Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488687
• Subject: NM_011952.2
• Aligned Length: 1141
• Identities: 1027
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  AT---GGCGGCGGCGGCGGCTCAGGGGGGCGGGGGCGGGGAGCCCCGTAGAACCGAGGGGGTCGGCCCGGGGGT  71
            ||   |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|..||||.|..|||||||.|||||.|||
Sbjct    1  ATGGCGGCGGCGGCGGCGGCTCCGGGGGGCGGGGGCGGGGAGCCCAGGGGAACTGCTGGGGTCGTCCCGGTGGT  74

Query   72  CCCGGGGGAGGTGGAGATGGTGAAGGGGCAGCCGTTCGACGTGGGCCCGCGCTACACGCAGTTGCAGTACATCG  145
            |||.||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||||
Sbjct   75  CCCCGGGGAGGTGGAGGTGGTGAAGGGGCAGCCATTCGATGTGGGCCCACGCTACACGCAGCTGCAGTACATCG  148

Query  146  GCGAGGGCGCGTACGGCATGGTCAGCTCGGCCTATGACCACGTGCGCAAGACTCGCGTGGCCATCAAGAAGATC  219
            ||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCGAGGGCGCGTACGGCATGGTCAGCTCAGCTTATGACCACGTGCGCAAGACCAGAGTGGCCATCAAGAAGATC  222

Query  220  AGCCCCTTTGAACATCAGACCTACTGCCAGCGCACGCTCCGGGAGATCCAGATCCTGCTGCGCTTCCGCCATGA  293
            |||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||..||||||||||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct  223  AGCCCCTTTGAGCATCAAACCTACTGTCAGCGCACGCTGAGGGAGATCCAGATCTTGCTGCGATTCCGCCATGA  296

Query  294  GAATGTCATCGGCATCCGAGACATTCTGCGGGCGTCCACCCTGGAAGCCATGAGAGATGTCTACATTGTGCAGG  367
            ||||||.||.||||||||||||||.||..|.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  297  GAATGTTATAGGCATCCGAGACATCCTCAGAGCGCCCACCCTGGAAGCCATGAGAGATGTTTACATTGTTCAGG  370

Query  368  ACCTGATGGAGACTGACCTGTACAAGTTGCTGAAAAGCCAGCAGCTGAGCAATGACCATATCTGCTACTTCCTC  441
            ||||.||||||||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  ACCTCATGGAGACAGACCTGTACAAGCTGCTTAAAAGCCAGCAGCTGAGCAATGACCACATCTGCTACTTCCTC  444

Query  442  TACCAGATCCTGCGGGGCCTCAAGTACATCCACTCCGCCAACGTGCTCCACCGAGATCTAAAGCCCTCCAACCT  515
            |||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct  445  TACCAGATCCTCCGGGGCCTCAAGTATATACACTCAGCCAATGTGCTGCACCGGGACCTGAAGCCTTCCAATCT  518

Query  516  GCTCATCAACACCACCTGCGACCTTAAGATTTGTGATTTCGGCCTGGCCCGGATTGCCGATCCTGAGCATGACC  589
            |||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct  519  GCTTATCAACACCACCTGCGACCTTAAGATCTGTGATTTTGGCCTGGCCCGGATTGCTGACCCTGAGCACGACC  592

Query  590  ACACCGGCTTCCTGACGGAGTATGTGGCTACGCGCTGGTACCGGGCCCCAGAGATCATGCTGAACTCCAAGGGC  663
            ||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  593  ACACTGGCTTTCTGACGGAGTATGTGGCCACACGCTGGTACCGAGCCCCAGAGATCATGCTTAATTCCAAGGGC  666

Query  664  TATACCAAGTCCATCGACATCTGGTCTGTGGGCTGCATTCTGGCTGAGATGCTCTCTAACCGGCCCATCTTCCC  737
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  TACACCAAATCCATCGACATCTGGTCTGTGGGCTGCATTCTGGCTGAGATGCTCTCCAACCGGCCCATCTTCCC  740

Query  738  TGGCAAGCACTACCTGGATCAGCTCAACCACATTCTGGGCATCCTGGGCTCCCCATCCCAGGAGGACCTGAATT  811
            .|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||.||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  CGGCAAGCACTACCTGGACCAGCTCAACCACATTCTAGGTATCTTGGGTTCCCCATCCCAGGAGGACCTTAATT  814

Query  812  GTATCATCAACATGAAGGCCCGAAACTACCTACAGTCTCTGCCCTCCAAGACCAAGGTGGCTTGGGCCAAGCTT  885
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  815  GCATCATTAACATGAAGGCCCGAAACTACCTGCAGTCTCTGCCCTCGAAAACCAAGGTGGCTTGGGCCAAGCTC  888

Query  886  TTCCCCAAGTCAGACTCCAAAGCCCTTGACCTGCTGGACCGGATGTTAACCTTTAACCCCAATAAACGGATCAC  959
            ||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||
Sbjct  889  TTTCCTAAATCTGACTCCAAAGCTCTTGACCTGCTGGACCGGATGTTAACCTTCAACCCAAACAAGCGCATCAC  962

Query  960  AGTGGAGGAAGCGCTGGCTCACCCCTACCTGGAGCAGTACTATGACCCGACGGATGAGCCAGTGGCCGAGGAGC  1033
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTAGAGGAAGCGCTGGCTCACCCTTACCTGGAACAGTACTACGATCCGACAGATGAGCCAGTGGCCGAGGAGC  1036

Query 1034  CCTTCACCTTCGCCATGGAGCTGGATGACCTACCTAAGGAGCGGCTGAAGGAGCTCATCTTCCAGGAGACAGCA  1107
            |.||||||||||.||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.
Sbjct 1037  CATTCACCTTCGACATGGAGCTGGATGACCTCCCCAAGGAGCGGCTGAAGGAGTTGATCTTCCAGGAGACAGCC  1110

Query 1108  CGCTTCCAGCCCGGAGTGCTGGAGGCCCCCG  1138
            |||||||||||.||.|.||..||||.|||| 
Sbjct 1111  CGCTTCCAGCCAGGGGCGCCAGAGGGCCCC-  1140