Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000481658
- Subject:
- XM_011527278.3
- Aligned Length:
- 1650
- Identities:
- 1264
- Gaps:
- 207
Alignment
Query 1 ------------------------------------ATGACCATGTCCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGT 38
|.||..||| .|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATAAAGAGAAGCAAAGTACTTGTATTCTGTTCAAAGATTATG---GAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGT 71
Query 39 GGCAGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCTTGCCCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTGATGC 112
|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 72 GGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGC 145
Query 113 TGGAGAACTTCAGGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATCAACCATTCCACCGAGATACTTTCCACTTTCTAAGGGAG 186
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||.||||||||.
Sbjct 146 TGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATCAACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAA 219
Query 187 GAAAAGTTTTGGATGATGGATATAGCAACCCAAAGAGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAACCTGAGATGAA 260
|||||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 220 GAAAAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGAGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGA 293
Query 261 GACTTTTCCAGAAGCAGGACCACATGAAGGGTGGTCCTGCCAGCAGATCTGGGAAGAAATTGCAAGTGATTTAA 334
|.||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||.|||||||||.|||||||||..||.||||
Sbjct 294 GTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTCCTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAA 367
Query 335 CCAGGCCTCAAGACTCTACCATAAAGAGCTCTCAGTTCTTTGAACAGGGTGATGCCCACTCCCAGGTTGAGGAA 408
|||||.||||.|||||||.||||||.|.||||||||||||||||.|.|||||||.||.||||||||||||.|.|
Sbjct 368 CCAGGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGTTCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCA 441
Query 409 GGAATATCTATAATGCACACAGGACAGAAACCTTCCAATTGTGGGAAGTGTAAACAATCCTTCAGTGATATGTC 482
|||.||.|.|.|||.||.||||||||||||||||||.|..||||||||||||||||.|||.||||||||.|..|
Sbjct 442 GGACTACCCACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCCCAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCATCAGTGATGTTCC 515
Query 483 CATCTTTGATCTTCCTCAGCAAATACGCTCAGCAGAGAAGTCTCATTCCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCT 556
|||||||||||||||||||||..||..|||||.||||||||||.||.|.|||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 516 CATCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGAGAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCT 589
Query 557 GTTACATCTCAGCACTTCATATTCATCAGAGAGTCCACCTGGGAGAGAAACTCTTTAAGTGTGACGTGTGTGGT 630
|||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||.||||||||.
Sbjct 590 GTTACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCCACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGC 663
Query 631 AAGGAATTCAGTCAGAGTTTACATCTGCAAACTCATCAGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACCTTTCAAATGTGA 704
||||||||.|||||.||.|.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 664 AAGGAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCATCAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGA 737
Query 705 ACAATGTGGGAGAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACTTACAGTTCATTGCAAATTACACATGGGAGAGAAACATT 778
.||||||||||.|||.|||||..|||||||||||||||..||||||.|.||||||||||..||||||||||.||
Sbjct 738 GCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACTTAATGTTCATCGTAAATTACACACAGGAGAGAAACCTT 811
Query 779 ATAATTGTGAGGCATGTGGGAGGGCCTTCATTCATGATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGAGAATTCACACAGGG 852
|.|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.||.|||||.|||||||.||.||.|||
Sbjct 812 ACATTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATGATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGG 885
Query 853 GAGAAGCCATTCAAATGTGAGATATGTAGTGTGAGCTTCCGTCTTAGGTCAAG--------------------- 905
|||||.||||||||||||||.||||||.||..||.||||..|.||||||||||
Sbjct 886 GAGAAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACCTTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGT 959
Query 906 ---------------------------------------------------------------TCTTAATAGGC 916
.||||||||||
Sbjct 960 TCACACAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATGTGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGC 1033
Query 917 ATTGTGTGGTCCACACAGGAAAGAAACCAAACAGCACTGGGGAATATGGAAAAGGCTTCATTCGTAGGCTGGAT 990
||||..||||||||||||||.|||||||..||||...||.|.|.|.||||||||||||.|||.|||||||.|||
Sbjct 1034 ATTGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGATGTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGAT 1107
Query 991 TTGTGTAAGCATCAGACGATCCACACAGGAGAGAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGACG 1064
||.|.||||||||||..|.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1108 TTTTATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAAAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATG 1181
Query 1065 GTCCTCCTATCTTTTGATCCATCAGCGAGTCCACACTGGA---------------------------------- 1104
||||||.|..|||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1182 GTCCTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAGTGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGAAAGG 1255
Query 1105 --------------------------------------------------GAAAAGCCATACAAATGTGACAAG 1128
|||||||||||.||||||||..||
Sbjct 1256 GATTTTATACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGAGATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAG 1329
Query 1129 TGTGGGAAGAGCTACATTACTAAGTCAGGTCTTGACTTGCACCACAGAGCCCACACAGGAGAGAGACCTTATAA 1202
|||||||||.||||..|||||||||....|||||||||||||||.||.|.||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1330 TGTGGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGACTTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAA 1403
Query 1203 CTGTGATGACTGTGGGAAGAGCTTTAGACAGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCATTGCCGAAAAA 1276
.|||.|.||.||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..||||
Sbjct 1404 TTGTAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGAAAA 1477
Query 1277 AACCATTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAAGCTTGTATACCGGTCATACCGTAAAGACCAACAAAAAAACCAC 1350
|||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||.||.||.||||||||||||||||.|..|.|.||.|.
Sbjct 1478 AACCATTCAAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTTGTACACAGGACATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTAT 1551
Query 1351 AGTGGAGAAAATCCATCCAAATGTGAAGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTTGATATAATTTT 1424
|||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||..|||||||||||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct 1552 AGTGGGGAAAACCCATCCAAATGTGAGGATTGTGGGAGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATACTTTT 1625
Query 1425 ATCATTATTTTTAAATGACACG 1446
||||||||||.||||||||||.
Sbjct 1626 ATCATTATTTCTAAATGACACA 1647