Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488206
• Subject: NR_001562.2
• Aligned Length: 1374
• Identities: 970
• Gaps: 333

Alignment

Query    1  -AT---GGGCCGC---CAGCTAGCGGGGTGCGGAGACGCTGGGAAGAAGGCTTCCTTCAAAATGTCTACTGTTC  67
             ||   |||.|||   |||.|  |..|||||..||.|          ..||||||||||||||.|||.||||||
Sbjct    1  CATCTGGGGACGCTCTCAGGT--CTTGGTGCCCAGCC----------CAGCTTCCTTCAAAATATCTGCTGTTC  62

Query   68  ACGAAATCCTGTGCAAGCTCAGCTTGGAGGGTGATCACTCTACACCCCCAAGTGCATATGGGTCTGTCAAAGCC  141
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||
Sbjct   63  ATGAAATCCTGTGCAAGCTCAGCTTGGAGGGTGAACACTCTACACTCCCAAGTGCATTTGGGTCAGTCAAAGCC  136

Query  142  TATACTAACTTTGATGCTGAGCGGGATGCTTTGAACATTGAAACAGCCATCAAGACCAAAGGTGTGGATGAGGT  215
            ||.||.||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  137  TACACCAAATTTGATGCTGAGCAGGATGCTTTGAACATTGAAATGGCCATCAAGACCAAAGGTGTGGATGAGAT  210

Query  216  CACCATTGTCAACATTTTGACCAACCGCAGCAATGCACAGAGACAGGATATTGCCTTCGCCTACCAGAGAAGGA  289
            |||||.|||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  211  CACCACTGTCAACATTTTGACTAACCACAGCAATGCACAGAGACAGGATATTGCCTTCACCTACCAGAGAAGGA  284

Query  290  CCAAAAAGGAACTTGCATCAGCACTGAAGTCAGCCTTATCTGGCCACCTGGAGACGGTGATTTTGGGCCTATTG  363
            |||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||  |||..|||..||||||||||||.
Sbjct  285  CCAAAAAGGAACTTGTATCAGCACTTAAGTCAGCCTTATCTGGCCACCT--AGATAGTGGCTTTGGGCCTATTA  356

Query  364  AAGACACCTGCTCAGTATGACGCTTCTGAGCTAAAAGCTTCCATGAAGGGGCTGGGAACCGACGAGGACTCTCT  437
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||.||
Sbjct  357  AAGACACCTGCTCAGTATGATGCTTCTGAGCTAAAATCTTCCATGAAGGGGCTGGGAACCAACAAGGACTCCCT  430

Query  438  CATTGAGATCATCTGCTCCAGAACCAACCAGGAGCTGCAGGAAATTAACAGAGTCTACAAGGAAATGTACAAGA  511
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  431  CATTGAGATCATCTGCTCAAGAACCAACCAAGAGCTGCAGGAAATTAACAGAGTCTACAAGGAAATGTACAAGA  504

Query  512  CTGATCTGGAGAAGGACATTATTTCGGACACATCTGGTGACTTCCGCAAGCTGATGGTTGCCCTGGCAAAGGGT  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  505  CTGATCTGGAGAAGGACATTATTTCGGACACATCTGGTGACTTCTGCAAGCTGATGGTTGCCCTGGCAAAGGGT  578

Query  586  AGAAGAGCAGAGGATGGCTCTGTCATTGATTATGAACTGATTGACCAAGATGCTCGGGATCTCTATGACGCTGG  659
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  579  AGAAGAGCAGAGGATGGCTCTGTCATTGATTATGAACTGATTGACCAAGATGCCCGGGATCTCTATGACGCTGG  652

Query  660  AGTGAAGAGGAAAGGAACTGATGTTCCCAAGTGGATCAGCATCATGACCGAGCGGAGCGTGCCCCACCTCCAGA  733
            .||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct  653  GGTGAAGAGGAAAGGAACTGAAGTTCCCAAGTGGATCAGCGTCATGACCGAGCGGAGCATGTCCCACTTCCAGA  726

Query  734  AAGTATTTGATAGGTACAAGAGTTACAGCCCTTATGACATGTTGGAAAGCATCAGGAAAGAGGTTAAAGGAGAC  807
            ||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  727  AAGTATTTGATAGGTACAAGAGCTACAGTCCTTATGACATGTTGGAGAGCATCAAGAAAGAGGTTAAAGGAGAC  800

Query  808  CTGGAAAATGCTTTCCTGAACCTGGTTCAGTGCATTCAGAACAAGCCCCTGTATTTTGCTGATCGGCTGTATGA  881
            |||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct  801  CTGGAAAATTCTTTCCTGAACCTGGTCCAGTGTATTCAGAACAAGCCCCTGTATTTCGCTGACCGGCTGTACGA  874

Query  882  CTCCATGAAGGGCAAGGGGACGCGAGATAAGGTCCTGATCAGAATCATGGTCTCCCGCAGTGAAGTGGACATGT  955
            ||||||.|.|||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  875  CTCCATAATGGGCATGGGGACTCAAGATAAGGTCCTGATCAGAATCATGGTCTCCCACAATGAAGTGGACATGT  948

Query  956  TGAAAATTAGGTCTGAATTCAAGAGAAAGTACGGCAAGTCCCTGTACTATTATATCCAGCAAGACACTAAGGGC  1029
            |||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||| 
Sbjct  949  TGAAAATTAGGTCTGAATTCAAGAGAAAGTATAGCAAGTCCCTGTACTATTACATCCAGCAAGACACTAAGGG-  1021

Query 1030  GACTACCAGAAAGCGCTGCTGTACCTGTGTGGTGGAGATGACG-------------------------------  1072
                            ||||||||||||||||||||||||.|.                               
Sbjct 1022  ----------------TGCTGTACCTGTGTGGTGGAGATGGCTGAAGTCCGACACAGCACGAGCGTCCAGAAAT  1079

Query 1073  --------------------------------------------------------------------------  1072
                                                                                      
Sbjct 1080  GGTGCTCCCCATGCTTCCAGCTAACAGGTCTAGAAAACCCGCTTGTGACTAGCAGTCCCTGTGGCTGTTCCTGT  1153

Query 1073  --------------------------------------------------------------------------  1072
                                                                                      
Sbjct 1154  GAGGATGACGTTAGCATTGCCCCCAACCTCATTTTAGTTGCCTAAGCATTGCCTGGCTTTCCTGTCTAGTCTCT  1227

Query 1073  --------------------------------------------------------------------------  1072
                                                                                      
Sbjct 1228  CCTGTAAGCCAAAGAAATGAACATTCCAAGGAATTGGAAGTGAAGTCTATGATGTGAAACACTTTGCCTCCTGT  1301

Query 1073  ------------------------------------------  1072
                                                      
Sbjct 1302  GTACTGTGTCATAAACGGATTAATAAACTGAATTTGTACTTT  1343