Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488615
• Subject: XM_017020541.1
• Aligned Length: 3265
• Identities: 2753
• Gaps: 505

Alignment

Query    1  ATGAGGCCAAAGACTTTTCCTGCCACGACTTATTCTGGAAATAGCCGGCAGCGACTGCAAGAGATTCGTGAGGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTTAAAGCAGCCATCCAAGTCTTCGGTTCAGGGGCTACCCGCAGGACCAAACAGTGACACTTCCCTGGATGCCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AAGTCCTGGGGAGCAAAGATGCCACCAGGCAGCAGCAGCAGATGAGAGCCACCCCAAAGTTCGGACCTTATCAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AAAGCCTTGAGGGAAATCAGATATTCCTTGTTGCCTTTTGCTAATGAATCGGGCACCTCTGCAGCTGCAGAAGT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GAACCGGCAAATGCTGCAGGAACTGGTGAACGCAGGATGCGACCAGGAGATGGCTGGCCGAGCTCTCAAGCAGA  370
                      |||    |||||..|| |.||.||          |.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------ATG----AGGAAACGG-GCACTCA----------AAGAGATGGCTGGCCGAGCTCTCAAGCAGA  49

Query  371  CTGGCAGCAGGAGCATCGAGGCCGCCCTGGAGTACATCAGCAAGATGGGCTACCTGGACCCGAGGAATGAGCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   50  CTGGCAGCAGGAGCATCGAGGCCGCCCTGGAGTACATCAGCAAGATGGGCTACCTGGACCCGAGGAATGAGCAG  123

Query  445  ATTGTGCGGGTCATTAAGCAGACCTCCCCAGGAAAGGGGCTCATGCCAACCCCAGTGACGCGGAGGCCCAGCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  124  ATTGTGCGGGTCATTAAGCAGACCTCCCCAGGAAAGGGGCTCATGCCAACCCCAGTGACGCGGAGGCCCAGCTT  197

Query  519  CGAAGGAACCGGCGATTCGTTTGCGTCCTACCACCAGCTGAGCGGTACCCCCTACGAGGGCCCAAGCTTCGGCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  198  CGAAGGAACCGGCGATTCGTTTGCGTCCTACCACCAGCTGAGCGGTACCCCCTACGAGGGCCCAAGCTTCGGCG  271

Query  593  CTGACGGCCCCACGGCGCTGGAGGAGATGCCGCGGCCGTACGTGGACTACCTTTTCCCCGGAGTCGGCCCCCAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  272  CTGACGGCCCCACGGCGCTGGAGGAGATGCCGCGGCCGTACGTGGACTACCTTTTCCCCGGAGTCGGCCCCCAC  345

Query  667  GGGCCCGGCCACCAGCACCAGCACCCACCCAAGGGCTACGGTGCCAGCGTAGAGGCAGCAGGGGCACACTTCCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  346  GGGCCCGGCCACCAGCACCAGCACCCACCCAAGGGCTACGGTGCCAGCGTAGAGGCAGCAGGGGCACACTTCCC  419

Query  741  GCTGCAGGGCGCGCACTACGGGCGGCCGCACCTGCTGGTGCCTGGGGAACCCCTGGGCTACGGAGTGCAGCGCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  420  GCTGCAGGGCGCGCACTACGGGCGGCCGCACCTGCTGGTGCCTGGGGAACCCCTGGGCTACGGAGTGCAGCGCA  493

Query  815  GCCCCTCCTTCCAGAGCAAGACGCCGCCGGAGACCGGGGGTTACGCCAGCCTGCCCACGAAGGGCCAGGGAGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  494  GCCCCTCCTTCCAGAGCAAGACGCCGCCGGAGACCGGGGGTTACGCCAGCCTGCCCACGAAGGGCCAGGGAGGA  567

Query  889  CCGCCAGGCGCCGGCCTCGCTTTCCCACCCCCTGCCGCCGGGCTCTACGTGCCGCACCCACACCACAAGCAGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  568  CCGCCAGGCGCCGGCCTCGCTTTCCCACCCCCTGCCGCCGGGCTCTACGTGCCGCACCCACACCACAAGCAGGC  641

Query  963  CGGTCCCGCGGCCCACCAGCTGCATGTGCTGGGCTCCCGCAGCCAGGTGTTCGCCAGCGACAGCCCCCCGCAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  642  CGGTCCCGCGGCCCACCAGCTGCATGTGCTGGGCTCCCGCAGCCAGGTGTTCGCCAGCGACAGCCCCCCGCAGA  715

Query 1037  GCCTGCTCACTCCCTCGCGGAACAGCCTCAACGTGGACCTGTATGAATTGAGCAGCACCTCCGTCCAGCAGTGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  716  GCCTGCTCACTCCCTCGCGGAACAGCCTCAACGTGGACCTGTATGAATTGGGCAGCACCTCCGTCCAGCAGTGG  789

Query 1111  CCGGCTGCCACCCTGGCCCGCCGGGACTCCCTGCAGAAGCCGGGCCTGGAGGCGCCGCCGCGCGCGCACGTGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  790  CCGGCTGCCACCCTGGCCCGCCGGGACTCCCTGCAGAAGCCGGGCCTGGAGGCGCCGCCGCGCGCGCACGTGGC  863

Query 1185  CTTCCGGCCTGACTGCCCAGTGCCCAGCAGGACCAACTCCTTCAACAGCCACCAGCCGCGGCCCGGTCCGCCTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  864  CTTCCGGCCTGACTGCCCAGTGCCCAGCAGGACCAACTCCTTCAACAGCCACCAGCCGCGGCCCGGTCCGCCTG  937

Query 1259  GCAAGGCCGAGCCCTCCCTGCCCGCCCCCAACACCGTGACGGCTGTCACGGCCGCGCACATCTTGCACCCGGTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  938  GCAAGGCCGAGCCCTCCCTGCCCGCCCCCAACACCGTGACGGCTGTCACGGCCGCGCACATCTTGCACCCGGTG  1011

Query 1333  AAGAGCGTGCGTGTGCTGAGGCCGGAGCCGCAGACGGCTGTGGGGCCCTCGCACCCCGCCTGGGTGCCCGCGCC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1012  AAGAGCGTGCGTGTGCTGAGGCCGGAGCCGCAGACGGCTGTGGGGCCCTCGCACCCCGCCTGGGTGCCCGCGCC  1085

Query 1407  TGCCCCGGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCGGCTGCGGAGGGCTTGGACGCCAAGGAGGAGCATGCCCTGGCGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1086  TGCCCCGGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCGGCTGCGGAGGGCTTGGACGCCAAGGAGGAGCATGCCCTGGCGC  1159

Query 1481  TGGGCGGCGCAGGCGCCTTCCCGCTGGACGTGGAGTACGGAGGCCCAGACCGGAGGTGCCCGCCTCCACCCTAC  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1160  TGGGCGGCGCAGGCGCCTTCCCGCTGGACGTGGAGTACGGAGGCCCAGACCGGAGGTGCCCGCCTCCGCCCTAC  1233

Query 1555  CCGAAGCACCTGCTGCTGCGCAGCAAGTCGGAGCAGTACGACCTGGACAGCCTGTGCGCAGGCATGGAGCAGAG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1234  CCGAAGCACCTGCTGCTGCGCAGCAAGTCGGAGCAGTACGACCTGGACAGCCTGTGCGCAGGCATGGAGCAGAG  1307

Query 1629  CCTCCGTGCGGGCCCCAACGAGCCCGAGGGCGGCGACAAGAGCCGCAAAAGCGCCAAGGGGGACAAAGGCGGAA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1308  CCTCCGTGCGGGCCCCAACGAGCCCGAGGGCGGCGACAAGAGCCGCAAAAGCGCCAAGGGGGACAAAGGCGGAA  1381

Query 1703  AGGATAAAAAGCAGATTCAGACCTCTCCCGTTCCCGTCCGCAAAAACAGCAGAGACGAAGAGAAGAGAGAGTCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1382  AGGATAAAAAGCAGATTCAGACCTCTCCCGTTCCCGTCCGCAAAAACAGCAGAGACGAAGAGAAGAGAGAGTCA  1455

Query 1777  CGCATCAAGAGCTACTCGCCATACGCCTTTAAGTTCTTCATGGAGCAGCACGTGGAGAATGTCATCAAAACCTA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1456  CGCATCAAGAGCTACTCGCCATACGCCTTTAAGTTCTTCATGGAGCAGCACGTGGAGAATGTCATCAAAACCTA  1529

Query 1851  CCAGCAGAAGGTTAACCGGAGGCTGCAGCTGGAGCAAGAAATGGCCAAAGCTGGACTCTGTGAAGCTGAGCAGG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1530  CCAGCAGAAGGTTAACCGGAGGCTGCAGCTGGAGCAAGAAATGGCCAAAGCTGGACTCTGTGAAGCTGAGCAGG  1603

Query 1925  AGCAGATGCGGAAGATCCTCTACCAGAAAGAGTCTAATTACAACAGGTTAAAGAGGGCCAAGATGGACAAGTCT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1604  AGCAGATGCGGAAGATCCTCTACCAGAAAGAGTCTAATTACAACAGGTTAAAGAGGGCCAAGATGGACAAGTCT  1677

Query 1999  ATGTTTGTCAAGATCAAAACCCTGGGGATCGGTGCCTTTGGAGAAGTGTGCCTTGCTTGTAAGGTGGACACTCA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1678  ATGTTTGTCAAGATCAAAACCCTGGGGATCGGTGCCTTTGGAGAAGTGTGCCTTGCTTGTAAGGTGGACACTCA  1751

Query 2073  CGCCCTGTACGCCATGAAGACCCTAAGGAAAAAGGATGTCCTGAACCGGAATCAGGTGGCCCACGTCAAGGCCG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1752  CGCCCTGTACGCCATGAAGACCCTAAGGAAAAAGGATGTCCTGAACCGGAATCAGGTGGCCCACGTCAAGGCCG  1825

Query 2147  AGAGGGACATCCTGGCCGAGGCAGACAATGAGTGGGTGGTCAAACTCTACTACTCCTTCCAAGACAAAGACAGC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1826  AGAGGGACATCCTGGCCGAGGCAGACAATGAGTGGGTGGTCAAACTCTACTACTCCTTCCAAGACAAAGACAGC  1899

Query 2221  CTGTACTTTGTGATGGACTACATCCCTGGTGGGGACATGATGAGCCTGCTGATCCGGATGGAGGTCTTCCCTGA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1900  CTGTACTTTGTGATGGACTACATCCCTGGTGGGGACATGATGAGCCTGCTGATCCGGATGGAGGTCTTCCCTGA  1973

Query 2295  GCACCTGGCCCGGTTCTACATCGCAGAGCTGACTTTGGCCATTGAGAGTGTCCACAAGATGGGCTTCATCCACC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1974  GCACCTGGCCCGGTTCTACATCGCAGAGCTGACTTTGGCCATTGAGAGTGTCCACAAGATGGGCTTCATCCACC  2047

Query 2369  GAGACATCAAGCCTGATAACATTTTGATAGATCTGGATGGTCACATTAAACTCACAGATTTCGGCCTCTGCACT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2048  GAGACATCAAGCCTGATAACATTTTGATAGATCTGGATGGTCACATTAAACTCACAGATTTCGGCCTCTGCACT  2121

Query 2443  GGGTTCAGGTGGACTCACAATTCCAAATATTACCAG--------------------------------------  2478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                      
Sbjct 2122  GGGTTCAGGTGGACTCACAATTCCAAATATTACCAGAAAGGGAGCCATGTCAGACAGGACAGCATGGAGCCCAG  2195

Query 2479  --------------------------------------------------------------------------  2478
                                                                                      
Sbjct 2196  CGACCTCTGGGATGATGTGTCTAACTGTCGGTGTGGGGACAGGCTGAAGACCCTAGAGCAGAGGGCGCGGAAGC  2269

Query 2479  -----------------------------------------------------------------------AAA  2481
                                                                                   |||
Sbjct 2270  AGCACCAGAGGTGCCTGGCACATTCACTGGTGGGGACTCCAAACTACATCGCACCCGAGGTGCTCCTCCGCAAA  2343

Query 2482  GGGTACACTCAACTCTGTGACTGGTGGAGTGTTGGAGTGATTCTCTTCGAGATGCTGGTGGGGCAGCCGCCCTT  2555
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2344  GGGTACACTCAACTCTGTGACTGGTGGAGTGTTGGAGTGATTCTCTTCGAGATGCTGGTGGGGCAGCCGCCCTT  2417

Query 2556  TTTGGCACCTACTCCCACAGAAACCCAGCTGAAGGTGATCAACTGGGAGAACACGCTCCACATTCCAGCCCAGG  2629
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2418  TTTGGCACCTACTCCCACAGAAACCCAGCTGAAGGTGATCAACTGGGAGAACACGCTCCACATTCCAGCCCAGG  2491

Query 2630  TGAAGCTGAGCCCTGAGGCCAGGGACCTCATCACCAAGCTGTGCTGCTCCGCAGACCACCGCCTGGGGCGGAAT  2703
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2492  TGAAGCTGAGCCCTGAGGCCAGGGACCTCATCACCAAGCTGTGCTGCTCCGCAGACCACCGCCTGGGGCGGAAT  2565

Query 2704  GGGGCCGATGACCTGAAGGCCCACCCCTTCTTCAGCGCCATTGACTTCTCCAGTGACATCCGGAAGCAGCCAGC  2777
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2566  GGGGCCGATGACCTGAAGGCCCACCCCTTCTTCAGCGCCATTGACTTCTCCAGTGACATCCGGAAGCAGCCAGC  2639

Query 2778  CCCCTACGTTCCCACCATCAGCCACCCCATGGACACCTCGAATTTCGACCCCGTAGATGAAGAAAGCCCTTGGA  2851
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2640  CCCCTACGTTCCCACCATCAGCCACCCCATGGACACCTCGAATTTCGACCCCGTAGATGAAGAAAGCCCTTGGA  2713

Query 2852  ACGATGCCAGCGAAGGTAGCACCAAGGCCTGGGACACACTCACCTCGCCCAATAACAAGCATCCTGAGCACGCA  2925
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2714  ACGATGCCAGCGAAGGTAGCACCAAGGCCTGGGACACACTCACCTCGCCCAATAACAAGCATCCTGAGCACGCA  2787

Query 2926  TTTTACGAATTCACCTTCCGAAGGTTCTTTGATGACAATGGCTACCCCTTTCGATGCCCAAAGCCTTCAGGAGC  2999
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2788  TTTTACGAATTCACCTTCCGAAGGTTCTTTGATGACAATGGCTACCCCTTTCGATGCCCAAAGCCTTCAGGAGC  2861

Query 3000  AGAAGCTTCACAGGCTGAGAGCTCAGATTTAGAAAGCTCTGATCTGGTGGATCAGACTGAAGGCTGCCAGCCTG  3073
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2862  AGAAGCTTCACAGGCTGAGAGCTCAGATTTAGAAAGCTCTGATCTGGTGGATCAGACTGAAGGCTGCCAGCCTG  2935

Query 3074  TGTACGTGG  3082
            |||||||| 
Sbjct 2936  TGTACGTG-  2943