Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000481576
- Subject:
- NR_147789.1
- Aligned Length:
- 3108
- Identities:
- 1875
- Gaps:
- 1233
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GCGATTGGTGGGCGGGGGGCCGGGCCTGGGCCGGCGGGGAGCGGATTGGTCGGAAAGTAGGTTAGTGGTGCGAC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 ATTTAGGGAAGGCAGAAAGTAGGTCAGGGACGGAGGTGCCTGTTTACCCGCGCCGGACTCACCGCCGCCGCCGC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CGCGGGATCCGAGTGCGGGCGCGGGCGCGGGCGCTCCCGGCGAGCCACGGTGGTGCTGGCTAGAGTGTATACGT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TTGGACCCAAGCTTAACTTTTCCAATGTGGAATCCTGGGCCTTCATTGGTTTTTGGAAGAAGCTGACCGCCTGA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 AAAGAAATTATAAAACATGAAAATCGCTTTGAGGTGACCAAGTCCAGAGGCCCCTAACTCCTCCCAAGCTGGAT 370
Query 1 ----------------------------------ATGGCAGACCAGAGAATGGACATTTCTTCAACCATCAGTG 40
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTGGGGTGTAAGAACTGTGACTTCAGATCATCCAATGGCAGACCAGAGAATGGACATTTCTTCAACCATCAGTG 444
Query 41 ATTTCATGTCCCCGGGCCCCACCGACCTGCTTTCCAGCTCTCTTGGTACCAGTGGTGTGGATTGCAACCGCAAA 114
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATTTCATGTCCCCGGGCCCCACCGACCTGCTTTCCAGCTCTCTTGGTACCAGTGGTGTGGATTGCAACCGCAAA 518
Query 115 CGGAAAGGCAGCTCCACTGACTACCA------------------------------------------------ 140
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CGGAAAGGCAGCTCCACTGACTACCATTCACAGGTCGAATTTGGGGAGCACAATGGCTGGAGGTCAGATGCCCA 592
Query 141 -----------------------AGAAAGCATGGACACAGACAAAGATGACCCTCATGGAAGGTTAGAATATAC 191
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTAGGAGATGCTATGATTAATATAGAAAGCATGGACACAGACAAAGATGACCCTCATGGAAGGTTAGAATATAC 666
Query 192 AGAACACCAAGGAAGGATAAAAAATGCAAGGGAAGCTCACAGTCAGATTGAAAAGCGGCGTCGGGATAAAATGA 265
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGAACACCAAGGAAGGATAAAAAATGCAAGGGAAGCTCACAGTCAGATTGAAAAGCGGCGTCGGGATAAAATGA 740
Query 266 ACAGTTTTATAGATGAATTGGCTTCTTTGGTACCAACATGCAACGCAATGTCCAGGAAATTAGATAAACTTACT 339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACAGTTTTATAGATGAATTGGCTTCTTTGGTACCAACATGCAACGCAATGTCCAGGAAATTAGATAAACTTACT 814
Query 340 GTGCTAAGGATGGCTGTTCAGCACATGAAAACATTAAGAGGTGCCACCAATCCATACACAGAAGCAAACTACAA 413
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTGCTAAGGATGGCTGTTCAGCACATGAAAACATTAAGAGGTGCCACCAATCCATACACAGAAGCAAACTACAA 888
Query 414 ACCAACTTTTCTATCAGACGATGAATTGAAACACCTCATTCTCAGGGCAGCAGATGGATTTTTGTTTGTCGTAG 487
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACCAACTTTTCTATCAGACGATGAATTGAAACACCTCATTCTCAGGGCAGCAGATGGATTTTTGTTTGTCGTAG 962
Query 488 GATGTGACCGAGGGAAGATACTCTTTGTCTCAGAGTCTGTCTTCAAGATCCTCAACTACAGCCAGAATGATCTG 561
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GATGTGACCGAGGGAAGATACTCTTTGTCTCAGAGTCTGTCTTCAAGATCCTCAACTACAGCCAGAATGATCTG 1036
Query 562 ATTGGTCAGAGTTTGTTTGACTACCTGCATCCTAAAGATATTGCCAAAGTCAAGGAGCAGCTCTCCTCCTCTGA 635
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATTGGTCAGAGTTTGTTTGACTACCTGCATCCTAAAGATATTGCCAAAGTCAAGGAGCAGCTCTCCTCCTCTGA 1110
Query 636 CACCGCACCCCGGGAGCGGCTCATAGATGCAAAAACTGGACTTCCAGTTAAAACAGATATAACCCCTGGGCCAT 709
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CACCGCACCCCGGGAGCGGCTCATAGATGCAAAAACTGGACTTCCAGTTAAAACAGATATAACCCCTGGGCCAT 1184
Query 710 CTCGATTATGTTCTGGAGCACGACGTTCTTTCTTCTGTAGGATGAAGTGTAACAGGCCTTCAGTAAAGGTTGAA 783
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTCGATTATGTTCTGGAGCACGACGTTCTTTCTTCTGTAGGATGAAGTGTAACAGGCCTTCAGTAAAGGTTGAA 1258
Query 784 GACAAGGACTTCCCCTCTACCTGCTCAAAGAAAAAAGATCGAAAAAGCTTCTGCACAATCCACAGCACAGGCTA 857
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GACAAGGACTTCCCCTCTACCTGCTCAAAGAAAAAAGATCGAAAAAGCTTCTGCACAATCCACAGCACAGGCTA 1332
Query 858 TTTGAAAAGCTGGCCACCCACAAAGATGGGGCTGGATGAAGACAACGAACCAGACAATGAGGGGTGTAACCTCA 931
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TTTGAAAAGCTGGCCACCCACAAAGATGGGGCTGGATGAAGACAACGAACCAGACAATGAGGGGTGTAACCTCA 1406
Query 932 GCTGCCTCGTCGCAATTGGACGACTGCATTCTCATGTAGTTCCACAACCAGTGAACGGGGAAATCAGGGTGAAA 1005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCTGCCTCGTCGCAATTGGACGACTGCATTCTCATGTAGTTCCACAACCAGTGAACGGGGAAATCAGGGTGAAA 1480
Query 1006 TCTATGGAATATGTTTCTCGGCACGCGATAGATGGAAAGTTTGTTTTTGTAGACCAGAGGGCAACAGCTATTTT 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCTATGGAATATGTTTCTCGGCACGCGATAGATGGAAAGTTTGTTTTTGTAGACCAGAGGGCAACAGCTATTTT 1554
Query 1080 GGCATATTTACCACAAGAACTTCTAGGCACATCGTGTTATGAATATTTTCACCAAGATGACATAGGACATCTTG 1153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GGCATATTTACCACAAGAACTTCTAGGCACATCGTGTTATGAATATTTTCACCAAGATGACATAGGACATCTTG 1628
Query 1154 CAGAATGTCATAGGCAAGTTTTACAGACGAGAGAAAAAATTACAACTAATTGCTATAAATTTAAAATCAAAGAT 1227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CAGAATGTCATAGGCAAGTTTTACAGACGAGAGAAAAAATTACAACTAATTGCTATAAATTTAAAATCAAAGAT 1702
Query 1228 GGTTCTTTTATCACACTACGGAGTCGATGGTTCAGTTTCATGAACCCTTGGACCAAGGAAGTAGAATATATTGT 1301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GGTTCTTTTATCACACTACGGAGTCGATGGTTCAGTTTCATGAACCCTTGGACCAAGGAAGTAGAATATATTGT 1776
Query 1302 CTCAACTAACACTGTTGTTTTAGCCAACGTCCTGGAAGGCGGGGACCCAACCTTCCCACAGCTCACAGCATCCC 1375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CTCAACTAACACTGTTGTTTTAGCCAACGTCCTGGAAGGCGGGGACCCAACCTTCCCACAGCTCACAGCATCCC 1850
Query 1376 CCCACAGCATGGACAGCATGCTGCCCTCTGGAGAAGGTGGCCCAAAGAGGACCCACCCCACTGTTCCAGGGATT 1449
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CCCACAGCATGGACAGCATGCTGCCCTCTGGAGAAGGTGGCCCAAAGAGGACCCACCCCACTGTTCCAGGGATT 1924
Query 1450 CCAGGGGGAACCCGGGCTGGGGCAGGAAAAATAGGCCGAATGATTGCTGAGGAAATCATGGAAATCCACAGGAT 1523
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CCAGGGGGAACCCGGGCTGGGGCAGGAAAAATAGGCCGAATGATTGCTGAGGAAATCATGGAAATCCACAGGAT 1998
Query 1524 AAGAGGGTCATCGCCTTCTAGCTGTGGCTCCAGCCCATTGAACATCACGAGTACGCCTCCCCCTGATGCCTCTT 1597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AAGAGGGTCATCGCCTTCTAGCTGTGGCTCCAGCCCATTGAACATCACGAGTACGCCTCCCCCTGATGCCTCTT 2072
Query 1598 CTCCAGGAGGCAAGAAG--------------------------------------------------------- 1614
|||||||||||||||||
Sbjct 2073 CTCCAGGAGGCAAGAAGATTCCACATTGCAACTCACCTTTAAGAAACTTCTACGTGTCAAGTTTTGAAGTGGTA 2146
Query 1615 -------------------------------------------------------------------------- 1614
Sbjct 2147 TCAAAAAAGAATACAATTATTTGAAAAGTCTATTAAAATATGCCTCCCTTTTCCAACTACTTATCTGTGGGAGG 2220
Query 1615 -------------------------------------------------------------------------- 1614
Sbjct 2221 TTGGATTTCCTTCATATACTTGAATCACAAGACGTATCTAAATAGACTGAATGGAAAAACATATATGAGAATCC 2294
Query 1615 ----------------------------------------ATTTTAAATGGAGGGACTCCAGACATTCCTTCCA 1648
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 AGTTGAAAATTATTAAGCCAGACATTAGATTTGCAAAAATATTTTAAATGGAGGGACTCCAGACATTCCTTCCA 2368
Query 1649 GTGGCCTACTATCAGGCCAGGCTCAGGAGAACCCAGGTTATCCATATTCTGATAGTTCTTCTATTCTTGGTGAG 1722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 GTGGCCTACTATCAGGCCAGGCTCAGGAGAACCCAGGTTATCCATATTCTGATAGTTCTTCTATTCTTGGTGAG 2442
Query 1723 AACCCCCACATAGGTATAGACATGATTGACAACGACCAAGGATCAAGTAGTCCCAGTAATGATGAGGCAGCAAT 1796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 AACCCCCACATAGGTATAGACATGATTGACAACGACCAAGGATCAAGTAGTCCCAGTAATGATGAGGCAGCAAT 2516
Query 1797 GGCTGTCATCATGAGCCTCTTGGAAGCAGATGCTGGACTGGGTGGCCCTGTTGACTTTAGTGACTTGCCATGGC 1870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 GGCTGTCATCATGAGCCTCTTGGAAGCAGATGCTGGACTGGGTGGCCCTGTTGACTTTAGTGACTTGCCATGGC 2590
Query 1871 CGCTG--------------------------------------------------------------------- 1875
|||||
Sbjct 2591 CGCTGTAAACACTACATGTTGCTTTGGCAACAGCTATAGTATCAAAGTGCATTACTGGTGGAGTTTTACAGTCT 2664
Query 1876 -------------------------------------------------------------------------- 1875
Sbjct 2665 GTGAAGCTTACTGGATAAGGAGAGAATAGCTTTTATGTACTGACTTCATAAAAGCCATCTCAGAGCCATTGATA 2738
Query 1876 -------------------------------------------------------------------------- 1875
Sbjct 2739 CAAGTCAATCTTACTATATGTAACTTCAGACAAAGTGGAACTAAGCCTGCTCCAGTGTTTCCTCATCATTGATT 2812
Query 1876 -------------------------------------------------------------------------- 1875
Sbjct 2813 ATTGGGCTAGCTGTGGATAGCTTGCATTAATTGTATATTTTGGATTCTGTTTGTGTTGAATTTTTTAATCATTG 2886
Query 1876 -------------------------------------------------------------------------- 1875
Sbjct 2887 TGCACAGAAGCATCATTGGTAGCTTTTATATGCAAATGGTCATTTCAGATGTATGGTGTTTTTACACTACAAAG 2960
Query 1876 -------------------------------------------------------------------------- 1875
Sbjct 2961 AAGTCCCCCATGTGGATATTTCTTATACTAATTGTATCATAAAGCCGTTTATTCTTCCTTGTAAGAATCCTTTA 3034
Query 1876 -------------------------------------------------------------------------- 1875
Sbjct 3035 CTATAAATATGGGTTAAAGTATAATGTACTAGACAGTTAAATATTTTTAATAAATGTTTCCCTTGTTCTATAAA 3108