Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488209
• Subject: NM_001167699.2
• Aligned Length: 1256
• Identities: 1041
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGGTTTTTGCTCACAGAATGGATAACAGCAAGCCACATTTGATTATTCCTACACTTCTGGTGCCCCTCCAAAA  74
            |||||||||||||||||||||||||||..|.||||.|.|.||.|.|.|.|.||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct    1  ATGGTTTTTGCTCACAGAATGGATAACGACCAGCCGCCTGTGGTGACTGCCACCCTGCTGGTGCCCCTTCAGAA  74

Query   75  CCGCAGCTGCACTGAAACAGC-----CACACCT-CTGCCAAGCCAATACCTGATGGAATTAAGTGAGGAGCACA  142
            |.||||||||.|.|||.||||     |   ||| |||||   |||...||||||||.|||...|||||||||||
Sbjct   75  CAGCAGCTGCGCGGAAGCAGCTGAGGC---CCTGCTGCC---CCATGGCCTGATGGGATTGCATGAGGAGCACA  142

Query  143  GTTGGATGAGCAACCAAACAGACCTTCACTATGTGCTGAAACCCGGGGAAGTGGCCACAGCCAGCATCTTCTTT  216
            |.||||||||||||...|||||.|||||.||.|.||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  143  GCTGGATGAGCAACAGGACAGAGCTTCAGTACGAGCTGAACCCTGGAGAGGTGGCCACCGCCAGCATCTTCTTT  216

Query  217  GG-GATTCTGTGGTTGTTTTCTATCTTCGGCAATTCCCTGGTTTGTTTGGTCATCCATAGGAGTAGGAGGACTC  289
            || |.|| ||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||.||||||||||..||||..|||||||||
Sbjct  217  GGCGCTT-TGTGGTTGTTCTCCATCTTTGGCAATTCCCTGGTATGTCTGGTCATCCACCGGAGCCGGAGGACTC  289

Query  290  AGTCTACCACCAACTACTTTGTGGTCTCCATGGCATGTGCTGACCTTCTCATCAGCGTTGCCAGCACGCCTTTC  363
            ||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct  290  AGTCCACCACCAACTACTTCGTGGTGTCCATGGCGTGTGCTGACCTTCTCATCAGCGTGGCCAGCACGCCGTTT  363

Query  364  GTCCTGCTCCAGTTCACCACTGGAAGGTGGACGCTGGGTAGTGCAACGTGCAAGGTTGTGCGATATTTTCAATA  437
            |||.||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|.|||||||||.||.||.||.||.||.||
Sbjct  364  GTCGTGCTGCAGTTCACCACCGGGAGGTGGACCCTGGGTAGCGCCATGTGCAAGGTGGTCCGCTACTTCCAGTA  437

Query  438  TCTCACTCCAGGTGTCCAGATCTACGTTCTCCTCTCCATCTGCATAGACCGGTTCTACACCATCGTCTATCCTC  511
            .|||||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  438  CCTCACCCCCGGCGTGCAGATCTACGTGCTGCTCTCCATCTGCATCGACCGCTTCTATACCATCGTCTACCCGC  511

Query  512  TGAGCTTCAAGGTGTCCAGAGAAAAAGCCAAGAAAATGATTGCGGCATCGTGGATCTTTGATGCAGGCTTTGTG  585
            |||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|.|||.|||
Sbjct  512  TGAGCTTCAAGGTGTCCCGAGAGAAGGCCAAGAAAATGATTGCAGCCTCCTGGATCTTGGACGCGGCCTTCGTG  585

Query  586  ACCCCTGTGCTCTTTTTCTATGGCTCCAACTGGGACAGTCATTGTAACTATTTCCTCCCCTCCTCTTGGGAAGG  659
            ||.|||||..||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||..||||.|||||.||
Sbjct  586  ACGCCTGTCTTCTTTTTCTACGGCTCTAACTGGGATAGTCACTGTAACTACTTCCTCCCTCCCTCCTGGGAGGG  659

Query  660  CACTGCCTACACTGTCATCCACTTCTTGGTGGGCTTTGTGATTCCATCTGTCCTCATAATTTTATTTTACCAAA  733
            .||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||..||||||||||..|.||||||||.|
Sbjct  660  AACTGCCTATACCGTCATCCACTTCTTGGTGGGCTTCGTGATTCCCTCCATCCTCATAATCCTGTTTTACCAGA  733

Query  734  AGGTCATAAAATATATTTGGAGAATAGGCACAGATGGCCGAACGGTGAGGAGGACAATGAACATTGTCCCTCGG  807
            ||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.|||.||||.|||||.||||||||||||||..||
Sbjct  734  AGGTCATAAAGTATATCTGGAGAATAGGCACGGACGGGCGGACGCTGAGAAGGACGATGAACATTGTCCCCAGG  807

Query  808  ACAAAAGTGAAAACTATCAAGATGTTCCTCATCTTAAATCTGTTGTTTTTGCTCTCCTGGCTGCCTTTTCATGT  881
            |||||.||||||||..|||||||||||||..||||.||.||..||||..||.||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  808  ACAAAGGTGAAAACGGTCAAGATGTTCCTGCTCTTGAACCTAGTGTTCCTGTTCTCCTGGCTACCTTTCCATGT  881

Query  882  AGCTCAGCTATGGCACCCCCATGAACAAGACTATAAGAAAAGTTCCCTTGTTTTCACAGCTATCACATGGATAT  955
            .||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||..||||.|||.|||
Sbjct  882  GGCTCAGCTCTGGCATCCCCATGAGCAAGACTACAAGAAGAGCTCCCTTGTCTTCACGGCAGTCACGTGGGTAT  955

Query  956  CCTTTAGTTCTTCAGCCTCTAAACCTACTCTGTATTCAATTTATAATGCCAATTTTCGGAGAGGGATGAAAGAG  1029
            |.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  956  CTTTCAGCTCTTCAGCCTCGAAACCCACTCTGTACTCTATTTATAATGCCAATTTTCGGAGAGGGATGAAAGAG  1029

Query 1030  ACTTTTTGCATGTCCTCTATGAAATGTTACCGAAGCAATGCCTATACTATCACAACAAGTTCAAGGATGGCCAA  1103
            ||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.|||.||||||||||
Sbjct 1030  ACATTCTGCATGTCCTCGATGAAATGCTACCGCAGCAATGCCTACACCATCACGACCAGCTCACGGATGGCCAA  1103

Query 1104  AAAAAACTACGTTGGCATTTCAGAAATCCCTTCCATGGCCAAAACTATTACCAAAGACTCGATCTATGACTCAT  1177
            ||.||||||.||.||||||||.|||||||||.||.||..||..||.||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1104  AAGAAACTATGTGGGCATTTCGGAAATCCCTCCCGTGAGCAGGACCATAACCAAAGACTCCATCTATGACTCAT  1177

Query 1178  TTGACAGAGAAGCCAAGGAAAAAAAGCTTGCTTGGCCCATTAACTCAAATCCACCAAATACTTTTGTCGACG  1249
            |||||.|.||.||||.|||.||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||    
Sbjct 1178  TTGACCGGGAGGCCAGGGAGAAGAAGCTCGCCTGGCCCATCAACTCAAACCCTCCAAACACTTTTGTC----  1245