Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488615
- Subject:
- XM_011535042.2
- Aligned Length:
- 3274
- Identities:
- 2798
- Gaps:
- 463
Alignment
Query 1 ATGAGGCCAAAGACTTTTCCTGCCACGACTTATTCTGGAAATAGCCGGCAGCGACTGCAAGAGATTCGTGAGGG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GTTAAAGCAGCCATCCAAGTCTTCGGTTCAGGGGCTACCCGCAGGACCAAACAGTGACACTTCCCTGGATGCCA 148
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Sbjct 1 ----ATGCAGC----------------------GCTA----------------------------TGGATGCC- 19
Query 149 AAGTCCTGGGGAGC---------AAAGATGCCACCAGGCAGCAGCAGCAGATGAGAGCCACCCCAAAGTTCGGA 213
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Sbjct 20 --------GGGAGCGATCTTTGGAAAG---------------------------GAGTCCCC------------ 46
Query 214 CCTTATCAGAAAGCCTTGAGGGAAATCAGATATTCCTTGTTGCCTTTTGCTAATGAATCGGGCACCTCTGCAGC 287
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Sbjct 47 ------------GGCTCGAGCGACA----------CT------------------------GCCCCCCTGGGGC 74
Query 288 TGCAGAAGTGAACCGGCAAATGCTGCAGGAACTGGTGAACGCAGGATGCGACCAGGAGATGGCTGGCCGAGCTC 361
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Sbjct 75 T---------------------CTG---------------------------CAGGAGATGGCTGGCCGAGCTC 100
Query 362 TCAAGCAGACTGGCAGCAGGAGCATCGAGGCCGCCCTGGAGTACATCAGCAAGATGGGCTACCTGGACCCGAGG 435
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Sbjct 101 TCAAGCAGACTGGCAGCAGGAGCATCGAGGCCGCCCTGGAGTACATCAGCAAGATGGGCTACCTGGACCCGAGG 174
Query 436 AATGAGCAGATTGTGCGGGTCATTAAGCAGACCTCCCCAGGAAAGGGGCTCATGCCAACCCCAGTGACGCGGAG 509
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Sbjct 175 AATGAGCAGATTGTGCGGGTCATTAAGCAGACCTCCCCAGGAAAGGGGCTCATGCCAACCCCAGTGACGCGGAG 248
Query 510 GCCCAGCTTCGAAGGAACCGGCGATTCGTTTGCGTCCTACCACCAGCTGAGCGGTACCCCCTACGAGGGCCCAA 583
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Sbjct 249 GCCCAGCTTCGAAGGAACCGGCGATTCGTTTGCGTCCTACCACCAGCTGAGCGGTACCCCCTACGAGGGCCCAA 322
Query 584 GCTTCGGCGCTGACGGCCCCACGGCGCTGGAGGAGATGCCGCGGCCGTACGTGGACTACCTTTTCCCCGGAGTC 657
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Sbjct 323 GCTTCGGCGCTGACGGCCCCACGGCGCTGGAGGAGATGCCGCGGCCGTACGTGGACTACCTTTTCCCCGGAGTC 396
Query 658 GGCCCCCACGGGCCCGGCCACCAGCACCAGCACCCACCCAAGGGCTACGGTGCCAGCGTAGAGGCAGCAGGGGC 731
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Sbjct 397 GGCCCCCACGGGCCCGGCCACCAGCACCAGCACCCACCCAAGGGCTACGGTGCCAGCGTAGAGGCAGCAGGGGC 470
Query 732 ACACTTCCCGCTGCAGGGCGCGCACTACGGGCGGCCGCACCTGCTGGTGCCTGGGGAACCCCTGGGCTACGGAG 805
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Sbjct 471 ACACTTCCCGCTGCAGGGCGCGCACTACGGGCGGCCGCACCTGCTGGTGCCTGGGGAACCCCTGGGCTACGGAG 544
Query 806 TGCAGCGCAGCCCCTCCTTCCAGAGCAAGACGCCGCCGGAGACCGGGGGTTACGCCAGCCTGCCCACGAAGGGC 879
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Sbjct 545 TGCAGCGCAGCCCCTCCTTCCAGAGCAAGACGCCGCCGGAGACCGGGGGTTACGCCAGCCTGCCCACGAAGGGC 618
Query 880 CAGGGAGGACCGCCAGGCGCCGGCCTCGCTTTCCCACCCCCTGCCGCCGGGCTCTACGTGCCGCACCCACACCA 953
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Sbjct 619 CAGGGAGGACCGCCAGGCGCCGGCCTCGCTTTCCCACCCCCTGCCGCCGGGCTCTACGTGCCGCACCCACACCA 692
Query 954 CAAGCAGGCCGGTCCCGCGGCCCACCAGCTGCATGTGCTGGGCTCCCGCAGCCAGGTGTTCGCCAGCGACAGCC 1027
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Sbjct 693 CAAGCAGGCCGGTCCCGCGGCCCACCAGCTGCATGTGCTGGGCTCCCGCAGCCAGGTGTTCGCCAGCGACAGCC 766
Query 1028 CCCCGCAGAGCCTGCTCACTCCCTCGCGGAACAGCCTCAACGTGGACCTGTATGAATTGAGCAGCACCTCCGTC 1101
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Sbjct 767 CCCCGCAGAGCCTGCTCACTCCCTCGCGGAACAGCCTCAACGTGGACCTGTATGAATTGGGCAGCACCTCCGTC 840
Query 1102 CAGCAGTGGCCGGCTGCCACCCTGGCCCGCCGGGACTCCCTGCAGAAGCCGGGCCTGGAGGCGCCGCCGCGCGC 1175
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Sbjct 841 CAGCAGTGGCCGGCTGCCACCCTGGCCCGCCGGGACTCCCTGCAGAAGCCGGGCCTGGAGGCGCCGCCGCGCGC 914
Query 1176 GCACGTGGCCTTCCGGCCTGACTGCCCAGTGCCCAGCAGGACCAACTCCTTCAACAGCCACCAGCCGCGGCCCG 1249
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Sbjct 915 GCACGTGGCCTTCCGGCCTGACTGCCCAGTGCCCAGCAGGACCAACTCCTTCAACAGCCACCAGCCGCGGCCCG 988
Query 1250 GTCCGCCTGGCAAGGCCGAGCCCTCCCTGCCCGCCCCCAACACCGTGACGGCTGTCACGGCCGCGCACATCTTG 1323
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Sbjct 989 GTCCGCCTGGCAAGGCCGAGCCCTCCCTGCCCGCCCCCAACACCGTGACGGCTGTCACGGCCGCGCACATCTTG 1062
Query 1324 CACCCGGTGAAGAGCGTGCGTGTGCTGAGGCCGGAGCCGCAGACGGCTGTGGGGCCCTCGCACCCCGCCTGGGT 1397
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Sbjct 1063 CACCCGGTGAAGAGCGTGCGTGTGCTGAGGCCGGAGCCGCAGACGGCTGTGGGGCCCTCGCACCCCGCCTGGGT 1136
Query 1398 GCCCGCGCCTGCCCCGGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCGGCTGCGGAGGGCTTGGACGCCAAGGAGGAGCATG 1471
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Sbjct 1137 GCCCGCGCCTGCCCCGGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCGGCTGCGGAGGGCTTGGACGCCAAGGAGGAGCATG 1210
Query 1472 CCCTGGCGCTGGGCGGCGCAGGCGCCTTCCCGCTGGACGTGGAGTACGGAGGCCCAGACCGGAGGTGCCCGCCT 1545
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Sbjct 1211 CCCTGGCGCTGGGCGGCGCAGGCGCCTTCCCGCTGGACGTGGAGTACGGAGGCCCAGACCGGAGGTGCCCGCCT 1284
Query 1546 CCACCCTACCCGAAGCACCTGCTGCTGCGCAGCAAGTCGGAGCAGTACGACCTGGACAGCCTGTGCGCAGGCAT 1619
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Sbjct 1285 CCGCCCTACCCGAAGCACCTGCTGCTGCGCAGCAAGTCGGAGCAGTACGACCTGGACAGCCTGTGCGCAGGCAT 1358
Query 1620 GGAGCAGAGCCTCCGTGCGGGCCCCAACGAGCCCGAGGGCGGCGACAAGAGCCGCAAAAGCGCCAAGGGGGACA 1693
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Sbjct 1359 GGAGCAGAGCCTCCGTGCGGGCCCCAACGAGCCCGAGGGCGGCGACAAGAGCCGCAAAAGCGCCAAGGGGGACA 1432
Query 1694 AAGGCGGAAAGGATAAAAAGCAGATTCAGACCTCTCCCGTTCCCGTCCGCAAAAACAGCAGAGACGAAGAGAAG 1767
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Sbjct 1433 AAGGCGGAAAGGATAAAAAGCAGATTCAGACCTCTCCCGTTCCCGTCCGCAAAAACAGCAGAGACGAAGAGAAG 1506
Query 1768 AGAGAGTCACGCATCAAGAGCTACTCGCCATACGCCTTTAAGTTCTTCATGGAGCAGCACGTGGAGAATGTCAT 1841
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Sbjct 1507 AGAGAGTCACGCATCAAGAGCTACTCGCCATACGCCTTTAAGTTCTTCATGGAGCAGCACGTGGAGAATGTCAT 1580
Query 1842 CAAAACCTACCAGCAGAAGGTTAACCGGAGGCTGCAGCTGGAGCAAGAAATGGCCAAAGCTGGACTCTGTGAAG 1915
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Sbjct 1581 CAAAACCTACCAGCAGAAGGTTAACCGGAGGCTGCAGCTGGAGCAAGAAATGGCCAAAGCTGGACTCTGTGAAG 1654
Query 1916 CTGAGCAGGAGCAGATGCGGAAGATCCTCTACCAGAAAGAGTCTAATTACAACAGGTTAAAGAGGGCCAAGATG 1989
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Sbjct 1655 CTGAGCAGGAGCAGATGCGGAAGATCCTCTACCAGAAAGAGTCTAATTACAACAGGTTAAAGAGGGCCAAGATG 1728
Query 1990 GACAAGTCTATGTTTGTCAAGATCAAAACCCTGGGGATCGGTGCCTTTGGAGAAGTGTGCCTTGCTTGTAAGGT 2063
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Sbjct 1729 GACAAGTCTATGTTTGTCAAGATCAAAACCCTGGGGATCGGTGCCTTTGGAGAAGTGTGCCTTGCTTGTAAGGT 1802
Query 2064 GGACACTCACGCCCTGTACGCCATGAAGACCCTAAGGAAAAAGGATGTCCTGAACCGGAATCAGGTGGCCCACG 2137
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Sbjct 1803 GGACACTCACGCCCTGTACGCCATGAAGACCCTAAGGAAAAAGGATGTCCTGAACCGGAATCAGGTGGCCCACG 1876
Query 2138 TCAAGGCCGAGAGGGACATCCTGGCCGAGGCAGACAATGAGTGGGTGGTCAAACTCTACTACTCCTTCCAAGAC 2211
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Sbjct 1877 TCAAGGCCGAGAGGGACATCCTGGCCGAGGCAGACAATGAGTGGGTGGTCAAACTCTACTACTCCTTCCAAGAC 1950
Query 2212 AAAGACAGCCTGTACTTTGTGATGGACTACATCCCTGGTGGGGACATGATGAGCCTGCTGATCCGGATGGAGGT 2285
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Sbjct 1951 AAAGACAGCCTGTACTTTGTGATGGACTACATCCCTGGTGGGGACATGATGAGCCTGCTGATCCGGATGGAGGT 2024
Query 2286 CTTCCCTGAGCACCTGGCCCGGTTCTACATCGCAGAGCTGACTTTGGCCATTGAGAGTGTCCACAAGATGGGCT 2359
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Sbjct 2025 CTTCCCTGAGCACCTGGCCCGGTTCTACATCGCAGAGCTGACTTTGGCCATTGAGAGTGTCCACAAGATGGGCT 2098
Query 2360 TCATCCACCGAGACATCAAGCCTGATAACATTTTGATAGATCTGGATGGTCACATTAAACTCACAGATTTCGGC 2433
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Sbjct 2099 TCATCCACCGAGACATCAAGCCTGATAACATTTTGATAGATCTGGATGGTCACATTAAACTCACAGATTTCGGC 2172
Query 2434 CTCTGCACTGGGTTCAGGTGGACTCACAATTCCAAATATTACCAG----------------------------- 2478
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Sbjct 2173 CTCTGCACTGGGTTCAGGTGGACTCACAATTCCAAATATTACCAGAAAGGGAGCCATGTCAGACAGGACAGCAT 2246
Query 2479 -------------------------------------------------------------------------- 2478
Sbjct 2247 GGAGCCCAGCGACCTCTGGGATGATGTGTCTAACTGTCGGTGTGGGGACAGGCTGAAGACCCTAGAGCAGAGGG 2320
Query 2479 -------------------------------------------------------------------------- 2478
Sbjct 2321 CGCGGAAGCAGCACCAGAGGTGCCTGGCACATTCACTGGTGGGGACTCCAAACTACATCGCACCCGAGGTGCTC 2394
Query 2479 ------AAAGGGTACACTCAACTCTGTGACTGGTGGAGTGTTGGAGTGATTCTCTTCGAGATGCTGGTGGGGCA 2546
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Sbjct 2395 CTCCGCAAAGGGTACACTCAACTCTGTGACTGGTGGAGTGTTGGAGTGATTCTCTTCGAGATGCTGGTGGGGCA 2468
Query 2547 GCCGCCCTTTTTGGCACCTACTCCCACAGAAACCCAGCTGAAGGTGATCAACTGGGAGAACACGCTCCACATTC 2620
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Sbjct 2469 GCCGCCCTTTTTGGCACCTACTCCCACAGAAACCCAGCTGAAGGTGATCAACTGGGAGAACACGCTCCACATTC 2542
Query 2621 CAGCCCAGGTGAAGCTGAGCCCTGAGGCCAGGGACCTCATCACCAAGCTGTGCTGCTCCGCAGACCACCGCCTG 2694
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Sbjct 2543 CAGCCCAGGTGAAGCTGAGCCCTGAGGCCAGGGACCTCATCACCAAGCTGTGCTGCTCCGCAGACCACCGCCTG 2616
Query 2695 GGGCGGAATGGGGCCGATGACCTGAAGGCCCACCCCTTCTTCAGCGCCATTGACTTCTCCAGTGACATCCGGAA 2768
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Sbjct 2617 GGGCGGAATGGGGCCGATGACCTGAAGGCCCACCCCTTCTTCAGCGCCATTGACTTCTCCAGTGACATCCGGAA 2690
Query 2769 GCAGCCAGCCCCCTACGTTCCCACCATCAGCCACCCCATGGACACCTCGAATTTCGACCCCGTAGATGAAGAAA 2842
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Sbjct 2691 GCAGCCAGCCCCCTACGTTCCCACCATCAGCCACCCCATGGACACCTCGAATTTCGACCCCGTAGATGAAGAAA 2764
Query 2843 GCCCTTGGAACGATGCCAGCGAAGGTAGCACCAAGGCCTGGGACACACTCACCTCGCCCAATAACAAGCATCCT 2916
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Sbjct 2765 GCCCTTGGAACGATGCCAGCGAAGGTAGCACCAAGGCCTGGGACACACTCACCTCGCCCAATAACAAGCATCCT 2838
Query 2917 GAGCACGCATTTTACGAATTCACCTTCCGAAGGTTCTTTGATGACAATGGCTACCCCTTTCGATGCCCAAAGCC 2990
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Sbjct 2839 GAGCACGCATTTTACGAATTCACCTTCCGAAGGTTCTTTGATGACAATGGCTACCCCTTTCGATGCCCAAAGCC 2912
Query 2991 TTCAGGAGCAGAAGCTTCACAGGCTGAGAGCTCAGATTTAGAAAGCTCTGATCTGGTGGATCAGACTGAAGGCT 3064
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Sbjct 2913 TTCAGGAGCAGAAGCTTCACAGGCTGAGAGCTCAGATTTAGAAAGCTCTGATCTGGTGGATCAGACTGAAGGCT 2986
Query 3065 GCCAGCCTGTGTACGTGG 3082
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Sbjct 2987 GCCAGCCTGTGTACGTG- 3003