Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488615
• Subject: XM_017020542.1
• Aligned Length: 3171
• Identities: 2608
• Gaps: 542

Alignment

Query    1  ATGAGGCCAAAGACTTTTCCTGCCACGACTTATTCTGGAAATAGCCGGCAGCGACTGCAAGAGATTCGTGAGGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGCCAAAGACTTTTCCTGCCACGACTTATTCTGGAAATAGCCGGCAGCGACTGCAAGAGATTCGTGAGGG  74

Query   75  GTTAAAGCAGCCATCCAAGTCTTCGGTTCAGGGGCTACCCGCAGGACCAAACAGTGACACTTCCCTGGATGCCA  148
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTTAAAACAGCCATCCAAGTCTTCGGTTCAGGGGCTACCCGCAGGACCAAACAGTGACACTTCCCTGGATGCCA  148

Query  149  AAGTCCTGGGGAGCAAAGATGCCACCAGGCAGCAGCAGCAGATGAGAGCCACCCCAAAGTTCGGACCTTATCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGTCCTGGGGAGCAAAGATGCCACCAGGCAGCAGCAGCAGATGAGAGCCACCCCAAAGTTCGGACCTTATCAG  222

Query  223  AAAGCCTTGAGGGAAATCAGATATTCCTTGTTGCCTTTTGCTAATGAATCGGGCACCTCTGCAGCTGCAGAAGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGCCTTGAGGGAAATCAGATATTCCTTGTTGCCTTTTGCTAATGAATCGGGCACCTCTGCAGCTGCAGAAGT  296

Query  297  GAACCGGCAAATGCTGCAGGAACTGGTGAACGCAGGATGCGACCAGGAGATGGCTGGCCGAGCTCTCAAGCAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAACCGGCAAATGCTGCAGGAACTGGTGAACGCAGGATGCGACCAGGAGATGGCTGGCCGAGCTCTCAAGCAGA  370

Query  371  CTGGCAGCAGGAGCATCGAGGCCGCCCTGGAGTACATCAGCAAGATGGGCTACCTGGACCCGAGGAATGAGCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGGCAGCAGGAGCATCGAGGCCGCCCTGGAGTACATCAGCAAGATGGGCTACCTGGACCCGAGGAATGAGCAG  444

Query  445  ATTGTGCGGGTCATTAAGCAGACCTCCCCAGGAAAGGGGCTCATGCCAACCCCAGTGACGCGGAGGCCCAGCTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTGTGCGGGTCATTAAGCAGACCTCCCCAGGAAAGGGGCTCATGCCAACCCCAGTGACGCGGAGGCCCAGCTT  518

Query  519  CGAAGGAACCGGCGATTCGTTTGCGTCCTACCACCAGCTGAGCGGTACCCCCTACGAGGGCCCAAGCTTCGGCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGAAGGAACCGGCGATTCGTTTGCGTCCTACCACCAGCTGAGCGGTACCCCCTACGAGGGCCCAAGCTTCGGCG  592

Query  593  CTGACGGCCCCACGGCGCTGGAGGAGATGCCGCGGCCGTACGTGGACTACCTTTTCCCCGGAGTCGGCCCCCAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGACGGCCCCACGGCGCTGGAGGAGATGCCGCGGCCGTACGTGGACTACCTTTTCCCCGGAGTCGGCCCCCAC  666

Query  667  GGGCCCGGCCACCAGCACCAGCACCCACCCAAGGGCTACGGTGCCAGCGTAGAGGCAGCAGGGGCACACTTCCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGGCCCGGCCACCAGCACCAGCACCCACCCAAGGGCTACGGTGCCAGCGTAGAGGCAGCAGGGGCACACTTCCC  740

Query  741  GCTGCAGGGCGCGCACTACGGGCGGCCGCACCTGCTGGTGCCTGGGGAACCCCTGGGCTACGGAGTGCAGCGCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTGCAGGGCGCGCACTACGGGCGGCCGCACCTGCTGGTGCCTGGGGAACCCCTGGGCTACGGAGTGCAGCGCA  814

Query  815  GCCCCTCCTTCCAGAGCAAGACGCCGCCGGAGACCGGGGGTTACGCCAGCCTGCCCACGAAGGGCCAGGGAGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCCCTCCTTCCAGAGCAAGACGCCGCCGGAGACCGGGGGTTACGCCAGCCTGCCCACGAAGGGCCAGGGAGGA  888

Query  889  CCGCCAGGCGCCGGCCTCGCTTTCCCACCCCCTGCCGCCGGGCTCTACGTGCCGCACCCACACCACAAGCAGGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCGCCAGGCGCCGGCCTCGCTTTCCCACCCCCTGCCGCCGGGCTCTACGTGCCGCACCCACACCACAAGCAGGC  962

Query  963  CGGTCCCGCGGCCCACCAGCTGCATGTGCTGGGCTCCCGCAGCCAGGTGTTCGCCAGCGACAGCCCCCCGCAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGGTCCCGCGGCCCACCAGCTGCATGTGCTGGGCTCCCGCAGCCAGGTGTTCGCCAGCGACAGCCCCCCGCAGA  1036

Query 1037  GCCTGCTCACTCCCTCGCGGAACAGCCTCAACGTGGACCTGTATGAATTGAGCAGCACCTCCGTCCAGCAGTGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCCTGCTCACTCCCTCGCGGAACAGCCTCAACGTGGACCTGTATGAATTGGGCAGCACCTCCGTCCAGCAGTGG  1110

Query 1111  CCGGCTGCCACCCTGGCCCGCCGGGACTCCCTGCAGAAGCCGGGCCTGGAGGCGCCGCCGCGCGCGCACGTGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCGGCTGCCACCCTGGCCCGCCGGGACTCCCTGCAGAAGCCGGGCCTGGAGGCGCCGCCGCGCGCGCACGTGGC  1184

Query 1185  CTTCCGGCCTGACTGCCCAGTGCCCAGCAGGACCAACTCCTTCAACAGCCACCAGCCGCGGCCCGGTCCGCCTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTTCCGGCCTGACTGCCCAGTGCCCAGCAGGACCAACTCCTTCAACAGCCACCAGCCGCGGCCCGGTCCGCCTG  1258

Query 1259  GCAAGGCCGAGCCCTCCCTGCCCGCCCCCAACACCGTGACGGCTGTCACGGCCGCGCACATCTTGCACCCGGTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCAAGGCCGAGCCCTCCCTGCCCGCCCCCAACACCGTGACGGCTGTCACGGCCGCGCACATCTTGCACCCGGTG  1332

Query 1333  AAGAGCGTGCGTGTGCTGAGGCCGGAGCCGCAGACGGCTGTGGGGCCCTCGCACCCCGCCTGGGTGCCCGCGCC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGAGCGTGCGTGTGCTGAGGCCGGAGCCGCAGACGGCTGTGGGGCCCTCGCACCCCGCCTGGGTGCCCGCGCC  1406

Query 1407  TGCCCCGGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCGGCTGCGGAGGGCTTGGACGCCAAGGAGGAGCATGCCCTGGCGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCCCCGGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCGGCTGCGGAGGGCTTGGACGCCAAGGAGGAGCATGCCCTGGCGC  1480

Query 1481  TGGGCGGCGCAGGCGCCTTCCCGCTGGACGTGGAGTACGGAGGCCCAGACCGGAGGTGCCCGCCTCCACCCTAC  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481  TGGGCGGCGCAGGCGCCTTCCCGCTGGACGTGGAGTACGGAGGCCCAGACCGGAGGTGCCCGCCTCCGCCCTAC  1554

Query 1555  CCGAAGCACCTGCTGCTGCGCAGCAAGTCGGAGCAGTACGACCTGGACAGCCTGTGCGCAGGCATGGAGCAGAG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCGAAGCACCTGCTGCTGCGCAGCAAGTCGGAGCAGTACGACCTGGACAGCCTGTGCGCAGGCATGGAGCAGAG  1628

Query 1629  CCTCCGTGCGGGCCCCAACGAGCCCGAGGGCGGCGACAAGAGCCGCAAAAGCGCCAAGGGGGACAAAGGCGGAA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCTCCGTGCGGGCCCCAACGAGCCCGAGGGCGGCGACAAGAGCCGCAAAAGCGCCAAGGGGGACAAAGGCGGAA  1702

Query 1703  AGGATAAAAAGCAGATTCAGACCTCTCCCGTTCCCGTCCGCAAAAACAGCAGAGACGAAGAGAAGAGAGAGTCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGGATAAAAAGCAGATTCAGACCTCTCCCGTTCCCGTCCGCAAAAACAGCAGAGACGAAGAGAAGAGAGAGTCA  1776

Query 1777  CGCATCAAGAGCTACTCGCCATACGCCTTTAAGTTCTTCATGGAGCAGCACGTGGAGAATGTCATCAAAACCTA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CGCATCAAGAGCTACTCGCCATACGCCTTTAAGTTCTTCATGGAGCAGCACGTGGAGAATGTCATCAAAACCTA  1850

Query 1851  CCAGCAGAAGGTTAACCGGAGGCTGCAGCTGGAGCAAGAAATGGCCAAAGCTGGACTCTGTGAAGCTGAGCAGG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCAGCAGAAGGTTAACCGGAGGCTGCAGCTGGAGCAAGAAATGGCCAAAGCTGGACTCTGTGAAGCTGAGCAGG  1924

Query 1925  AGCAGATGCGGAAGATCCTCTACCAGAAAGAGTCTAATTACAACAGGTTAAAGAGGGCCAAGATGGACAAGTCT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGCAGATGCGGAAGATCCTCTACCAGAAAGAGTCTAATTACAACAGGTTAAAGAGGGCCAAGATGGACAAGTCT  1998

Query 1999  ATGTTTGTCAAGATCAAAACCCTGGGGATCGGTGCCTTTGGAGAAGTGTGCCTTGCTTGTAAGGTGGACACTCA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ATGTTTGTCAAGATCAAAACCCTGGGGATCGGTGCCTTTGGAGAAGTGTGCCTTGCTTGTAAGGTGGACACTCA  2072

Query 2073  CGCCCTGTACGCCATGAAGACCCTAAGGAAAAAGGATGTCCTGAACCGGAATCAGGTGGCCCACGTCAAGGCCG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CGCCCTGTACGCCATGAAGACCCTAAGGAAAAAGGATGTCCTGAACCGGAATCAGGTGGCCCACGTCAAGGCCG  2146

Query 2147  AGAGGGACATCCTGGCCGAGGCAGACAATGAGTGGGTGGTCAAACTCTACTACTCCTTCCAAGACAAAGACAGC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGAGGGACATCCTGGCCGAGGCAGACAATGAGTGGGTGGTCAAACTCTACTACTCCTTCCAAGACAAAGACAGC  2220

Query 2221  CTGTACTTTGTGATGGACTACATCCCTGGTGGGGACATGATGAGCCTGCTGATCCGGATGGAGGTCTTCCCTGA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTGTACTTTGTGATGGACTACATCCCTGGTGGGGACATGATGAGCCTGCTGATCCGGATGGAGGTCTTCCCTGA  2294

Query 2295  GCACCTGGCCCGGTTCTACATCGCAGAGCTGACTTTGGCCATTGAGAGTGTCCACAAGATGGGCTTCATCCACC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GCACCTGGCCCGGTTCTACATCGCAGAGCTGACTTTGGCCATTGAGAGTGTCCACAAGATGGGCTTCATCCACC  2368

Query 2369  GAGACATCAAGCCTGATAACATTTTGATAGATCTGGATGGTCACATTAAACTCACAGATTTCGGCCTCTGCACT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GAGACATCAAGCCTGATAACATTTTGATAGATCTGGATGGTCACATTAAACTCACAGATTTCGGCCTCTGCACT  2442

Query 2443  GGGTTCAGGTGGACTCACAATTCCAAATATTACCAGAAAGGGTACACTCAACTCTGT--GACTGG------TGG  2508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |.|..|||  |||.||      |||
Sbjct 2443  GGGTTCAGGTGGACTCACAATTCCAAATATTACCAGAAAGGG-------AGCCATGTCAGACAGGACAGCATGG  2509

Query 2509  AG----------TGTTGGAGTGAT-TCTCT-----TC--------GAGATGCTG--------------GTGGG-  2543
            ||          |.|.||| |||| |.|||     ||        ||.|.||||              |.||| 
Sbjct 2510  AGCCCAGCGACCTCTGGGA-TGATGTGTCTAACTGTCGGTGTGGGGACAGGCTGAAGACCCTAGAGCAGAGGGC  2582

Query 2544  ------GCAGC--------CGCCCTTTTTGGCACCT------------ACTCC------CACAGAAACCCAGCT  2585
                  |||||        .|||     ||||||.|            |||||      ||..|.|.||.||.|
Sbjct 2583  GCGGAAGCAGCACCAGAGGTGCC-----TGGCACATTCACTGGTGGGGACTCCAAACTACATCGCACCCGAGGT  2651

Query 2586  G----------AAGGTGATCAACTGGGAGAACACGCTCCACATTCCAGCCCAGGTGAAGCTGAGCCCTGAGGCC  2649
            |          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct 2652  GCTCCTCCGCAAAGGTGATCAACTGGGAGAACACGCTCCACATTCCAGCCCAGGTGAAGCTGAGCCC-------  2718

Query 2650  AGGGACCTCATCACCAAGCTGTGCTGCTCCGCAGACCACCGCCTGGGGCGGAATGGGGCCGATGACCTGAAGGC  2723
                                                                                      
Sbjct 2719  --------------------------------------------------------------------------  2718

Query 2724  CCACCCCTTCTTCAGCGCCATTGACTTCTCCAGTGACATCCGGAAGCAGCCAGCCCCCTACGTTCCCACCATCA  2797
                                                                                      
Sbjct 2719  --------------------------------------------------------------------------  2718

Query 2798  GCCACCCCATGGACACCTCGAATTTCGACCCCGTAGATGAAGAAAGCCCTTGGAACGATGCCAGCGAAGGTAGC  2871
                                                                                      
Sbjct 2719  --------------------------------------------------------------------------  2718

Query 2872  ACCAAGGCCTGGGACACACTCACCTCGCCCAATAACAAGCATCCTGAGCACGCATTTTACGAATTCACCTTCCG  2945
                                                                                      
Sbjct 2719  --------------------------------------------------------------------------  2718

Query 2946  AAGGTTCTTTGATGACAATGGCTACCCCTTTCGATGCCCAAAGCCTTCAGGAGCAGAAGCTTCACAGGCTGAGA  3019
                                                                                      
Sbjct 2719  --------------------------------------------------------------------------  2718

Query 3020  GCTCAGATTTAGAAAGCTCTGATCTGGTGGATCAGACTGAAGGCTGCCAGCCTGTGTACGTGG  3082
                                                                           
Sbjct 2719  ---------------------------------------------------------------  2718