Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488021
• Subject: XR_001752701.2
• Aligned Length: 3794
• Identities: 2509
• Gaps: 1248

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  CGCCGCCGCGAGGCGGGGAAGCGCGGGGCCGCGGCGGTGCGGGTTCTAGGGCGGCGGCCGTCGCCGTCGCAGCA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GCGCCCCGAGCGGGGAGGGCCGAGGAGGCCCGACGAGCTGGGGATGGAGAGTACCGGGCCCCTCACTGCCTCAG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AGCGCGTGTGCGGCTCTGGGCGCGCACAGTGACGGTGACGGCACCCCTGGCCCGGCAGCGCCGAGGCCGCTTCG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CCAGACAGCCAGCGGCCGGCGGCAGGCCGGGCCATGAGCGGCAGGGGCCGGGCCGGGCCTCGCTGACCCTGGCT  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  CCGCGCGGCAGCTTCCCCAGTTTCCGCTCCGGTCTCTCGGCATGAGAGTCCGCCCGGGCCCGGGGCTGCGGCTG  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  CCCCAGACCCGCCGCACGCTGGCGCGCTCCGGGCCCGCGGAGCCGCGGTGCTGATACCTGCGCCGCACTGCGCC  444

Query    1  ------------------------------------ATGGAGGTGGTGGGTGACTTCGAGTACAGCAAGAGGGA  38
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCCGCCCGTCCGCTGTGTGCCCCGGGGGCGCGGCCATGGAGGTGGTGGGTGACTTCGAGTACAGCAAGAGGGA  518

Query   39  TCTCGTGGGACACGGGGCCTTCGCCGTGGTCTTCCGGGGGCGGCACCGCCAGAAAACTGATTGGGAGGTAGCTA  112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCTCGTGGGACACGGGGCCTTCGCCGTGGTCTTCCGGGGGCGGCACCGCCAGAAAACTGATTGGGAGGTAGCTA  592

Query  113  TTAAAAGTATTAATAAAAAGAACTTGTCAAAATCACAAATACTGCTTGGAAAGGAAATTAAAATCTTAAAGGAA  186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTAAAAGTATTAATAAAAAGAACTTGTCAAAATCACAAATACTGCTTGGAAAGGAAATTAAAATCTTAAAGGAA  666

Query  187  CTTCAGCATGAAAATATTGTAGCACTCTATGATGTTCAGGAATTACCCAACTCTGTCTTTTTGGTGATGGAGTA  260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTTCAGCATGAAAATATTGTAGCACTCTATGATGTTCAGGAATTACCCAACTCTGTCTTTTTGGTGATGGAGTA  740

Query  261  TTGCAATGGTGGAGACCTCGCAGATTATTTGCA-----------------------------------------  293
            |||||||||||||||||||||||||||||||||                                         
Sbjct  741  TTGCAATGGTGGAGACCTCGCAGATTATTTGCAAGGTAACTGTGTATGTGTGTCAGTGTTCAGTAAAGACAGTG  814

Query  294  ----------------------AGCGAAAGGGACTCTCAGTGAAGACACGATCAGAGTGTTTCTGCATCAGATT  345
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGCAGCCTGTTTAATCCTAAGAGCGAAAGGGACTCTCAGTGAAGACACGATCAGAGTGTTTCTGCATCAGATT  888

Query  346  GCTGCTGCCATGCGAATCCTGCACAGCAAAGGAATCATCCACAGAGATCTCAAACCACAGAACATCTTGCTGTC  419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCTGCTGCCATGCGAATCCTGCACAGCAAAGGAATCATCCACAGAGATCTCAAACCACAGAACATCTTGCTGTC  962

Query  420  CTATGCCAATCGCAGAAAATCAAGTGTCAGTGGTATTCGCATCAAAATAGCGGATTTTGGTTTTGCTCGTTACC  493
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTATGCCAATCGCAGAAAATCAAGTGTCAGTGGTATTCGCATCAAAATAGCGGATTTTGGTTTTGCTCGTTACC  1036

Query  494  TACATAGTAACATGATGGCTGCAACACTGTGTGGATCCCCGATGTACATGGCTCCTGAGGTTATTATGTCTCAA  567
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TACATAGTAACATGATGGCTGCAACACTGTGTGGATCCCCGATGTACATGGCTCCTGAGGTTATTATGTCTCAA  1110

Query  568  CATTATGATGCTAAGGCTGACTTGTGGAGCATAGGAACAGTGATATACCAATGCCTAGTTGGAAAACCACCTTT  641
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CATTATGATGCTAAGGCTGACTTGTGGAGCATAGGAACAGTGATATACCAATGCCTAGTTGGAAAACCACCTTT  1184

Query  642  TCA-----------------------------------------------------------------------  644
            |||                                                                       
Sbjct 1185  TCAGGCCAATAGTCCTCAAGACTTAAGGATGTTTTATGAAAAAAACAGGAGCTTAATGCCTAGTATTCCCAGAG  1258

Query  645  -----------------------------------------------------------------------GAA  647
                                                                                   |||
Sbjct 1259  AAACATCACCTTATTTGGCTAATCTCCTTTTGGGTTTGCTTCAGAGAAACCAAAAAGATAGAATGGACTTTGAA  1332

Query  648  GCGTTTTTTAGCCATCCTTTTCTTGAGCAAGGTCCAGTAAAAAAATCTTGCCCAGTTCCAGTGCCCATGTATTC  721
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCATTTTTTAGCCATCCTTTTCTTGAGCAAGGTCCAGTAAAAAAATCTTGCCCAGTTCCAGTGCCCATGTATTC  1406

Query  722  TGGTTCTGTCTCTGGAAGCTCCTGTGGCAGCTCTCCATCTTGTCGTTTTGCTTCTCCACCA-------------  782
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct 1407  TGGTTCTGTCTCTGGAAGCTCCTGTGGCAGCTCTCCATCTTGTCGTTTTGCTTCTCCACCATCCCTTCCAGATA  1480

Query  783  --------------------------------------------------------------------------  782
                                                                                      
Sbjct 1481  TGCAGCATATTCAGGAAGAAAACTTATCTTCCCCACCATTGGGTCCTCCCAACTATCTACAAGTTTCCAAAGAT  1554

Query  783  --------------------------------------------------------------------------  782
                                                                                      
Sbjct 1555  TCTGCCAGTACTAGTAGCAAGAACTCTTCTTGTGACACGGATGACTTTGTTTTGGTGCCACACAACATCTCGTC  1628

Query  783  -----------GTGATATGCCAATGGGGACTGCTGGCAGACGTGCTTCAAATGAATTCTTGGTGTGTGGAGGGC  845
                       |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGACCACTCATGTGATATGCCAGTGGGGACTGCTGGCAGACGTGCTTCAAATGAATTCTTGGTGTGTGGAGGGC  1702

Query  846  AGTGTCAGCCTACTGTGTCACCTCACAGCGAAACAGCACCAATTCCAGTTCCTACTCAAATAAGGAATTATCAG  919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGTGTCAGCCTACTGTGTCACCTCACAGCGAAACAGCACCAATTCCAGTTCCTACTCAAATAAGGAATTATCAG  1776

Query  920  CGCATAGAGCAGAATCTTACATCTACTGCCAGCTCAGGCACAAATGTACATGGTTCTCCAAGATCTGCAGTGGT  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CGCATAGAGCAGAATCTTACATCTACTGCCAGCTCAGGCACAAATGTACATGGTTCTCCAAGATCTGCAGTGGT  1850

Query  994  ACGAAGGTCCAACACCAGCCCCATGGGCTTCCTCCGGCCGGGATCATGCTCCCCAGTACCAGCAGACACAGCAC  1067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ACGAAGGTCCAACACCAGCCCCATGGGCTTCCTCCGGCCGGGATCATGCTCCCCAGTACCAGCAGACACAGCAC  1924

Query 1068  AGACAGTTGGACGAAGGCTCTCCACTGGGTCTTCTAGGCCTTACTCACCTTCCCCTTTGGTTGGTACCATTCCT  1141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGACAGTTGGACGAAGGCTCTCCACTGGGTCTTCTAGGCCTTACTCACCTTCCCCTTTGGTTGGTACCATTCCT  1998

Query 1142  GAGCAATTCAGTCAGTGCTGCTGTGGGCATCCTCAGGGCCATGACTCCAGGAGTAGAAACTCCTCAGGTTCTCC  1215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAGCAATTCAGTCAGTGCTGCTGTGGGCATCCTCAGGGCCATGACTCCAGGAGTAGAAACTCCTCAGGTTCTCC  2072

Query 1216  AGTGCCACAAGCTCAGTCCCCACAGTCTCTCTTATCGGGTGCTAGACTGCAGAGCGCCCCCACCCTCACTGACA  1289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGTGCCACAAGCTCAGTCCCCACAGTCTCTCTTATCGGGTGCTAGACTGCAGAGCGCCCCCACCCTCACTGACA  2146

Query 1290  TCTATCAGAACAAGCAGAAGCTCAGAAAACAGCACTCTGACCCCGTGTGCCCATCCCATACTGGGGCTGGGTAC  1363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TCTATCAGAACAAGCAGAAGCTCAGAAAACAGCACTCTGACCCCGTGTGCCCATCCCATACTGGGGCTGGGTAC  2220

Query 1364  AGCTACTCGCCTCAGCCCAGTCGGCCTGGCAGCCTTGGAACTTCTCCCACCAAGCACTTGGGGTCCTCTCCACG  1437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AGCTACTCGCCTCAGCCCAGTCGGCCTGGCAGCCTTGGAACTTCTCCCACCAAGCACTTGGGGTCCTCTCCACG  2294

Query 1438  GAGTTCTGACTGGTTCTTTAAAACTCCTTTGCCAACAATCATTGGCTCTCCTACTAAGACCACAGCTCCTTTCA  1511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GAGTTCTGACTGGTTCTTTAAAACTCCTTTGCCAACAATCATTGGCTCTCCTACTAAGACCACAGCTCCTTTCA  2368

Query 1512  AAATCCCTAAAACTCAAGCATCTTCCAACCTGTTAGCCTTGGTTACTCGTCATGGGCCTGCTGAAGAACAGTCG  1585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AAATCCCTAAAACTCAAGCATCTTCCAACCTGTTAGCCTTGGTTACTCGTCATGGGCCTGCTGAAGAACAGTCG  2442

Query 1586  AAAGATGGGAATGAGCCACGGGAATGTGCCCATTGCCTCTTAGTGCAAGGAAGTGAGAGGCAGCGGGCCGAGCA  1659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AAAGATGGGAATGAGCCACGGGAATGTGCCCATTGCCTCTTAGTGCAAGGAAGTGAGAGGCAGCGGGCCGAGCA  2516

Query 1660  GCAGAGCAAGGCAGTGTTTGGCAGATCTGTCAGTACCGGGAAGTTATCAGATCAACAAGGAAAGACTCCTATAT  1733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GCAGAGCAAGGCAGTGTTTGGCAGATCTGTCAGTACCGGGAAGTTATCAGATCAACAAGGAAAGACTCCTATAT  2590

Query 1734  GTCGACATCAGGGCAGCACAGACAGTTTAAATACAGAACGACCAATGGATATAGCTCCGGCAGGAGCCTGTGGT  1807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  GTCGACATCAGGGCAGCACAGACAGTTTAAATACAGAACGACCAATGGATATAGCTCCGGCAGGAGCCTGTGGT  2664

Query 1808  GGTGTTCTGGCACCTCCTGCAGGTACAGCAGCAAGTTCCAAGGCTGTCCTCTTCACTGTAGGGTCTCCTCCACA  1881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GGTGTTCTGGCACCTCCTGCAGGTACAGCAGCAAGTTCCAAGGCTGTCCTCTTCACTGTAGGGTCTCCTCCACA  2738

Query 1882  CAGTGCGGCAGCCCCCACTTGTACCCACATGTTCCTTCGAACAAGAACAACCTCAGCGGGAACACACAG--ACA  1953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||   .|.|||  ||.
Sbjct 2739  CAGTGCGGCAGCCCCCACTTGTACCCACATGTTCCTTCGAACAAGAACAACCTCAGTGGG---GCCCAGCAACT  2809

Query 1954  CCTTACGCCATCTGAATGTGATGCTGATGTTCACTGAGT------GTGTGC-TGG-------ACCTG--ACAG-  2010
            ||....||..|||             .|||.|..|||||      |||||| |||       .||||  .||| 
Sbjct 2810  CCGGGGGCTCTCT-------------TTGTGCCATGAGTGGCCGCGTGTGCGTGGGGTCCCCGCCTGGCCCAGG  2870

Query 2011  ----------------CCATGAGGGGAGGAA------ACCCTGAGCT--GTGCACATC-TGCTGTGTCCTTGTA  2059
                            |||.|||..||||.|      |.||||||.|  ||||    | |.|.|||  |||...
Sbjct 2871  CTTCGGCTCTTCCCCTCCAGGAGCAGAGGCAGCTCCCAGCCTGAGATACGTGC----CTTACGGTG--CTTCAC  2938

Query 2060  CCAGATCCAG--GAGAGTGTGGTGGTGGACCAGATCAGTCAGCT---GAGC-----AA----------AGAC--  2111
            ||   .||||  .||||.|             |.||| |||.||   .|||     ||          ||||  
Sbjct 2939  CC---CCCAGCCTAGAGGG-------------GCTCA-TCACCTTTGAAGCCCCTGAACTGCCGGAGGAGACGC  2995

Query 2112  ---TGGGGGCGGGTGGAGCAGCTGGTGTTGTACATGAAAGCAGCACAGCTGCTTGCGGCTTCTCTGCATCTTGC  2182
               |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2996  TGATGGAGGCGGGTGGAGCAGCTGGTGTTGTACATGAAAGCAGCACAGCTGCTTGCGGCTTCTCTGCATCTTGC  3069

Query 2183  CAAAGCCCAGATCAAGTCCGGGAAACTGAGCCCATCCACAGCTGTGAAACAAGTTGTCAAGAATCTGAACGAAC  2256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3070  CAAAGCCCAGATCAAGTCCGGGAAACTGAGCCCATCCACAGCTGTGAAACAAGTTGTCAAGAATCTGAACGAAC  3143

Query 2257  GATATAAATTCTGCATCACCATGTGCAAGAAACTTACAGAAAAGCTGAATCGATTCTTCTCTGACAAACAGAGG  2330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3144  GATATAAATTCTGCATCACCATGTGCAAGAAACTTACAGAAAAGCTGAATCGATTCTTCTCTGACAAACAGAGG  3217

Query 2331  TTTATTGATGAAGTCAACAGTGTGACTGCAGAGAAACTCATCTATAATTGTGCTGTAGAAATGGTTCAGTCTGC  2404
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3218  TTTATTGATGAAATCAACAGTGTGACTGCAGAGAAACTCATCTATAATTGTGCTGTAGAAATGGTTCAGTCTGC  3291

Query 2405  AGCCCTGGATGAGATGTTTCAGCAGACCGAAGATATTGTTTATCGCTATCATAAGGCAGCCCTTCTTTTGGAAG  2478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3292  AGCCCTGGATGAGATGTTTCAGCAGACCGAAGATATTGTTTATCGCTATCATAAGGCAGCCCTTCTTTTGGAAG  3365

Query 2479  GCCTAAGTAGGATTCTACAGGACCCTGCAGATATTGAAAATGTGCATAAATATAAATGTAGTATTGAGAGAAGA  2552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3366  GCCTAAGTAGGATTCTACAGGACCCTGCAGATATTGAAAATGTGCATAAATATAAATGTAGTATTGAGAGAAGA  3439

Query 2553  CTGTCGGCGCTCTGCCATAGCACCGCAACCGTG-----------------------------------------  2585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||                                         
Sbjct 3440  CTGTCGGCGCTCTGCCATAGCACCGCAACCGTGTGAGCAGCAGGCTCATCCCGTGGACCGGTGGTGGGAACGTG  3513

Query 2586  --------------------------------------------------------------------------  2585
                                                                                      
Sbjct 3514  AGGAAGAGGGGAAGGAAGGAAGAGCTTTTCCATTTGGTGCTCCAATGTCTCCTGCTGGACCCATCTGCCTAGTG  3587

Query 2586  --------------------------------------------------------------------------  2585
                                                                                      
Sbjct 3588  GAAGGCAGCAAAATTTCAAGAAACAGGTGAGGTTGAGCAGCTTGGTGCAACCCCATGGGGCCTGGAGTTGGAGC  3661

Query 2586  --------------------------------------------------------------------------  2585
                                                                                      
Sbjct 3662  TCAACAGCAATGGATTTCAGAGACCACCCTGAAACTCCCAGTAAAAAAGACTTGGGAGACATGTTAATAAACTC  3735

Query 2586  --------------------  2585
                                
Sbjct 3736  AAGCATTTGATCGACCCACT  3755