Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488206
• Subject: NR_003573.1
• Aligned Length: 1322
• Identities: 1035
• Gaps: 262

Alignment

Query    1  -AT---GGGCCGC---CAGCTAGCGGGGTGCGGAGACGCTGGGAAGAAGGCTTCCTTCAAAATGTCTACTGTTC  67
             ||   |||.|||   |||||..|||.|..|||   |.|         .|||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  CATTTGGGGACGCTCTCAGCTCTCGGCGCACGG---CCC---------AGCTTCCTTCAAAATGTCTACTGTTC  62

Query   68  ACGAAATCCTGTGCAAGCTCAGCTTGGAGGGTGATCACTCTACACCCCCAAGTGCATATGGGTCTGTCAAAGCC  141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   63  ACGAAATCCTGTGCAAGCTCAGCTTGGAGGGTGATCACTCTACACCCCCAAGTGCATATGGGTCTGTCAAAGCC  136

Query  142  TATACTAACTTTGATGCTGAGCGGGATGCTTTGAACATTGAAACAGCCATCAAGACCAAAGGTGTGGATGAGGT  215
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  137  TACACTAACTTTGATGCTGAGCGGGATGCTTTGAACATTGAAACAGCCATCAAGACCAAAGGTGTGGATGAGGT  210

Query  216  CACCATTGTCAACATTTTGACCAACCGCAGCAATGCACAGAGACAGGATATTGCCTTCGCCTACCAGAGAAGGA  289
            ||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct  211  CACCATTGTCAACATTGTGACCAACCGCGACAATGCACAGAGACAGGATATTGTCTTCTCCTACCAGAGAAGGA  284

Query  290  CCAAAAAGGAACTTGCATCAGCACTGAAGTCAGCCTTATCTGGCCACCTGGAGACGGTGATTTTGGGCCTATTG  363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  285  CCAAAAAGGAACTTGCATCAGCACTGAAGTCAGCCTTATCTGGCCACCTGGAGACGGTGATTTTGGGCCTATTG  358

Query  364  AAGACACCTGCTCAGTATGACGCTTCTGAGCTAAAAGCTTCCATGAAGGGGCTGGGAACCGACGAGGACTCTCT  437
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  359  AAGACACCTGCTCAGTATGACGCTTCTGAGCTAAAAGCTTCCATGAAGGGGCTAGGAACCGACGAGGACTCTCT  432

Query  438  CATTGAGATCATCTGCTCCAGAACCAACCAGGAGCTGCAGGAAATTAACAGAGTCTACAAGGAAATGTACAAGA  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  433  CATTGAGATCATCTGCTCCAGAACCAACCAGGAGCTGCAGGAAATTAACAGAGTCTACAAGGAAATGTACAAGA  506

Query  512  CTGATCTGGAGAAGGACATTATTTCGGACACATCTGGTGACTTCCGCAAGCTGATGGTTGCCCTGGCAAAGGGT  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  507  CTGATCTGGAGAAGGACATTATTTCGGACACATCTGGTGACTTCCGCAAGCTGATGGTTGCCCTGGCAAAGGGT  580

Query  586  AGAAGAGCAGAGGATGGCTCTGTCATTGATTATGAACTGATTGACCAAGATGCTCGGGATCTCTATGACGCTGG  659
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct  581  AGAAGAGCAGAGGATGGCTCTGTCATTGATTATGAACTGATTGACCAAGATGCCCAGGATCTCTATGACGCTGG  654

Query  660  AGTGAAGAGGAAAGGAACTGATGTTCCCAAGTGGATCAGCATCATGACCGAGCGGAGCGTGCCCCACCTCCAGA  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  655  AGTGAAGAGGAAAGGAACTGATGTTCCCAAGTGGATCAGCATCATGACCGAGCGGAGCGTGCCCCACCTCCAGA  728

Query  734  AAGTATTTGATAGGTACAAGAGTTACAGCCCTTATGACATGTTGGAAAGCATCAGGAAAGAGGTTAAAGGAGAC  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  729  AAGTATTTGATAGGTACAAGAGTTACAGCCCTTATGACATGTTGGAAAGCATCAGGAAAGAGGTTAAAGGAGAC  802

Query  808  CTGGAAAATGCTTTCCTGAACCTGGTTCAGTGCATTCAGAACAAGCCCCTGTATTTTGCTGATCGGCTGTATGA  881
            ||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||.||
Sbjct  803  CTGGAAAATGCTTTCCTGAACCTGGTCCAGCGCATTCAGAACAAGCCCTTGTATTTTGCTGATCAGCTGTACGA  876

Query  882  CTCCATGAAGGGCAAGGGGACGCGAGATAAGGTCCTGATCAGAATCATGGTCTCCCGCAGTGAAGTGGACATGT  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  877  CTCCATGAAGGGCAAGGGGACGCGAGATAAGGTCCTGATCAGAATCATGGTCTCCCGCAGTGAAGTGGACATGT  950

Query  956  TGAAAATTAGGTCTGAATTCAAGAGAAAGTACGGCAAGTCCCTGTACTATTATATCCAGCAAGACACTAAGGGC  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  951  TGAAAATTAGGTCTGAATTCAAGAGAAAGTACGGCAAGTCCCTGTACTATTACATCCAGCAAGACACTAAGGGC  1024

Query 1030  GACTACCAGAAAGCGCTGCTGTACCTGTGTGGTGGAGATGACG-------------------------------  1072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.                               
Sbjct 1025  GACTACCAGAAAGCGCTGCTGTACCTGTGTGGTGGAGACGACTGAAGCCCGACACAGCCTGAGCGTCCAGAAAT  1098

Query 1073  --------------------------------------------------------------------------  1072
                                                                                      
Sbjct 1099  GGTGCTCACCATGCTTCCAGCTAACAGGTCTACTAAACATACAAAAGTTTAGCCGGGCGTGGTGGCGCTCGCCT  1172

Query 1073  --------------------------------------------------------------------------  1072
                                                                                      
Sbjct 1173  GTAGTCCCAGCTAGTCCGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACCCGGAAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCGA  1246

Query 1073  ----------------------------------------------------------------  1072
                                                                            
Sbjct 1247  GATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCTAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAA  1310