Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488826
• Subject: XM_006532409.2
• Aligned Length: 1243
• Identities: 945
• Gaps: 140

Alignment

Query    1  ATGGCTGAGCCCCGCCAGGAGTTCGAAGTGATGGAAGATCACGCTGGGACGTACGGGTTGGGGGACAGGAAAGA  74
            ||||||||.||.|||||||||||.||....||||||||.||.|||||                        |||
Sbjct    1  ATGGCTGACCCTCGCCAGGAGTTTGACACAATGGAAGACCATGCTGG------------------------AGA  50

Query   75  TCAGGGGGGCTACACCATGCACCAAGACCAAGAGGGTGACACGGACGCTGGCCTGAAAGAATCTCCCCTGCAGA  148
            |         |||||..|||.||||||||||||.||.||||.||||..||||.|.|||||.|||||||..|||.
Sbjct   51  T---------TACACTCTGCTCCAAGACCAAGAAGGAGACATGGACCATGGCTTAAAAGAGTCTCCCCCACAGC  115

Query  149  CCCCCACTGAGGACGGATCTGAGGAACCGGGCTCTGAAACCTCTGATGCTAAGAGCACTCCAACAGCGGAAGCT  222
            |||||.|.||.||.|||.|.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct  116  CCCCCGCCGATGATGGAGCGGAGGAACCAGGGTCGGAGACCTCCGATGCTAAGAGCACTCCAACTGCTGAAGCC  189

Query  223  GAAGAAGCAGGCATTGGAGACACCCCCAGCCTGGAAGACGAAGCTGCTGGTCACGTGACCCAAGCTCGCATGGT  296
            ||||||||||||||.|||||||||||.|.||.|||.|||.||||.|||||.||.|||||.||||||||..|||.
Sbjct  190  GAAGAAGCAGGCATCGGAGACACCCCGAACCAGGAGGACCAAGCCGCTGGGCATGTGACTCAAGCTCGTGTGGC  263

Query  297  CAGTAAAAGCAAAGACGGGACTGGAAGCGATGACAAAAAAGCCAAGGGGGCTGATGGTAAAA------CGAAGA  364
            |      |||||||||.||||.||||..||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||      ||||||
Sbjct  264  C------AGCAAAGACAGGACAGGAAATGACGAGAAGAAAGCCAAGGGCGCTGATGGCAAAACCGGGGCGAAGA  331

Query  365  TCGCCACACCGCGGGGAGCAGCCCCTCCAGGCCAGAAGGGCCAGGCCAACGCCACCAGGATTCCAGCAAAAACC  438
            ||||||||||.||||||||||||.||||.|.||||||||||..|.||||||||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct  332  TCGCCACACCTCGGGGAGCAGCCTCTCCGGCCCAGAAGGGCACGTCCAACGCCACCAGGATCCCGGCCAAGACC  405

Query  439  CCGCCC-GCTCCAAAGACACCACCCAGCTCTGGTGAACCTCCAAAATCAGGGGATCGCAGCGGCTACAGCAGCC  511
            .||||| || ||.|||||.||.||..|.||.||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct  406  ACGCCCAGC-CCTAAGACTCCTCCAGGGTCAGGTGAACCACCAAAATCCGGAGAACGAAGCGGCTACAGCAGCC  478

Query  512  CCGGCTCCCCAGGCACTCCCGGCAGCCGCTCCCGCACCCCGTCCCTTCCAACCCCACCCACCCGGGAGCCCAAG  585
            |||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  479  CCGGCTCTCCCGGAACGCCTGGCAGTCGCTCGCGCACCCCATCCCTACCAACACCGCCCACCCGGGAGCCCAAG  552

Query  586  AAGGTGGCAGTTGTCCGTACTCCACCCAAGTCGCCGTCTTCCGCCAAGAGCCGCCTGCAGACAGCCCCCGTGCC  659
            |||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||..|....|||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  553  AAGGTGGCAGTGGTCCGCACTCCCCCTAAGTCACCATCAGCTAGTAAGAGCCGCCTGCAGACTGCCCCTGTGCC  626

Query  660  CATGCCAGACCTGAAGAATGTCAAGTCCAAGATCGGCTCCACTGAGAACCTGAAGCACCAGCCGGGAGGCGGGA  733
            ||||||||||||.||||||||||.|||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||             
Sbjct  627  CATGCCAGACCTAAAGAATGTCAGGTCGAAGATTGGCTCTACTGAGAACCTGAAGCACCAG-------------  687

Query  734  AGGTGCAGATAATTAATAAGAAGCTGGATCTTAGCAACGTCCAGTCCAAGTGTGGCTCAAAGGATAATATCAAA  807
                                                                                      
Sbjct  688  --------------------------------------------------------------------------  687

Query  808  CACGTCCCGGGAGGCGGCAATGTGCAAATAGTCTACAAACCAGTTGACCTGAGCAAGGTGACCTCCAAGTGTGG  881
                  ||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  688  ------CCAGGAGGTGGCAAGGTGCAAATAGTCTACAAGCCGGTGGACCTGAGCAAAGTGACCTCCAAGTGTGG  755

Query  882  CTCATTAGGCAACATCCATCATAAACCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCTGAGAAGCTTGACTTCAAGG  955
            |||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  756  CTCGTTAGGGAACATCCATCACAAGCCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCAGAGAAGCTGGACTTCAAGG  829

Query  956  ACAGAGTCCAGTCGAAGATTGGGTCCCTGGACAATATCACCCACGTCCCTGGCGGAGGAAATAAAAAGATTGAA  1029
            ||||||||||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct  830  ACAGAGTCCAGTCGAAGATTGGCTCCTTGGATAATATCACCCACGTCCCTGGAGGAGGGAATAAGAAGATTGAA  903

Query 1030  ACCCACAAGCTGACCTTCCGCGAGAACGCCAAAGCCAAGACAGACCACGGGGCGGAGATCGTGTACAAGTCGCC  1103
            ||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct  904  ACCCACAAGCTGACCTTCAGGGAGAATGCCAAAGCCAAGACAGACCATGGAGCAGAAATTGTGTATAAGTCACC  977

Query 1104  AGTGGTGTCTGGGGACACGTCTCCACGGCATCTCAGCAATGTCTCCTCCACCGGCAGCATCGACATGGTAGACT  1177
            .|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  978  CGTGGTGTCTGGGGACACATCTCCACGGCACCTCAGCAATGTGTCTTCCACGGGCAGCATCGACATGGTGGACT  1051

Query 1178  CGCCCCAGCTCGCCACGCTAGCTGACGAGGTGTCTGCCTCCCTGGCCAAGCAGGGTTTG  1236
            |.||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1052  CACCACAGCTTGCCACACTAGCCGATGAAGTGTCTGCTTCCTTGGCCAAGCAGGGTTTG  1110