Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481585
• Subject: XM_024453667.1
• Aligned Length: 1920
• Identities: 1716
• Gaps: 204

Alignment

Query    1  ------------------------------------ATGAAAGGCAGTAATAGAAATAAGGATCATTCAGCAGA  38
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCTACATCCTGATACACTCACTGTCACAGTAATGAAAGGCAGTAATAGAAATAAGGATCATTCAGCAGA  74

Query   39  AGGAGAAGGGGTTGGAAAACGACCAAAACGAAAGTGTCTTCAGTGGCATCCATTGCTAGCAAAGAAACTTCTTG  112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGGAGAAGGGGTTGGAAAACGACCAAAACGAAAGTGTCTTCAGTGGCATCCATTGCTAGCAAAGAAACTTCTTG  148

Query  113  ATTTTTCAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGACGAAGAGGAGGATATTGATAAGGTTCAACTTCTTGGGGCCGATGGC  186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATTTTTCAGAAGAGGAAGAAGAGGAAGACGAAGAGGAGGATATTGATAAGGTTCAACTTCTTGGGGCCGATGGC  222

Query  187  CTAGAGCAAGATGTTGGTGAAACTGAAGATGATGAATCACCAGAGCAGCGAGCCCGGAGACCAATGAATGCATT  260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTAGAGCAAGATGTTGGTGAAACTGAAGATGATGAATCACCAGAGCAGCGAGCCCGGAGACCAATGAATGCATT  296

Query  261  TCTTTTATTTTGCAAACGCCATCGCTCTCTTGTACGTCAGGAACACCCCAGGCTTGATAACCGAGGTGCTACCA  334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCTTTTATTTTGCAAACGCCATCGCTCTCTTGTACGTCAGGAACACCCCAGGCTTGATAACCGAGGTGCTACCA  370

Query  335  AGATACTAGCTGATTGGTGGGCTGTTCTTGATCCAAAGGAAAAGCAGAAATACACAGACATGGCCAAGGAGTAT  408
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGATACTAGCTGATTGGTGGGCTGTTCTTGATCCAAAGGAAAAGCAGAAATACACAGACATGGCCAAGGAGTAT  444

Query  409  AAGGATGCATTTATGAAAGCAAATCCTGGCTACAAATGGTGTCCTACCACAAACAAGCCTGTGAAATCCCCAAC  482
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGGATGCATTTATGAAAGCAAATCCTGGCTACAAATGGTGTCCTACCACAAACAAGCCTGTGAAATCCCCAAC  518

Query  483  ACCCACTGTCAATCCACGAAAGAAACTTTGGGCCTTCCCATCTGACTCTTCAAGAGACTTGCCAAGCCCCAAGA  556
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACCCACTGTCAATCCACGAAAGAAACTTTGGGCCTTCCCATCTGACTCTTCAAGAGACTTGCCAAGCCCCAAGA  592

Query  557  AAGCAAAGACTGAAGAAATGCCTCAGCTTAACTTTGGAATGGCTGATCCTACTCAAATGGGAGGCCTGAGTATG  630
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGCAAAGACTGAAGAAATGCCTCAGCTTAACTTTGGAATGGCTGATCCTACTCAAATGGGAGGCCTGAGTATG  666

Query  631  CTGCTGTTAGCTGGAGAACATGCTCTTGGCACACCAGAGGTATCCTCTGGCACATGCAGGCCTGATGTTTCAGA  704
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGCTGTTAGCTGGAGAACATGCTCTTGGCACACCAGAGGTATCCTCTGGCACATGCAGGCCTGATGTTTCAGA  740

Query  705  ATCTCCTGAATTACGTCAGAAGTCACCATTGTTTCAGTTTGCCGAGATATCTTCAAGTACGTCCCACTCTGATG  778
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATCTCCTGAATTACGTCAGAAGTCACCATTGTTTCAGTTTGCCGAGATATCTTCAAGTACGTCCCACTCTGATG  814

Query  779  CTTCTACAAAGCAGTGTCAAACATCTGCCTTGTTTCAGTTTGCAGAGATTTCTTCAAACACTTCGCAGTTGGGT  852
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTTCTACAAAGCAGTGTCAAACATCTGCCTTGTTTCAGTTTGCAGAGATTTCTTCAAACACTTCGCAGTTGGGT  888

Query  853  GGTGCTGAGCCTGTAAAACGCTGTGGAAAGTCTGCACTCTTTCAACTGGCAGAGGAAAACGAAGCTCAGGAAAA  926
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGTGCTGAGCCTGTAAAACGCTGTGGAAAGTCTGCACTCTTTCAACTGGCAGAGGAAAACGAAGCTCAGGAAAA  962

Query  927  GGAAACTCCTCTGATCATGAAGGGTGTTGGAATGAAGAAAGCTGGACATTTAGTCAGAGTGGGACCAGTGGGAG  1000
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAAACTCCTCTGATCATGAAGGGTGTTGGAATGAAGAAAGCTGGACATTTAGTCAGAGTGGGACCAGTGGGAG  1036

Query 1001  CAAGAAGTTCAAGAAGACAAAGCCAAAAGAAGACTGTCTCCTTGGCTCCGCAAAGCTGGATGAAGAATTTGAAA  1074
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAAGAAGTTCAAGAAGACAAAGCCAAAAGAAGACTGTCTCCTTGGCTCCGCAAAGCTGGATGAAGAATTTGAAA  1110

Query 1075  AAAAATTCAACAGCCTCCCTCAATATAGTCCTGTTACATTTGACCGGAAATGTGTACCTGTCCCAAGAAAAAAG  1148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAAATTCAACAGCCTCCCTCAATATAGTCCTGTTACATTTGACCGGAAATGTGTACCTGTCCCAAGAAAAAAG  1184

Query 1149  AAGAAGACTGGAAATGTGTCCTCAGAACCGACTAAAACCAGCAAAGGTCCTTTCCAGTCTCAGAAAAAGAACTT  1222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                
Sbjct 1185  AAGAAGACTGGAAATGTGTCCTCAGAACCGACTAAAACCAGC--------------------------------  1226

Query 1223  ATTCCACAAAATTGTCAGCAAATATAAGCACAAAAAGGAGAAGCCCAATGTTCCGGAAAAAGGAAGTGGGGATA  1296
                                                                      ||||||||||||||||
Sbjct 1227  ----------------------------------------------------------AAAGGAAGTGGGGATA  1242

Query 1297  AATGGTCAAACAAGCAACTCTTCTTGGATGCCATTCACCCTACAGAAGCCATATTTTCAGAAGACAGAAACACC  1370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct 1243  AATGGTCAAACAAGCAACTCTTCTTGGATGCCATTCACCCTACAGA----------------------------  1288

Query 1371  ATGGAGCCTGTTCATAAGGTTAAAAATATCCCATCCATTTTCAACACTCCAGAGCCAACAACAACGCAAGAACC  1444
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1289  --------------------------------------------------AGAGCCAACAACAACGCAAGAACC  1312

Query 1445  TTTGGTGGGCAGCCAAAAGAGAAAAGCAAGGAAAACCAAGATTACACACCTTGTCAGGACAGCAGATGGCCGGG  1518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313  TTTGGTGGGCAGCCAAAAGAGAAAAGCAAGGAAAACCAAGATTACACACCTTGTCAGGACAGCAGATGGCCGGG  1386

Query 1519  TATCACCAGCAGGAGGTACTTTGGATGACAAACCAAAGGAACAACTGCAGAGGAGTCTCCCTAAAGCAACTGAG  1592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1387  TATCACCAGCAGGAGGTACTTTGGATGACAAACCAAAGGAACAACTGCAGAGGAGTCTCCCTAAAGCAACTGAG  1460

Query 1593  ACAGACTGCAATGACAAATGCTCACACAACACCGAGGTCGGGGAGACGCGGAGCAGTACTCCAGAAATGCCTGC  1666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1461  ACAGACTGCAATGACAAATGCTCACACAACACCGAGGTCGGGGAGACGCGGAGCAGTACTCCAGAAATGCCTGC  1534

Query 1667  CGTGTCTGCGTTCTTTAGCCTCGCTGCGCTGGCTGAAGTGGCAGCCATGGAAAATGTGCACAGAGGTCAGAGGT  1740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1535  CGTGTCTGCGTTCTTTAGCCTCGCTGCGCTGGCTGAAGTGGCAGCCATGGAAAATGTGCACAGAGGTCAGAGGT  1608

Query 1741  CAACTCCGCTCACCCATGATGGACAGCCAAAAGAAATGCCGCAGGCTCCTGTACTTATTTCCTGCGCTGACCAG  1814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1609  CAACTCCGCTCACCCATGATGGACAGCCAAAAGAAATGCCGCAGGCTCCTGTACTTATTTCCTGCGCTGACCAG  1682

Query 1815  TGAAGCGCCCTTTCATTGTAAAACATTGTGCTTTACCTACTACCCTAGCCTTGTCTTTACCGAGGGATGC  1884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1683  TGAAGCGCCCTTTCATTGTAAAACATTGTGCTTTACCTACTACCCTAGCCTTGTCTTTACCGAGGGATGC  1752