Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488382
- Subject:
- XM_017317328.1
- Aligned Length:
- 2217
- Identities:
- 1899
- Gaps:
- 143
Alignment
Query 1 ATGGTAGTGTTCAATGGCCTTCTTAAGATCAAAATCTGCGAGGCCGTGAGCTTGAAGCCCACAGCCTGGTCGCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTAGTGTTCAATGGCCTTCTTAAGATCAAAATCTGCGAGGCGGTGAGCTTGAAGCCCACAGCCTGGTCGCT 74
Query 75 GCGCCATGCGGTGGGACCCCGGCCGCAGACTTTCCTTCTCGACCCCTACATTGCCCTCAATGTGGACGACTCGC 148
||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 75 GCGCCATGCGGTGGGACCCCGGCCACAGACGTTCCTTTTGGACCCCTACATTGCCCTTAACGTGGACGACTCGC 148
Query 149 GCATCGGCCAAACGGCCACCAAGCAGAAGACCAACAGCCCGGCCTGGCACGACGAGTTCGTCACCGATGTGTGC 222
|||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCATCGGCCAAACAGCCACCAAGCAAAAGACCAACAGCCCGGCCTGGCACGATGAGTTCGTCACCGATGTGTGC 222
Query 223 AACGGACGCAAGATCGAGCTGGCTGTCTTTCACGATGCCCCCATAGGCTACGACGACTTCGTGGCCAACTGCAC 296
||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AATGGGCGCAAGATCGAGCTGGCTGTCTTTCACGACGCTCCTATCGGCTACGACGACTTCGTGGCCAACTGCAC 296
Query 297 CATCCAGTTTGAGGAGCTGCTGCAGAACGGGAGCCGCCACTTCGAGGACTGGATTGATCTGGAGCCAGAAGGAA 370
|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 297 CATCCAGTTCGAGGAGCTGCTGCAGAATGGGAGCCGTCACTTCGAGGACTGGATTGACCTGGAGCCAGAAGGAA 370
Query 371 GAGTGTATGTGATCATCGATCTCTCAGGGTCGTCGGGTGAAGCCCCTAAAGACAATGAAGAGCGTGTGTTCAGG 444
.||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 371 AAGTGTACGTGATCATCGATCTCTCGGGATCATCGGGTGAAGCCCCTAAAGACAATGAAGAACGAGTGTTCAGG 444
Query 445 GAACGCATGCGGCCGAGGAAGCGGCAGGGGGCCGTCAGGCGCAGGGTCCATCAGGTCAACGGCCACAAGTTCAT 518
||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 445 GAGCGTATGCGGCCAAGGAAGCGGCAAGGGGCTGTCAGGCGCAGGGTCCACCAGGTCAATGGCCACAAGTTCAT 518
Query 519 GGCCACCTATCTT-CGGCAGCCCACCTACTGCTCCCATTGCAGAGACTTCATCTGGGGTGTCATAGGAAAGCAG 591
||||||||| ||| |||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 519 GGCCACCTA-CTTGCGGCAACCCACCTACTGCTCCCACTGCAGAGATTTCATCTGGGGTGTCATAGGAAAACAG 591
Query 592 GGATACCAGTGTCAAGTCTGCACCTGCGTGGTCCACAAGCGGTGCCACGAGCTCATAATCACAAAGTGTGCTGG 665
|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 592 GGATATCAATGTCAAGTTTGCACTTGCGTTGTCCACAAGCGATGTCATGAGCTCATTATTACAAAGTGCGCTGG 665
Query 666 GTTAAAGAAGCAGGAGACCCCCGACCAGGTGGGCTCCCAGCGGTTCAGCGTCAACATGCCCCACAAGTTCGGTA 739
|.|.|||||.|||||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 666 GCTGAAGAAACAGGAAACCCCTGACGAGGTGGGCTCCCAACGGTTCAGCGTCAACATGCCCCACAAGTTCGGGA 739
Query 740 TCCACAACTACAAGGTCCCTACCTTCTGCGATCACTGTGGGTCCCTGCTCTGGGGACTCTTGCGGCAGGGTTTG 813
|||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 740 TCCACAACTACAAGGTCCCCACGTTCTGTGACCACTGTGGGTCCCTGCTCTGGGGCCTCTTGCGGCAGGGCTTG 813
Query 814 CAGTGTAAAGTCTGCAAAATGAATGTTCACCGTCGATGTGAGACCAACGTGGCTCCCAACTGTGGAGTGGATGC 887
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 814 CAGTGTAAAGTCTGCAAAATGAATGTTCACCGGCGATGTGAGACCAATGTGGCTCCCAACTGTGGGGTAGACGC 887
Query 888 CAGAGGAATCGCCAAAGTACTGGCCGACCTGGGCGTTACCCCAGACAAAATCACCAACAGCGGCCAGAGAAGGA 961
|||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 888 CAGAGGAATTGCCAAAGTGCTGGCTGACCTTGGTGTTACTCCAGACAAAATCACCAACAGTGGCCAAAGGAGGA 961
Query 962 AAAAGCTCATTGCTGGTGCCGAGTCCCCGCAGCCTGCTTCTGGAAGCTCACCATCTGAGGAAGATCGATCCAAG 1035
||||||||..|||||||||.||||||||.|||||.||||||||||.|||.||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 962 AAAAGCTCGCTGCTGGTGCTGAGTCCCCACAGCCGGCTTCTGGAAACTCCCCATCTGAAGACGACCGATCCAAG 1035
Query 1036 TCAGCACCCACCTCCCCTTGTGACCAGGAAATAAAAGAACTTGAGAACAACATTCGGAAAGCCTTGTCATTTGA 1109
|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1036 TCAGCGCCCACCTCCCCTTGTGACCAGGAACTAAAAGAACTTGAAAACAACATTCGGAAGGCCTTGTCATTTGA 1109
Query 1110 CAACCGAGGAGAGGAGCACCGGGCAGCATCGT----CTCCTGATGGCCAGCTGATGAGCCCCGGTGAGAATGGC 1179
||||||||||||||||||||| |||.|||| |.|| ||||||||||||...||||||||.|||||.||.
Sbjct 1110 CAACCGAGGAGAGGAGCACCG---AGCGTCGTCGGCCACC-GATGGCCAGCTGGCAAGCCCCGGAGAGAACGGG 1179
Query 1180 GAAGTCCGGCAAGGCCAGGCCAAGCGCCTGGGCCTGGATGAGTTCAACTTCATCAAGGTGTTGGGCAAAGGCAG 1253
||||||||||.||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180 GAAGTCCGGCCAGGCCAGGCCAAGCGCTTGGGGCTGGATGAGTTCAACTTCATCAAGGTGTTGGGCAAAGGCAG 1253
Query 1254 CTTTGGCAAGGTCATGTTGGCAGAACTCAAGGGCAAAGATGAAGTATATGCTGTGAAGGTCTTAAAGAAGGACG 1327
|||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1254 CTTTGGCAAGGTCATGTTGGCGGAACTCAAAGGCAAAGATGAAGTCTACGCTGTGAAGGTCTTGAAGAAGGACG 1327
Query 1328 TCATCCTTCAGGATGATGACGTGGACTGCACAATGACAGAGAAGAGGATTTTGGCTCTGGCACGGAAACACCCG 1401
|.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1328 TTATCCTACAAGACGATGATGTGGACTGCACAATGACAGAGAAGAGGATTTTGGCTCTGGCTCGGAAACACCCT 1401
Query 1402 TACCTTACCCAACTCTACTGCTGCTTCCAGACCAAGGACCGCCTCTTTTTCGTCATGGAATATGTAAATGGTGG 1475
||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1402 TATCTAACCCAACTCTATTGCTGCTTCCAGACCAAGGACCGCCTCTTCTTCGTCATGGAATATGTAAATGGTGG 1475
Query 1476 AGACCTCATGTTTCAGATTCAGCGCTCCCGAAAATTCGACGAGCCTCGTTCACGGTTCTATGCTGCAGAGGTCA 1549
||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1476 AGACCTCATGTTCCAGATTCAGCGGTCCCGAAAATTTGATGAGCCTCGTTCTCGGTTCTATGCCGCAGAGGTCA 1549
Query 1550 CATCGGCCCTCATGTTCCTCCACCAGCATGGAGTCATCTACAGGGATTTGAAACTGGACAACATCCTTCTGGAT 1623
||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1550 CATCAGCCCTCATGTTTCTCCACCAGCACGGAGTGATCTACAGGGATTTGAAACTGGACAACATCCTTCTAGAT 1623
Query 1624 GCAGAAGGTCACTGCAAGCTGGCTGACTTCGGGATGTGCAAGGAAGGGATTCTGAATGGTGTGACGACCACCAC 1697
||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1624 GCAGAAGGCCACTGCAAGCTGGCTGACTTTGGGATGTGCAAGGAAGGGATTATGAATGGTGTGACAACTACCAC 1697
Query 1698 GTTCTGTGGGACTCCTGACTACATAGCTCCTGAGATCCTGCAGGAGTTGGAGTATGGCCCCTCCGTGGACTGGT 1771
.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1698 CTTCTGTGGGACTCCTGACTACATAGCTCCAGAGATCCTACAGGAGTTGGAGTACGGCCCCTCAGTGGACTGGT 1771
Query 1772 GGGCCCTGGGGGTGCTGATGTACGAGATGATGGCTGGACAGCCTCCCTTTGAGGCCGACAATGAGGACGACCTA 1845
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||.|.
Sbjct 1772 GGGCCCTGGGGGTGCTGATGTACGAGATGATGGCTGGGCAGCCCCCCTTTGAAGCTGACAACGAGGACGACTTG 1845
Query 1846 TTTGAGTCCATCCTCCATGACGACGTGCTGTACCCAGTCTGGCTCAGCAAGGAGGCTGTCAGCATCTTGAAAGC 1919
||.||.||||||||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||
Sbjct 1846 TTCGAATCCATCCTTCATGATGATGTTCTCTATCCTGTCTGGCTTAGCAAGGAAGCTGTCAGCATCCTGAAAGC 1919
Query 1920 TTTCATGACGAAGAATCCCCACAAGCGCCTGGGCTGTGTGGCATCGCAGAATGGCGAGGACGCCATCAAGCAGC 1993
|||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1920 TTTCATGACCAAGAACCCGCACAAGCGCCTGGGCTGTGTGGCAGCGCAGAACGGGGAGGACGCCATCAAGCAAC 1993
Query 1994 ACCCATTCTTCAAAGAGATTGACTGGGTGCTCCTGGAGCAGAAGAAGATCAAGCCACCCTTCAAACCACGCATT 2067
|.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1994 ATCCATTCTTCAAGGAGATTGACTGGGTACTGCTGGAGCAGAAGAAAATCAAGCCCCCCTTCAAGCC------- 2060
Query 2068 AAAACCAAAAGAGACGTCAATAATTTTGACCAAGACTTTACCCGGGAAGAGCCGGTACTCACCCTTGTGGACGA 2141
|||| |.||||| ||| |.|.|
Sbjct 2061 ----------GAGA-------ATTTTTG-------CTT---CAGTG---------------------------- 2079
Query 2142 AGCAATTGTAAAGCAGATCAACCAGGAGGAATTCAAAGGTTTCTCCTACTTTGGTGAAGACCTGATGCCCG 2212
Sbjct 2080 ----------------------------------------------------------------------- 2079