Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488384
• Subject: NM_001289921.1
• Aligned Length: 1378
• Identities: 1067
• Gaps: 223

Alignment

Query    1  ATGCGAGCACAAATTGAAGTGATACCATGCAAAATTTGTGGCGATAAGTCCTCTGGGATCCACTACGGAGTCAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CACATGTGAAGGCTGCAAGGGATTCTTTAGGAGGAGCCAGCAGAACAATGCTTCTTATTCCTGCCCAAGGCAGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GAAACTGTTTAATTGACAGAACGAACAGAAACCGTTGCCAACACTGCCGACTGCAGAAGTGTCTTGCCCTAGGA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ATGTCAAGAGATGCTGTGAAGTTTGGGAGGATGTCCAAGAAGCAAAGGGACAGCCTGTATGCTGAGGTGCAGAA  296
            |||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCAAGAGATGCTGTAAAGTTCGGGAGGATGTCCAAGAAGCAGCGGGACAGCCTGTATGCTGAGGTGCAGAA  74

Query  297  GCACCAGCAGCGGCTGCAGGAACAGCGGCAGCAGCAGAGTGGGGAGGCAGAAGCCCTTGCCAGGGTGTACAGCA  370
            |||.|||||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct   75  GCATCAGCAAAGGCTGCAGGAGCAGCGGCAGCAGCAGAGTGGGGAGGCGGAGGCCCTCGCCAGGGTGTACAGCA  148

Query  371  GCAGCATTAGCAACGGCCTGAGCAACCTGAACAACGAGACCAGCGGCACTTATGCCAACGGGCACGTCATTGAC  444
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||||.|||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAGCATTAGCAATGGCCTCAGCAACCTGAACACCGAGACCGGCGGCACATACGCCAACGGGCACGTCATTGAC  222

Query  445  CTGCCCAAGTCTGAGGGTTATTACAACGTCGATTCCGGTCAGCCGTCCCCTGATCAGTCAGGACTTGACATGAC  518
            |||||||||||.||.||||||||||.|.|.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  223  CTGCCCAAGTCCGAAGGTTATTACAGCATAGATTCCGGTCAGCCGTCTCCCGATCAGTCAGGACTGGACATGAC  296

Query  519  TGGAATCAAACAGATAAAGCAAGAACCTATCTATGACCTCACATCCGTACCCAACTTGTTTACCTATAGCTCTT  592
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGGATCAAACAGATAAAGCAAGAACCTATCTATGACCTCACATCTGTACCCAACTTGTTTACCTATAGCTCTT  370

Query  593  TCAACAATGGGCAGTTAGCACCAGGGATAACCATGACTGAAATCGACCGAATTGCACAGAACATCATTAAGTCC  666
            |||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCAACAACGGGCAGTTAGCTCCCGGGATAACAATGTCTGAGATCGATCGAATTGCACAGAACATCATTAAGTCC  444

Query  667  CATTTGGAGACATGTCAATACACCATGGAAGAGCTGCACCAGCTGGCGTGGCAGACCCACACCTATGAAGAAAT  740
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  445  CATTTGGAGACATGTCAGTACACCATGGAAGAACTCCATCAGCTGGCATGGCAGACCCACACCTACGAGGAAAT  518

Query  741  TAAAGCATATCAAAGCAAGTCCAGGGAAGCACTGTGGCAACAATGTGCCATCCAGATCACTCACGCCATCCAAT  814
            .||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|
Sbjct  519  CAAGGCGTATCAAAGCAAGTCCAGGGAGGCTCTGTGGCAGCAGTGTGCCATCCAGATCACCCATGCTATCCAGT  592

Query  815  ACGTGGTGGAGTTTGCAAAGCGGATAACAGGCTTCATGGAGCTCTGTCAAAATGATCAAATTCTACTTCTGAAG  888
            |||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||..|||||||||||
Sbjct  593  ACGTGGTGGAGTTCGCCAAGCGGATAACAGGCTTCATGGAGCTGTGTCAGAACGATCAGATCTTACTTCTGAAG  666

Query  889  TCAGGTTGCTTGGAAGTGGTTTTAGTGAGAATGTGCCGTGCCTTCAACCCATTAAACAACACTGTTCTGTTTGA  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCAGGTTGCTTGGAAGTGGTTTTAGTGAGAATGTGTCGTGCCTTCAACCCATTAAACAACACTGTTCTGTTTGA  740

Query  963  AGGAAAATATGGAGGAATGCAAATGTTCAAAGCCTTAGGTTCTGATGACCTAGTGAATGAAGCATTTGACTTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGAAAATATGGAGGAATGCAAATGTTCAAAGCCTTAGGTTCGGATGACCTAGTGAATGAAGCATTTGACTTTG  814

Query 1037  CAAAGAATTTGTGTTCCTTGCAGCTGACCGAGGAGGAGATCGCTTTGTTCTCATCTGCTGTTCTGATATCTCCA  1110
            |.||||||.|||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  815  CGAAGAATCTGTGTTCCTTGCAGCTGACTGAGGAAGAGATTGCTCTGTTCTCCTCTGCTGTTCTGATATCCCCA  888

Query 1111  GACCGAGCCTGGCTTATAGAACCAAGGAAAGTCCAGAAGCTTCAGGAAAAAATTTATTTTGCACTTCAACATGT  1184
            ||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  889  GACCGAGCCTGGCTGATCGAACCAAGAAAAGTCCAGAAGCTTCAGGAAAAGATTTATTTTGCACTGCAACATGT  962

Query 1185  GATTCAGAAGAATCACCTGGATGATGAGACCTTGGCAAAGTTAATAGCCAAGATACCAACCATCACGGCAGTTT  1258
            ||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  963  GATTCAGAAGAACCACCTGGATGATGAGACCCTGGCAAAGTTAATAGCCAAGATACCAACTATCACGGCAGTCT  1036

Query 1259  GCAACTTGCACGGGGAGAAGCTGCAGGTATTTAAGCAATCTCATCCAGAGATAGTGAATACACTGTTTCCTCCG  1332
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037  GCAACTTGCATGGGGAGAAGCTGCAGGTATTTAAGCAGTCTCATCCAGACATAGTGAATACACTGTTTCCTCCA  1110

Query 1333  TTATACAAGGAGCTCTTTAATCCTGACTGTGCCACCGGCTGCAAAG  1378
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||..|.|.||||||| 
Sbjct 1111  TTGTACAAGGAGCTCTTTAATCCTGACTGTGCTGCGGTCTGCAAA-  1155