Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488208
• Subject: XM_017317742.1
• Aligned Length: 1712
• Identities: 1405
• Gaps: 189

Alignment

Query    1  ATGCTGAGCAGGTTGATGAGCGGCAGCAGCAGGAGCCTGGAGCGCGAGTACAGCTGCACCGTGCGGCTGCTGGA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGAGCAGGTTGATGAGCGGCAGCAGCAGGAGTCTGGAGCGCGAGTACAGCTGCACCGTGCGGCTGCTGGA  74

Query   75  CGACAGCGAGTACACCTGCACCATCCAGAGAGATGCCAAAGGCCAGTACCTGTTTGACCTTCTTTGCCACCATC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  CGACAGCGAGTACACCTGCACCATCCAGAGAGATGCCAAAGGCCAGTACCTGTTTGACCTCCTTTGCCACCACC  148

Query  149  TGAACCTACTTGAGAAAGACTATTTTGGTATCCGCTTTGTAGACCCAGATAAGCAGCGGCATTGGCTGGAATTT  222
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct  149  TGAACCTACTTGAGAAAGACTACTTTGGGATTCGTTTTGTGGACCCAGATAAGCAGCGGCATTGGTTGGAGTTT  222

Query  223  ACAAAGTCTGTGGTGAAACAATTGAGATCCCAGCCTCCATTCACCATGTGCTTCCGTGTGAAGTTTTATCCTGC  296
            ||||||||.||||||||.||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  223  ACAAAGTCAGTGGTGAAGCAGCTGAGATCCCAGCCTCCGTTCACCATGTGCTTCCGCGTGAAGTTTTACCCTGC  296

Query  297  AGACCCTGCTGCTCTGAAAGAAGAAATAACCAGGTATTTAGTCTTCCTGCAGATCAAAAGGGATCTCTACCATG  370
            .|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  CGACCCCGCTGCCCTGAAAGAGGAAATAACCAGGTACTTAGTCTTCCTTCAGATCAAAAGGGATCTCTACCACG  370

Query  371  GCCGACTCCTCTGTAAAACATCGGATGCTGCCTTGTTAGCAGCTTACATCCTTCAAGCGGAGATTGGGGATTAT  444
            ||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCGTCTTCTCTGTAAAACATCGGATGCCGCCTTGTTAGCGGCCTATATCCTTCAAGCGGAGATTGGGGATTAT  444

Query  445  GACTCAGGGAAA-CACCCTGAAGGCTACAGCTCCAAGTTCCAGTTTTTCCCTAAACATTCAGAGAAGCTGGAAA  517
            ||| |.|||||| |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct  445  GAC-CCGGGAAAGCACCCTGAAGGCTACAGCTCCAAGTTCCAATTTTTCCCGAAACATTCAGAGAAACTGGAAA  517

Query  518  GGAAAATTGCTGAGATTCACAAGACGGAACTGAGTGGTCAAACACCAGCAACATCAGAGCTGAACTTCTTAAGA  591
            .||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  518  AGAAAATTGCTGAGATTCACAAGACCGAACTCAGTGGTCAAACACCAGCAACATCAGAGCTGAATTTCTTAAGA  591

Query  592  AAAGCACAGACATTGGAAACATATGGAGTGGATCCTCACCCATGTAAGGACGTGTCAGGAAATGCTGCATTTCT  665
            ||.||.|||||.||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  592  AAGGCCCAGACGTTAGAGACCTACGGAGTGGACCCTCACCCATGTAAGGATGTGTCGGGAAATGCTGCGTTTCT  665

Query  666  GGCCTTCACTCCTTTTGGGTTTGTTGTTCTTCAAGGAAACAAGAGGGTCCACTTCATTAAATGGAATGAGGTGA  739
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  GGCCTTCACTCCTTTCGGGTTTGTTGTTCTTCAAGGAAACAAGAGGGTCCACTTCATTAAATGGAATGAGGTGA  739

Query  740  CCAAGCTGAAATTTGAAGGAAAGACTTTCTATTTATACGTAAGTCAGAAAGAGGAAAAGAAAATTATTCTTACA  813
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct  740  CCAAGCTGAAATTTGAAGGAAAGACTTTCTATTTATATGTAAGTCAGAAAGAGGAAAAAAAGATTATTCTCACA  813

Query  814  TATTTTGCTCCAACTCCTGAAGCGTGTAAGCACCTCTGGAAATGTGGAATCGAGAACCAAGCCTTCTACAAGCT  887
            ||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  TATTTTGCCCCAACTCCAGAAGCCTGCAAGCACCTCTGGAAATGTGGAATTGAGAACCAAGCCTTCTACAAGCT  887

Query  888  GGAGAAGTCAAGCCAAGTCCGCACAGTGTCCAGCAGCAATTTATTCTTTAAAGGGAGCCGGTTCCGATACAGTG  961
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  GGAAAAGTCAAGCCAAGTCCGCACAGTGTCCAGCAGCAATTTGTTCTTTAAGGGGAGCCGGTTCCGATACAGTG  961

Query  962  GCCGAGTTGCAAAGGAAGTCATGGAATCAAGTGCTAAGATCAAACGGGAGCCACCGGAAATACACAGAGCAGGG  1035
            ||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  962  GCCGGGTCGCAAAGGAAGTAATGGAGTCCAGTGCCAAGATCAAACGGGAGCCGCCAGAAATACACAGAGCAGGG  1035

Query 1036  ATGGTTCCCAGCCGGAGCTGTCCCTCCATAACCCATGGCCCAAGGCTGAGCAGCGTCCCCAGGACCCGCAGAAG  1109
            |||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1036  ATGGTCCCTAGCCGCAGCTGTCCTTCTATAACCCATGGCCCACGACTGAGCAGCGTCCCCAGGACACGAAGAAG  1109

Query 1110  AGCTGTTCACATCTCCATCATGGAAGGCCTAGAGTCCTTACGGGACAGTGCCCATTCCACACCAGTGCGTTCCA  1183
            ||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||..||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||.
Sbjct 1110  AGCTGTGCACATCTCTATCATGGAAGGCCTTGAGTCGCTACGAGACAGTGCCCATTCCACCCCAGTGCGGTCCT  1183

Query 1184  CTTCCCATGGGGACACCTTCCTGCCTCACGTGAGAAGCAGCCGGACAGATAGCAATGAGCGAGTAGCTGTGATT  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 1184  CTTCCCATGGGGACACCTTCCTGCCTCACGTGAGAAGCAGCCGGGCAGACAGCAATGAACGTGTCGCTGTGATA  1257

Query 1258  GCAGACGAGGCCTACAGCCCTGCAGACAGCGTGCTGCCCACCCCTGTGGCTGAGCACAGCCTGGAGCTGATGTT  1331
            ||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1258  GCGGATGAGGCCTACAGCCCCGCAGACAGTGTGCTGCCCACCCCTGTAGCCGAGCACAGCCTGGAGCTGATGCT  1331

Query 1332  GCTTTCCCGGCAGATCAATGGAGCCACCTGCAGCATTGAGGAGGAGAAGGAATCTGAAGCCAGCACCCCAACTG  1405
            |||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 1332  GCTCTCCCGGCAGATCAACGGGGCCACGTGCAGCATTGAGGAGGAGAAGGAGTCGGAGGCCAGCACCCCGACTG  1405

Query 1406  CTACAGAGGTGGAGGCCCTTGGGGGAGAGCTGAGGGCCCTGTGTCAGGGGCACAGCGGGCCCGAGGAGGAACAG  1479
            |.|||||||.|||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|||.|.|||   
Sbjct 1406  CGACAGAGGCGGAGGCCCTGGGAGGAGAGCTGAGGGCCCTGTGTCAGGGGCACGGCGGGTCAGAGCAAGAA---  1476

Query 1480  GTGAATAAGTTTGTTCTAAGTGTCCTCCGTTTGCTCCTTGTGACCATGGGACTCCTCTTTGTTTTGCTCCTCCT  1553
                                                                                      
Sbjct 1477  --------------------------------------------------------------------------  1476

Query 1554  CCTGATCATCCTTACCGAGTCTGACCTTGACATTGCCTTTTTCCGTGATATCCGCCAGACCCCCGAGTTTGAAC  1627
                                                                                      
Sbjct 1477  --------------------------------------------------------------------------  1476

Query 1628  AATTCCACTATCAATACTTTTGTCCCCTCAGGCGATGGTTTGCCTGCAAAATCCGCTCAGTGGTGAGCCTGCTC  1701
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477  ----------------------------CAGGCGATGGTTTGCCTGCAAAATCCGCTCAGTGGTGAGCCTGCTC  1522

Query 1702  ATTGACACCG  1711
            ||        
Sbjct 1523  AT--------  1524