Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488616
• Subject: XM_011516926.2
• Aligned Length: 1749
• Identities: 1556
• Gaps: 177

Alignment

Query    1  ATGTGCACCGTAGTGGACCCTCGCATTGTCCGGAGATACCTACTCAGGCGGCAGCTCGGGCAGGGGGCCTATGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGCACCGTAGTGGACCCTCGCATTGTCCGGAGATACCTACTCAGGCGGCAGCTCGGGCAGGGGGCCTATGG  74

Query   75  CATTGTGTGGAAGGCAGTGGACCGGAGGACTGGTGAGGTCGTGGCCATCAAGAAAATCTTTGATGCTTTTAGGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATTGTGTGGAAGGCAGTGGACCGGAGGACTGGTGAGGTCGTGGCCATCAAGAAAATCTTTGATGCTTTTAGGG  148

Query  149  ATAAGACAGATGCC---------------------------------------------------------CAG  165
            ||||||||||||||                                                         |||
Sbjct  149  ATAAGACAGATGCCCAGGACATGGGCTTCCTTCTTGCTCCACCCACCCACACACCTGTGTTTCTGTCTCTTCAG  222

Query  166  AGAACATTCCGGGAAATCACGCTCCTCCAGGAGTTTGGGGACCATCCCAACATCATCAGCCTCCTTGACGTGAT  239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAACATTCCGGGAAATCACGCTCCTCCAGGAGTTTGGGGACCATCCCAACATCATCAGCCTCCTTGACGTGAT  296

Query  240  CCGGGCAGAGAACGACAGGGACATTTACCTGGTGTTTGAGTTTATGGACACTGACCTGAACGCAGTCATCCGGA  313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGGGCAGAGAACGACAGGGACATTTACCTGGTGTTTGAGTTTATGGACACTGACCTGAACGCAGTCATCCGGA  370

Query  314  AGGGCGGCCTGCTGCAGGACGTCCACGTGCGCTCCATCTTCTACCAGCTCCTGCGGGCCACCCGGTTCCTCCAC  387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGGCGGCCTGCTGCAGGACGTCCACGTGCGCTCCATCTTCTACCAGCTCCTGCGGGCCACCCGGTTCCTCCAC  444

Query  388  TCGGGGCACGTTGTGCACCGGGACCAGAAGCCGTCCAATGTGCTCCTGGATGCCAACTGCACAGTGAAGCTGTG  461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCGGGGCACGTTGTGCACCGGGACCAGAAGCCGTCCAATGTGCTCCTGGATGCCAACTGCACAGTGAAGCTGTG  518

Query  462  TGACTTTGGCCTGGCCCGCTCCCTGGGCGACCTCCCCGAGGGGCCTGAGGACCAGGCCGTGACAGAGTACGTGG  535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGACTTTGGCCTGGCCCGCTCCCTGGGCGACCTCCCCGAGGGGCCTGAGGACCAGGCCGTGACAGAGTACGTGG  592

Query  536  CCACACGCTGGTACCGAGCACCGGAGGTGCTGCTCTCTTCGCACCGATACACCCTTGGGGTGGACATGTGGAGT  609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCACACGCTGGTACCGAGCACCGGAGGTGCTGCTCTCTTCGCACCGATACACCCTTGGGGTGGACATGTGGAGT  666

Query  610  CTGGGCTGTATCCTGGGGGAGATGCTGCGGGGGAGACCCCTGTTCCCCGGCACGTCCACCCTCCACCAGCTGGA  683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGGGCTGTATCCTGGGGGAGATGCTGCGGGGGAGACCCCTGTTCCCCGGCACGTCCACCCTCCACCAGCTGGA  740

Query  684  GCTGATCCTGGAGACCATCCCACCGCCATCTGAGGAGGACCTCCTGGCTCTCGGCTCAGGCTGCCGTGCCTCTG  757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCTGATCCTGGAGACCATCCCACCGCCATCTGAGGAGGACCTCCTGGCTCTCGGCTCAGGCTGCCGTGCCTCTG  814

Query  758  TGCTGCACCAGCTGGGGTCCCGGCCACGACAGACGCTGGATGCCCTCCTACCGCCAGACACCTCCCCAGAGGCC  831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCTGCACCAGCTGGGGTCCCGGCCACGACAGACGCTGGATGCCCTCCTACCGCCAGACACCTCCCCAGAGGCC  888

Query  832  TTGGACCTCCTTAGGCGACTCCTGGTGTTCGCCCCGGACAAGCGGTTAAGCGCGACCCAGGCACTGCAGCACCC  905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTGGACCTCCTTAGGCGACTCCTGGTGTTCGCCCCGGACAAGCGGTTAAGCGCGACCCAGGCACTGCAGCACCC  962

Query  906  CTACGTGCAGAGGTTCCACTGCCCCAGCGACGAGTGGGCACGAGAGGCAGATGTGCGGCCCCGGGCACACGAAG  979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTACGTGCAGAGGTTCCACTGCCCCAGCGACGAGTGGGCACGAGAGGCAGATGTGCGGCCCCGGGCACACGAAG  1036

Query  980  GGGTCCAGCTCTCTGTGCCTGAGTACCGCAGCCGCGTCTATCAGATGATCCTGGAGTGTGGAGGCAGCAGCGGC  1053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGGTCCAGCTCTCTGTGCCTGAGTACCGCAGCCGCGTCTATCAGATGATCCTGGAGTGTGGAGGCAGCAGCGGC  1110

Query 1054  ACCTCGAGAGAGAAGGGCCCGGAGGGTGTCTCCCCAAGCCAGGCACACCTGCACAAACCCAGAGCCGACCCTCA  1127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCTCGAGAGAGAAGGGCCCGGAGGGTGTCTCCCCAAGCCAGGCACACCTGCACAAACCCAGAGCCGACCCTCA  1184

Query 1128  GCTGCCTTCTAGGACACCTGTGCAGGGTCCCAGACCCAGGCCCCAGAGCAGCCCAGGCCATGACCCTGCCGAGC  1201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCTGCCTTCTAGGACACCTGTGCAGGGTCCCAGACCCAGGCCCCAGAGCAGCCCAGGCCATGACCCTGCCGAGC  1258

Query 1202  ACGAGTCCCCCCGTGCAGCCAAGAACGTTCCCAGGCAGAACTCCGCTCCCCTGCTCCAAACTGCTCTCCTAGGG  1275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACGAGTCCCCCCGTGCAGCCAAGAACGTTCCCAGGCAGAACTCCGCTCCCCTGCTCCAAACTGCTCTCCTAGGG  1332

Query 1276  AATGGGGAAAGGCCCCCTGGGGCGAAGGAAGCGCCCCCCTTGACACTCTCGCTGGTGAAGCCAAGCGGGAGGGG  1349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AATGGGGAAAGGCCCCCTGGGGCGAAGGAAGCGCCCCCCTTGACACTCTCGCTGGTGAAGCCAAGCGGGAGGGG  1406

Query 1350  AGCTGCGCCCTCCCTGACCTCCCAGGCTGCGGCTCAGGTGGCCAACCAGGCCCTGATCCGGGGTGACTGGAACC  1423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGCTGCGCCCTCCCTGACCTCCCAGGCTGCGGCTCAGGTGGCCAACCAGGCCCTGATCCGGGGTGACTGGAACC  1480

Query 1424  GGGGCGGTGGGGTGAGGGTGGCCAGCGTACAACAGGT--------------------CCCTCCCCGGCTTCCTC  1477
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    ||.||||| .|.|||||
Sbjct 1481  GGGGCGGTGGGGTGAGGGTGGCCAGCGTACAACAGGTAAGCCCGGCCCAGTCTGCCCCCGTCCCC-TCATCCTC  1553

Query 1478  CGGAGG----------------CCCGGCCCGGCCGGAGGATGTTCAGCACCTCTGCCTT--GCAGGGTGCCCAG  1533
            |                     |||  |||.||       |.|||    ||||  ||||  .||.|.|.|||| 
Sbjct 1554  C-----TTTCCCCTTTCCCCTTCCC--CCCTGC-------TTTTC----CCTC--CCTTCCCCATGCTTCCCA-  1606

Query 1534  GGGGGTG------------CCAGGGCTTT----GCT-TGGAGGCTACTCCCAA-GCCTACGGGACTGTCTGCCA  1589
                .||            ||||    ||    .|| |.||||  || |.||| ||||             ||.
Sbjct 1607  ----TTGCCCCTCCAATGTCCAG----TTCAAATCTCTCGAGG--AC-CTCAAGGCCT-------------CCC  1656

Query 1590  CTCGGCACTGGGCCACCTGCCC-CTGCTGGAGGGGCACC---ATGTG  1632
            |||  |||||   ||||  ||| |||.|     |||.||   |||  
Sbjct 1657  CTC--CACTG---CACC--CCCTCTGAT-----GGCCCCTTTATG--  1689