Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000487875
• Subject: NM_001261816.2
• Aligned Length: 1670
• Identities: 1354
• Gaps: 309

Alignment

Query    1  ATGGCCAGGACCACCAGCCAGCTGTATGACGCCGTGCCCATCCAGTCCAGCGTGGTGTTATGTTCCTGCCCATC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCAGGACCACCAGCCAGCTGTATGACGCCGTGCCCATCCAGTCCAGCGTGGTGTTATGTTCCTGCCCATC  74

Query   75  CCCATCAATGGTGAGGACCCAGACTGAGTCCAGCACGCCCCCTGGCATTCCTGGTGGCAGCAGGCAGGGCCCCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCATCAATGGTGAGGACCCAGACTGAGTCCAGCACGCCCCCTGGCATTCCTGGTGGCAGCAGGCAGGGCCCCG  148

Query  149  CCATGGACGGCACTGCAGCCGAGCCTCGGCCCGGCGCCGGCTCCCTGCAGCATGCCCAGCCTCCGCCGCAGCCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATGGACGGCACTGCAGCCGAGCCTCGGCCCGGCGCCGGCTCCCTGCAGCATGCCCAGCCTCCGCCGCAGCCT  222

Query  223  CGGAAGAAGCGGCCTGAGGACTTCAAGTTTGGGAAAATCCTTGGGGAAGGCTCTTTTTCCACGGTTGTCCTGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGAAGAAGCGGCCTGAGGACTTCAAGTTTGGGAAAATCCTTGGGGAAGGCTCTTTTTCCACGGTTGTCCTGGC  296

Query  297  TCGAGAACTGGCAACCTCCAGAGAATATGCGATTAAAATTCTGGAGAAGCGACATATCATAAAAGAGAACAAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCGAGAACTGGCAACCTCCAGAGAATATGCGATTAAAATTCTGGAGAAGCGACATATCATAAAAGAGAACAAGG  370

Query  371  TCCCCTATGTAACCAGAGAGCGGGATGTCATGTCGCGCCTGGATCACCCCTTCTTTGTTAAGCTTTACTTCACA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCCCTATGTAACCAGAGAGCGGGATGTCATGTCGCGCCTGGATCACCCCTTCTTTGTTAAGCTTTACTTCACA  444

Query  445  TTTCAGGACGACGAGAAGCTGTATTTCGGCCTTAGTTATGCCAAAAATGGAGAACTACTTAAATATATTCGCAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTCAGGACGACGAGAAGCTGTATTTCGGCCTTAGTTATGCCAAAAATGGAGAACTACTTAAATATATTCGCAA  518

Query  519  AATCGGTTCATTCGATGAGACCTGTACCCGATTTTACACGGCTGAGATTGTGTCTGCTTTAGAGTACTTGCACG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATCGGTTCATTCGATGAGACCTGTACCCGATTTTACACGGCTGAGATTGTGTCTGCTTTAGAGTACTTGCACG  592

Query  593  GCAAGGGCATCATTCACAGGGACCTTAAACCGGAAAACATTTTGTTAAATGAAGATATGCACATCCAGATCACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAAGGGCATCATTCACAGGGACCTTAAACCGGAAAACATTTTGTTAAATGAAGATATGCACATCCAGATCACA  666

Query  667  GATTTTGGAACAGCAAAAGTCTTATCCCCAGAGAGCAAACAAGCCAGGGCCAACTCATTCGTGGGAACAGCGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATTTTGGAACAGCAAAAGTCTTATCCCCAGAGAGCAAACAAGCCAGGGCCAACTCATTCGTGGGAACAGCGCA  740

Query  741  GTACGTTTCTCCAGAGCTGCTCACGGAGAAGTCCGCCTGTAAGAGTTCAGACCTTTGGGCTCTTGGATGCATAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTACGTTTCTCCAGAGCTGCTCACGGAGAAGTCCGCCTGTAAGAGTTCAGACCTTTGGGCTCTTGGATGCATAA  814

Query  815  TATACCAGCTTGTGGCAGGACTCCCACCATTCCGAGCTGGAAACGAGTATCTTATATTTCAGAAGATCATTAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TATACCAGCTTGTGGCAGGACTCCCACCATTCCGAGCTGGAAACGAGTATCTTATATTTCAGAAGATCATTAAG  888

Query  889  TTGGAATATGACTTTCCAGAAAAATTCTTCCCTAAGGCAAGAGACCTCGTGGAGAAACTTTTGGTTTTAGATGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTGGAATATGACTTTCCAGAAAAATTCTTCCCTAAGGCAAGAGACCTCGTGGAGAAACTTTTGGTTTTAGATGC  962

Query  963  CACAAAGCGGTTAGGCTGTGAGGAAATGGAAGGATACGGACCTCTTAAAGCACACCCGTTCTTCGAGTCCGTCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACAAAGCGGTTAGGCTGTGAGGAAATGGAAGGATACGGACCTCTTAAAGCACACCCGTTCTTCGAGTCCGTCA  1036

Query 1037  CGTGGGAGAACCTGCACCAGCAGACGCCTCCGAAGCTCACCGCTTACCTGCCGGCTATGTCGGAAGACGACGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CGTGGGAGAACCTGCACCAGCAGACGCCTCCGAAGCTCACCGCTTACCTGCCGGCTATGTCGGAAGACGACGAG  1110

Query 1111  GACTGCTATGGCAATTATGACAATCTCCTGAGCCAGTTTGGCTGCATGCAGGTGTCTTCGTCCTCCTCCTCACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACTGCTATGGCAATTATGACAATCTCCTGAGCCAGTTTGGCTGCATGCAGGTGTCTTCGTCCTCCTCCTCACA  1184

Query 1185  CTCCCTGTCAGCCTCCGACACGGGCCTGCCCCAGAGGTCAGGCAGCAACATAGAGCAGTACATTCACGATCTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTCCCTGTCAGCCTCCGACACGGGCCTGCCCCAGAGGTCAGGCAGCAACATAGAGCAGTACATTCACGATCTGG  1258

Query 1259  ACTCGAACTCCTTTGAACTGGACTTACAGTTTTCCGAAGATGAGAAGAGGTTGTTGTTGGAGAAGCAGGCTGGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACTCGAACTCCTTTGAACTGGACTTACAGTTTTCCGAAGATGAGAAGAGGTTGTTGTTGGAGAAGCAGGCTGGC  1332

Query 1333  GGAAACCCTTGGC-ACCAGTTTGTAGAAAATAATTTAATACTAAAGATGGGCCCAGTGGATAAGCGGAAGGGTT  1405
            |||||||||||.| |.|||...||     ||.||.                                       
Sbjct 1333  GGAAACCCTTGCCTAACAGGACGT-----ATTATC---------------------------------------  1362

Query 1406  TATTTGCAAGACGACGACAGCTGTTGCTCACAGAAGGACCACATTTATATTATGTGGATCCTGTCAACAAAGTT  1479
                                                                                      
Sbjct 1363  --------------------------------------------------------------------------  1362

Query 1480  CTGAAAGGTGAAATTCCTTGGTCACAAGAACTTCGACCAGAGGCCAAGAATTTTAAAACTTTCTTTGTCCACAC  1553
                                                                                      
Sbjct 1363  --------------------------------------------------------------------------  1362

Query 1554  GCCTAACAGGACGTATTATCTGATGGACCCCAGCGGGAACGCACACAAGTGGTGCAGGAAGATCCAGGAGGTTT  1627
                                                                                      
Sbjct 1363  --------------------------------------------------------------------------  1362

Query 1628  GGAGGCAGCGATACCAGAGCCACCCGGACGCCGCTGTGCAGG  1669
                                                      
Sbjct 1363  ------------------------------------------  1362