identities: 2069
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGTGCTTCCGGACAAAGCTCTCAGTATCCTGGGTGCCATTGTTTCTTCTACTCAGCCGTGTTTTTTCTACTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGCTTCCGGACAAAGCTCTCAGTATCCTGGGTGCCATTGTTTCTTCTACTCAGCCGTGTTTTTTCTACTGA  74

Query   75  GACAGACAAACCCTCAGCCCAGGACAGCAGAAGCCGTGGGAGTTCAGGCCAACCGGCAGACCTGCTACAGGTTC  148
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GACAGACAAACCCTCAGCCCAGGATAGCAGAAGCCGTGGGAGTTCAGGCCAACCGGCAGACCTGCTACAGGTTC  148

Query  149  TCTCTGCTGGTGACCACCCACCCCACAACCACTCAAGAAGCCTCATCAAAACATTGTTGGAGAAAACTGGGTGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTCTGCTGGTGACCACCCACCCCACAACCACTCAAGAAGCCTCATCAAAACATTGTTGGAGAAAACTGGGTGC  222

Query  223  CCACGGAGGAGAAACGGAATGCAAGGAGATTGCAATCTGTGCTTTGAACCAGATGCACTATTACTAATAGCTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCACGGAGGAGAAACGGAATGCAAGGAGATTGCAATCTGTGCTTTGAACCAGATGCACTATTACTAATAGCTGG  296

Query  297  AGGAAATTTTGAAGATCAGCTTAGAGAAGAAGTGGTCCAGAGAGTTTCTCTTCTCCTTCTCTATTACATTATTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGAAATTTTGAAGATCAGCTTAGAGAAGAAGTGGTCCAGAGAGTTTCTCTTCTCCTTCTCTATTACATTATTC  370

Query  371  ATCAGGAAGAGATCTGTTCTTCAAAGCTCAACATGAGTAATAAAGAGTATAAATTTTACCTACACAGCCTACTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATCAGGAAGAGATCTGTTCTTCAAAGCTCAACATGAGTAATAAAGAGTATAAATTTTACCTACACAGCCTACTG  444

Query  445  AGCCTCAGGCAGGATGAAGATTCCTCTTTCCTTTCACAGAATGAGACAGAAGATATCTTGGCTTTCACCAGGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCCTCAGGCAGGATGAAGATTCCTCTTTCCTTTCACAGAATGAGACAGAAGATATCTTGGCTTTCACCAGGCA  518

Query  519  GTACTTTGACACTTCTCAAAGCCAGTGTATGGAAACCAAAACGCTGCAGAAAAAATCTGGAATAGTGAGCAGTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTACTTTGACACTTCTCAAAGCCAGTGTATGGAAACCAAAACGCTGCAGAAAAAATCTGGAATAGTGAGCAGTG  592

Query  593  AAGGTGCTAATGAAAGTACGCTTCCTCAGTTGGCAGCCATGATCATTACTTTGTCCCTCCAGGGTGTTTGTCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGGTGCTAATGAAAGTACGCTTCCTCAGTTGGCAGCCATGATCATTACTTTGTCCCTCCAGGGTGTTTGTCTG  666

Query  667  GGACAAGGAAACTTGCCTTCCCCAGACTACTTTACAGAATATATTTTCAGTTCCTTGAATCGTACGAATACCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGACAAGGAAACTTGCCTTCCCCAGACTACTTTACAGAATATATTTTCAGTTCCTTGAATCGTACGAATACCCT  740

Query  741  CCGCCTATCAGAACTAGACCAACTCCTCAACACTCTCTGGACCAGAAGTACTTGTATCAAAAATGAGAAAATCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCGCCTATCAGAACTAGACCAACTCCTCAACACTCTCTGGACCAGAAGTACTTGTATCAAAAATGAGAAAATCC  814

Query  815  ATCAATTTCAAAGGAAACAAAACAACATAATAACCCATGATCAGGACTATTCTAATTTCTCTTCATCCATGGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATCAATTTCAAAGGAAACAAAACAACATAATAACCCATGATCAGGACTATTCTAATTTCTCTTCATCCATGGAA  888

Query  889  AAAGAGTCTGAGGATGGTCCAGTTTCCTGGGATCAGACCTGCTTCTCTGCTAGGCAGCTGGTGGAGATATTTCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAGAGTCTGAGGATGGTCCAGTTTCCTGGGATCAGACCTGCTTCTCTGCTAGGCAGCTGGTGGAGATATTTCT  962

Query  963  ACAGAAGGGCCTCTCACTCATTTCTAAGGAGGACTTTAAGCAAATGAGTCCAGGGATCATCCAGCAGCTCCTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACAGAAGGGCCTCTCACTCATTTCTAAGGAGGACTTTAAGCAAATGAGTCCAGGGATCATCCAGCAGCTCCTCA  1036

Query 1037  GCTGCTCCTGCCACTTACCCAAGGACCAACAAGCAAAGCTGCCACCTACCACTCTGGAGAAATACGGCTACAGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTGCTCCTGCCACTTACCCAAGGACCAACAAGCAAAGCTGCCACCTACCACTCTGGAGAAATACGGCTACAGC  1110

Query 1111  ACGGTGGCTGTCACCCTTCTCACACTGGGCTCCATGCTGGGGACAGCGCTGGTCCTTTTCCATAGCTGTGAGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACGGTGGCTGTCACCCTTCTCACACTGGGCTCCATGCTGGGGACAGCGCTGGTCCTTTTCCATAGCTGTGAGGA  1184

Query 1185  GAACTACAGGCTTATCTTACAGCTGTTTGTGGGCTTGGCCGTCGGGACACTGTCTGGGGACGCTCTGCTCCACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAACTACAGGCTTATCTTACAGCTGTTTGTGGGCTTGGCCGTCGGGACACTGTCTGGGGACGCTCTGCTCCACC  1258

Query 1259  TTATCCCTCAGGTTCTTGGTTTACATAAGCAGGAAGCCCCAGAATTTGGGCATTTCCATGAAAGCAAAGGTCAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTATCCCTCAGGTTCTTGGTTTACATAAGCAGGAAGCCCCAGAATTTGGGCATTTCCATGAAAGCAAAGGTCAT  1332

Query 1333  ATTTGGAAACTGATGGGATTAATTGGAGGCATCCATGGATTTTTCTTGATAGAAAAATGTTTTATTCTTCTTGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATTTGGAAACTGATGGGATTAATTGGAGGCATCCATGGATTTTTCTTGATAGAAAAATGTTTTATTCTTCTTGT  1406

Query 1407  ATCACCAAATGACAAGCAGGGCCTGTCATTGGTTAATGGGCACGTGGGTCATTCCCACCATCTTGCACTCAACT  1480
            ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ATCACCAAATGACA---AGGGCCTGTCATTGGTTAATGGGCACGTGGGTCATTCCCACCATCTTGCACTCAACT  1477

Query 1481  CTGAATTAAGTGACCAGGCAGGCAGAGGCAAATCTGCTTCAACTATCCAGTTGAAAAGCCCAGAAGATTCACAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  CTGAATTAAGTGACCAGGCAGGCAGAGGCAAATCTGCTTCAACTATCCAGTTGAAAAGCCCAGAAGATTCACAG  1551

Query 1555  GCAGCTGAAATGCCTATAGGCAGTATGACAGCCTCCAACAGAAAATGTAAAGCCATTAGCTTGTTAGCAATCAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552  GCAGCTGAAATGCCTATAGGCAGTATGACAGCCTCCAACAGAAAATGTAAAGCCATTAGCTTGTTAGCAATCAT  1625

Query 1629  GATTCTGGTTGGGGACAGCCTGCATAATTTTGCAGATGGCCTAGCCATAGGAGCAGCCTTCTCATCATCATCCG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  GATTCTGGTTGGGGACAGCCTGCATAATTTTGCAGATGGCCTAGCCATAGGAGCAGCCTTCTCATCATCATCCG  1699

Query 1703  AGTCAGGAGTGACCACTACGATTGCTATCTTGTGTCATGAAATCCCACATGAAATGGGAGACTTTGCCGTGCTC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700  AGTCAGGAGTGACCACTACGATTGCTATCTTGTGTCATGAAATCCCACATGAAATGGGAGACTTTGCCGTGCTC  1773

Query 1777  TTAAGCTCTGGACTTTCTATGAAGACTGCCATCCTGATGAATTTTATAAGCTCCCTAACTGCCTTCATGGGATT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774  TTAAGCTCTGGACTTTCTATGAAGACTGCCATCCTGATGAATTTTATAAGCTCCCTAACTGCCTTCATGGGATT  1847

Query 1851  ATACATTGGCCTTTCCGTGTCAGCTGATCCATGTGTTCAAGACTGGATCTTCACAGTCACTGCTGGGATGTTCT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848  ATACATTGGCCTTTCCGTGTCAGCTGATCCATGTGTTCAAGACTGGATCTTCACAGTCACTGCTGGGATGTTCT  1921

Query 1925  TATATTTATCCTTGGTTGAAATGCTTCCTGAAATGACTCATGTTCAAACACAACGACCCTGGATGATGTTTCTC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922  TATATTTATCCTTGGTTGAAATGCTTCCTGAAATGACTCATGTTCAAACACAACGACCCTGGATGATGTTTCTC  1995

Query 1999  CTGCAAAACTTTGGATTGATCCTAGGTTGGCTTTCTCTCCTGCTCTTGGCTATATATGAGCAAAATATTAAAAT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  CTGCAAAACTTTGGATTGATCCTAGGTTGGCTTTCTCTCCTGCTCTTGGCTATATATGAGCAAAATATTAAAAT  2069

Query 2073  A  2073
            |
Sbjct 2070  A  2070