Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488113
- Subject:
- XM_024450552.1
- Aligned Length:
- 2338
- Identities:
- 2250
- Gaps:
- 88
Alignment
Query 1 ---------------------ATGATGGAAGAATTGCATAGCCTGGACCCACGACGGCAGGAATTATTGGAGGC 53
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACAGCCTGTGGAGCAGAAATGATGGAAGAATTGCATAGCCTGGACCCACGACGGCAGGAATTATTGGAGGC 74
Query 54 CAGGTTTACTGGAGTAGGTGTTAGTAAGGGACCACTTAATAGTGAGTCTTCCAACCAGAGCTTGTGCAGCGTCG 127
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAGGTTTACTGGAGTAGGTGTTAGTAAGGGACCACTTAATAGTGAGTCTTCCAACCAGAGCTTGTGCAGCGTCG 148
Query 128 GATCCTTGAGTGATAAAGAAGTAGAGACTCCCGAGAAAAAGCAGAATGACCAGCGAAATCGGAAAAGAAAAGCT 201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GATCCTTGAGTGATAAAGAAGTAGAGACTCCCGAGAAAAAGCAGAATGACCAGCGAAATCGGAAAAGAAAAGCT 222
Query 202 GAACCATATGAAACTAGCCAAGGGAAAGGCACTCCTAGGGGACATAAAATTAGTGATTACTTTGAGTTTGCTGG 275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAACCATATGAAACTAGCCAAGGGAAAGGCACTCCTAGGGGACATAAAATTAGTGATTACTTTGAGTTTGCTGG 296
Query 276 GGGAAGCGCGCCAGGAACCAGCCCTGGCAGAAGTGTTCCACCAGTTGCACGATCCTCACCGCAACATTCCTTAT 349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGGAAGCGCGCCAGGAACCAGCCCTGGCAGAAGTGTTCCACCAGTTGCACGATCCTCACCGCAACATTCCTTAT 370
Query 350 CCAATCCCTTACCGCGACGAGTAGAACAGCCCCTCTATGGTTTAGATGGCAGTGCTGCAAAGGAGGCAACGGAG 423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCAATCCCTTACCGCGACGAGTAGAACAGCCCCTCTATGGTTTAGATGGCAGTGCTGCAAAGGAGGCAACGGAG 444
Query 424 GAGCAGTCTGCTCTGCCAACCCTCATGTCAGTGATGCTAGCAAAACCTCGGCTTGACACAGAGCAGCTGGCGCA 497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAGCAGTCTGCTCTGCCAACCCTCATGTCAGTGATGCTAGCAAAACCTCGGCTTGACACAGAGCAGCTGGCGCA 518
Query 498 AAGGGGAGCTGGCCTCTGCTTCACTTTTGTTTCAGCTCAGCAAAACAGTCCCTCATCTACGGGATCTGGCAACA 571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAGGGGAGCTGGCCTCTGCTTCACTTTTGTTTCAGCTCAGCAAAACAGTCCCTCATCTACGGGATCTGGCAACA 592
Query 572 CAGAGCATTCCTGCAGCTCCCAAAAACAGATCTCCATCCAGCACAGACAGACCCAGTCCGACCTCACAATAGAA 645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CAGAGCATTCCTGCAGCTCCCAAAAACAGATCTCCATCCAGCACAGACAGACCCAGTCCGACCTCACAATAGAA 666
Query 646 AAAATATCTGCACTAGAAAACAGTAAGAATTCTGACTTAGAGAAGAAGGAGGGAAGAATAGATGATTTATTAAG 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AAAATATCTGCACTAGAAAACAGTAAGAATTCTGACTTAGAGAAGAAGGAGGGAAGAATAGATGATTTATTAAG 740
Query 720 AGCCAACTGTGATTTGAGACGGCAGATTGATGAACAGCAAAAGATGCTAGAGAAATACAAGGAACGATTAAATA 793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGCCAACTGTGATTTGAGACGGCAGATTGATGAACAGCAAAAGATGCTAGAGAAATACAAGGAACGATTAAATA 814
Query 794 GATGTGTGACAATGAGCAAGAAACTCCTTATAGAAAAGTCAAAACAAGAGAAGATGGCGTGTAGAGATAAGAGC 867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GATGTGTGACAATGAGCAAGAAACTCCTTATAGAAAAGTCAAAACAAGAGAAGATGGCGTGTAGAGATAAGAGC 888
Query 868 ATGCAAGACCGCTTGAGACTGGGCCACTTTACTACTGTCCGACACGGAGCCTCATTTACTGAACAGTGGACAGA 941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATGCAAGACCGCTTGAGACTGGGCCACTTTACTACTGTCCGACACGGAGCCTCATTTACTGAACAGTGGACAGA 962
Query 942 TGGTTATGCTTTTCAGAATCTTATCAAGCAACAGGAAAGGATAAATTCACAGAGGGAAGAGATAGAAAGACAAC 1015
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGGTTATGCTTTTCAGAATCTTATCAAGCAACAGGAAAGGATAAATTCACAGAGGGAAGAGATAGAAAGACAAC 1036
Query 1016 GGAAAATGTTAGCAAAGCGGAAACCTCCTGCCATGGGTCAGGCCCCTCCTGCAACCAATGAGCAGAAACAGCGG 1089
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGAAAATGTTAGCAAAGCGGAAACCTCCTGCCATGGGTCAGGCCCCTCCTGCAACCAATGAGCAGAAACAGCGG 1110
Query 1090 AAAAGCAAGACCAATGGAGCTGAAAATGAAAC------------------------------------------ 1121
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAAAGCAAGACCAATGGAGCTGAAAATGAAACGCCCTCTTCTGGGAATACAGAGCTAAAGGATACAGCCCCAGC 1184
Query 1122 ------------------------GTTAACGTTAGCAGAATACCATGAACAAGAAGAAATCTTCAAACTCAGAT 1171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTTAGGAGCCCACAGTTTACTTAGGTTAACGTTAGCAGAATACCATGAACAAGAAGAAATCTTCAAACTCAGAT 1258
Query 1172 TAGGTCATCTTAAAAAGGAGGAAGCAGAGATCCAGGCAGAGCTGGAGAGACTAGAAAGGGTTAGAAATCTACAT 1245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TAGGTCATCTTAAAAAGGAGGAAGCAGAGATCCAGGCAGAGCTGGAGAGACTAGAAAGGGTTAGAAATCTACAT 1332
Query 1246 ATCAGGGAACTAAAAAGGATACATAATGAAGATAATTCACAATTTAAAGATCATCCAACGCTAAATGACAGATA 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATCAGGGAACTAAAAAGGATACATAATGAAGATAATTCACAATTTAAAGATCATCCAACGCTAAATGACAGATA 1406
Query 1320 TTTGTTGTTACATCTTTTGGGTAGAGGAGGTTTCAGTGAAGTTTACAAGGCATTTGATCTAACAGAGCAAAGAT 1393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TTTGTTGTTACATCTTTTGGGTAGAGGAGGTTTCAGTGAAGTTTACAAGGCATTTGATCTAACAGAGCAAAGAT 1480
Query 1394 ACGTAGCTGTGAAAATTCACCAGTTAAATAAAAACTGGAGAGATGAGAAAAAGGAGAATTACCACAAGCATGCA 1467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ACGTAGCTGTGAAAATTCACCAGTTAAATAAAAACTGGAGAGATGAGAAAAAGGAGAATTACCACAAGCATGCA 1554
Query 1468 TGTAGGGAATACCGGATTCATAAAGAGCTGGATCATCCCAGAATAGTTAAGCTGTATGATTACTTTTCACTGGA 1541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TGTAGGGAATACCGGATTCATAAAGAGCTGGATCATCCCAGAATAGTTAAGCTGTATGATTACTTTTCACTGGA 1628
Query 1542 TACTGACTCGTTTTGTACAGTATTAGAATACTGTGAGGGAAATGATCTGGACTTCTACCTGAAACAGCACAAAT 1615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TACTGACTCGTTTTGTACAGTATTAGAATACTGTGAGGGAAATGATCTGGACTTCTACCTGAAACAGCACAAAT 1702
Query 1616 TAATGTCGGAGAAAGAGGCCCGGTCCATTATCATGCAGATTGTGAATGCTTTAAAGTACTTAAATGAAATAAAA 1689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TAATGTCGGAGAAAGAGGCCCGGTCCATTATCATGCAGATTGTGAATGCTTTAAAGTACTTAAATGAAATAAAA 1776
Query 1690 CCTCCCATCATACACTATGACCTCAAACCAGGTAATATTCTTTTAGTAAATGGTACAGCGTGTGGAGAGATAAA 1763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CCTCCCATCATACACTATGACCTCAAACCAGGTAATATTCTTTTAGTAAATGGTACAGCGTGTGGAGAGATAAA 1850
Query 1764 AATTACAGATTTTGGTCTTTCGAAGATCATGGATGATGATAGCTACAATTCAGTGGATGGCATGGAGCTAACAT 1837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AATTACAGATTTTGGTCTTTCGAAGATCATGGATGATGATAGCTACAATTCAGTGGATGGCATGGAGCTAACAT 1924
Query 1838 CACAAGGTGCTGGTACTTATTGGTATTTACCACCAGAGTGTTTTGTGGTTGGGAAAGAACCACCAAAGATCTCA 1911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CACAAGGTGCTGGTACTTATTGGTATTTACCACCAGAGTGTTTTGTGGTTGGGAAAGAACCACCAAAGATCTCA 1998
Query 1912 AATAAAGTTGATGTGTGGTCGGTGGGTGTGATCTTCTATCAGTGTCTTTATGGAAGGAAGCCTTTTGGCCATAA 1985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AATAAAGTTGATGTGTGGTCGGTGGGTGTGATCTTCTATCAGTGTCTTTATGGAAGGAAGCCTTTTGGCCATAA 2072
Query 1986 CCAGTCTCAGCAAGACATCCTACAAGAGAATACGATTCTTAAAGCTACTGAAGTGCAGTTCCCGCCAAAGCCAG 2059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CCAGTCTCAGCAAGACATCCTACAAGAGAATACGATTCTTAAAGCTACTGAAGTGCAGTTCCCGCCAAAGCCAG 2146
Query 2060 TAGTAACACCTGAAGCAAAGGCGTTTATTCGACGATGCTTGGCCTACCGAAAGGAGGACCGCATTGATGTCCAG 2133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TAGTAACACCTGAAGCAAAGGCGTTTATTCGACGATGCTTGGCCTACCGAAAGGAGGACCGCATTGATGTCCAG 2220
Query 2134 CAGCTGGCCTGTGATCCCTACTTGTTGCCTCACATCCGAAAGTCAGTCTCTACAAGTAGCCCTGCTGGAGCTGC 2207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CAGCTGGCCTGTGATCCCTACTTGTTGCCTCACATCCGAAAGTCAGTCTCTACAAGTAGCCCTGCTGGAGCTGC 2294
Query 2208 TATTGCATCAACCTCTGGGGCGTCCAATAACAGTTCTTCTAATG 2251
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TATTGCATCAACCTCTGGGGCGTCCAATAACAGTTCTTCTAAT- 2337