Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488427
• Subject: NM_001030004.3
• Aligned Length: 1445
• Identities: 1133
• Gaps: 283

Alignment

Query    1  ATGCGACTCTCCAAAACCCTCGTCGACATGGACA---TG-----GCCGACTACAGTGCTGCACTGGACCCAGCC  66
                                       ||||.||   ||     |||  |..|.|.|||.||.||||       
Sbjct    1  ---------------------------ATGGTCAGCGTGAACGCGCC--CCTCGGGGCTCCAGTGGA-------  38

Query   67  TACACCACCCTGGAATTTGAGAATGTGCAGGTGTTGACGATGGGCAATGACACGTCCCCATCAGAAGGCACCAA  140
                                       .||.|.||           |.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   39  ---------------------------GAGTTCTT-----------ACGACACGTCCCCATCAGAAGGCACCAA  74

Query  141  CCTCAACGCGCCCAACAGCCTGGGTGTCAGCGCCCTGTGTGCCATCTGCGGGGACCGGGCCACGGGCAAACACT  214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCAACGCGCCCAACAGCCTGGGTGTCAGCGCCCTGTGTGCCATCTGCGGGGACCGGGCCACGGGCAAACACT  148

Query  215  ACGGTGCCTCGAGCTGTGACGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGGAGGAGCGTGCGGAAGAACCACATGTACTCCTGC  288
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACGGTGCCTCGAGCTGTGACGGCTGCAAGGGCTTCTTCCGGAGGAGCGTGCGGAAGAACCACATGTACTCCTGC  222

Query  289  AGATTTAGCCGGCAGTGCGTGGTGGACAAAGACAAGAGGAACCAGTGCCGCTACTGCAGGCTCAAGAAATGCTT  362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGATTTAGCCGGCAGTGCGTGGTGGACAAAGACAAGAGGAACCAGTGCCGCTACTGCAGGCTCAAGAAATGCTT  296

Query  363  CCGGGCTGGCATGAAGAAGGAAGCCGTCCAGAATGAGCGGGACCGGATCAGCACTCGAAGGTCAAGCTATGAGG  436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGGGCTGGCATGAAGAAGGAAGCCGTCCAGAATGAGCGGGACCGGATCAGCACTCGAAGGTCAAGCTATGAGG  370

Query  437  ACAGCAGCCTGCCCTCCATCAATGCGCTCCTGCAGGCGGAGGTCCTGTCCCGACAGATCACCTCCCCCGTCTCC  510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAGCAGCCTGCCCTCCATCAATGCGCTCCTGCAGGCGGAGGTCCTGTCCCGACAGATCACCTCCCCCGTCTCC  444

Query  511  GGGATCAACGGCGACATTCGGGCGAAGAAGATTGCCAGCATCGCAGATGTGTGTGAGTCCATGAAGGAGCAGCT  584
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGATCAACGGCGACATTCGGGCGAAGAAGATTGCCAGCATCGCAGATGTGTGTGAGTCCATGAAGGAGCAGCT  518

Query  585  GCTGGTTCTCGTTGAGTGGGCCAAGTACATCCCAGCTTTCTGCGAGCTCCCCCTGGACGACCAGGTGGCCCTGC  658
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGGTTCTCGTTGAGTGGGCCAAGTACATCCCAGCTTTCTGCGAGCTCCCCCTGGACGACCAGGTGGCCCTGC  592

Query  659  TCAGAGCCCATGCTGGCGAGCACCTGCTGCTCGGAGCCACCAAGAGATCCATGGTGTTCAAGGACGTGCTGCTC  732
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCAGAGCCCATGCTGGCGAGCACCTGCTGCTCGGAGCCACCAAGAGATCCATGGTGTTCAAGGACGTGCTGCTC  666

Query  733  CTAGGCAATGACTACATTGTCCCTCGGCACTGCCCGGAGCTGGCGGAGATGAGCCGGGTGTCCATACGCATCCT  806
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTAGGCAATGACTACATTGTCCCTCGGCACTGCCCGGAGCTGGCGGAGATGAGCCGGGTGTCCATACGCATCCT  740

Query  807  TGACGAGCTGGTGCTGCCCTTCCAGGAGCTGCAGATCGATGACAATGAGTATGCCTACCTCAAAGCCATCATCT  880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGACGAGCTGGTGCTGCCCTTCCAGGAGCTGCAGATCGATGACAATGAGTATGCCTACCTCAAAGCCATCATCT  814

Query  881  TCTTTGACCCAGATGCCAAGGGGCTGAGCGATCCAGGGAAGATCAAGCGGCTGCGTTCCCAGGTGCAGGTGAGC  954
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTTTGACCCAGATGCCAAGGGGCTGAGCGATCCAGGGAAGATCAAGCGGCTGCGTTCCCAGGTGCAGGTGAGC  888

Query  955  TTGGAGGACTACATCAACGACCGCCAGTATGACTCGCGTGGCCGCTTTGGAGAGCTGCTGCTGCTGCTGCCCAC  1028
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTGGAGGACTACATCAACGACCGCCAGTATGACTCGCGTGGCCGCTTTGGAGAGCTGCTGCTGCTGCTGCCCAC  962

Query 1029  CTTGCAGAGCATCACCTGGCAGATGATCGAGCAGATCCAGTTCATCAAGCTCTTCGGCATGGCCAAGATTGACA  1102
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTGCAGAGCATCACCTGGCAGATGATCGAGCAGATCCAGTTCATCAAGCTCTTCGGCATGGCCAAGATTGACA  1036

Query 1103  ACCTGTTGCAGGAGATGCTGCTGGGAGGGTCCCCCAGCGATGCACCCCATGCCCACCACCCCCTGCACCCTCAC  1176
            |||||||||||||||||||||||||| |||||    |.|       |||.|||||                   
Sbjct 1037  ACCTGTTGCAGGAGATGCTGCTGGGA-GGTCC----GTG-------CCAAGCCCA-------------------  1079

Query 1177  CTGATGCAGGAACATATGGGAACCAACGTCATCGTTGCCAACACAATGCCCACTCACCTCAGCAACGGACAGAT  1250
                 |.|||..|    |||             ||||                                     
Sbjct 1080  -----GGAGGGGC----GGG-------------GTTG-------------------------------------  1094

Query 1251  GTGTGAGTGGCCCCGACCCAGGGGACAGGCAGC-CAC-CCCTGAG---ACCCCACAGC-CCTCACCGCCAGGTG  1318
                ||||||...|..||||||.|||||||  | ||| |..||||   |||||.|||| |||          ||
Sbjct 1095  ----GAGTGGGGACTCCCCAGGAGACAGGC--CTCACACAGTGAGCTCACCCCTCAGCTCCT----------TG  1152

Query 1319  GCT----CAGGGTCTGAGCC-CTAT----AAGCTCCTGCCGGGAGCCGTCGCCACAATCGTCAAGCCCCTCTCT  1383
            |||    ||    |||.||| ||.|    |||.|.||                                     
Sbjct 1153  GCTTCCCCA----CTGTGCCGCTTTGGGCAAGTTGCT-------------------------------------  1185

Query 1384  GCCATCCCCCAGCCGACCATCACCAAGCAGGAAGTTATC  1422
                                                   
Sbjct 1186  ---------------------------------------  1185