Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000481658
• Subject: NM_013360.2
• Aligned Length: 1456
• Identities: 1182
• Gaps: 113

Alignment

Query    1  ATGACCATGTCCAAG------GAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCAGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGG  68
                  |||.|.|||      ||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------ATGGCAAAGCTCTACGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGATCTTCACTGAGGAGGAGCTGGG  68

Query   69  GCTGCTGGACCTTGCCCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTGTCAGTGG  142
            |||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||| 
Sbjct   69  GCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTTGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTG-  141

Query  143  GGCATCAACCATTCCACCGAGATACTTTCCACTTTCTAAGGGAGGAAAAGTTTTGGATGATGGATATAGCAACC  216
                                                                                      
Sbjct  142  --------------------------------------------------------------------------  141

Query  217  CAAAGAGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAACCTGAGATGAAGACTTTTCCAGAAGCAGGACCACATGAAGG  290
                              |||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct  142  ------------------GGAGGCAAGATCCAAACTGAGATGGAGACTGTTCCAGAAGCAGGAACACATGAAGA  197

Query  291  GTGGTCCTGCCAGCAGATCTGGGAAGAAATTGCAAGTGATTTAACCAGGCCTCAAGACTCTACCATAAAGAGCT  364
            .|..||||||.||||.||.||||||.|||||||||||||.|||||||||.|||||||..|.|||||||..|.||
Sbjct  198  ATTTTCCTGCAAGCAAATTTGGGAACAAATTGCAAGTGACTTAACCAGGTCTCAAGATACCACCATAAGTAACT  271

Query  365  CTCAGTTCTTTGAACAGGGTGATGCCCACTCCCAGGTTGAGGAAGGAATATCTATAATGCACACAGGACAGAAA  438
            |||||||.||||||||.|.|||...||.|||||||.||.|.|.|.||.||||||.|.|.||||||.||.|.|||
Sbjct  272  CTCAGTTATTTGAACAAGATGACAACCCCTCCCAGATTAAAGCAAGACTATCTACAGTTCACACAAGAGAAAAA  345

Query  439  CCTTCCAATTGTGGGAAGTGTAAACAATCCTTCAGTGATATGTCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAAATACGCTC  512
            ||||.|.|..|||..||.||||||||.|.||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||..||...||
Sbjct  346  CCTTTCCAGGGTGAAAATTGTAAACAGTTCTTCAGTGATGTTTCCTTCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATATTC  419

Query  513  AGCAGAGAAGTCTCATTCCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCACTTCATATTCATCAGA  586
            ||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  420  AGGAGAGAAGTCTCATACCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCCCTTCATATTCATCAGA  493

Query  587  GAGTCCACCTGGGAGAGAAACTCTTTAAGTGTGACGTGTGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGTTTACATCTGCAA  660
            |.||||||.||||||.||||..||.|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|.||.|||||||
Sbjct  494  GGGTCCACATGGGAGTGAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTTAGTCAGAGCTCACGTCTGCAA  567

Query  661  ACTCATCAGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACCTTTCAAATGTGAACAATGTGGGAGAGGCTTCAGATGTAGATC  734
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  568  ACTCATCAAAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGATC  641

Query  735  AGCACTTACAGTTCATTGCAAATTACACATGGGAGAGAAACATTATAATTGTGAGGCATGTGGGAGGGCCTTCA  808
            ||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||..||||||||.|||.||||
Sbjct  642  AGCACTTAAAGTTCATTGCAAATTACACATGAGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGAAATGTGGGAAGGCTTTCA  715

Query  809  TTCATGATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGAGAATTCACACAGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGAGATATGTAGT  882
            |.||..||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||.||
Sbjct  716  TGCACAATTTCCAGCTTCAGAAACATCACAGAATTCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGAAATATGTGGT  789

Query  883  GTGAGCTTCCGTCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGTGTGGTCCACACAGGAAAGAAAC----CAAACAGCA  952
            ..|||||||.||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||.|.||||||    ||||    .
Sbjct  790  AAGAGCTTCTGTCTTAGGTCAAGTCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAA----T  859

Query  953  CTGGGGAATATGGAAAAGGCTTCATTCGTAGGCTGGATTTGTGTAAGCATCAGACGATCCACACAGGAGAGAAA  1026
            |||...|.|||||||.|||.||||||..||||||.||||||..|||||||||||.|||.||.|..|||.|||||
Sbjct  860  CTGAAAAGTATGGAAGAGGTTTCATTGATAGGCTAGATTTGCATAAGCATCAGATGATTCATATGGGACAGAAA  933

Query 1027  CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGACGGTCCTCCTATCTTTTGATCCATCAGCGAGTCCACAC  1100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct  934  CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAAATGGTCCTCATATCTTTTGGTCCATCAACGAGTCCACAC  1007

Query 1101  TGGAGAAAAGCCATACAAATGTGACAAGTGTGGGAAGAGCTACATTACTAAGTCAGGTCTTGACTTGCACCACA  1174
            ||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1008  TGGAGAAAAGCCATACAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTGACTTCCACCATA  1081

Query 1175  GAGCCCACACAGGAGAGAGACCTTATAACTGTGATGACTGTGGGAAGAGCTTTAGACAGGCCTCAAGTATTTTG  1248
            ||.|||||||.|||||||||.||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 1082  GAACCCACACGGGAGAGAGATCTTATAACTGTGATAACTGCGGGAAGAGCTTTAGACATGCTTCTAGTATTTTG  1155

Query 1249  AATCATAAGAGACTCCATTGCCGAAAAAAACCATTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAAGCTTGTATACCGGTC  1322
            ||||||||||.||||||.||||.||.|||.|||||.||||||||.||.||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1156  AATCATAAGAAACTCCACTGCCAAAGAAAGCCATTGAAATGTGAAGACTGTGGAAAGAGGCTTGTATGCCGGTC  1229

Query 1323  ATACCGTAAAGACCAACAAAAAAACCACAGTGGAGAAAATCCATCCAAATGTGAAGACTGTGGGAAGCGCTACA  1396
            ||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1230  ATACTGTAAAGACCAACAAAGAGACCACAGTGGAGAAAACCCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACA  1303

Query 1397  AGAGGCGCTTGAATCTTGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACACG  1446
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 1304  AGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGACATA  1353