Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481658
• Subject: NM_006300.4
• Aligned Length: 1450
• Identities: 1246
• Gaps: 32

Alignment

Query    1  ATGACCATGTCCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCAGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT  74
            |||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGTTCTTCACTGAGGAGGAACTGGGGCTACT  74

Query   75  GGACCTTGCCCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATC  148
            |||||.||||||||||||||||||.|.|||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCAAGACGTGATGCTTGAGAACTTCACGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATC  148

Query  149  AACCATTCCACCGAGATACTTTCCACTTTCTAAGGGAGGAAAAGTTTTGGATGATGGATATAGCAACCCAAAGA  222
            ||||||||||||      ||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||
Sbjct  149  AACCATTCCACC------CTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAAGA  216

Query  223  GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAACCTGAGATGAAGACTTTTCCAGAAGCAGGACCACATGAAGGGTGGTC  296
            |||||.||||||||.|||                  ||||||.||.|.|||||||||||||||||||..||..|
Sbjct  217  GAAGGAAATTCAGGCGGC------------------AAGACTATTGCGGAAGCAGGACCACATGAAGACTGCCC  272

Query  297  CTGCCAGCAGATCTGGGAAGAAATTGCAAGTGATTTAACCAGGCCTCAAGACTCTACCATAAAGAGCTCTCAGT  370
            .||||||||.|||||||||.|||.|||||||||.||||||..|.||||||||||.|.||||||.|..|||||.|
Sbjct  273  TTGCCAGCAAATCTGGGAACAAACTGCAAGTGACTTAACCCAGTCTCAAGACTCCATCATAAATAATTCTCACT  346

Query  371  TCTTTGAACAGGGTGATGCCCACTCCCAGGTTGAGGAAGGAATATCTATAATGCACACAGGACAGAAACCTTCC  444
            ||||||||||.|||||||.||.||||||||||||||.||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct  347  TCTTTGAACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAGGCAGGACTATCTATAATTCATACAGGACAGAAACCTTCA  420

Query  445  AATTGTGGGAAGTGTAAACAATCCTTCAGTGATATGTCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAAATACGCTCAGCAGA  518
            .|...|||||||||||||||.||||||||||||.|..||||||||||||.|||||||||..|.|.|||||.|||
Sbjct  421  CAGAATGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTGCCATCTTTGATCCTCCTCAGCAGTTCCACTCAGGAGA  494

Query  519  GAAGTCTCATTCCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCACTTCATATTCATCAGAGAGTCC  592
            ||||||||||.|.||..||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||.|
Sbjct  495  GAAGTCTCATACATGCAATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCTCTTCGTATTCACCAGAGAGTTC  568

Query  593  ACCTGGGAGAGAAACTCTTTAAGTGTGACGTGTGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGTTTACATCTGCAAACTCAT  666
            ||.||.||||||||||||.||||||||||.||.||||||||||||||||||||||.|.|..|||||||||||.|
Sbjct  569  ACTTGAGAGAGAAACTCTCTAAGTGTGACATGCGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGCTCATGTCTGCAAACTCGT  642

Query  667  CAGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACCTTTCAAATGTGAACAATGTGGGAGAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACT  740
            .||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||.|...|||
Sbjct  643  GAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGAGCGATACT  716

Query  741  TACAGTTCATTGCAAATTACACATGGGAGAGAAACATTATAATTGTGAGGCATGTGGGAGGGCCTTCATTCATG  814
            |..||||||.|||||||||||||..||||||||||.|||||.|||||||..|||||||||||||||||||||.|
Sbjct  717  TCAAGTTCACTGCAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTATATTTGTGAGAAATGTGGGAGGGCCTTCATTCACG  790

Query  815  ATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGAGAATTCACACAGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGAGATATGTAGTGTGAGC  888
            ||||||||||||||||||||||||.||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||.||..||||
Sbjct  791  ATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGATAATTCATACTGGGGAGAAGCCGTTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGC  864

Query  889  TTCCGTCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGTGTGGTCCACACAGGAAAGAAAC----CAAACAGCACTGGGG  958
            |||.|.||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||.|.||||||    ||||    .|||.||
Sbjct  865  TTCTGCCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAA----TCTGAGG  934

Query  959  AATATGGAAAAGGCTTCATTCGTAGGCTGGATTTGTGTAAGCATCAGACGATCCACACAGGAGAGAAACCATAT  1032
            |.|.||||||||||||||.|..|||.||.||||||..|||||||||||..||.|||||||||.|||||||.||.
Sbjct  935  AGTGTGGAAAAGGCTTCACTGATAGCCTAGATTTGCATAAGCATCAGATAATTCACACAGGACAGAAACCGTAC  1008

Query 1033  AATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGACGGTCCTCCTATCTTTTGATCCATCAGCGAGTCCACACTGGAGA  1106
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.||||||.||||||
Sbjct 1009  AATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATATCTTTTGATCCATCAGCGAATCCACAGTGGAGA  1082

Query 1107  AAAGCCATACAAATGTGACAAGTGTGGGAAGAGCTACATTACTAAGTCAGGTCTTGACTTGCACCACAGAGCCC  1180
            |||.|||||||.||||||..|||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||||.||.|.||
Sbjct 1083  AAAACCATACAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTAACTTGCACCAGAGGGTCC  1156

Query 1181  ACACAGGAGAGAGACCTTATAACTGTGATGACTGTGGGAAGAGCTTTAGACAGGCCTCAAGTATTTTGAATCAT  1254
            |.||.|||||||||||||||||.|||.|.||.|||||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||||||
Sbjct 1157  ATACTGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCTTCAAGTATTTTGAATCAT  1230

Query 1255  AAGAGACTCCATTGCCGAAAAAAACCATTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAAGCTTGTATACCGGTCATACCG  1328
            ||||.||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||.|.|.|
Sbjct 1231  AAGAAACTCCACTGCCGGAAAAAACCCTTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAGGCTTGTACACCGGTCTTTCTG  1304

Query 1329  TAAAGACCAACAAAAAAACCACAGTGGAGAAAATCCATCCAAATGTGAAGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGC  1402
            |||||||||||||..|.||||||.|||||||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305  TAAAGACCAACAAGGAGACCACAATGGAGAAAACTCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGC  1378

Query 1403  GCTTGAATCTTGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACACG  1446
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.|
Sbjct 1379  GCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGATATG  1422