Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487715
• Subject: NM_001294334.1
• Aligned Length: 2260
• Identities: 1924
• Gaps: 179

Alignment

Query    1  ATGATGGAAGAATTGCATAGCCTGGACCCACGACGGCAGGAATTATTGGAGGCCAGGTTTACTGGAGTAGGTGT  74
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.|||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGATGGAAGAACTGCATAGCCTGGACCCACGAAGGCAGGAATTACTAGAGGCCAGGTTCACTGGAGTTGGTGT  74

Query   75  TAGTAAGGGACCACTTAATAGTGAGTCTTCCAACCAGAGCTTGTGCAGCGTCGGATCCTTGAGTGATAAAGAAG  148
            .||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||..||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct   75  AAGTAAGGGGCCACTCAACAGTGAGTCTTCCAACCAGAGTCTGTGCAGCGTGGGGTCGTTGAGTGATAAAGAAG  148

Query  149  TAGAGACTCCCGAGAAAAAGCAGAATGACCAGCGAAATCGGAAAAGAAAAGCTGAACCATATGAAACTAGCCAA  222
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct  149  TAGAGACTCCTGAGAAAAAGCAGAATGACCAGCGAAATCGGAAAAGGAAAGCCGAGCCATATGACACTAGCCAA  222

Query  223  GGGAAAGGCACTCCTAGGGGACATAAAATTAGTGATTACTTTGAGTTTGCTGGGGGAAGCGCGCCAGGAACCAG  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  223  GGGAAAGGCACTCCTAGGGGACATAAAATTAGTGATTACTTTGAGTTTGCTGGGGGAAGCGGGCCAGGAACCAG  296

Query  297  CCCTGGCAGAAGTGTTCCACCAGTTGCACGATCCTCACCGCAACATTCCTTATCCAATCCCTTACCGCGACGAG  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  297  CCCTGGCAGAAGTGTTCCACCAGTTGCACGATCCTCACCGCAACATTCCTTATCCAATCCCTTACCGCGTCGAG  370

Query  371  TAGAACAGCCCCTCTATGGTTTAGATGGCAGTGCTGCAAAGGAGGCAACGGAGGAGCAGTCTGCTCTGCCAACC  444
            .|||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  CAGAACAGCCTCTGTATGGTTTAGATGGCAGTGCAGCAAAGGAGGCCTCAGAAGAGCAGTCTGCTCTGCCCACC  444

Query  445  CTCATGTCAGTGATGCTAGCAAAACCTCGGCTTGACACAGAGCAGCTGGCGCAAAGGGGAGCTGGCCTCTGCTT  518
            |||||||||||||||.||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTCATGTCAGTGATGTTAGCAAAACCGCGACTTGACACAGAGCAGTTAGCGCCACGGGGAGCTGGCCTCTGCTT  518

Query  519  CACTTTTGTTTCAGCTCAGCAAAACAGTCCCTCATCTACGGGATCTGGCAACACAGAGCATTCCTGCAGCTCCC  592
            ||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct  519  CACTTTCGTCTCTGCTCAACAAAACAGTCCTTCTTCTACGGGTTCTGGCAATACAGAACATTCTTGCAGCTCCC  592

Query  593  AAAAACAGATCTCCATCCAGCACAGACAGACCCAGTCCGACCTCACAATAGAAAAAATATCTGCACTAGAAAAC  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAAAACAGATCTCCATCCAGCACAGACAGACCCAGTCTGACCTCACAATAGAAAAAATATCTGCACTAGAAAAC  666

Query  667  AGTAAGAATTCTGACTTAGAGAAGAAGGAGGGAAGAATAGATGATTTATTAAGAGCCAACTGTGATTTGAGACG  740
            ||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGTAAGAACTCTGACTTAGAGAAGAAGGAAGGAAGAATAGATGATTTATTAAGAGCCAACTGTGATTTGAGACG  740

Query  741  GCAGATTGATGAACAGCAAAAGATGCTAGAGAAATACAAGGAACGATTAAATAGATGTGTGACAATGAGCAAGA  814
            .|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  741  ACAGATAGATGAACAGCAAAAGATGCTAGAGAAATACAAGGAACGATTAAATAGATGTGTCACCATGAGCAAGA  814

Query  815  AACTCCTTATAGAAAAGTCAAAACAAGAGAAGATGGCGTGTAGAGATAAGAGCATGCAAGACCGCTTGAGACTG  888
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.||.|.
Sbjct  815  AGCTCCTTATAGAAAAGTCAAAACAAGAGAAGATGGCGTGCAGAGATAAGAGCATGCAGGACCGATTGCGATTA  888

Query  889  GGCCACTTTACTACTGTCCGACACGGAGCCTCATTTACTGAACAGTGGACAGATGGTTATGCTTTTCAGAATCT  962
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  889  GGCCACTTTACTACTGTCCGGCATGGAGCCTCGTTTACTGAGCAGTGGACAGATGGTTATGCTTTCCAAAACCT  962

Query  963  TATCAAGCAACAGGAAAGGATAAATTCACAGAGGGAAGAGATAGAAAGACAACGGAAAATGTTAGCAAAGCGGA  1036
            .||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  963  CATCAAGCAACAGGAAAGGATAAATTCACAGAGAGAAGAGATAGAAAGGCAACGGAAAATGTTAGCAAAACGGA  1036

Query 1037  AACCTCCTGCCATGGGTCAGGCCCCTCCTGCAACCAATGAGCAGAAACAGCGGAAAAGCAAGACCAATGGAGCT  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  AACCTCCTGCCATGGGTCAGGCCCCTCCTGCAACCAATGAGCAGAAACAACGGAAAAGCAAGACTAATGGAGCT  1110

Query 1111  GAAAATGAAACGTTAACGTTAGCAGAATACCATGAACAAGAAGAAATCTTCAAACTCAGATTAGGTCATCTTAA  1184
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAAAATGAAACGTTAACGTTAGCCGAGTACCATGAACAAGAGGAAATCTTCAAACTTAGATTAGGTCATCTTAA  1184

Query 1185  AAAGGAGGAAGCAGAGATCCAGGCAGAGCTGGAGAGACTAGAAAGGGTTAGAAATCTACATATCAGGGAACTAA  1258
            .||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.|||
Sbjct 1185  GAAAGAGGAAGCAGAAATCCAGGCAGAGCTGGAAAGGCTGGAAAGGGTTAGGAATCTACACATCAGGGAATTAA  1258

Query 1259  AAAGGATACATAATGAAGATAATTCACAATTTAAAGATCATCCAACGCTAAATGACAGATATTTGTTGTTACAT  1332
            |||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAAGGATACATAATGAAGACAATTCGCAGTTTAAAGACCATCCAACACTAAATGACAGATATTTGTTGTTACAT  1332

Query 1333  CTTTTGGGTAGAGGAGGTTTCAGTGAAGTTTACAAGGCATTTGATCTAACAGAGCAAAGATACGTAGCTGTGAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1333  CTTTTGGGTAGAGGAGGTTTCAGTGAAGTTTACAAGGCATTTGATCTAACGGAGCAAAGATATGTAGCTGTGAA  1406

Query 1407  AATTCACCAGTTAAATAAAAACTGGAGAGATGAGAAAAAGGAGAATTACCACAAGCATGCATGTAGGGAATACC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1407  AATTCACCAGTTAAATAAAAACTGGAGAGATGAGAAAAAGGAGAATTACCACAAGCATGCGTGTAGGGAATACC  1480

Query 1481  GGATTCATAAAGAGCTGGATCATCCCAGAATAGTTAAGCTGTATGATTACTTTTCACTGGATACTGACTCGTTT  1554
            |||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1481  GGATTCACAAGGAGCTGGACCACCCCAGGATAGTGAAGCTGTATGATTACTTTTCACTGGACACTGACTCGTTT  1554

Query 1555  TGTACAGTATTAGAATACTGTGAGGGAAATGATCTGGACTTCTACCTGAAACAGCACAAATTAATGTCGGAGAA  1628
            |||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGTACAGTATTAGAATACTGTGAAGGGAATGACCTGGACTTCTACCTAAAACAGCACAAATTAATGTCGGAGAA  1628

Query 1629  AGAGGCCCGGTCCATTATCATGCAGATTGTGAATGCTTTAAAGTACTTAAATGAAATAAAACCTCCCATCATAC  1702
            |||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGAAGCCCGATCCATTATTATGCAGATTGTGAATGCTTTAAAGTACTTAAATGAAATAAAACCTCCCATCATAC  1702

Query 1703  ACTATGACCTCAAACCAGGTAATATTCTTTTAGTAAATGGTACAGCGTGTGGAGAGATAAAAATTACAGATTTT  1776
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACTATGACCTCAAACCAGGTAATATCCTTTTAGTAAATGGTACAGCATGTGGAGAGATAAAAATTACAGATTTT  1776

Query 1777  GGTCTTTCGAAGATCATGGATGATGATAGCTACAATTCAGTGGATGGCATGGAGCTAACATCACAAGGTGCTGG  1850
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 1777  GGTCTTTCCAAGATCATGGATGATGATAGCTACAATTCAGTGGATGGCATGGAGCTGACGTCACAAGGAGCTGG  1850

Query 1851  TACTTATTGGTATTTACCACCAGAGTGTTTTGTGGTTGGGAAAGAACCACCAAAGATCTCAAATAAAGTTGATG  1924
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1851  TACTTATTGGTATTTACCACCAGAGTGTTTTGTGGTTGGGAAAGAGCCACCAAAGATCTCAAATAAAGTCGATG  1924

Query 1925  TGTGGTCGGTGGGTGTGATCTTCTATCAGTGTCTTTATGGAAGGAAGCCTTTTGGCCATAACCAGTCTCAGCAA  1998
            |.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||                   .|.||.||
Sbjct 1925  TTTGGTCAGTGGGTGTGATCTTCTACCAGTGTCTTTATGGGAGGAAG-------------------GTGAGGAA  1979

Query 1999  GACATCCTACAAGAGAATACGATTCTTAAAGCTACTGAAGTGCAGTTCCC----GCCAAAGCCAGTAGTAACAC  2068
            |         |||                       |.||||.||...||    ||||.|.||      |.|||
Sbjct 1980  G---------AAG-----------------------GCAGTGGAGCAGCCTGGGGCCATACCC------ACCAC  2015

Query 2069  CTGAAGCAAAGGCGTTTATTC------GACGATGCTTGGCCTACCGAAAGGAGGACCGCATTGATGTCCAGCAG  2136
            ||    ||..|| |.||.|||      |...||..||||..|.|.|||||.||        ||.|.|..||.| 
Sbjct 2016  CT----CACTGG-GATTCTTCTTTGCAGTTAATCATTGGAATCCTGAAAGTAG--------TGGTTTAAAGAA-  2075

Query 2137  CTGGCCTGTGATCCCTACTTGTTGCCTCACATCCGAAAGTCAGTCTCTACAAGTAGCCCTGCTGGAGCTGCTAT  2210
                     .||.|..||||     ||||.                                            
Sbjct 2076  ---------AATACAGACTT-----CTCAG--------------------------------------------  2091

Query 2211  TGCATCAACCTCTGGGGCGTCCAATAACAGTTCTTCTAAT  2250
                                                    
Sbjct 2092  ----------------------------------------  2091