Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488616
• Subject: XM_011516925.2
• Aligned Length: 1714
• Identities: 1603
• Gaps: 101

Alignment

Query    1  ATGTGCACCGTAG---TGGACCCTCGCATTGT-----CCGGAGATACCTACTCAGGCGGCAGCTCGGGC-----  61
            |||    ||..||   .||||     ||..||     |.|.|||.|||       |.|||||   ||||     
Sbjct    1  ATG----CCAGAGGCTGGGAC-----CAGGGTGGGGGCAGAAGAGACC-------GTGGCAG---GGGCTAGAT  55

Query   62  -----AGG-------GGGCCTATGGCATTGTGTGGAAGGCAGTGGACCGGAGGACTGGTGAGGTCGTGGCCATC  123
                 |||       .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   56  TCTGGAGGAATCTGAAGGCCTATGGCATTGTGTGGAAGGCAGTGGACCGGAGGACTGGTGAGGTCGTGGCCATC  129

Query  124  AAGAAAATCTTTGATGCTTTTAGGGATAAGACAGATGCC-----------------------------------  162
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct  130  AAGAAAATCTTTGATGCTTTTAGGGATAAGACAGATGCCCAGGACATGGGCTTCCTTCTTGCTCCACCCACCCA  203

Query  163  ----------------------CAGAGAACATTCCGGGAAATCACGCTCCTCCAGGAGTTTGGGGACCATCCCA  214
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  204  CACACCTGTGTTTCTGTCTCTTCAGAGAACATTCCGGGAAATCACGCTCCTCCAGGAGTTTGGGGACCATCCCA  277

Query  215  ACATCATCAGCCTCCTTGACGTGATCCGGGCAGAGAACGACAGGGACATTTACCTGGTGTTTGAGTTTATGGAC  288
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  278  ACATCATCAGCCTCCTTGACGTGATCCGGGCAGAGAACGACAGGGACATTTACCTGGTGTTTGAGTTTATGGAC  351

Query  289  ACTGACCTGAACGCAGTCATCCGGAAGGGCGGCCTGCTGCAGGACGTCCACGTGCGCTCCATCTTCTACCAGCT  362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  352  ACTGACCTGAACGCAGTCATCCGGAAGGGCGGCCTGCTGCAGGACGTCCACGTGCGCTCCATCTTCTACCAGCT  425

Query  363  CCTGCGGGCCACCCGGTTCCTCCACTCGGGGCACGTTGTGCACCGGGACCAGAAGCCGTCCAATGTGCTCCTGG  436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  426  CCTGCGGGCCACCCGGTTCCTCCACTCGGGGCACGTTGTGCACCGGGACCAGAAGCCGTCCAATGTGCTCCTGG  499

Query  437  ATGCCAACTGCACAGTGAAGCTGTGTGACTTTGGCCTGGCCCGCTCCCTGGGCGACCTCCCCGAGGGGCCTGAG  510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  500  ATGCCAACTGCACAGTGAAGCTGTGTGACTTTGGCCTGGCCCGCTCCCTGGGCGACCTCCCCGAGGGGCCTGAG  573

Query  511  GACCAGGCCGTGACAGAGTACGTGGCCACACGCTGGTACCGAGCACCGGAGGTGCTGCTCTCTTCGCACCGATA  584
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  574  GACCAGGCCGTGACAGAGTACGTGGCCACACGCTGGTACCGAGCACCGGAGGTGCTGCTCTCTTCGCACCGATA  647

Query  585  CACCCTTGGGGTGGACATGTGGAGTCTGGGCTGTATCCTGGGGGAGATGCTGCGGGGGAGACCCCTGTTCCCCG  658
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  648  CACCCTTGGGGTGGACATGTGGAGTCTGGGCTGTATCCTGGGGGAGATGCTGCGGGGGAGACCCCTGTTCCCCG  721

Query  659  GCACGTCCACCCTCCACCAGCTGGAGCTGATCCTGGAGACCATCCCACCGCCATCTGAGGAGGACCTCCTGGCT  732
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  722  GCACGTCCACCCTCCACCAGCTGGAGCTGATCCTGGAGACCATCCCACCGCCATCTGAGGAGGACCTCCTGGCT  795

Query  733  CTCGGCTCAGGCTGCCGTGCCTCTGTGCTGCACCAGCTGGGGTCCCGGCCACGACAGACGCTGGATGCCCTCCT  806
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  796  CTCGGCTCAGGCTGCCGTGCCTCTGTGCTGCACCAGCTGGGGTCCCGGCCACGACAGACGCTGGATGCCCTCCT  869

Query  807  ACCGCCAGACACCTCCCCAGAGGCCTTGGACCTCCTTAGGCGACTCCTGGTGTTCGCCCCGGACAAGCGGTTAA  880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  870  ACCGCCAGACACCTCCCCAGAGGCCTTGGACCTCCTTAGGCGACTCCTGGTGTTCGCCCCGGACAAGCGGTTAA  943

Query  881  GCGCGACCCAGGCACTGCAGCACCCCTACGTGCAGAGGTTCCACTGCCCCAGCGACGAGTGGGCACGAGAGGCA  954
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  944  GCGCGACCCAGGCACTGCAGCACCCCTACGTGCAGAGGTTCCACTGCCCCAGCGACGAGTGGGCACGAGAGGCA  1017

Query  955  GATGTGCGGCCCCGGGCACACGAAGGGGTCCAGCTCTCTGTGCCTGAGTACCGCAGCCGCGTCTATCAGATGAT  1028
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018  GATGTGCGGCCCCGGGCACACGAAGGGGTCCAGCTCTCTGTGCCTGAGTACCGCAGCCGCGTCTATCAGATGAT  1091

Query 1029  CCTGGAGTGTGGAGGCAGCAGCGGCACCTCGAGAGAGAAGGGCCCGGAGGGTGTCTCCCCAAGCCAGGCACACC  1102
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1092  CCTGGAGTGTGGAGGCAGCAGCGGCACCTCGAGAGAGAAGGGCCCGGAGGGTGTCTCCCCAAGCCAGGCACACC  1165

Query 1103  TGCACAAACCCAGAGCCGACCCTCAGCTGCCTTCTAGGACACCTGTGCAGGGTCCCAGACCCAGGCCCCAGAGC  1176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1166  TGCACAAACCCAGAGCCGACCCTCAGCTGCCTTCTAGGACACCTGTGCAGGGTCCCAGACCCAGGCCCCAGAGC  1239

Query 1177  AGCCCAGGCCATGACCCTGCCGAGCACGAGTCCCCCCGTGCAGCCAAGAACGTTCCCAGGCAGAACTCCGCTCC  1250
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1240  AGCCCAGGCCATGACCCTGCCGAGCACGAGTCCCCCCGTGCAGCCAAGAACGTTCCCAGGCAGAACTCCGCTCC  1313

Query 1251  CCTGCTCCAAACTGCTCTCCTAGGGAATGGGGAAAGGCCCCCTGGGGCGAAGGAAGCGCCCCCCTTGACACTCT  1324
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1314  CCTGCTCCAAACTGCTCTCCTAGGGAATGGGGAAAGGCCCCCTGGGGCGAAGGAAGCGCCCCCCTTGACACTCT  1387

Query 1325  CGCTGGTGAAGCCAAGCGGGAGGGGAGCTGCGCCCTCCCTGACCTCCCAGGCTGCGGCTCAGGTGGCCAACCAG  1398
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1388  CGCTGGTGAAGCCAAGCGGGAGGGGAGCTGCGCCCTCCCTGACCTCCCAGGCTGCGGCTCAGGTGGCCAACCAG  1461

Query 1399  GCCCTGATCCGGGGTGACTGGAACCGGGGCGGTGGGGTGAGGGTGGCCAGCGTACAACAGGTCCCTCCCCGGCT  1472
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1462  GCCCTGATCCGGGGTGACTGGAACCGGGGCGGTGGGGTGAGGGTGGCCAGCGTACAACAGGTCCCTCCCCGGCT  1535

Query 1473  TCCTCCGGAGGCCCGGCCCGGCCGGAGGATGTTCAGCACCTCTGCCTTGCAGGGTGCCCAGGGGGGTGCCAGGG  1546
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1536  TCCTCCGGAGGCCCGGCCCGGCCGGAGGATGTTCAGCACCTCTGCCTTGCAGGGTGCCCAGGGGGGTGCCAGGG  1609

Query 1547  CTTTGCTTGGAGGCTACTCCCAAGCCTACGGGACTGTCTGCCACTCGGCACTGGGCCACCTGCCCCTGCTGGAG  1620
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1610  CTTTGCTTGGAGGCTACTCCCAAGCCTACGGGACTGTCTGCCACTCGGCACTGGGCCACCTGCCCCTGCTGGAG  1683

Query 1621  GGGCACCATGTG  1632
            ||||||||||||
Sbjct 1684  GGGCACCATGTG  1695