Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481576
• Subject: XM_024448522.1
• Aligned Length: 1903
• Identities: 1786
• Gaps: 104

Alignment

Query    1  ATGGCAGACCAGAGAATGGACATTTCTTCAACCATCAGTGATTTCATGTCCCCGGGCCCCACCGACCTGCT---  71
                                                         ||||            ||...|||||   
Sbjct    1  ---------------------------------------------ATGT------------CCTTTCTGCTGAA  17

Query   72  -TTC-CAGCTC---TCTTGGTACCAGTGGTGTGGATTGCAACCGCAA--ACGGAAAGGCAGCT--CCAC-----  131
             ||| |||.||   | ||||            |||  |||    |||  .|.|.|.|.|||.|  ||||     
Sbjct   18  GTTCACAGGTCGAAT-TTGG------------GGA--GCA----CAATGGCTGGAGGTCAGATGCCCACTAGGA  72

Query  132  -------TGACTACCA-AGAAAGCATGGACACAGACAAAGATGACCCTCATGGAAGGTTAGAATATACAGAACA  197
                   |||.||..| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   73  GATGCTATGATTAATATAGAAAGCATGGACACAGACAAAGATGACCCTCATGGAAGGTTAGAATATACAGAACA  146

Query  198  CCAAGGAAGGATAAAAAATGCAAGGGAAGCTCACAGTCAGATTGAAAAGCGGCGTCGGGATAAAATGAACAGTT  271
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  147  CCAAGGAAGGATAAAAAATGCAAGGGAAGCTCACAGTCAGATTGAAAAGCGGCGTCGGGATAAAATGAACAGTT  220

Query  272  TTATAGATGAATTGGCTTCTTTGGTACCAACATGCAACGCAATGTCCAGGAAATTAGATAAACTTACTGTGCTA  345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  221  TTATAGATGAATTGGCTTCTTTGGTACCAACATGCAACGCAATGTCCAGGAAATTAGATAAACTTACTGTGCTA  294

Query  346  AGGATGGCTGTTCAGCACATGAAAACATTAAGAGGTGCCACCAATCCATACACAGAAGCAAACTACAAACCAAC  419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  AGGATGGCTGTTCAGCACATGAAAACATTAAGAGGTGCCACCAATCCATACACAGAAGCAAACTACAAACCAAC  368

Query  420  TTTTCTATCAGACGATGAATTGAAACACCTCATTCTCAGGGCAGCAGATGGATTTTTGTTTGTCGTAGGATGTG  493
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  TTTTCTATCAGACGATGAATTGAAACACCTCATTCTCAGGGCAGCAGATGGATTTTTGTTTGTCGTAGGATGTG  442

Query  494  ACCGAGGGAAGATACTCTTTGTCTCAGAGTCTGTCTTCAAGATCCTCAACTACAGCCAGAATGATCTGATTGGT  567
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  ACCGAGGGAAGATACTCTTTGTCTCAGAGTCTGTCTTCAAGATCCTCAACTACAGCCAGAATGATCTGATTGGT  516

Query  568  CAGAGTTTGTTTGACTACCTGCATCCTAAAGATATTGCCAAAGTCAAGGAGCAGCTCTCCTCCTCTGACACCGC  641
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  CAGAGTTTGTTTGACTACCTGCATCCTAAAGATATTGCCAAAGTCAAGGAGCAGCTCTCCTCCTCTGACACCGC  590

Query  642  ACCCCGGGAGCGGCTCATAGATGCAAAAACTGGACTTCCAGTTAAAACAGATATAACCCCTGGGCCATCTCGAT  715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  ACCCCGGGAGCGGCTCATAGATGCAAAAACTGGACTTCCAGTTAAAACAGATATAACCCCTGGGCCATCTCGAT  664

Query  716  TATGTTCTGGAGCACGACGTTCTTTCTTCTGTAGGATGAAGTGTAACAGGCCTTCAGTAAAGGTTGAAGACAAG  789
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  TATGTTCTGGAGCACGACGTTCTTTCTTCTGTAGGATGAAGTGTAACAGGCCTTCAGTAAAGGTTGAAGACAAG  738

Query  790  GACTTCCCCTCTACCTGCTCAAAGAAAAA---AGATCGAAAAAGCTTCTGCACAATCCACAGCACAGGCTATTT  860
            |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  GACTTCCCCTCTACCTGCTCAAAGAAAAAAGCAGATCGAAAAAGCTTCTGCACAATCCACAGCACAGGCTATTT  812

Query  861  GAAAAGCTGGCCACCCACAAAGATGGGGCTGGATGAAGACAACGAACCAGACAATGAGGGGTGTAACCTCAGCT  934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  GAAAAGCTGGCCACCCACAAAGATGGGGCTGGATGAAGACAACGAACCAGACAATGAGGGGTGTAACCTCAGCT  886

Query  935  GCCTCGTCGCAATTGGACGACTGCATTCTCATGTAGTTCCACAACCAGTGAACGGGGAAATCAGGGTGAAATCT  1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  GCCTCGTCGCAATTGGACGACTGCATTCTCATGTAGTTCCACAACCAGTGAACGGGGAAATCAGGGTGAAATCT  960

Query 1009  ATGGAATATGTTTCTCGGCACGCGATAGATGGAAAGTTTGTTTTTGTAGACCAGAGGGCAACAGCTATTTTGGC  1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  ATGGAATATGTTTCTCGGCACGCGATAGATGGAAAGTTTGTTTTTGTAGACCAGAGGGCAACAGCTATTTTGGC  1034

Query 1083  ATATTTACCACAAGAACTTCTAGGCACATCGTGTTATGAATATTTTCACCAAGATGACATAGGACATCTTGCAG  1156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  ATATTTACCACAAGAACTTCTAGGCACATCGTGTTATGAATATTTTCACCAAGATGACATAGGACATCTTGCAG  1108

Query 1157  AATGTCATAGGCAAGTTTTACAGACGAGAGAAAAAATTACAACTAATTGCTATAAATTTAAAATCAAAGATGGT  1230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  AATGTCATAGGCAAGTTTTACAGACGAGAGAAAAAATTACAACTAATTGCTATAAATTTAAAATCAAAGATGGT  1182

Query 1231  TCTTTTATCACACTACGGAGTCGATGGTTCAGTTTCATGAACCCTTGGACCAAGGAAGTAGAATATATTGTCTC  1304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  TCTTTTATCACACTACGGAGTCGATGGTTCAGTTTCATGAACCCTTGGACCAAGGAAGTAGAATATATTGTCTC  1256

Query 1305  AACTAACACTGTTGTTTTAGCCAACGTCCTGGAAGGCGGGGACCCAACCTTCCCACAGCTCACAGCATCCCCCC  1378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257  AACTAACACTGTTGTTTTAGCCAACGTCCTGGAAGGCGGGGACCCAACCTTCCCACAGCTCACAGCATCCCCCC  1330

Query 1379  ACAGCATGGACAGCATGCTGCCCTCTGGAGAAGGTGGCCCAAAGAGGACCCACCCCACTGTTCCAGGGATTCCA  1452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331  ACAGCATGGACAGCATGCTGCCCTCTGGAGAAGGTGGCCCAAAGAGGACCCACCCCACTGTTCCAGGGATTCCA  1404

Query 1453  GGGGGAACCCGGGCTGGGGCAGGAAAAATAGGCCGAATGATTGCTGAGGAAATCATGGAAATCCACAGGATAAG  1526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405  GGGGGAACCCGGGCTGGGGCAGGAAAAATAGGCCGAATGATTGCTGAGGAAATCATGGAAATCCACAGGATAAG  1478

Query 1527  AGGGTCATCGCCTTCTAGCTGTGGCTCCAGCCCATTGAACATCACGAGTACGCCTCCCCCTGATGCCTCTTCTC  1600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479  AGGGTCATCGCCTTCTAGCTGTGGCTCCAGCCCATTGAACATCACGAGTACGCCTCCCCCTGATGCCTCTTCTC  1552

Query 1601  CAGGAGGCAAGAAGATTTTAAATGGAGGGACTCCAGACATTCCTTCCAGTGGCCTACTATCAGGCCAGGCTCAG  1674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553  CAGGAGGCAAGAAGATTTTAAATGGAGGGACTCCAGACATTCCTTCCAGTGGCCTACTATCAGGCCAGGCTCAG  1626

Query 1675  GAGAACCCAGGTTATCCATATTCTGATAGTTCTTCTATTCTTGGTGAGAACCCCCACATAGGTATAGACATGAT  1748
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627  GAGAACCCAGGTTATCCATATTCTGATAGTTCTTCTATTCTTGGTGAGAACCCCCACATAGGTATAGACATGAT  1700

Query 1749  TGACAACGACCAAGGATCAAGTAGTCCCAGTAATGATGAGGCAGCAATGGCTGTCATCATGAGCCTCTTGGAAG  1822
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1701  TGACAACGACCAAGGATCAAGTAGTCCCAGTAATGATGAGGCAGCAATGGCTGTCATCATGAGCCTCTTGGAAG  1774

Query 1823  CAGATGCTGGACTGGGTGGCCCTGTTGACTTTAGTGACTTGCCATGGCCGCTG  1875
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1775  CAGATGCTGGACTGGGTGGCCCTGTTGACTTTAGTGACTTGCCATGGCCGCTG  1827