Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481576
• Subject: NM_001351815.1
• Aligned Length: 1875
• Identities: 1875
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCAGACCAGAGAATGGACATTTCTTCAACCATCAGTGATTTCATGTCCCCGGGCCCCACCGACCTGCTTTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGACCAGAGAATGGACATTTCTTCAACCATCAGTGATTTCATGTCCCCGGGCCCCACCGACCTGCTTTC  74

Query   75  CAGCTCTCTTGGTACCAGTGGTGTGGATTGCAACCGCAAACGGAAAGGCAGCTCCACTGACTACCAAGAAAGCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGCTCTCTTGGTACCAGTGGTGTGGATTGCAACCGCAAACGGAAAGGCAGCTCCACTGACTACCAAGAAAGCA  148

Query  149  TGGACACAGACAAAGATGACCCTCATGGAAGGTTAGAATATACAGAACACCAAGGAAGGATAAAAAATGCAAGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGACACAGACAAAGATGACCCTCATGGAAGGTTAGAATATACAGAACACCAAGGAAGGATAAAAAATGCAAGG  222

Query  223  GAAGCTCACAGTCAGATTGAAAAGCGGCGTCGGGATAAAATGAACAGTTTTATAGATGAATTGGCTTCTTTGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGCTCACAGTCAGATTGAAAAGCGGCGTCGGGATAAAATGAACAGTTTTATAGATGAATTGGCTTCTTTGGT  296

Query  297  ACCAACATGCAACGCAATGTCCAGGAAATTAGATAAACTTACTGTGCTAAGGATGGCTGTTCAGCACATGAAAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACCAACATGCAACGCAATGTCCAGGAAATTAGATAAACTTACTGTGCTAAGGATGGCTGTTCAGCACATGAAAA  370

Query  371  CATTAAGAGGTGCCACCAATCCATACACAGAAGCAAACTACAAACCAACTTTTCTATCAGACGATGAATTGAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CATTAAGAGGTGCCACCAATCCATACACAGAAGCAAACTACAAACCAACTTTTCTATCAGACGATGAATTGAAA  444

Query  445  CACCTCATTCTCAGGGCAGCAGATGGATTTTTGTTTGTCGTAGGATGTGACCGAGGGAAGATACTCTTTGTCTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACCTCATTCTCAGGGCAGCAGATGGATTTTTGTTTGTCGTAGGATGTGACCGAGGGAAGATACTCTTTGTCTC  518

Query  519  AGAGTCTGTCTTCAAGATCCTCAACTACAGCCAGAATGATCTGATTGGTCAGAGTTTGTTTGACTACCTGCATC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAGTCTGTCTTCAAGATCCTCAACTACAGCCAGAATGATCTGATTGGTCAGAGTTTGTTTGACTACCTGCATC  592

Query  593  CTAAAGATATTGCCAAAGTCAAGGAGCAGCTCTCCTCCTCTGACACCGCACCCCGGGAGCGGCTCATAGATGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTAAAGATATTGCCAAAGTCAAGGAGCAGCTCTCCTCCTCTGACACCGCACCCCGGGAGCGGCTCATAGATGCA  666

Query  667  AAAACTGGACTTCCAGTTAAAACAGATATAACCCCTGGGCCATCTCGATTATGTTCTGGAGCACGACGTTCTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAAACTGGACTTCCAGTTAAAACAGATATAACCCCTGGGCCATCTCGATTATGTTCTGGAGCACGACGTTCTTT  740

Query  741  CTTCTGTAGGATGAAGTGTAACAGGCCTTCAGTAAAGGTTGAAGACAAGGACTTCCCCTCTACCTGCTCAAAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTTCTGTAGGATGAAGTGTAACAGGCCTTCAGTAAAGGTTGAAGACAAGGACTTCCCCTCTACCTGCTCAAAGA  814

Query  815  AAAAAGATCGAAAAAGCTTCTGCACAATCCACAGCACAGGCTATTTGAAAAGCTGGCCACCCACAAAGATGGGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAAAGATCGAAAAAGCTTCTGCACAATCCACAGCACAGGCTATTTGAAAAGCTGGCCACCCACAAAGATGGGG  888

Query  889  CTGGATGAAGACAACGAACCAGACAATGAGGGGTGTAACCTCAGCTGCCTCGTCGCAATTGGACGACTGCATTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGGATGAAGACAACGAACCAGACAATGAGGGGTGTAACCTCAGCTGCCTCGTCGCAATTGGACGACTGCATTC  962

Query  963  TCATGTAGTTCCACAACCAGTGAACGGGGAAATCAGGGTGAAATCTATGGAATATGTTTCTCGGCACGCGATAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCATGTAGTTCCACAACCAGTGAACGGGGAAATCAGGGTGAAATCTATGGAATATGTTTCTCGGCACGCGATAG  1036

Query 1037  ATGGAAAGTTTGTTTTTGTAGACCAGAGGGCAACAGCTATTTTGGCATATTTACCACAAGAACTTCTAGGCACA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGGAAAGTTTGTTTTTGTAGACCAGAGGGCAACAGCTATTTTGGCATATTTACCACAAGAACTTCTAGGCACA  1110

Query 1111  TCGTGTTATGAATATTTTCACCAAGATGACATAGGACATCTTGCAGAATGTCATAGGCAAGTTTTACAGACGAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCGTGTTATGAATATTTTCACCAAGATGACATAGGACATCTTGCAGAATGTCATAGGCAAGTTTTACAGACGAG  1184

Query 1185  AGAAAAAATTACAACTAATTGCTATAAATTTAAAATCAAAGATGGTTCTTTTATCACACTACGGAGTCGATGGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGAAAAAATTACAACTAATTGCTATAAATTTAAAATCAAAGATGGTTCTTTTATCACACTACGGAGTCGATGGT  1258

Query 1259  TCAGTTTCATGAACCCTTGGACCAAGGAAGTAGAATATATTGTCTCAACTAACACTGTTGTTTTAGCCAACGTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCAGTTTCATGAACCCTTGGACCAAGGAAGTAGAATATATTGTCTCAACTAACACTGTTGTTTTAGCCAACGTC  1332

Query 1333  CTGGAAGGCGGGGACCCAACCTTCCCACAGCTCACAGCATCCCCCCACAGCATGGACAGCATGCTGCCCTCTGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGGAAGGCGGGGACCCAACCTTCCCACAGCTCACAGCATCCCCCCACAGCATGGACAGCATGCTGCCCTCTGG  1406

Query 1407  AGAAGGTGGCCCAAAGAGGACCCACCCCACTGTTCCAGGGATTCCAGGGGGAACCCGGGCTGGGGCAGGAAAAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGAAGGTGGCCCAAAGAGGACCCACCCCACTGTTCCAGGGATTCCAGGGGGAACCCGGGCTGGGGCAGGAAAAA  1480

Query 1481  TAGGCCGAATGATTGCTGAGGAAATCATGGAAATCCACAGGATAAGAGGGTCATCGCCTTCTAGCTGTGGCTCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TAGGCCGAATGATTGCTGAGGAAATCATGGAAATCCACAGGATAAGAGGGTCATCGCCTTCTAGCTGTGGCTCC  1554

Query 1555  AGCCCATTGAACATCACGAGTACGCCTCCCCCTGATGCCTCTTCTCCAGGAGGCAAGAAGATTTTAAATGGAGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGCCCATTGAACATCACGAGTACGCCTCCCCCTGATGCCTCTTCTCCAGGAGGCAAGAAGATTTTAAATGGAGG  1628

Query 1629  GACTCCAGACATTCCTTCCAGTGGCCTACTATCAGGCCAGGCTCAGGAGAACCCAGGTTATCCATATTCTGATA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GACTCCAGACATTCCTTCCAGTGGCCTACTATCAGGCCAGGCTCAGGAGAACCCAGGTTATCCATATTCTGATA  1702

Query 1703  GTTCTTCTATTCTTGGTGAGAACCCCCACATAGGTATAGACATGATTGACAACGACCAAGGATCAAGTAGTCCC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTTCTTCTATTCTTGGTGAGAACCCCCACATAGGTATAGACATGATTGACAACGACCAAGGATCAAGTAGTCCC  1776

Query 1777  AGTAATGATGAGGCAGCAATGGCTGTCATCATGAGCCTCTTGGAAGCAGATGCTGGACTGGGTGGCCCTGTTGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGTAATGATGAGGCAGCAATGGCTGTCATCATGAGCCTCTTGGAAGCAGATGCTGGACTGGGTGGCCCTGTTGA  1850

Query 1851  CTTTAGTGACTTGCCATGGCCGCTG  1875
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTTTAGTGACTTGCCATGGCCGCTG  1875