Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000481604
- Subject:
- XM_024446663.1
- Aligned Length:
- 2479
- Identities:
- 1855
- Gaps:
- 619
Alignment
Query 1 ATGGCGACCTCCGAGAGGGGCTCTCCTGAGGACCAGAGCTGCCTCTCTCCTGAGAGGCTTGGGCAGATCCCGAA 74
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGACCTCCGAGA-GGGCTCTCCTGAGGACCAGAGCTGCCTCTCTCCTGAGAGGCTTGGGCAGATCCCGAA 73
Query 75 CTGGAGCCCGATCGTTACAGTTTCGCGCAGAAAAAGAGCGTCAGCCTTGCTGGTCTTTTCCCATGGGGCAGAAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 CTGGAGCCCGATCGTTACAGTTTCGCGCAGAAAAAGAGCGTCAGCCTTGCTGGTCTTTTCCCATGGGGCAGAAG 147
Query 149 ACGAAAGGCAGCTCTAACATAGCCTCCTCCTACCTGCTCCAGCAGCTCATGCACCGCTATCAGGAGCTGGACTC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 ACGAAAGGCAGCTCTAACATAGCCTCCTCCTACCTGCTCCAGCAGCTCATGCACCGCTATCAGGAGCTGGACTC 221
Query 223 GGACGGAGATGAGGACCAGGGCGAGGGCGAGGCGGGATCCGAGGAGTCCTCAGAGTCCGAAATGCTGAATTTGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 GGACGGAGATGAGGACCAGGGCGAGGGCGAGGCGGGATCCGAGGAGTCCTCAGAGTCCGAAATGCTGAATTTGG 295
Query 297 AGGAGGAATTTGATGGGGTCCTGAGAGAGGAGGCTGTGGCCAAAGCACTCCATCACTTGGGGCGCTCAGGCTCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 AGGAGGAATTTGATGGGGTCCTGAGAGAGGAGGCTGTGGCCAAAGCACTCCATCACTTGGGGCGCTCAGGCTCT 369
Query 371 GGGACTGAGCAAGTCTACCTCAATCTAACTTTATCAGGTTGTAATTTAATTGATGTTAGCATTCTCTGTGGATA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 GGGACTGAGCAAGTCTACCTCAATCTAACTTTATCAGGTTGTAATTTAATTGATGTTAGCATTCTCTGTGGATA 443
Query 445 TGTTCATCTACAGAAGTTGGATCTTTCAGCGAATAAAATTGAAGATTTATCTTGTGTGAGTTGTATGCCTTATC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 TGTTCATCTACAGAAGTTGGATCTTTCAGCGAATAAAATTGAAGATTTATCTTGTGTGAGTTGTATGCCTTATC 517
Query 519 TCCTAGAACTTAATGCTTCTCAAAATAATTTGACTACGTTCTTCAATTTCAAGCCACCCAAAAACCTCAAGAAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 TCCTAGAACTTAATGCTTCTCAAAATAATTTGACTACGTTCTTCAATTTCAAGCCACCCAAAAACCTCAAGAAG 591
Query 593 GCGGATTTTTCCCACAACCAAATTTCTGAAATTTGTGATTTGTCAGCGTATCATGCTCTCACTAAACTAATTTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 GCGGATTTTTCCCACAACCAAATTTCTGAAATTTGTGATTTGTCAGCGTATCATGCTCTCACTAAACTAATTTT 665
Query 667 GGATGGCAATGAGATAGAAGAAATCAGTGGACTAGAGATGTGCAACAACCTAATTCACCTTAGTTTGGCCAACA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 GGATGGCAATGAGATAGAAGAAATCAGTGGACTAGAGATGTGCAACAACCTAATTCACCTTAGTTTGGCCAACA 739
Query 741 ATAAGATCACGACAATTAATGGCTTAAACAAGTTACCAATCAAAATACTTTGTCTGAGCAATAACCAGATTGAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 ATAAGATCACGACAATTAATGGCTTAAACAAGTTACCAATCAAAATACTTTGTCTGAGCAATAACCAGATTGAG 813
Query 815 ATGATCACAGGTTTGGAGGATCTGAAAGCCCTGCAGAACCTGGATCTGTCCCACAATCAGATAAGCAGCCTCCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 ATGATCACAGGTTTGGAGGATCTGAAAGCCCTGCAGAACCTGGATCTGTCCCACAATCAGATAAGCAGCCTCCA 887
Query 889 AGGCTTAGAGAATCATGACCTCCTGGAAGTGATCAACCTGGAGGATAATAAGATTGCTGAGCTGAGAGAAATAG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 AGGCTTAGAGAATCATGACCTCCTGGAAGTGATCAACCTGGAGGATAATAAGATTGCTGAGCTGAGAGAAATAG 961
Query 963 AATACATTAAAAATTTACCCATCCTTCGAGTTCTCAATCTTCTAGAAAATCCAATTCAGGAAAAGTCTGAATAT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 AATACATTAAAAATTTACCCATCCTTCGAGTTCTCAATCTTCTAGAAAATCCAATTCAGGAAAAGTCTGAATAT 1035
Query 1037 TGGTTCTTCGTAATTTTTATGCTTCTGCGATTAACAGAATTAGATCAGAAGAAGATTAAAGTGGAAGAAAAGGT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 TGGTTCTTCGTAATTTTTATGCTTCTGCGATTAACAGAATTAGATCAGAAGAAGATTAAAGTGGAAGAAAAGGT 1109
Query 1111 TTCAGCAGTGAATAAATATGATCCTCCCCCTGAAGTGGTTGCAGCTCAAGACCACCTGACCCATGTTGTCAACA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 TTCAGCAGTGAATAAATATGATCCTCCCCCTGAAGTGGTTGCAGCTCAAGACCACCTGACCCATGTTGTCAACA 1183
Query 1185 GCGTGATGCAGCCGCAGAGGATCTTTGACAGCACTCTTCCCAGCCTGGATGCTCCTTATCCCATGCTGATACTA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 GCGTGATGCAGCCGCAGAGGATCTTTGACAGCACTCTTCCCAGCCTGGATGCCCCTTATCCCATGCTGATACTA 1257
Query 1259 GCTGGTCCTGAAGCTTGTGGGAAACGAGAGCTTGCCCATCGCCTCTGCAGACAGTTTAGCACTTACTTCAGATA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 GCTGGTCCTGAAGCTTGTGGGAAACGAGAGCTTGCCCATCGCCTCTGCAGACAGTTTAGCACTTACTTCAGATA 1331
Query 1333 TGGGGCCTGTCATACCACAAGACCACCTTACTTTGGAGAAGGGGATCGAGTTGATTATCATTTTATCTCTCAAG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 TGGGGCCTGTCATACCACAAGACCACCTTACTTTGGAGAAGGGGATCGAGTTGATTATCATTTTATCTCTCAAG 1405
Query 1407 ACGTTTTTGATGAAATGGTGAACATGGGGAAATTCATTCTAACATTTAGTTATGGTAATCACAAGTATGGATTA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 ACGTTTTTGATGAAATGGTGAACATGGGGAAATTCATTCTAACATTTAGTTATGGTAATCACAAGTATGGATTA 1479
Query 1481 AATAGGGACACCGTAGAAGGTATCGCAAGAGATGGTTTGGCAAGCTGTATTCATATGGAAATAGAAGGTGTAAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 AATAGGGACACCGTAGAAGGTATCGCAAGAGATGGTTTGGCAAGCTGTATTCATATGGAAATAGAAGGTGTAAG 1553
Query 1555 AAGTTTGAAATATTCCTATTTTGAGCCTCGTTATATCCTGGTGGTGCCCATGAACAAGGAAAAATATGAGGGAT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 AAGTTTGAAATATTCCTATTTTGAGCCTCGTTATATCCTGGTGGTGCCCATGAACAAGGAAAAATATGAGGGAT 1627
Query 1629 ATTTGCGGAGAAAAGGATTATTCAGTCGTGCAGAAATTGAATTTGCTGTCTCCAGAGTGGACCTTTATATTAAA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 ATTTGCGGAGAAAAGGATTATTCAGTCGTGCAGAAATTGAATTTGCTGTCTCCAGAGTGGACCTTTATATTAAA 1701
Query 1703 ATTAATCAGAATTTTCCGGGATATTTTGATGAGGTAATCAATGCAGATGATCTGGATGTTGCCTACCAAAAACT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702 ATTAATCAGAATTTTCCGGGATATTTTGATGAGGTAATCAATGCAGATGATCTGGATGTTGCCTACCAAAAACT 1775
Query 1777 GAGTCAGCTCATTAGAGAATACCTTGGATTGACTGAGGAACTTGCCAAGAGTTTGGCTACAACTGCAGATGTTA 1850
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||| .
Sbjct 1776 GAGTCAGCTCATTAGAGAATACCTTGGATTGACTGAGGAACCTGCCAAGAGTTTGGCTACAACTGCAG-----G 1844
Query 1851 AGACATCCCACCTGAA---ACCTGAAGCGCATCCTACAAAGTATATTTCTTCGAATATGGGTGATTTCCTGCAT 1921
||| |||| ||| ||.|.|
Sbjct 1845 AGA---------TGAAGTGACC---AGGGTA------------------------------------------- 1863
Query 1922 TCTACAGACAGAAACTACCTCATTAAATTTTGGGCCAAACTTTCAGCCAAAAAAACACCAGCGGAAAGAGATTC 1995
Sbjct 1864 -------------------------------------------------------------------------- 1863
Query 1996 TATACACAGACAGCACGAGGCAGCCCGGCAAGCTCTAATGGGAAGGATACGCCCTGATCACACACTCCTATTTC 2069
Sbjct 1864 -------------------------------------------------------------------------- 1863
Query 2070 AAAGGGGTCCAGTACCAGCACCTCTCACCAGTGGTCTACACTATTATACAACTTTAGAAGAACTCTGGAAAAGT 2143
Sbjct 1864 -------------------------------------------------------------------------- 1863
Query 2144 TTTGATCTTTGTGAAGACTATTTTAAACCTCCATTTGGACCATATCCTGAAAAGAGTGGGAAGGATTCCTTGGT 2217
Sbjct 1864 -------------------------------------------------------------------------- 1863
Query 2218 TTCCATGAAATGTTCATTGTTTCGGTTCTGTCCGTGGTCAAAAGAATTGCCTTTCCAGCCTCCGGAGGGGAGCA 2291
Sbjct 1864 -------------------------------------------------------------------------- 1863
Query 2292 TTTCTTCACACCTAGGATCAGGAGCCAGTGACAGTGAGACCGAAGAGACCCGGAAAGCACTACCTATACAATCA 2365
Sbjct 1864 -------------------------------------------------------------------------- 1863
Query 2366 TTTTCACATGAAAAAGAGTCTCACCAACACAGACAACACTCGGTCCCAGTCATCAGTCGCCCAGGTTCCAACGT 2439
Sbjct 1864 -------------------------------------------------------------------------- 1863
Query 2440 CAAACCCACCCTCCCTCCAATCCCTCAGGGCCGCAGG 2476
Sbjct 1864 ------------------------------------- 1863